Difference between revisions of "BGIOSGA024446"
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Revision as of 16:52, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024446 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024446, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_25697 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024446-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024446-PA |
| Length |
18195 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:11273424..11291618 |
| Sequence Coding Region |
11291373..11291618,11291197..11291282,11290077..11290178,11289062..11289168,11288867..11288967 |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:11273424..11291618 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGGACCCCGCGCCATGGCGGCGTCGACCCGCGGCGGGCGGCGGAGGAGGAGGCGCCGCGGAGGCCGCGCTCGTGCTGCTCGCCCTGGCGGCGCTCTACGGCGCCATGTCCCTCGTCGCCTACCGCGTCATCCACATGCGCCACGTCGCCCCCCTGGGCGCCGACGCGCCGCTCGGGGACTTCTCCGAGGGACGCGTGCTCCACCACCTCCGCTGCCTCTCCGTCGACATCCCCGGCCGCCAGGAGGGGAGCCCGGGGCTGGAGGCCGCGGCGCGGTACATCAAGGGGCAGCTCGAGGAGCTCGCCGCGCGCGCGGGGCCGGAGTACAGAATAGAGGTTGAGGAATCACTTGTTAGTGGCTCGTTCAGCATGAGGTTTTTGCGCCACAGAGTAACTCTAACATACAGGAATCACAAGAATATTGTTATGAGGATTTCATCAAATGTTTCAGAAGATCAGGATCTAGCCTTCTTGGTGAATGGACATTTTGACAGTCCACTTGGATCTCCTGGTGCAGCTGACTGTGGTTCTTGTGTTGCATCTATGCTTGAGTTATCAAGGCTCATCATTGATTCTGGGTGGGTTCCTTCTCAACCGGTGATTTTTCTATTCAACGGAGCTGAAGAACTTTTCCTTTTGGGTTCACATGGTTTCATAAAGACACATAAATGGAACAACACGATTGGTGCCTTTATTAATATCGAAGCTTCTGGAAGCGGCGGTGCTGATTTAGTTTGTCAATCTGGACCTGGATCTTGGCCTTCTCGTATTTATGCTCAGACTGCGAAGTATCCTATGGCAAACAGTGTTGCTCAGGATATGTTTGGAATAATCCCAGGTGATACAGATTATAGGATATTTGCTGAAGACATTACAAACATTCCAGGACTTGATATTATCTTTGTTCTGGGTGGTTATTTTTACCATACTTCATATGATACTGTGGAAAACTTGCTTCCTGGAAGTATTCAAGCACGTGGAGAAAATTTATTCAACCTTGTGAAGGCTTTTACAAATTCTCCCATGCTGTTGAAAGAGAATAAGCGATCTAATGAAGCTGCTATGCCTATAAAGGATGATTTGAGAGCTATCTTTTTTGATTACTTGACTTGGTTCATGGTTATTTATCCCCGTGGTGTCTCTTTGGTTCTCCACAGTCTTCCAGTAGCCATTTTCCTGCTTGCACCACTATTCCTGACGTCTCCAAACATTACCTTGATGTCATGGTCTCTGACTGTTCTGGATTTAATGAGAGGAATGCTGCTTCATGCATTTGGTGCCATCCTTGCAATAGTCATTCCTGCTGTGGCTGCAGCTGCCTGTGCTTTGCGGGCTTGGGTTAGCTGGTTTGCTCACCCTTATTTGGCATTCCTTATGTTTGTTCCAACTTCATTAGCTGGTCTATTTCTCCCGAGGATTGTATGGGGATTATCAGAGCAAGCACATTTTTGGGGTGCTTTCGGGCTCTATTCCTTAATAACTTTGGTTTACATGCTAGCTGGCCTGAGTGGAGGTTTTCTAACATTCTTCATTTCCATGTCGATGCTTCTTGGGCGTTTTATCTGTAGCATTAGTCGGAAACATTGGAACAAACAATCACCAAAGTTGTTGGTTGGTTATGTGGTACCTATGATCCCATGTCTCCTTTATTGTCTTTACTATGGTGGTTTCCTTATCCAGTTCTTGATTGAGAAGATGGGAATGATGGGATCTCTCCCAAAACCATACGGATATTTTGTAGCTGATGTCATTGTTGGGTCAGTAGTTGGATTGGTCGTGGGATGGTGTTTTGGTCCAGTAACACCTATTGCTAGTCGATGGCTGGCCAAAACCTCCATCCTCCATGGCTTGTTACAAGTTACAGTGGTTGGTTTGGCGATCTCATCACAACTGTTTCCTTACAGCACTGGAGCACCTAAAAGAGTTGTTCTTCAACACACCTTTGTTACAGATGCTAATAGTATTGTGGAGTCACACTATGGTTTCTCTGTGGTTGATGCTAATTCATTGGAGTTTCTTTTCAATAATGCGCCTGAGGCAGCAAAATGGCTGAAGGATAACTCACTATTATCTTTTGAAGAAAAGTATCACTCCGACAGAAGTTCATGGTTGGCACTATATCCTGTCAATTTCTTGTTCTCTGGGAGCTTAAAGTTTCCTTCAGAAAATGAAGAGATTAGAAAACATTACCAGCATTTCCCCCAGATGGTTATTCAGAAGACCTCGAGTAATAATGGGCACCGGAGGATGCATCTTGAGCTTTCACTTGGTTCATTATCGGAGATTTGGACCTCTGTGCTTAATATTACTGGACCACTATCAAATTGGTCCTTTTCTGATATGACACTTCCAGATCCTCAAAGTTTTAGTGGCGGGCCACCATCATATATATGCAGACTTAGTGGAGAAAGCCACGAGAATTGGTCTTTCTGGTTGGAGGCGAACTCTTCTGAACCTTTGAGAATCGATGTAGCTGTACTTGACCAGTATCTCCTTGATCGTACAAGGAAACTGAAGAGTCTCTTCCCAAGTTGGGCAGACATTACAGCCTTCACAACATTTTTCTCAACTTATCACTTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVDPAPWRRRPAAGGGGGGAAEAALVLLALAALYGAMSLVAYRVIHMRHVAPLGADAPLGDFSEGRVLHHLRCLSVDIPGRQEGSPGLEAAARYIKGQLEELAARAGPEYRIEVEESLVSGSFSMRFLRHRVTLTYRNHKNIVMRISSNVSEDQDLAFLVNGHFDSPLGSPGAADCGSCVASMLELSRLIIDSGWVPSQPVIFLFNGAEELFLLGSHGFIKTHKWNNTIGAFINIEASGSGGADLVCQSGPGSWPSRIYAQTAKYPMANSVAQDMFGIIPGDTDYRIFAEDITNIPGLDIIFVLGGYFYHTSYDTVENLLPGSIQARGENLFNLVKAFTNSPMLLKENKRSNEAAMPIKDDLRAIFFDYLTWFMVIYPRGVSLVLHSLPVAIFLLAPLFLTSPNITLMSWSLTVLDLMRGMLLHAFGAILAIVIPAVAAAACALRAWVSWFAHPYLAFLMFVPTSLAGLFLPRIVWGLSEQAHFWGAFGLYSLITLVYMLAGLSGGFLTFFISMSMLLGRFICSISRKHWNKQSPKLLVGYVVPMIPCLLYCLYYGGFLIQFLIEKMGMMGSLPKPYGYFVADVIVGSVVGLVVGWCFGPVTPIASRWLAKTSILHGLLQVTVVGLAISSQLFPYSTGAPKRVVLQHTFVTDANSIVESHYGFSVVDANSLEFLFNNAPEAAKWLKDNSLLSFEEKYHSDRSSWLALYPVNFLFSGSLKFPSENEEIRKHYQHFPQMVIQKTSSNNGHRRMHLELSLGSLSEIWTSVLNITGPLSNWSFSDMTLPDPQSFSGGPPSYICRLSGESHENWSFWLEANSSEPLRIDVAVLDQYLLDRTRKLKSLFPSWADITAFTTFFSTYHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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