Difference between revisions of "BGIOSGA022958"
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Revision as of 16:44, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA022958 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022958, complete gene. |
| LocusTag |
B1423D04.35 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022958-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022958-PA |
| Length |
10251 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:18197670..18207920 |
| Sequence Coding Region |
18197670..18197948,18200093..18200637,18200813..18200899,18201013..18201069,18201180..18201418 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:18197670..18207920 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:18197670..18207920 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGAAGGGGAGCCCGGAGGAGGAGGCCCTCCTCGCCGGCGTCGGAGGTGATCATAAGCTGGTGGAGTCGGATGAGTTGGCGCCAGCTGCAGCGGTGGTGCGGGAGGAGGTGAAGAAGCAGCTGTGGCTGGCCGTCCCGCTCGTCGCCGGCGCGCTGCTGCAGAACGTCATCCAGATGATCTCCGTGATGTTCGTCGGCCACCTCGGCGAGCTCCCCCTCGCCGGCGCCTCCATGGCCAGCTCCTTCGCCTCCGTCACCGGCCTCAGCCTCCTGCTAGGAATGGCAAGCGCACTGGACACCCTGTGCGGCCAGGCGTTCGGCGCCCGGCAGTATCATCTCCTGGGCGTCTACAAGCAGCGCGCCATGCTGCTGCTCACCGCCGTCAGCGTCCCGCTCGCCGTCGTCTGGTTCTACACCGGCGACATCCTCGTCGCGTTCGGGCAGGACGCCGACATCGCCGCGGAGGCCGGCGCGTACGCCCGGTGGATGATCCCGGCGCTGTTCGCCTACGGCCCGCTGCAGTGCCACGTCCGGTTCCTGCAGACGCAGAACGTGGTGCTCCCGGTGATGGCGAGCGCCGGCGCGGCGGCGCTGTGCCACCTGGTCGTGTGCTGGGCGCTCGTCTACGCCGCCGGGATGGGCAGCAAGGGCGCGGCGCTGAGCAACGCCGTGTCGTACTGGATCAATGTCGCCATCCTGGCGGTGTACGTGAGGGTGTCGAGCTCTTGCAAGAAGACATGGACGGGGTTCTCCATGGAAGCCTTCCATGACCCGCTCAGCTTCTTCAGGCTCGCCATCCCTTCCGCTCTCATGGTCTGCTTGGAGATGTGGTCGTTTGAGCTCATTGTGCTTCTTTCAGGTCTTCTTCCCAACCCGAAGCTAGAGACGTCCGTGCTATCAATCAGCCTCAACACTGCTGCTTTCGTTTGGATGATCCCCTTTGGCCTCGGTTCTGCCATAAGCACCCGTGTCTCCAACGAGCTCGGAGCGGGCCGGCCCCGCGCGGCCCGCCTCGCCGTGCGGGTCGTCGTGTTCATGGCCGTCTCGGAGGGATTGGTGATAGGGTTGGTGCTGGTTGGCGTGCGCTACATCTGGGGCCATGCTTACAGCGACGAGGAGGAGGTTGTCACATACGTGGCCAAGATGATGCTGGTCATCGCAGTCTCCAACTTCTTCGACGGGATACAGTGTGTCCTTTCAGGTGTGGCTAGAGGGTGTGGATGGCAAAAAATTGGAGCTTGTGTAAACCTTGGCGCCTACTATATCGTTGGCATCCCTTCAGCTTACCTCATAGCTTTTGTCTTACATGTCGGCGGAATGGGTCTATGGCTAGGCATCATCTGCGGCCTCTTGGTGCAAGTCCTGCTACTAATGGCAATAACACTATGCACAAATTGGGATAAAGAGGCGGCTAATGCGAAGGACAGGGTCTTCAGTTCTTCTCTTCCTTCAGATCTCGCAACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAKGSPEEEALLAGVGGDHKLVESDELAPAAAVVREEVKKQLWLAVPLVAGALLQNVIQMISVMFVGHLGELPLAGASMASSFASVTGLSLLLGMASALDTLCGQAFGARQYHLLGVYKQRAMLLLTAVSVPLAVVWFYTGDILVAFGQDADIAAEAGAYARWMIPALFAYGPLQCHVRFLQTQNVVLPVMASAGAAALCHLVVCWALVYAAGMGSKGAALSNAVSYWINVAILAVYVRVSSSCKKTWTGFSMEAFHDPLSFFRLAIPSALMVCLEMWSFELIVLLSGLLPNPKLETSVLSISLNTAAFVWMIPFGLGSAISTRVSNELGAGRPRAARLAVRVVVFMAVSEGLVIGLVLVGVRYIWGHAYSDEEEVVTYVAKMMLVIAVSNFFDGIQCVLSGVARGCGWQKIGACVNLGAYYIVGIPSAYLIAFVLHVGGMGLWLGIICGLLVQVLLLMAITLCTNWDKEAANAKDRVFSSSLPSDLAT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..279#2424..2968#3144..3230#3344..3400#3511..3749#9776..9894#10010..10096#10192..10251#ATGGCGGCGAAGGGGAGCCCGGAGGAGGAGGCCCTCCTCGCCGGCGTCGGAGGTGATCATAAGCTGGTGGAGTCGGATGAGTTGGCGCCAGCTGCAGCGGTGGTGCGGGAGGAGGTGAAGAAGCAGCTGTGGCTGGCCGTCCCGCTCGTCGCCGGCGCGCTGCTGCAGAACGTCATCCAGATGATCTCCGTGATGTTCGTCGGCCACCTCGGCGAGCTCCCCCTCGCCGGCGCCTCCATGGCCAGCTCCTTCGCCTCCGTCACCGGCCTCAGCCTCCTGGTATTAATACGGTTTTTAATTACTCATCCATCATCATTTTGCTCATATAATTACTAGTAGAAACTAGTACTCTACTTCCTCGGCCGTAAACATTTCTGGAGACTTTGGCGTGAATTAAGGAGGTACGTGAAATTGAATGACGAAAAGTTCTAATTGATTGAAAAAAGAAAAATATGTGGATAAATTAAATGAGAGGTGGTTGTGATTGGTTGAGATGATAAGAGGCAAATGAAGAAATAATTACACTTAAGACAAATTTGAACCTAGCTAACGCAATTCATCTATATATGTCGCTAGCTGTAGCAAATTATGATCAACATCGTTTTAGCCAAATTATGATAAACATGAATATCGTTTTAGTCCATCATTTAGCCTATAGCTGATTATAAAACATATATAATCTTATTAATGAAATATATTAATTCATAGGTACATTATATATGTGGTTATTAGCAACTTAAAAGTTCACTACAACGAAAAACAACATCAAAATAAGTTATAAAATTATGATTTAAAATTTAAATTTTAACTGCAGTTAATAAGTTGAAGAGAAAACGAAACGCACTAGAAGTTATATCTCCAGTCTATTTTGGTTCATATATATCTGGATCAATATAATTCGTCCCCTTTGTTGGTAGAGGATCGATCGACATTTCTCCCCACAATTCTATGATTGGGAAGATCAAGTGATCAACCACTCTATATTGATCAGTACGTGTCACTATAAAATCGTTTGCTCTAATTATAATATTGACAGGAGAACTACTTTTAATTTCAGTGTACAACTAGTCTTCTTCCAAGGGGAAAATTTAATTAGTATTTCTTTGTGAAAGTGGTGCTGTCTAGCTATGATTTCGAGGCCCCACCTCTGAGTATATTATATATTTTGTTCAGCATTTTTCGCTCCTTTTGACCGTAGAGAGGACTTTTCACTGAAGAGAGGAGAAAGATCAATGGTAGTCCAATGTTAAATCATCCAGTTGTCATCTGCATGTTTTCCTGCTTAGAACCTTTCTGAACGTATTACCAGTAGGCTCCATGATTGTTCCAAATCTAAAAAAAAATACTAATATAGCAAGCATATGGCAATTAAGTTTGAGGTTGCATGGTCTTACCGAAGGAAATTTATACCTGCTGCGCTCTGCTGATATATTTTAGGAAAATTAAATAGAGCACGGCAGGTTGAAACTTTGCCAACAATTTACAAATATTGTTCTAAAAAAACAATTTACAAATATTTATCCTGATATATATAGTGCTCATGACAACATTTTGCCTTTGACCAACAAATTATATTACAAAACGATGGGATCATTTCCCCCTAGGTTACTAGAAGGCACTATATATGATGCCATATTTTCTATAAGAAATAGTCAAATTTTTACACTGTAAATTACTTACATTTATACTATAATTTTTAATAATTATATTGTAATTTTATAATACATATTGTATAAGAAAATTAGGACTAAAAGTAATTTTTTATTTACATAGAAGAAGAGATAGGAAAGTTATTAAAAATACTTACACAATCACATAGAAAAAAAACTGTGAAATTAATCAAGTAAAATAGATGGCGCCATATCTTTAACAACTGCTATAAATTTGTGAATATCATACCGAAGACATTGCATATCATATCTTTGCGCTGATATAATTCCTAGAGGCGCTAGTAAATAACTGGGCATCTTAGTCGGTGCATCTGTGATGGAGACGTATGGCCTATTACAAAGGTCTCATCTTTACCGGGCCGAAAAAGGCCCGTCACAGATGCAGTATCTTGAGTCCTAAGGCCTAGGTAATAAGAATTTTGGATGGTGATGAATTCACTTATAAATTTATAGGGTAGAACTATAATTCAAAGATTGGTATAGTTGCTATACAAGCAAATCCGTGTCGCAATTTTGAGTTCAATTTTTCCCTTTTTTTTTCCCTGAACAAACACTCGTGTCACATATTTTCTCTGTCCAAGACTCTTCCTGTTCAAATCATGATATTTCGAATGAACACCTTTTCCCCTTCTACGTACATACCGCGAATACATGCATCAATTCCGTCAAAAGCAAAAATACAACATATACATTGTTTCGAAACAAGCTTAACCATTTTGAAATTGAATAAATTCCACTGGGCTTCATGATCAGCTAGGAATGGCAAGCGCACTGGACACCCTGTGCGGCCAGGCGTTCGGCGCCCGGCAGTATCATCTCCTGGGCGTCTACAAGCAGCGCGCCATGCTGCTGCTCACCGCCGTCAGCGTCCCGCTCGCCGTCGTCTGGTTCTACACCGGCGACATCCTCGTCGCGTTCGGGCAGGACGCCGACATCGCCGCGGAGGCCGGCGCGTACGCCCGGTGGATGATCCCGGCGCTGTTCGCCTACGGCCCGCTGCAGTGCCACGTCCGGTTCCTGCAGACGCAGAACGTGGTGCTCCCGGTGATGGCGAGCGCCGGCGCGGCGGCGCTGTGCCACCTGGTCGTGTGCTGGGCGCTCGTCTACGCCGCCGGGATGGGCAGCAAGGGCGCGGCGCTGAGCAACGCCGTGTCGTACTGGATCAATGTCGCCATCCTGGCGGTGTACGTGAGGGTGTCGAGCTCTTGCAAGAAGACATGGACGGGGTTCTCCATGGAAGCCTTCCATGACCCGCTCAGCTTCTTCAGGCTCGCCATCCCTTCCGCTCTCATGGTCTGGTCAGTGATCGATCGACTCAGTTCACACTCTTCCTCGATCTGTTGAGAATTTGATACTTCTCTGAAAGTTTAAATCCTTCTCTTTTTTTTTTTGAAAATTTCGAGCCTTTTTTTATGTTGTGCAACTCGATCGAAGATACTCGTGTGGCGATGACATTCTGCTCTGGCATTGCAGCTTGGAGATGTGGTCGTTTGAGCTCATTGTGCTTCTTTCAGGTCTTCTTCCCAACCCGAAGCTAGAGACGTCCGTGCTATCAATCAGGTAATACTAAACAGAAATTGATCACCACACATTTCGACTGAAATGTTTTTGTGCTATGCCAAATAGAGAGAAAAAAAAACAGTCTGAAACATATTCGGTTGCAATTTTGACAGCCTCAACACTGCTGCTTTCGTTTGGATGATCCCCTTTGGCCTCGGTTCTGCCATAAGGTATACGTAGCATTCATCCTCCTAGCTTACACTGCATTGCAGTCAACATTGCTCATCATCATCATCGTCATCAGTGCCTGTATTATCCATCATGATCTTGCATGATGCAGCACCCGTGTCTCCAACGAGCTCGGAGCGGGCCGGCCCCGCGCGGCCCGCCTCGCCGTGCGGGTCGTCGTGTTCATGGCCGTCTCGGAGGGATTGGTGATAGGGTTGGTGCTGGTTGGCGTGCGCTACATCTGGGGCCATGCTTACAGCGACGAGGAGGAGGTTGTCACATACGTGGCCAAGATGATGCTGGTCATCGCAGTCTCCAACTTCTTCGACGGGATACAGTGTGTCCTTTCAGGTACACCTGATTATTTCTCCTTCCTGGCTGGATACTAAGTTACACAAGTTCGTCGTCACAATAGCCAAGCTGATTAGCGATGAATCATGTGTAGAGTGTTTTGCTTTCTCTCCAAGAATTCTATTTAAGATATTCTCTGATTTATAATAGGCTTTAATAGACGGCGTAGGAGGGTTTCAGAATATATTTATTATACATCAATTTCCTCTTTTAGTGATTGAAACGGCACGTTAGCACCAAGTATATGAAAACTAGGACTTAGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGTTATGGACGTTACCTTTGTGTTATTGAGCCTTCTATAGTTTTAAATTTATTTTTCTTACATTTAAAGTGAGTCATGACTATATGGCTTTTTATTTTATTTTGTAACATTGTAGATTTATATATGTTTTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAAATTATGCGTAAGTCATGGACAGACAAAAGCAGTATATGCTTATGAAGCGATAGAGGATGATATAATATATATTGCCAATTACCCTGGCTCTTTACCTTGATGGCATACATGCTCATTGCACTTTAGATAGCAATGTGTTGTATAGACACCTCGTTAATATTTGTGAACCGACGTTTGGTGGATTGGGGTTTGTAAGTTGGAGCTAATACATAGGGGTTGAGTGTGACATATTGATATATATATATATAGTTAGCCCTATAAGGGCTGAATACATTTGGATCAGCTGATATACTAAAAGCAACTTAAGTTTAAACTCCAAGATTGAGAAGGAAAAGATTGACATATATGCCCTCTACTCTTGTTTAATCTATCCTTCAGAACATAAATACTGTATGCAAAGATCACATTTAATCTTTTTTTATGATAATGTATTCACTTTAAATATTCTAGATATAATTGCATTGAAATTATCACTATATATGTTAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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