Difference between revisions of "BGIOSGA024899"

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Revision as of 16:54, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA024899

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024899, complete gene.

LocusTag

OS07G0123700

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024899-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024899-PA

Length

9324

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:1313822..1323145

Sequence Coding Region

1323098..1323145,1321824..1322158),complement(1321269..1321372,1320753..1320821),complement(1320343..1320403
,1319941..1320080),complement(1319250..1319439,1318918..1318979),complement(1318441..1318529
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,1313822..1313950

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:1313822..1323145 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:1313822..1323145 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGCAGTACCACCTCAGCGCGCAGCTACGCGGCCACGAGGATGACGTTCGTGGCATTTGTATCTGTGGGGATGCTGGGATTGCAACATCCTCAAGAGACCGGACAGTGAGATTCTGGACACAGCACCCAGAAAAGAAGCATGAATACGTTCTCTCGAAGACTCTTGTTGGACATTCCAGTTTTGTGGGACCATTGGCTTGGATCCCTCCTTCAGACCGCTTTCCTGAAGGAGGACTTGTTTCTGGTGGAATGGATACTCTTGTTTTGCTCTGGGATTTGCATAAAGGAGAGGTTGTTGAGACTATGAAGGGTCACACTTCACAAGTTACTGGACTTGCTGTAGACAACAATGGCGACATCATCTCTTCATCCATGGATTGCACTGTAAGACGGTGGAGAAATGGCAGTGTAGTAGAGGTTTGGGAAGCTCACAAGGTTGCCGTGCAAACTGTTCTGATGCTGCCATCTGGAGAACTATTTACTGGCTCAAGTGATTCCACAATTAAGTTTTGGAAAGGAAGGACATGTCTACATACATTCACAGGACATGCAGATACTGTTCGATGTTTAGCACAAATGCCAGGGCTCGGGATCCTCTCTGCCTCACATGATGGCACTATTAAGGTGTGGGCATTAACTGGCCAGCCCCTGTTGGAGATGATTGGACACACTTCTCTTGTGTATTCTGTGGACGCACATTCATCTGGGGTAATTGTTAGTGGCAGTGAAGATCGATCTGCCAAGATATGGAAAGATGGGATCTGTGTTCAAAGCATTGAACACCCAGGTTGCATATGGGGTGCTAAATTCTTGGAAAACGGAGATATTGTAACTGCATGCTCTGATGGAATCGTGAGGATATGGACAACTGACAATAATAGGTTTTGCAGTGATGAGGAGCTTGCAGCTTTTACAGATCTTATTTCTCAGTACATACTTAGTAGAAAGACTGTCGGTGGATTGAAGTTGTCGGATCTACCAGGAATTGAGGCACTGCAAGTTCCAGGAAACTCTGATGGTCAGACACTGATTGTTAGAGAAGGGGACAATGGTGTTGCTTATTCTTGGAATTCAAAAGAGCTAAAATGGGACAAAATTGGTGAAGTAGTGGATGGACCTGGGGATGCTGCAGCTGCACCAGGCCAGTTTCATGATGGTGTTCGTTATGATTTTGTTTTTAATGTTGACATTGGAGATGGAGAGCCTATGCGAAAGCTACCCTATAATCGATCAGATGATCCGTATGCAGTTGCGGACAAATGGCTCCTGAAGGAGAATCTCCCTTTGACATATCGCCAACAAGTGGTAGAATTTATACTACAGAATTCTGGCCAGAATAATTTTGTTCCAGATCCATCTTTTCGGGACCCCTACACTGGAGCTAATGCATATGTACCTGGGCAATCAGCGTCTTCAACTGTTAGTGCTCCTAAACCAACTTTCAAGCACATACCAAAGAATGGAATGCTGACATTTGAGACGGCTCAGTTTGAGGGAATTCTTAAGAAACTCTCTGAATTCAATGCAACACTTTCATCTAATTTGGAACAGAAGGAACTATCTTTGTCTGAGATCGAGTTGTCCAGATTAGCTGCCATAGCAAAAGTATTGAAAGAAACATCATTTTATCATACAAGTAAGCTTGCAGATGCTGACATGACCTTGCTGCTGAAAATGTTGAAGTCTTGGCCTACACAAATGATGTTTCCAGTTATTGATTTTCTGAGGATGTTTGTGTTGCATCCTGATGGAGCCACTCTACTTCTCAAGGCTATTGAAAGTGGAAATGATGTACTTGCCGAGACTTTCCATAAGGTTGTAACGCCACCTGTGCAGCCACCAAATGTGCTTACAACCCTTAAAGCAGTTACTAACTTATTTGACAAGCCATGCTTGCACCAATGGTTGAGAATCCATGGCATGGAGATTATTGATTCAGTATCAAGCTGTAAGACAACTTTTAGCAAGAATGCTCACCTGGCATATTCCACACTTCTACTCAATTATGCTGTTCTTTCAATCGAATCAAAGGATGAACAAAGTCAGGCACAGATACTTTCTGCTGCCCTTGAAATCGCTGAAGACGACACCCAAGTTGCTGATTCGAAATACCGGGCCCTTGTTGCAATCGGCTCTCTCATGTTGAATGGCCTTGTGAAGTCCATTGCTCTTGATCTTGATGTTAAGAGTGTTGCGAACACCGCAAGAGCTTCAAAGGACTCGAAGATCGCTGAAGTTGGAGCCGACATCGAGCTTCTGACAAGATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAQYHLSAQLRGHEDDVRGICICGDAGIATSSRDRTVRFWTQHPEKKHEYVLSKTLVGHSSFVGPLAWIPPSDRFPEGGLVSGGMDTLVLLWDLHKGEVVETMKGHTSQVTGLAVDNNGDIISSSMDCTVRRWRNGSVVEVWEAHKVAVQTVLMLPSGELFTGSSDSTIKFWKGRTCLHTFTGHADTVRCLAQMPGLGILSASHDGTIKVWALTGQPLLEMIGHTSLVYSVDAHSSGVIVSGSEDRSAKIWKDGICVQSIEHPGCIWGAKFLENGDIVTACSDGIVRIWTTDNNRFCSDEELAAFTDLISQYILSRKTVGGLKLSDLPGIEALQVPGNSDGQTLIVREGDNGVAYSWNSKELKWDKIGEVVDGPGDAAAAPGQFHDGVRYDFVFNVDIGDGEPMRKLPYNRSDDPYAVADKWLLKENLPLTYRQQVVEFILQNSGQNNFVPDPSFRDPYTGANAYVPGQSASSTVSAPKPTFKHIPKNGMLTFETAQFEGILKKLSEFNATLSSNLEQKELSLSEIELSRLAAIAKVLKETSFYHTSKLADADMTLLLKMLKSWPTQMMFPVIDFLRMFVLHPDGATLLLKAIESGNDVLAETFHKVVTPPVQPPNVLTTLKAVTNLFDKPCLHQWLRIHGMEIIDSVSSCKTTFSKNAHLAYSTLLLNYAVLSIESKDEQSQAQILSAALEIAEDDTQVADSKYRALVAIGSLMLNGLVKSIALDLDVKSVANTARASKDSKIAEVGADIELLTR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..48#988..1322#1774..1877#2325..2393#2743..2803#3066..3205#3707..3896#4167..4228#4617..4705#5023..5101#5176..5235#5435..5581#5670..5708#5858..5895#6178..6264#6618..6783#7499..7576#7783..7919#8181..8257#8546..8615#8711..8776#9196..9324#ATGGCGCAGTACCACCTCAGCGCGCAGCTACGCGGCCACGAGGATGACGTAAGCGTCCCCTCCTCCCTCCCTCCCGCACCTCTCGGCGTCGCTTCTCGCCTCGTCTCCGCTTTGCTTCTCCCGCAAGTCTGCGCGATTCCGCCGTCGTTCCCCGATCCGAGCGCTCGCCGGTGGGGGGCTCGGGTCCGCTCGCGGACGCCGCGGGCTGCGGTATCGATCTGCTATAGTAGGGCGATGGCGCGTTTTGTTGCGGGGACGGCGGTGCTGCTTGCGGCTCCGAATTGGGGGTAGCTCGACCTAGCTTGGTTGCGCTCGCTGTTCTAGCTCTCGCGCTCTCCTCCTGTTTGTTCGGTGCCTTACTTGGGTTCGTAGATTTCAAACGCTCGTGCATTGCTAGTTTAGTTTAGTTCGGTCGGCAAGCTTGCTTAGTGTCAGAGCCAACTGCTGTTTTGATTGCTAGTTCGGTCGGCAAGTTCTACCCAATCTATCGCATGTGAATTCACTGTGTTACTGTGGATTTTGGGGGTTTAGTGGAGGGTTATCGTGGATGTCCTCGCCAGTGATTATTGTACTTTGGGTAATTAGTAGATTGGTGAACTCGTGAGTGATCAGTTGCTTGGTCTCAAATTTGATGTGATTCTCTTCATTTCGTATCACAGTAGAACTTCCTGTTCCCTGCTCCACCCGATCTCAGTAATTCAGTCCCATCCAGAATGTTCCTTGTCAATTTGACAACATTTTCGTCCTTTTTTTTTTCATTACAAAGCATGTTTTGTTATGCATGTCTGTGCCTGTAGAATGCGTATCTTATATGACATGAGCTAATTGCAGCTTTTCTTTGTGCGATCCTCAGGTTTTTCAATTTCAGCGCAATATAGTTCAATTATGCTTATTGTGCCCTTCCACATTAACAACACATTCTTCTAATTTTACATTTGCAAGCACACTTGTTTCATGGTCTGCTTATTGCGATTTACTCCTCAACAGGTTCGTGGCATTTGTATCTGTGGGGATGCTGGGATTGCAACATCCTCAAGAGACCGGACAGTGAGATTCTGGACACAGCACCCAGAAAAGAAGCATGAATACGTTCTCTCGAAGACTCTTGTTGGACATTCCAGTTTTGTGGGACCATTGGCTTGGATCCCTCCTTCAGACCGCTTTCCTGAAGGAGGACTTGTTTCTGGTGGAATGGATACTCTTGTTTTGCTCTGGGATTTGCATAAAGGAGAGGTTGTTGAGACTATGAAGGGTCACACTTCACAAGTTACTGGACTTGCTGTAGACAACAATGGCGACATCATCTCTTCATCCATGGATTGGTAGGTTTTCTCTGAGAAATCAATATAATTCTATGCTGCTTTCTTATATGGCTTGGTTCTGTTTCTGCTTGCTAATTACTATCCTATGCTAATTTCATTAAAAAAATGTATGTTGTCAATGGCATAATGTAACATGCTATGATAATTTGTATAGCTTTGGCACCTTCTTATTTATGGATCACTCATTTTCTTTCATTTTGTGCCAATTCATGTTTCTACTTCTGTTTCCTTTTCCTTTGAGGCTCTGTTGCAAATGTTACTACTAATAATTTGTGTCAAAAGCTGCCTCTAAGTATTTGGTATTTTAGGCACACGCATCTGCTATTTACTCTTTCTTAAATTGTTTGTTCTAATGACAGGATGGCCTAATACTAATAAACAATTAAGGGTCCTTATTAGAGTGGTTTATTGTTGTCCTATCTGATATATGTATTGCCAATTGTCCATACAGCACTGTAAGACGGTGGAGAAATGGCAGTGTAGTAGAGGTTTGGGAAGCTCACAAGGTTGCCGTGCAAACTGTTCTGATGCTGCCATCTGGAGAACTATTTACTGGTAGAGCATCTGTTATGCCTTCACATTTATTTCGTTTTTACTTGGTACTTGTTTATTTTCTGTATTTGTGCACTGGCACCTTGTTCATAACTGATCCAATGTGATTGGTTTGAGCTTCCTATCAAACTTTTGGAATCTGATGGTTTACTGGAAATATCCCGAAAGCAATGGTTCATCTGGAATTGTTTTGGCTTTTTGAAAGTACTTATAATAGTAATTCTTATTGGATGTACTAAGTAGCTATGTGTCTAGCAACCGCTACCTTAGAGGCGAAGGAAAATGGGTTTACTAGTATAGGTAAACGTCTCAATTTCCACAATACAGTGCAGGGGGTACAAAATGCATACTGAACCTCAATTTATTATAGTGTTTCCTGGGACTTGTTCTGAACAAATGTGACCAAAAATTCGTCAAATGATCTATTGATGCTTTTCCTCCTTCATACAGGCTCAAGTGATTCCACAATTAAGTTTTGGAAAGGAAGGACATGTCTACATACATTCACAGGACATGCAGGTTATTTGCCTGTTCCTAATGCATAATACTCTGTTTATTGTTTATACTTTCTTGGACATTGACACAAATGTATATGTGTGCAAGGGTGCTTCTACTGTAATAGTGTGGTTCACCAGATAGCTGAGAGTTGTCAATTTTACTCTGGTCAATTTTTTTTCTCACTTTAGAATTGATTCTGGTTGCACTGGAGCAAAATGTTATGCATTTGTTTTATGCAAAGAGAAAAATATCATTTATGAATTGATTGTCAGTGCCCTTCTCAATATATAAGCATAAGTTTGTTTTTGTGTTTTGTTGCTAGCTCACCCATGTTTATTTGACCTCATTTTGTGTAACATTGTTACGGCAGATACTGTTCGATGTTTAGCACAAATGCCAGGGCTCGGGATCCTCTCTGCCTCACATGATGGGTGAGTAACCAGCTTCACTTACAAATAGAGAGATAAAAACTGTCGGTTTGTCTCGAACTAGAAAAGCAGCACATTTACATTATTGTTTGATCATTGTTATTGCTGTTGCTTCTTCTAAGGCCTACTTCTCATGCAGGGGCCCTTTGGTTTACTAAAAAAATTTAGCCACCCCTTAATCCTTTTTTTTAAAATTTTATCACACACATGTGCATCACTGTATTTTATCACGCACGCTCGCAAATGATATTTTGTTTGGTCACAGCACTATTAAGGTGTGGGCATTAACTGGCCAGCCCCTGTTGGAGATGATTGGACACACTTCTCTTGTGTATTCTGTGGACGCACATTCATCTGGGGTAATTGTTAGTGGCAGTGAAGATCGATCTGCCAAGATATGGAAAGGTGATTTGTTCTGCGTTCTTCTTAGACTGAGTTCATGTTAAAATTCAGTAGTATTTTTTCATTGGATTGATTATACTTGCATAGTCAACTCATGAGTCCTACCATGAACATTTGTTCCAAACAATTTCTGAACTGATTTTTCCATTGTGAAGTGCAATCCGTTTTACAAACTCCTTTGTCTAAAGAAATGTAACTTTGTAGTTAAAATCATTATGTAAGATTCAGCTTCCTCTGCTCCAGATCTGATCTTAACTAGTTTTGTATATGACACCTTGGTATGGTAGTTGGTAGTACATGTTTGTATTCACATTTCTTGCTTTTGTAACAAAGGAAACGATCTTTGAGGTGAAACCCAGTGAAGTGTATGTTTTGCTAAGCAGGGATCATGCATGCTTTTTCAAAAAAAAGGGTGTTTTGTATGGTTGTTATAAGTATGTAGCAGAATGCACATTAAGCACCTCATGTACTTGATCAAATGACTTTGCTAGTTGTATAATGCAGATGGGATCTGTGTTCAAAGCATTGAACACCCAGGTTGCATATGGGGTGCTAAATTCTTGGAAAACGGAGATATTGTAACTGCATGCTCTGATGGAATCGTGAGGATATGGACAACTGACAATAATAGGTTTTGCAGTGATGAGGAGCTTGCAGCTTTTACAGATCTTATTTCTCAGTACATACTTAGTAGGTTGGTTCGCTTTGCTTCTTGAATTATTCTATTTATGTTCTATGCGAAGTATTGACATCTTCTCAACGTGCCCCCCCCTCTTTTGGGTATCAACGTGACCTAATTGTAACCTTATCGGTATGCATAAAGGATGCATAAAGTAGTCTATTTACAGTTTAGACATGATTCTTTTAATCTTTTTATTTGAATAATAGAACCTGATGTTTATTCATGCAATATCAAGTTTTAATTTGACCGATAGTTTTTGTGCCTTTTATTTTGCTTGTATAGAAAGACTGTCGGTGGATTGAAGTTGTCGGATCTACCAGGAATTGAGGCACTGCAAGTTCCAGGTCACATACCTCATTTCTTATCAATTTTTTTAGATTATTGTTGATATTCCTACGTTGCTTAAATATACATAGAAAATTCTTAAGCTGTTTGCCTTTTTTTTTTAAAAAAAATAAATCAAAACAGCATGCTACTAGAGTTAAGAAGCATAAGAATTAGACTTGATCTCTAAATGAAGTTTTGTACTTGAAAGTACTTTGTGGGTTTATGCTAAATTAGACTTTTGGAAATGTCTAGAGTATTTTGATAAAATATTGCAGTTGTGAAACTCAATTGTCTACCGATTCTTTAGTAACTTTGTGATGTTCAAGTTGAAGGAATGAAAAGTTCATCTTTCTTTATCTTTGCATAATAGTATCATCATTTTTGAACTTGTTTGCTTGTAAGCAGGAAACTCTGATGGTCAGACACTGATTGTTAGAGAAGGGGACAATGGTGTTGCTTATTCTTGGAATTCAAAAGAGCTAAAATGGGACAAAGTAAGCACTTTTGTGCTTTTAGTATCTCCATTGTGTCCCCCCTAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024899