Difference between revisions of "BGIOSGA024637"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA024637

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024637, complete gene.

LocusTag

OS07G0203800

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024637-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024637-PA

Length

12517

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:5603517..5616033

Sequence Coding Region

5615788..5616033,5614770..5614904),complement(5614570..5614649,5613882..5613965),complement(5612977..5613065
,5612697..5612832),complement(5610703..5612599,5608542..5608852),complement(5607762..5608074
,5607042..5607197),complement(5606805..5606943,5606315..5606391),complement(5605575..5605796
,5604673..5604794),complement(5603771..5603879,5603517..5603690

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:5603517..5616033 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:5603517..5616033 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGTCCCCCACCGCCGTCGGGGGCGGGGGAGGGGGCGAGGCCGGCGCCGCATCGTCGTCGTCGTCCTCCTCGGGCCCCTCCACATCGTCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCATCGGCATCCGCGTCCTCATCAGCCGTCGCCACCCGCTACCTCGCCAAGCGCGTGCTCCGCGGGAGCGCCGTGCTCCACGTCGCCCAGGGCTGCTTCCGCTCCCCCGACTGCGTCGACGTCGTTCTCTGCAAGGAAAATTCGCTGGAATTGGTTGTTATTGGTGAAGATGGTGTTTTACAATCGATCTGTGAACAAACCACATTTGGTATTATAAAAGATGTTGGTGTCTTAAACTGGCGCTGTACACACTTTGGTTTAATGCCGAAGATAGAAGGGAAAGAAATTCTGGTTATACTTTCAGATTCTGGAAAGCTATCTCTTCTTTACTTTTGTTCTGAGATGCATAGGTTCTTTGCAATTGCAAATATTGAACTATCCAAACCAGGAAATTTGAGGCATCGGCTCGGGAGAATTTTAGCTATAGATCGAGAATCTAGGTTTGTTGCTGTCAGTGCATATGAGGATGAGTTTGCATTTGTACGTGTTTCAGTGGATCACAAACTTCATGCTCCTAATGGAGAAATTGAAGAGGATGCTAAAATCATCAGTACTGCATATAATACCAGCAGTATCCATGGTACAGTTTGGAGTATGTGCTTCATATCAACATGCCTGGATGAAGAATATTATCCTGTAGTTGCAATGATAGTTAACAGGGGCTCTGATGTAAATGACTTGGCACTCTATGGGCTAGATTCCCATAAACGTACTATTGACCGCATATCTACTTATTTAGAAGCTGGACCTTTGGCACTTGAAATCTCAGAAATTCCCCAACTGTATGGCTTTGCACTTATGTTTCGTGCTGGTGATGTTCTGTTGATGGATCTGAGGAACCCAAAGGACATCAGTTGTATCCATAGAATAAGCTTGTCAACTAGTCTAATTGGAGATCATGTCTCCGTTGAAGATTCCTGTAGGGGATTAGATGTCGATGATGATGTGGCGGCTTGTGCTTTGCTGGAACTGAGAGACTCTGGAAATAACATGATGAGGGATGACAGTTACATGGACATTGACGGTACTGATAACAAAGCTGTAGTGAAATCAAGGATTGTTTGCTCATGGAACTGGGAGCCAAATGCCATGCAAGGACATCCAAGGCTGATCTTTTGCTTGGATGATGGAGAATTTCATCTTCTAGAGTTTAGTTTGGATATGGAAGGAGTGAAGGTATTGCCTGAGTGTGTCCATAGAGGTTTGCCTTGCAAACCTCTTTTGTGGATGGACAAAGGAATGGTAGTTGGATTTGTAGAGATGGGAGATGGGATGATCCTCCAACTTGAAAATAATAGATTGGTGCATAAAAGTGCAATTCAGAATGTAGCGCCAATATTGGATCTAGCAATTGCTGACCACCATGGTGAGAAGCAGGATCAGATGTTTGCATGTTGTGGAATGTGCCCTGAGGGGTCCTTGCGAGTAATACGTAATGGTGTCAATGTGGAGAAACTTCTGAGGACAGATCCTATTTATCATGGTGTTACTGGTTTGTGGACCTTGAGAATGAAGAGAACTGATGCTTATCACTCTTTTCTTGTATTGTCATTCGTTGAGGAAACCAGAATACTATCAGTAGGACTCAGTTTTAATGACATCTGTGATGCTGTAGGATTTCAGACTGATGTTTGCACTCTGGCATGTGGTTTAGTAGCTGATGGTTTGCTTGTGCAAATTCACAGCAAATGTGTAAAGCTTTGTTTACCTACAGCATGTGCTCACCCTGAGGGAACTTTGCTCCCGTCTCCTGTTTGTGCTGACTGGTATCCTGATGTCACTATCAGTGTTGGTGCTGTTGGACATAATGTTGTTGTTGTTGCTACATCGAATCCTTGTTGCCTTTACATACTTGGGGTCAGATCATTATCTTCGTTTCAGTATGAGCTGTATGAGATACAACATGTCCAGTTGCATTATGAAGTATCTTGCATATCTATTCCACAAGAGGACTGGAGACTCGATAATTCATCTTCTAGTTGTGCAACAAGTGGTGATTTTCGGAAAGATTTTGCAGCTAATATTCGCAAGTTTGCTGTAATTGGAACTCACGAACCTTCTGTGCATATCATTTCGTTGGAACCTGGAGAAGCATTTCAGCAACTTGCTGTTGGGCATATATCAGTAAACAACGCGCTCGGCACTCCTATCAGTGGTTGTATACCTGAAAATGTTAGGTTTGTAGCAGCTGCAAGGTTCTACATTCTTGCAGGACTAAGGAATGGAATGCTACTGAGGTTTGAGTCACAAACAAGCAAAGGGCATTGTTTCCCTGGTTCCTTTTACAAGGAGTCCTCTACCCCTTGTGATGATACATCCCTTATGTTGATTGCTGTACGGCGTATTGGAATCACTCCTGTAGTTTTGGTACCGTTGCATGACAGAGCCAATGCTGACATTATTGTTCTCGGTGATAGGCCTTGGCTATTGCATTCTGCTAGACACAGCTTGGCATATTCATCCATCTCATTTCTGCCTGCTTCCCATGTGACACCAGTGTCTTCTACTGATTGCCCCAATGGTCTGCTGTTTGTTTCGGAGAACTGTTTGCATTTGGTTGAAATGGTTCATGGCAAAAGACTAAATGCACAGAAGTTTTCGATTGGAGGGACTCCAAGGAAAGTGTTATACCACAGTGATAGTAGAACACTGTTGGTGCTGAGAACTGGGTTAACCAGTGTATCCTGTTCTTCAGATATTGTTCAAATAGATCCAAGTAATGGGGCATTGCTTTCCAGATTCAAGTGCGAACCTGGTGAAACAGCAAAATGCATGCAAATTGCAAAGATAGGGAATGATCAAGTATTAATCGTTGGAACTAGTAAGTCCAATGGCCGACCAATGATGCCAAACGGTGAAGCAGAAAGTATCAAGGGTCGTCTAATTCTTTTAAGCTTGGAGACTATTGAAAGTCCTCGTGAGAGCGGTTCGTTTACTGCAGCTTCTAATTTGAATTCATCTCATGCTGGTTCTCCATTCCCGGAATTTGTTGGATATGCAGCAGAGGAGCTGTCTAGTAACAGCATGTGCAGCAGTCCTGATGAAGTTTGCTGCAATCAAATTCAACCTGAACTCATGGCAGGCCATTTGAGATCACTAGTCCAACATACATTCAATGGCGCTGTTCTTGCTGTACATCCATATCTAGATAGATATGTGTTGGCAGCAGCTGGAAATGTGCTTTTTGTATTTGGATTTTTAAATGAAAGTCCCCATCGGATAAAAAAGTATACTACGAGTAGGACACGATTTACAATAACCTGTTTGAAGACGTATGCATCACGGATTGCAGTGGGTGATTGCCGCGATGGTGTTCTCTTCTATTCTTATCATGAGAATCTTAGGAAGTTGGAACTGATCTATTCTGATCCTGCCCAACGGCTAGTGGGTGATGTTGCCCTTTTGAGCTGTGAAACTGCTGTTGTATCAGATCGACGAGGGAGCATATCTGTACTGTCTTGCCCAAGATTAGAAGTATCCGAAAGTCCAGAGAAGAACCTAGCGGTGCATTGTTCAGGTTACATGGGTGAAACAGCTATGAGCATCCAGAAGAGGTGGAGGTTGAGGAATAACACCTGCTGGCTGCTGCCGCTGGGCTGCTGGCTGCTGCGAGGCGAGGCGTCGTCGGCGGTGAGGAAGAGTCGCCAGTGGGGTCGTAGACTTGTCGGTGTGGCTATGGCGGCGTCGTCAGTGGTGGTGGCGGCGGCGAAACGGCGAGACGGCGGCGCGAAACGGCGGGACGGCGCCGCGAGATGGTGGCGGTACGAGACGGCGGTTGCATTTAAGCATTGGCTTCCAATTGATGATTTGACAGAACCAGTGTTGGAGTCGGTATACAACTGTGTCGTCGCAAGCACTCTGCTGGGGAGTATCTTTGTTATGATTCCACTCACAAGTGAGGAGCATCAAATGTTGCAAGATGTCCAAGAAAGACTTTCGGTTCACCCATTGACTGCTCCACTCTTAGGAAATGATCATGCAGAGTTTCGTCGCCGTGGTATCCCATCGGGAGTACCGCCCATTCTGGATGGCGACATGCTTGTGCAGTTCCTGGAGCTCACCAGCGAACAACAGCACGATGTTCTCAATATTGTTTCTCCTGGAAAGAAGAGGCAACACGATATCTCGGTTTTCCAGGTCATGCGAGCATTAGAGAGGGTGCATTACGCACTCAACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MESPTAVGGGGGGEAGAASSSSSSSGPSTSSAAAAATASASASSSAVATRYLAKRVLRGSAVLHVAQGCFRSPDCVDVVLCKENSLELVVIGEDGVLQSICEQTTFGIIKDVGVLNWRCTHFGLMPKIEGKEILVILSDSGKLSLLYFCSEMHRFFAIANIELSKPGNLRHRLGRILAIDRESRFVAVSAYEDEFAFVRVSVDHKLHAPNGEIEEDAKIISTAYNTSSIHGTVWSMCFISTCLDEEYYPVVAMIVNRGSDVNDLALYGLDSHKRTIDRISTYLEAGPLALEISEIPQLYGFALMFRAGDVLLMDLRNPKDISCIHRISLSTSLIGDHVSVEDSCRGLDVDDDVAACALLELRDSGNNMMRDDSYMDIDGTDNKAVVKSRIVCSWNWEPNAMQGHPRLIFCLDDGEFHLLEFSLDMEGVKVLPECVHRGLPCKPLLWMDKGMVVGFVEMGDGMILQLENNRLVHKSAIQNVAPILDLAIADHHGEKQDQMFACCGMCPEGSLRVIRNGVNVEKLLRTDPIYHGVTGLWTLRMKRTDAYHSFLVLSFVEETRILSVGLSFNDICDAVGFQTDVCTLACGLVADGLLVQIHSKCVKLCLPTACAHPEGTLLPSPVCADWYPDVTISVGAVGHNVVVVATSNPCCLYILGVRSLSSFQYELYEIQHVQLHYEVSCISIPQEDWRLDNSSSSCATSGDFRKDFAANIRKFAVIGTHEPSVHIISLEPGEAFQQLAVGHISVNNALGTPISGCIPENVRFVAAARFYILAGLRNGMLLRFESQTSKGHCFPGSFYKESSTPCDDTSLMLIAVRRIGITPVVLVPLHDRANADIIVLGDRPWLLHSARHSLAYSSISFLPASHVTPVSSTDCPNGLLFVSENCLHLVEMVHGKRLNAQKFSIGGTPRKVLYHSDSRTLLVLRTGLTSVSCSSDIVQIDPSNGALLSRFKCEPGETAKCMQIAKIGNDQVLIVGTSKSNGRPMMPNGEAESIKGRLILLSLETIESPRESGSFTAASNLNSSHAGSPFPEFVGYAAEELSSNSMCSSPDEVCCNQIQPELMAGHLRSLVQHTFNGAVLAVHPYLDRYVLAAAGNVLFVFGFLNESPHRIKKYTTSRTRFTITCLKTYASRIAVGDCRDGVLFYSYHENLRKLELIYSDPAQRLVGDVALLSCETAVVSDRRGSISVLSCPRLEVSESPEKNLAVHCSGYMGETAMSIQKRWRLRNNTCWLLPLGCWLLRGEASSAVRKSRQWGRRLVGVAMAASSVVVAAAKRRDGGAKRRDGAARWWRYETAVAFKHWLPIDDLTEPVLESVYNCVVASTLLGSIFVMIPLTSEEHQMLQDVQERLSVHPLTAPLLGNDHAEFRRRGIPSGVPPILDGDMLVQFLELTSEQQHDVLNIVSPGKKRQHDISVFQVMRALERVHYALN</aaseq>

Gene Sequence

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