Difference between revisions of "BGIOSGA025570"
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Revision as of 16:57, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025570 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized proteincDNA, clone: |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025570, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1123_B01.122 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025570-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025570-PA |
| Length |
12454 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:12461244..12473697 |
| Sequence Coding Region |
12461244..12461292,12462388..12462554,12464190..12464432,12467015..12467126,12467222..12467392 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:12461244..12473697 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:12461244..12473697 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGAGGGGCCAGCGGCGGCGGCGAGGGATTCGTCGGCGCCTCTTCCGTTTCAAACAATATTAGCCTACCAAATGAGGGTACTAGCCCTAGAGGAACAGATAATGCTGAATGTTCTGAGACATCTTCAGACAGGTCGAATTCGGAAAGCATAAAACCTGAAGAATGTGCAATGCCATCTTCAATATTTGATAAGAAGATTTCCATAAAAAAGAAGCTCAGATTGTTAAGTCGAATGGCTATACTGAAAGATGATGGAACTGTAGAAGTTGATATCCCCACTAATGCTGAGGCTGCATCTCTTGACCTTTCTTCAAATGATTACTGTAATGAAGCCTTTAGTGGGGAACCATTGGCATCTTCAGATTTCCAGCACAGACCTCCTATGCAAATTGTTATGCTCATTGTTGGTACTAGAGGAGATGTGCAGCCTTTTATAGCTATAGGAAAACGATTGCAGATCTATGGCCATCGTGTTAGACTGGCAACTCATGCCAACTTCAAGGATTTTGTTGTGACGGCTGGCCTGGAGTTTTATCCCCTAGGCGGAGACCCAAAACTTCTTGCAGGATACATGGTGAAGAATAAAGGGTTCTTGCCTGCAACTCCATCAGAAATCCCTATCCAGCGGAAGGAGATTAAAGAGATTATATTCTCCTTGCTTCCTGCTTGCAAAGATCCCGATACTGATACTGGTGCTCCTTTCAATGTAAATGCTATAATAGCTAATCCTGCAGCGTACGGGCATGTGCATGTGGCTGAGGCTCTGAAGGTACCAATCCACATAATTTTCACAATGCCATGGACGCCTACTTGTGAATTCCCTCATCCCTTCTCCCGTGTAAAACAACCTGCAGGATATAGACTATCATACCAGATTGTTGACTCCTTTGTTTGGCTTGGTATTCGGGATATTATAAATGATCTTCGGAAAAGGAAGTTGAAGTTAAGACCAGTTACGTACCTAAGTAGCGCACATGCTTATTCAAATGATATTCCTCATGCATATATCTGGAGTCCTTACCTTGTACCCAAACCAAAGGACTGGGGACCCAAAATTGACGTTGTTGGGTTTTGCTTCCTCGATCTTGCTTCAAATTATAAACCTCCTGAACCCCTTCTCAAATGGCTTGAGAGTGGTGAAAAGCCTATTTACATAGGTTTTGGCAGCCTTCCAATTCCAGAACCAGATAAGTTGACAAGAATCATAGTGGAAGCACTTGAAATTACTGGACAGAGAGGTATCATTAACAAGGGTTGGGGTGGCCTTGGAAATTTAGAGGAACCTAAGGAATTTGTATATGTAATAGATAACATTCCACATGACTGGCTTTTTTTGCAGTGCAAGGCTGTGGTACACCATGGTGGTGCTGGGACAACAGCTGCCAGTCTTAAGGCTGCGTGCCCCACTACCATCGTACCATTCTTTGGAGATCAATTCTTTTGGGGCAACATGGTGCATGCTAGAGGATTGGGAGCCCCACCTGTCCCTGTGGAGCAATTACAATTGCATCTACTGGTTGATGCAATTAAATTTATGATGGATCCAAAGGTGAAGGAGAGAGCTGTTGAGCTAGCAAAAGCAATTGAATCGGAAGATGGCGTTGACGGGGCAGTGAAAGCATTTTTGAAACATCTCCCACAGCCCAGGAGCCTTGAGAAGCCGCAGCCTGCACCGCCATCGTCAACCTTCATGCAGCCCTTTCTCCTCCCCGTAAAGAGATGTTTTGGCATCGCCACATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRGASGGGEGFVGASSVSNNISLPNEGTSPRGTDNAECSETSSDRSNSESIKPEECAMPSSIFDKKISIKKKLRLLSRMAILKDDGTVEVDIPTNAEAASLDLSSNDYCNEAFSGEPLASSDFQHRPPMQIVMLIVGTRGDVQPFIAIGKRLQIYGHRVRLATHANFKDFVVTAGLEFYPLGGDPKLLAGYMVKNKGFLPATPSEIPIQRKEIKEIIFSLLPACKDPDTDTGAPFNVNAIIANPAAYGHVHVAEALKVPIHIIFTMPWTPTCEFPHPFSRVKQPAGYRLSYQIVDSFVWLGIRDIINDLRKRKLKLRPVTYLSSAHAYSNDIPHAYIWSPYLVPKPKDWGPKIDVVGFCFLDLASNYKPPEPLLKWLESGEKPIYIGFGSLPIPEPDKLTRIIVEALEITGQRGIINKGWGGLGNLEEPKEFVYVIDNIPHDWLFLQCKAVVHHGGAGTTAASLKAACPTTIVPFFGDQFFWGNMVHARGLGAPPVPVEQLQLHLLVDAIKFMMDPKVKERAVELAKAIESEDGVDGAVKAFLKHLPQPRSLEKPQPAPPSSTFMQPFLLPVKRCFGIAT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..49#1145..1311#2947..3189#5772..5883#5979..6149#6699..6762#6840..6897#7566..7743#8174..8304#10061..10163#10266..10342#10964..11011#11111..11260#12263..12454#ATGAGAGGGGCCAGCGGCGGCGGCGAGGGATTCGTCGGCGCCTCTTCCGGTGATTCCCCTCTCCCCTTCCCCTTGTTTATCGCTTCTCCGTGCCGTTGCCCAGGTGCGAAGGCTTCTGGGAACTTTTACTGCTGTGTTCGTGCTGCTTCGTTTGTTTCGGACAGTTTCATAGTCTCATTCTCTGCTGTTTCGTCCTGCGCCGTGTCGGTGCGCTTGCGCTGCGGTATGGTCCCTGCGGCCTGGTTAGGGTTTGGTGTCGAGGTGGTCGGGGGAGTCTTAGGGAGGGCGGCATTGTTGTATGGAAAGCTGGGGGTTCGGCGATGAATCCGGAGCGCCCGTTAGGGTTTATGAGAGCTTGGTGCTTCTTTTTCGCGAATTTTTGTTCTACTGTATTAATAATTCTGTCAGTAAGAGAAACTTAGCAACCTTTGTTTTGCTTTCTTGTGTTTGGGTGTAATTCCATTTTTTGGGAGGAAAGAGACAGGGAGAACTGGGCATATTTGGGGAAGTATGGTGTTTCCTGCCGGTCCCCACTCTTTTGACTGAATAGTTGTGGACTTTGACATTCAGTTCTCAGGCTTGAAAGCTCGTCCATTTTATTGATTTTCTCTTCTTATATTTTCTAGTGCTACAAAATGTGGCACCTGTAACCTGTTAGTTGTGATAATGGAATGAACTAGGGAGGTTCCTGCTAGTATTTGTCGCCACCGAGTGTTTGTTCTCTTCAAATTAGTTCCTTGTACACAAAATGTCCTTTTGATTATCATATGTGATTCCTTGTACATTTGATTGCACTACATGTTTTGCGACATGATTTTCATCCTATCTTGAGTAATACACAAAAATGTTGGCCAGCAAGATTATTATAATGTGACTATTAGAACTTAGAAGCTTGATAAGAAAAATGGAGATCAATTGTAAAGCTATAAAGGACATGCTGGGTTCCACTGATGTTCTGGACTTCTGGTGTTATCAAAAAGTGCTCCCTGTGACCTTTGAAGCTGCATTATTTAGTCAAGTATTTCTTGGATGGTGGAATTTTAATTCATTATGTAACTTTTTTGATAATGGAGACAATCCTAGTCCCTACATTGAGATGCATACGGCTTATTGCTTTACGTAACTGTGCAATACTTTGTTGTAGTTTCAAACAATATTAGCCTACCAAATGAGGGTACTAGCCCTAGAGGAACAGATAATGCTGAATGTTCTGAGACATCTTCAGACAGGTCGAATTCGGAAAGCATAAAACCTGAAGAATGTGCAATGCCATCTTCAATATTTGATAAGAAGATTTCCATAAAAAAGAAGGTAAGTTTATCTTCACCTGTGTTAGATAATTCTATTGGGGTCTCTTTGCTGGTGCTTGCATGATGACAACATGCAATTTATGTGGCGCTTGGCACAAATATCGCATTTTTTCTGTTCGCTGTACAGATGACATAATGAATTATTAATTCTCATAATTATTGCTATTAAGTCAACTGTACACCGCCATGGAGTCATGGATATGCAATGTGATATTCATTTTACTGAAAAACTGGATCACCATGGATAAGAATAGTGCAATGTTTCTTATTCTGTGAACGATGTTAATCAATACTGCAGTACAGTATTTTGGACTGATATGCCAGTATAAAAAAAGCTACAAAATATACTCCCTCCGTTTCAGGTTATAAAATGTTTTGACTTTGGTTAAAGTCCAACTGCTTTAACTTTGACCAAATTTATAGAGAAAAGTAGTAACATTTTCAACCCAAGACATATTTATTATGAAAATATATCCAATTATTGATTTGATGAATCTAATTTAGTATTATAAATATTACTATATTTGTCTATAAACTGTTCACATCAACTGGAAGACAAGGCCTTGCGAGCTTCTGTTTGTAATTTCTATCTGTAATATTGACATGTTTCCCAAATTAGCCATGTACACCTAATATTCATTCTTTTCTGAAACGTGATGATGACATGGAATGCTTAGAGTTATGATAACATTAACTCTGTTGATTTTTAAGGCATAATTTTATTTTAAAAAGTCTTCTAGATCAAATTTCGACCGTTGGTTTGTCTAAAGTATTTCTTTAATAGCTATAAAACCAATTTTGTGTGAAAGCATTTTCGAATACAAATCTATATGTATAACATTCATACAATAAAATATCTCTTCTTAATGAAATAGAAAGCACAGTTCTCCTTCGTTTTCGAGAAAAAAAATACTTCTAAGGTGATACTTTTCGATCTTGTAAAATTCAACAGAGGGAGTACATAGTTCTCCTGCGTTTTCGAGAAAAAAAAACTTCTTTGGTGACACTTTTCGATCTTGTAAAATTCAACAGAGGGAGTACATTACGACATCATGCCCTCTTGTCACCAATGTTCTAAAAATTGGCATTAGTCGGGGCTAGGCAGCGATTCGGTACTAGAGACGTGCAGTGATTCGGTACAAGTCTGGACTTTTGTGGTTTATTTATGGAAGCATGGCTATAATGGTTTAGTTATGCGAAATCAGGAAACATTTCTAAGTTAGGTAGGCTAGTTAACCTTGGTATGCATTTTTGTTGGGCCAATTATCTATTATGAGTTTGCTCCATCTTGATTATGCAAGACTTGGAGCCTTCGTGTGACCATACTAGTCAGAAACAACATCTGAAGTTCATGCTAGATGCCATAGATCTTCCCTGCTTTTATTTGGAACAATAAAATGACACAAAACATTTTACCAGTACAAACTAATAGCTAAAATTTATGCCAAGCAATGTAACTTTTGAATGTTTAAACTTTCTAATTATAATTACAGAGATTTAGTGTTTTTAGTATTAGTTATCTCAACTGTTTGGTTAACATTCATAGTGTCAAACTCCTTGTTTAACATTCACTCCTTTATGCACTTTAACAAATGGCATATTTTCTGTTCTTCTGATCCTTATGTCTTCACTGCAGCTCAGATTGTTAAGTCGAATGGCTATACTGAAAGATGATGGAACTGTAGAAGTTGATATCCCCACTAATGCTGAGGCTGCATCTCTTGACCTTTCTTCAAATGATTACTGTAATGAAGCCTTTAGTGGGGAACCATTGGCATCTTCAGATTTCCAGCACAGACCTCCTATGCAAATTGTTATGCTCATTGTTGGTACTAGAGGAGATGTGCAGCCTTTTATAGCTATAGGAAAACGATTGCAGGTTGGCATGCTATTCAATCCTTTTTGATAATCTGTGGCTACTGCTTCTATTGACTGTTGCTTTTGCAGTGGTACCGTCAATACTTGGTTTTGATTCTAGTCCTTACACAGTAGTGTGTTGAACTGTCAGTAGATTTCCTGCTTTCCCAGATTAGATGAAATGTTTGATACATGGAAGTAGATACCATGGCAGCTCAGAGTTTAAAATTTTCGTTGACCTGCTTGGTGCATGAAACTGTGTGGCTAAGTTATGCAAACATGCAAGGTAGTTATTAAGTTCTTGTATTGTTTATTTTTACTAACAATTTCTGCTTCATGTGAAGTATAATTAATAAATTCTATTTTAAAAGCTCTATTTGGTGCATTTTCCTCTATATTAGCACAAACATGTTGTCATGGTTTATGATTTAACGTCAAAAACGCATAATAAGTGAGCTATCACAAATTGATGATTTTCATAATGCATTTTATTAATTGTTTATCGGAGTTAAGATTTTACTCCTGTGGCTAGGTCCTCTTAAGAATCTTGTAGAATATTCTTATTGAGCTGCCATAATTCTTAGGAATAAGTCTGAACTTGACTCGAGTTCCAAAGACATCATTAACCCTCAAACATCAATTGCACCCCTGAACTTTCTCATGCCAGACTCCTAACTCCTGCTGAAACCATCTAATTTTCTTCCAACATGGCCATCTTCTCAGCAATGCTATACGTGCAGGTGTAAGAAGTGGGTCATTTTCTCAGTTCATCTGTAGAAGTTATATTGTTTTGTTTCTATCAATGTTATTTGAAACTGGTTTCTTTTTTCAAGAAATCCAGAATTCTTGATTCATTCAACCAAAGCTAACAAAAACATTCTTTCCTTTTCCAGTTTAGCAACCTCGACATTAATTTATCAAATGCAGTCTCCTCTCACAACTTGTTTCGTATGAGCTTCAGCTATCTTGACTCTATGTGCTATCAAGCGAGCTCGTTCTTTGTTCCCCATCCTCAAATTTCTGAGTCATGTTAGTCAAGAAAAGTTGATTCAAGAAGGGGTGTTTCTCTTTACTTTATACCACATCCAAAGTGCAACCCCCAGCCTACAAGTTCAGTCAAAACTTCATATCCAGATATGCAAAAATCAACCATGAAATTAGTCCATCACTGCATCTTAACTCAAATACCAAATCAAAAGGAAAATTTCTGAACAACCCTGCTTACCCCTGACCTCATGCATGTTAGACATCTCCAGGGATTTAAATTGCTCCATGAGATCCATATTGATGTCTTACATGCTGCCTTTGCCCCATATGCAGCCGATGAAGGCCTGAGGTCCTTGACCTGCCAGAGCTTACGACTTGCTTTGCCTGATTGAATCTGTTGAAACCTCAACAGTTCGATGAATGGTGGCTAGGTTTTTTGGAGCAATGTACTTTCCCATCTAAGCTTCACAACTAGCCACCGCCCCCTCTCATGCCTGCACGTTTTATTCCCATGCCAATGTGAACTTTGCATCAAAGTGGATGAACAGGGTGGCCAGGTTGACAGAGTACCTGATTACGAGATGGTTTTAATGTTCAGTTTATCAGTTATTAATTTGGTATGACCATATGACAGAGTTCAGGGGGTGGATATATGGCCTGGGAGTTGAAGGTC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