Difference between revisions of "BGIOSGA022654"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA022654

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022654, complete gene.

LocusTag

P0603C10.39-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA022654-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA022654-PA

Length

14614

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:9337226..9351839

Sequence Coding Region

9337226..9337336,9337442..9337514,9337758..9337835,9337916..9337996,9338179..9338252
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,9351660..9351839

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:9337226..9351839 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:9337226..9351839 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGTCCGGGAAGGTCGTGTCCTTCGTCGGCGCCGACGAGCTGGGCGTGTCCCTCGCCGCCTCCTTCGTCCGGTCCGGGGTCATCGTCCGCTGCTTCGTCGCTCCCGGGGGTGATGGATCGGCGACGGCGCTCGCGGAGCTGGGCGGCGTCCGGTGCGCGAGCCCCGCGGAAGCCGCGCGAGACGCTGAGCTAGTCATTGTGCTCAGTGACACGGATGGGGTTGATGAGCTGTTCTTCGGACCTGAGGGGATAGTGAAAGGACTGTGCTCGGGTGCTGTTGTATTGATTCGATCAACAATGCTGCCTAGTCATCTGGAGAAGTTGAATCAGAAGCTTGCAGATGAGAAGAAGAATGCCCTTCTTGATGGATACATTTTTAGTGGTTTATCTGATGAATTAAAGCAAAAGATTGTTGTTGTTGCATCTGGGAGACATGATGTTACAGAAAGAACCGGGCAATTCTTCTCTGGTCTTGATACAGCAGTTTACTTTGTTGAAGGTGAATTTGGCAGTAGCAGCAAAATTAAGCTGGTTAATGATTTGCTGGAGAGCATTCATTTTATAGCATCTATTGAAGCAATGTTTCTTGGTGTTCGGGCTGGGATTCATCCATCAATTATCTATGACATAATATCGAATGCTGCCGGAAGCTCAAGAATATTCGTGGAGATCGTACCAAAGCTTTTGAGAGAGGATTCTTTGCTTATTGATTATCTAGAGTCATCCAAGACAAACGCAGGCTATGTGATGGATATGGCTAAAGCAGTAATATTCCCTTTGCCACTTGTAGCTGTTTCTTATCAACAATTAATACATGGTTGTTCATCAGCAAATGGAGATGCATTAGTCTCACCGTTGAAGGTTTGGGAACAGTCATTTGGAGTAAACATCATAGATGCTGCCAGTCAACAAATCTACGATGCAAGCAAATTAGCTGACCAGCTTGTTATGGCATGTAAAACAGCAAAAACTATCGGCTTTATTGGTCTTGGAGCTATGGGCTTTGGAATGGCATCTCATTTGCTAAAATCAGGTTTCTCCGTTATTGCTTATGATGTATACAAGCCAACACTGGCCAGGTTTACTGATTTAGGTGGATTGACTAAAGATTCTCCTGAGGAAGTATCAAAAGATGTGGAAATACTTGTTATCATGGTTGCAAATGAAGTTCAAGCTGAAAATGTTCTATATGGAAATGCTGGTGCTGTATCAGTAATGGCCGCTGGAACATCCATCATCCTATCTTCAACAGTTTCTCCTGGATTTGTGATTAAACTCAAGGAAAGATTAGAAGCTGAATGCCGAGACATAAAGTTGGTTGATGCTCCGGTGTCTGGTGGTGTCAAAAGGGCAGCAGAGGGGACATTAACAATAATCGCTTCAGGAACAGATGAAGCTCTGCAGTGTACTGGCAGTGTTCTCTCAGCACTAAGTGAGAAGCTTTATGTCATCAAAGGAGGATGTGGAGCTGCAAGTTCTGTAAAGATGGTAAACCAACTTCTTGCTGGGGTTCATATAGCCTCAGCAGCTGAAGCAATGGCATTTGGTGCTCGATTAAATTTGAGGACAAGGAGACTTTTTGAAATTATTCAACATGCAAGAGGTTATTCATGGATGTTTGGAAATCGTGTGCCACACATGCTTGATAATGATTATACTCCTTATTCTGCAGTGGACATATTTGTCAAGGATCTTGGTATAGTATCTCATGAAAGCTCCAACGCAAGGATCCCACTGCATGTCTCTAGTATTGCTCATCAACTTTTTCTTTCAGGTTCTGCTTCTGGATGGGGTCGATTTGATGATGCTGCTGTTGTGAAGGTTTATGAGACATTAACTGGATTAAAAGTTGAAGGGAGGCCTCCCATGCTTAACAAAGAAGATGTTCTGAGTTCTCTTCCTGCTGAATGGCCAGAAGATCCCATGGATGATCTTGTTTCATCTGCATCTCATAATAGCAAAAAAATTCTTGTGGTTTTGGATGATGATCCAACTGGAACCCAGACAGTTCATGATATAGAAGTTTTAACTGAATGGCCTGTTGAAGCCCTTTCAGAACAGTTTCAAAAGCTACCAGCTTGCTTTTTTATTTTGACAAACTCCCGTTCAATGACTGCGGAAAAGGCTACACTATTAGTAAAAGATATCTGCAGAAATCTTGAAGCTGCAGCTAAGTCTGTCCCTGGTGTTAGCTATACAGTGGTATTGAGAGGGGATTCCACTTTACGTGGCCATTTCCCAGAGGAAGCCGATGCAGTCGTTTCAGTGTTAGGTGAGATGGATGCTTGGATAATATGCCCATTTTTCCTTCAAGGTGGCCGCTACACTATTGATGACATTCACTATGTTGCAGATTCTGACAGATTAATTCCTGCTGGTGAAACTGAGTTTGCAAAGGATGCAGCTTTTGGCTATAAATCTTCCAATCTCAGACAGTGGGTTGAAGAGAAGACAAAAGGACGGATTTCTGAGAACCAAGTTTCAACAATTTCTGTTAATCTCCTACGTAAAGAGGGACCGAATGCAGTCTGCCAGCATCTCTGTAGTTTGAAGAAGGGTTCTGCATGTATTGTCAATGCTGCTAGTGAGAGGGACATGTCTGTGTTTGCTGCTGGAATGATCCAGGCTGAATTGAAAGGAAAGAGATTTCTGTGCCGCACAGCTGCAAGTTTTGTAAGTGCTAGAATTGCAATAAAGCCAAAGCCACCTATTCGTCCAACTGACCTAGGTTTAAAAAGAGCTTTAACTGGAGGCCTCATTGTTGTTGGCTCTTATGTGCCAAAAACTACAAAGCAGGTTGATGAACTTAGGTCACTGTGTGAGCAATCTCTCCGAATAATAGAGGTATCTGTTGAGATGATTTCAATGAAATCGGCTGAGGATAGAGACCATGAAATTAGCCGAGTTATTGAATTGGGAAATGCTTATATACAATCCAGGAAAGACACTCTAGTTGTCACCAGCCGCCAACTCATCACAGGAAAAACTCCTGAAGAAAGCTTAGAAATTAATTACAAAGTGAGCTCAGCCCTAGTGGAGATTGTGAGAGGGATTGGCAGTCGACCCCGTTATATTCTTGCAAAGGGAGGAATCACTTCATCCGATCTTGCTACGAAGGCTTTGGAAGCTCGGCGTGCCAAAGTAATGGGACAAGCTTTAGCTGGTGTCCCTTTATGGCAGCTTGGTCCTGAGAGTAGACATCCTGGTGTCCCTTACATTGTTTTTCCTGGTAATGTTGGTGACAACAGTGCTCTTGCAAAAGTGGTCCAGAATTGGGCTTGCCCTTCTAGAAGTTCTGCAAAAGAACTTCTCCTTAACGCAGAGAATGGTGGTTATGCCATTGGTGCTTTCAATGTATATAACCTTGAGGGAATTGATGCTGTCGTTTCAGCTGCCGAAGCCGAAAAAAGTCCTGCTATTCTGCAGGTTCATCCCAGTGCCCTGAAGCAAGGTGGAGTTCCATTGGTCTCATGTTGCATTGCTGCTGCAGAACACGCTAGTGTACCTATCACCGTTCATTATGACCATGGAACTTCCAAGTCTGATTTGCTTCAAGCTCTTGAGATGGGTTTTGATTCAATCATGGTGGACGGATCACATCTACCTTTAGGGAAGAACATCTTATACACAAGGAGCATATCTTCCTTGGCTCATTCAAAAGGCATGCTTGTAGAAGCTGAACTGGGGAGACTCTCAGGCACTGAAGATGGCTTGACAGTCGAAGAATATGAAGCAAGATTTACTGATGTTGCTCAGGCCTTGGAATTCATTGATGAAACTGGTATCGATTCTCTAGCAGTATGTATTGGAAATGTTCATGGAAAATATCCCCCCAGTGGACCAAATCTCAGATTTGACTTGCTAGAGGACCTTCGTGCATTGACAATGAAGAAAGGTGTTAGCTTGGTTCTCCATGGAGCATCCGGACTGCCGCATGAACTTGTAAAGGAATGCGTAGCTTTGGGGGTGAGGAAATTCAACGTGAACACGGAGGTCCGAAACAGCTACCTTGAATCCCTTAAAAGGCCAGAAAAGGACCTGATTCATGTCATGGCATCTGCTAAGGAAGCAATGAAAGCTGTTGTGGCTGAGAAAATGCGCCTGTTCGGTTCATCTGGGAAAGCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASGKVVSFVGADELGVSLAASFVRSGVIVRCFVAPGGDGSATALAELGGVRCASPAEAARDAELVIVLSDTDGVDELFFGPEGIVKGLCSGAVVLIRSTMLPSHLEKLNQKLADEKKNALLDGYIFSGLSDELKQKIVVVASGRHDVTERTGQFFSGLDTAVYFVEGEFGSSSKIKLVNDLLESIHFIASIEAMFLGVRAGIHPSIIYDIISNAAGSSRIFVEIVPKLLREDSLLIDYLESSKTNAGYVMDMAKAVIFPLPLVAVSYQQLIHGCSSANGDALVSPLKVWEQSFGVNIIDAASQQIYDASKLADQLVMACKTAKTIGFIGLGAMGFGMASHLLKSGFSVIAYDVYKPTLARFTDLGGLTKDSPEEVSKDVEILVIMVANEVQAENVLYGNAGAVSVMAAGTSIILSSTVSPGFVIKLKERLEAECRDIKLVDAPVSGGVKRAAEGTLTIIASGTDEALQCTGSVLSALSEKLYVIKGGCGAASSVKMVNQLLAGVHIASAAEAMAFGARLNLRTRRLFEIIQHARGYSWMFGNRVPHMLDNDYTPYSAVDIFVKDLGIVSHESSNARIPLHVSSIAHQLFLSGSASGWGRFDDAAVVKVYETLTGLKVEGRPPMLNKEDVLSSLPAEWPEDPMDDLVSSASHNSKKILVVLDDDPTGTQTVHDIEVLTEWPVEALSEQFQKLPACFFILTNSRSMTAEKATLLVKDICRNLEAAAKSVPGVSYTVVLRGDSTLRGHFPEEADAVVSVLGEMDAWIICPFFLQGGRYTIDDIHYVADSDRLIPAGETEFAKDAAFGYKSSNLRQWVEEKTKGRISENQVSTISVNLLRKEGPNAVCQHLCSLKKGSACIVNAASERDMSVFAAGMIQAELKGKRFLCRTAASFVSARIAIKPKPPIRPTDLGLKRALTGGLIVVGSYVPKTTKQVDELRSLCEQSLRIIEVSVEMISMKSAEDRDHEISRVIELGNAYIQSRKDTLVVTSRQLITGKTPEESLEINYKVSSALVEIVRGIGSRPRYILAKGGITSSDLATKALEARRAKVMGQALAGVPLWQLGPESRHPGVPYIVFPGNVGDNSALAKVVQNWACPSRSSAKELLLNAENGGYAIGAFNVYNLEGIDAVVSAAEAEKSPAILQVHPSALKQGGVPLVSCCIAAAEHASVPITVHYDHGTSKSDLLQALEMGFDSIMVDGSHLPLGKNILYTRSISSLAHSKGMLVEAELGRLSGTEDGLTVEEYEARFTDVAQALEFIDETGIDSLAVCIGNVHGKYPPSGPNLRFDLLEDLRALTMKKGVSLVLHGASGLPHELVKECVALGVRKFNVNTEVRNSYLESLKRPEKDLIHVMASAKEAMKAVVAEKMRLFGSSGKA</aaseq>

Gene Sequence

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