Difference between revisions of "BGIOSGA021779"
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Revision as of 16:37, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021779 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021779, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0036B04.22 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021779-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021779-PA |
| Length |
16029 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:4761642..4777670 |
| Sequence Coding Region |
4777512..4777670,4776297..4776454),complement(4776055..4776216,4775306..4775523),complement(4775109..4775204 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:4761642..4777670 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:4761642..4777670 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCAGCCTGGTGGAGCGGCTGCGGGTGCGGTCGGAGAAGCGGCCGCTGTACACGCTCGATGAGTCCGACGACGACCTCCCGCCGCGCGGCGGGGGCGGGAAGGGGAGGGATCGGCACAGCGACGGCCCCACCGAGCGGATCGAGCGGGAGGACGCGGTTAGCCCTCTTACGGAAATGGAAAAGATATTAGACTGTGAAGAAACAAAACCTGATGCTTCTGAAGAGACTAGTTCTTCTGAGTCCGGATCAAAGAAGAAACCTGTCAAACGATATCTTATAAAATGGAAAGGAATATCACACCTTCACTGCACTTGGGTTTCAGAAAGTGAATATTTGGAAACTGCCAAGATATACCCCCGGCTGAAAACTAGACTCAATAACTTCCATAAGCAAATGGATTCAACGGATAAGTCTGATGATGACTATTCTGCAATTAGACCTGAGTGGACTACTGTTGACAGGATCCTTGCTACCAGAAAAAGCTCTACTGGTGAAAGGGAGTACTATGTGAAATGGAAGGAACTAACATACGACGAATGTACTTGGGAAAATGACTCCGACATTGCAGTCTTTCAGCCTCAGATTGAACGCTTCAATGAGATTCAGTCCAGGAGGAAGAAGTCTACTGACAAGTGCAAGAGTGTCACTCGTGAGATACGTCAATATAAGGAGAGCCCGAAGTTTCTCTCTGGTGGGACACTACATCCCTACCAGCTTGAAGGGTTAAACTTCTTACGCTATTCTTGGTACCATAATAAACGTGTAATACTTGGGGACGAGATGGGTCTTGGTAAAACGATACAGAGTATTGCCTTTTTGGGCTCTCTATTTGTGGACAAGCTTGGTCCTCATCTGGTCGTTGCACCCCTTTCAACCTTGCGAAATTGGGAGCGTGAATTTGCAACTTGGGCACCTCAAATGAATGTTGTAATGTATTTTGGATCCGCAGCTTCTCGTGAAATTATTAGGAAGTATGAATTTTACTACCCCAAAGAGAAACCTAAGAAGCTTAAGAAAAAGAAATCATCTCCATCTAATGAAGACAAGAAACAATCAAGAATAAAATTTGATGTCCTTTTGACATCTTATGAGATGATCAATATGGATTCTACTGTTCTAAAAACCATAGAATGGGAATGCATGATTGTGGATGAGGGGCATCGTTTGAAGAACAAAGATTCCAAGTTGTTCGGTCAACTTAAAGAGTATCATACTAAGCATCGTGTTCTCTTAACGGGAACCCCAGTTCAGAACAACCTGGATGAACTTTTCATGCTTATGCACTTCCTTGAGGGTGACAGTTTTGGTAGTATAGCTGATCTCCAAGAGGAATTCAAGGACATAAACCAGGACAAACAAGTTGAGAAGCTCCATGGAATGCTGAAGCCGCATCTTCTTCGGCGATTCAAGAAAGATGTTATGAAAGAACTTCCTCCGAAAAAGGAGCTGATTTTACGTGTTGAGCTTACAAGCAAACAAAAAGAGTACTATAAAGCAATTCTCACCAAGAATTATGAAGTGTTAACTCGTCGTAGTGGTGGACATGTTTCACTTATTAATGTTGTAATGGAACTACGCAAACTTTGTTGCCATGCATTCATGACAGATGAACCCGAAGAGCCTGCCAATTCAGAAGAAGCTTTAAGGAGGCTTTTAGAATCTTCTGGAAAAATGGAGCTGCTTGACAAGATGATGGTGAAACTGAAAGAGCAGGGTCACAGGGTTCTTATTTATTCACAGTTCCAGCACATGTTGGACTTACTTGAGGATTATTTAAGCTACCGGAAATGGAGTTATGAGCGTATTGATGGAAAAATAGGTGGTGCTGAGAGGCAGATACGAATTGATCGCTTCAATGCTAAAAATTCTACTAGGTTTTGCTTTCTTCTTTCAACCAGAGCTGGTGGTCTTGGTATAAATCTGGCAACTGCCGATACTGTAATTATTTATGACAGTGATTGGAATCCTCATGCTGATTTACAAGCTATGGCGAGAGCCCATCGCTTAGGGCAGACAAGCAAGGTTATGATATATAGGCTTGTTAGTCGTGGTACAATTGAGGAGCGGATGATGCAACTTACAAAGAAAAAAATGGTATTGGAGCACTTAGTTGTTGGGCGTCTCACGAAAGGCACTAATATTGTCCAGGAGGAGTTGGATGATATTATTCGGCATGGCTCAAAGGAACTTTTTGACGATGAAAATGATGAAGCCGGAAAATCTTGCCAAATCCATTATGATGATGCTGCGATTGATAGATTATTGGACCGTGACCAAGCTGACGGGGAAGAGCCTGTGGAAGATGAAGAAGAAGACGAATTTCTAAAAGGATTCAAGGTTGCTAACTTTGAGTACATAGATGAAGCTAAGGCTTTAGCTGCAAAAGAGGAGGAGGCACGCAAAAAGGCCGAAGCTGAAGCTGCAAACTCTGACAGAGCAAATTTTTGGGATAAATTATTGAAGGACAGATACGATGTACAAAAAGTTGAAGAGCATACTACTATGGGAAAAGGAAAAAGGAGCCGCAAACAGATGGCTGCTGCTGATGAGGACGACATTACCGGCCTGCATGACATGAGTTCTGAAGATGATGATTACTCTTATGATGATGATGTGTCAGATAACGACACAAGTTTACAATCAGGCCTTGCTGGGAGGAGGGGCCCATATTCCAAGAAAAAACAACGTAATGTTGATTCACTTCCATTCATGGAGGGCGAAGGACGGGCTTTGAGAGTTTATGGGTTCAACCAAATTCAGCGAACACAATTCCTTCAAACGCTTATGAGATATGGTTTTCAGAACTACGATTGGAAGGAATTTACTCCTCGATTGAAGGGGAAAAGTGTTGAGGAAATCCAGAGATATGCTGAACTTGTCATGATCCATCTTCTTGAGGACATCAATGACTCAGGATATTATGCAGATGGCGTGCCAAAGGAAATGCGCACAGATGAGACATTGGTCAGGCTAGCCAACATATCACTTGTGGAAGAGAAGGTGGCTGCCATGGAACAAGGAAAAATAACAAAACTCTTTCCCAGCTATTTGTTATATGAATTTCCTAGCTTAGTTGGTGGAAGAGTATGGAAAGCGGAACAGGATCTACTGTTGCTGAAAGCATTAATAAAGCATGGGTATGCAAGGTGGCAATATATATCAGATGACAGAGATAATGGGATTTTTGAGGCTGCACGACAAGAGCTGAGGCTTCCTACTGCTAATGAACTGATTAGTTCTCACTCAAACAATGAGACAAACGGAAATCTGGAAAGCACACAAGAAGGCCAGTCGAACCCAACGAGCATGATCCATTACAGGGATACACAGAGAAAGATAGTTGAGTTTATTAGAAAGAGATACCATCTTTTGGAGAGATGTTTGAATCTTGAATACGCTGTGATTAAAACAAAAACCCCTGTTCCTGATGATCTCGCTGAACAAGATTTTCCTGGTGGTCATAGACCGGCCGTTCCAGACTACAGTGAAATGCTGAGAGAATTGCCTGTCCTTGAACCTATTTCCAAAGAAGTGGCGCCTGAAGGCACAACTGATCAGTCACAAGTTTCCCATCTTTACAACAAGATGTGCTTTGTCCTTGAAGACAGTGCTGTTCCTGCACTCAACTCGCATTTCGGTGACAAGGCAGCTTCCTCCGGTTTAGCCAATAGCCTCCATAAGTTTGAAGCTGTATGCGAAGACGTTAGTCGCATCTTGAGATCCCATGAAAATGGTACCACTCCCAAAGAGGAAGTTATGCTAGATGCAAGCTCCAAAGAGACCACGTCTCCAAAAGATCCAGCAACCGAGGTGCCTTCGTCAGCTTCCAAAGAAGCTACGCCTCCAGTACAAGATCCAGTCATAGAGGCAGTGAAGGAGGAGCCACCCACTGTTAAGGCGGAGGACAAAATGGAAATCGATAGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSLVERLRVRSEKRPLYTLDESDDDLPPRGGGGKGRDRHSDGPTERIEREDAVSPLTEMEKILDCEETKPDASEETSSSESGSKKKPVKRYLIKWKGISHLHCTWVSESEYLETAKIYPRLKTRLNNFHKQMDSTDKSDDDYSAIRPEWTTVDRILATRKSSTGEREYYVKWKELTYDECTWENDSDIAVFQPQIERFNEIQSRRKKSTDKCKSVTREIRQYKESPKFLSGGTLHPYQLEGLNFLRYSWYHNKRVILGDEMGLGKTIQSIAFLGSLFVDKLGPHLVVAPLSTLRNWEREFATWAPQMNVVMYFGSAASREIIRKYEFYYPKEKPKKLKKKKSSPSNEDKKQSRIKFDVLLTSYEMINMDSTVLKTIEWECMIVDEGHRLKNKDSKLFGQLKEYHTKHRVLLTGTPVQNNLDELFMLMHFLEGDSFGSIADLQEEFKDINQDKQVEKLHGMLKPHLLRRFKKDVMKELPPKKELILRVELTSKQKEYYKAILTKNYEVLTRRSGGHVSLINVVMELRKLCCHAFMTDEPEEPANSEEALRRLLESSGKMELLDKMMVKLKEQGHRVLIYSQFQHMLDLLEDYLSYRKWSYERIDGKIGGAERQIRIDRFNAKNSTRFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHADLQAMARAHRLGQTSKVMIYRLVSRGTIEERMMQLTKKKMVLEHLVVGRLTKGTNIVQEELDDIIRHGSKELFDDENDEAGKSCQIHYDDAAIDRLLDRDQADGEEPVEDEEEDEFLKGFKVANFEYIDEAKALAAKEEEARKKAEAEAANSDRANFWDKLLKDRYDVQKVEEHTTMGKGKRSRKQMAAADEDDITGLHDMSSEDDDYSYDDDVSDNDTSLQSGLAGRRGPYSKKKQRNVDSLPFMEGEGRALRVYGFNQIQRTQFLQTLMRYGFQNYDWKEFTPRLKGKSVEEIQRYAELVMIHLLEDINDSGYYADGVPKEMRTDETLVRLANISLVEEKVAAMEQGKITKLFPSYLLYEFPSLVGGRVWKAEQDLLLLKALIKHGYARWQYISDDRDNGIFEAARQELRLPTANELISSHSNNETNGNLESTQEGQSNPTSMIHYRDTQRKIVEFIRKRYHLLERCLNLEYAVIKTKTPVPDDLAEQDFPGGHRPAVPDYSEMLRELPVLEPISKEVAPEGTTDQSQVSHLYNKMCFVLEDSAVPALNSHFGDKAASSGLANSLHKFEAVCEDVSRILRSHENGTTPKEEVMLDASSKETTSPKDPATEVPSSASKEATPPVQDPVIEAVKEEPPTVKAEDKMEIDS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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