Difference between revisions of "BGIOSGA024189"
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Revision as of 16:50, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024189 |
|---|---|
| Description |
Translation initiation factor eIF1 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024189, complete gene. |
| LocusTag |
P0681F05.112 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024189-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024189-PA |
| Length |
15898 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18845995..18861892 |
| Sequence Coding Region |
18861875..18861892,18861426..18861617,18861048..18861320,18859799..18860017,18859238..18859298 |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:18845995..18861892 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCCTCGTCTCGAGTAAGGGTTGGCAATCTAGTCCCCCTCAATGAAGGAAATGCGAGCTCGTCAAATGGATCGGTGTCAAGCATTCCTATCTATCTGGGTGCCAATGTTGTAGGGAGGAATCATTTGGTGGTCGTCGACAAGAGAGTCAGCCGCAAGCATCTGAGCCTACATGCCTCGGCGGATGGTTCCATTGAAGCGGTAGTGGAAGGACCAAATCCTATCATTGTTCGATCTGAGGGCCAGAGGAGGAAGGTCTGTGCTCAAGAGAGAGTAAAGATTGCACATGATGATGTCCTGGAACTCATCCCTGGTGAATATTTTGTGAAGTATTTGAATGTGGGCGATAACCATAAAAGTTCCACATCAATGGGTTCAAGTGATTTTAAAAAGGGGAAGAGGCTCTGTGAGGATGATACTGTAGTTATCAAAAGAAATCGTCAGATTATGGAAGATGAGGCTTTGGCAAGAAGTTTACAGAAAAGCTTTGCAGAAGAAAGTTCAACTATTTCCGGTTTGGGTTGTGATCAAATGTTAAGTTCACTTGATAGTGCTGGTTCTTCTGAGAGAAATAACGAGAGAATACACTCTGTTGATTATCTGAAAGATGTACTTTCATTGACTTTTCGGCTCATGCGTGTTCAAGGTCTTCCTTCATGGACTAATACTTCCTCAGTTACCATTCAAGATGTCATACAGGGTGAAGTGCTTCTTGCTGTACTCTCAAATTATATGGTGGACATGGAATGGCTGCTTACAGCATGTCCAAGCTTAAGGAAAGTTCGACATGTCCTAGTTATACATGGAGAAGATGGTGCATCAGTGGAGCTTCTGAAGAAAGTGAAGCCAGCCAATTGGATCCTTCACAAGCCTCCACTTCCAATTTCATTTGGAACACATCATTCAAAGGCCATGCTGCTTGTATATCCTCAAGGGATTCGTGTTGTTGTGCACACAGCAAATTTGATACATGTCGACTGGAATAACAAAACTCAGGGGCTATGGATGCAAGATTTTCCCTGGAAAGATGCAAAAGATGTGAATAGAATTGTTTCCTTTGAAAACGATTTGGTTGATTATCTGAGTGCAATTAAGTGGCCTGAGTTCAGGGTAAATTTACCAGTGGTTGGTGATGTCAACATCAATGCAGCATTCTTTAGGAAGTTTGATTATAAGAGCTCATTGGTCAGGTTGATTGGATCCGTTCCTGGTTATCATGTTGGCCCCAATATTAAAAAGTGGGGTCATATGAAGCTTAGGAGTGTTCTTGAAGGGTGCACATTTGAACAACAGTTTTGCAAGGCTCCCATGATTTATCAGTTCTCTTCCTTGGGGTCACTTGATGAGAAATGGATGAGTGAGTTTGCATGCTCACTATCAGCTGGTAAATCAGATAATGGTTCACCTTTGGGTATTGGTAAACCACTGATTGTCTGGCCTACAGTGGAGGATGTTAGGACATCAATAGAGGGTTATGCAGCTGGTAGTTGCATTCCAAGCCCTCAAAAGAATGTTGAAAAAGATTTCTTGAGGAAGTATTGGGCCAGGTGGAAAGCGGACCATGTGGGTCGTTGTCGTGCGATGCCTCACATAAAAACTTTTACTCGATACAATGGTCAAGACATTGCATGGTTTCTACTAACCTCGGCAAATTTAAGCAAAGCTGCTTGGGGTGCGTTGCAGAAGAATAATACACAACTGATGATACGCTCATATGAGTTAGGTGTACTGTTCTTGCCCAAAACTCACCAATCTGTACCACAATTTTCATGTACGGGGAAGAACAATTCAAACCTGAATAACCTGGCCCCTGGGAAAGAGATCAAAACCAAACTGGTCACACTCTGCTGGAAAAGCGACGAAGAAAAAGAACAATCCACGGAAATTATCAGATTGCCAGTGCCATATCAACTTCCTCCAAAGCCTTACGGCACAGAAGATGACCCATGGTCTTGGGACAAGAGGTACACAAAGAAGGACGTGTATGGTTCAGTCTGGCCGCGCCATGGAGGCATCCAAGCCAAGAAGAGGGAGAGCACCAAGGACACGCGACTAGCAGAAGCCGAGCGACCGCCTTCTCGATCCATATCTTCCGGTCGAGTTCTTGGTCGATCTCTTCCCTCCTCCACCTCCTCCTCACAGGTTCTTGGTGTAGCTTGCCACTTTCACCAGCAAAGTTTCATGTCTGATCTCGACATTCAGATCCCAACTGCCTTCGATCCCTTTGCTGAGGCCAATGCTGGAGACTCTGGTGCGGCTGCAGGATCAAAGGACTACGTTCATGTACGCATCCAGCAGCGTAATGGCCGTAAGAGCCTGACCACTGTCCAGGGATTGAAGAAGGAATTCAGCTACAACAAGATCCTTAAAGATCTCAAGAAAGAGTTTTGCTGCAATGGTACTGTTGTCCAGGACCCAGAGCTTGGCCAGGTCATTCAACTTCAGGGTGATCAGAGGAAGAACGTATCAAATTTTCTTGTTCAGGCCGGCATTGTGAAGAAGGAACACATCAAGATTCATGGTTTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASSSRVRVGNLVPLNEGNASSSNGSVSSIPIYLGANVVGRNHLVVVDKRVSRKHLSLHASADGSIEAVVEGPNPIIVRSEGQRRKVCAQERVKIAHDDVLELIPGEYFVKYLNVGDNHKSSTSMGSSDFKKGKRLCEDDTVVIKRNRQIMEDEALARSLQKSFAEESSTISGLGCDQMLSSLDSAGSSERNNERIHSVDYLKDVLSLTFRLMRVQGLPSWTNTSSVTIQDVIQGEVLLAVLSNYMVDMEWLLTACPSLRKVRHVLVIHGEDGASVELLKKVKPANWILHKPPLPISFGTHHSKAMLLVYPQGIRVVVHTANLIHVDWNNKTQGLWMQDFPWKDAKDVNRIVSFENDLVDYLSAIKWPEFRVNLPVVGDVNINAAFFRKFDYKSSLVRLIGSVPGYHVGPNIKKWGHMKLRSVLEGCTFEQQFCKAPMIYQFSSLGSLDEKWMSEFACSLSAGKSDNGSPLGIGKPLIVWPTVEDVRTSIEGYAAGSCIPSPQKNVEKDFLRKYWARWKADHVGRCRAMPHIKTFTRYNGQDIAWFLLTSANLSKAAWGALQKNNTQLMIRSYELGVLFLPKTHQSVPQFSCTGKNNSNLNNLAPGKEIKTKLVTLCWKSDEEKEQSTEIIRLPVPYQLPPKPYGTEDDPWSWDKRYTKKDVYGSVWPRHGGIQAKKRESTKDTRLAEAERPPSRSISSGRVLGRSLPSSTSSSQVLGVACHFHQQSFMSDLDIQIPTAFDPFAEANAGDSGAAAGSKDYVHVRIQQRNGRKSLTTVQGLKKEFSYNKILKDLKKEFCCNGTVVQDPELGQVIQLQGDQRKNVSNFLVQAGIVKKEHIKIHGF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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