Difference between revisions of "BGIOSGA025792"

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Revision as of 16:59, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA025792

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025792, complete gene.

LocusTag

OsI_26176

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA025792-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA025792-PA

Length

9868

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:17832125..17841992

Sequence Coding Region

17832125..17832443,17833347..17833588,17833669..17833767,17835455..17835538,17836319..17836405
,17837433..17837553,17839224..17839288,17839487..17839525,17839757..17840265
,17840351..17840849,17841006..17841688,17841890..17841992

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:17832125..17841992 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCGACCGCCAACCTCAGGTCGCGCGCCGCCGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCATGCCTCGCGGCCCTCGCGGTGGCGGCTCTCCTCCACCGCCGGCGCAGACGGGGTCGCGCTCGCGCGCCAGCCTCGCCCGGCCTCCTCGGGGGACGGCGAGGGCGCCGCCCGCGCCGAGCCTGCGAGGAGGAGGAGAAGCCGCAGGCCCGGTTCAGGCGCGTGGTCGCAGACAACTCCTACTCCGCCTTCAAGCACCTGCGCCGCCAGGGTGCTGGACCGGTTGGCTCCGGCCACCACGGCAGCGAGGCCCAGCCGACGTCTCAAGAGTCATCACAAAAGGTGCATCCATTTGAGGAGGAAATCACTTCCTTGCTGAACAACCCACCTGATTTTCAGAATTTTATGCCTGGTGATCGATGCCCAGAAATGAGCACTTCATACAATTGGGTCGAAACAGATGCTCAGTTGGAGGACCTGGCTAGGTTGTTGGATGATGAAAAAGCTTTTGCTGTTGATACAGAGCAACATAGCCTTCGGTCATTCTTGGGATACACTGCACTAATGCAGATCTCTACCCAGAAGGCAGATTATTTAATAGACACAATAGCGCTGCATGACGTGATGAGCATTCTACGACCAGTTTTTGCCAATCCTTCAATCTGTAAGATCTTCCATGGAGCTGACAATGATGTTCTTTGGCTTCAGAGAGACTTTCATATTTATGTTGTGAATATGTTTGATACTGCCAAGGCATGTGAGGTTCTATCAAAACCACAGAAGTCATTAGCATATTTGCTTGAATTATATTGTGGAGTGACCACAGACAAGACAATGCAGCGTGAGGATTGGAGATTACGCCCACTAACACCAGAAATGATTCAGTATGCCCGTTGTGATGCGCATTATCTGTTGTACATTGCAAATTGTTTGGCATCAGAGCTTCATGCAAAAACTTACGATGCTTCAGACTCTCCCAATGACAAAATCAATTTTTTCTTCGAGGCCAGCCATCGCTCAAATATGGATCTTGTTTGGAAAATTTGTGCATGGAGGGATTTAATGGCTCGCATGCATGATGAGAGCTTACGGTATGTCCTGTCAGACCAAGCTATAGCTTCCCTTGCTGTTAGTGTTCCAAGAGGTCCAACTGAGGTGTGTTCTGCCATATTAGAAACTGAAACAAGCAATTCAACTGTGTATCCTTCCTTGCCGCCACCTTCACCTATTGTTGTTGCTCACGCTGAAGAACTTCGCTATCTGATTGAGGACATCACTGTCAGCATGGATGCCATCTTTAAAAATTTGCTTGAGAAGTACAAAGATCCAAGTAGATTATGTCGACTATCAGTTTTTAATTATAACCTTGTATCACAGCTGAGTTTGAAGCAAAAAAATATGTTCTCCTTTGCATCAAGTGGGGAGAAGTTGTTGATGGCACCAACTAACAAAAAGGCTTCCCGGGAATTATTCATTAAAAAGTTTTCATGCAAGTCCCCAGTATATCACAATTGCAGGATCTACGCCAGTGATGGAAGACTGCTTTGCTACTGTGACCGTAAAAAGTTGGAATGGTATATTCAACGTAATTTAGCAAAATTAATAGAGGATAATCCTCCAGCAATTGCGCTCTTGTTTGAACCTAAGGGTCGCCCAGAGGATGAGGATAATGACTTCTATATTCAGAGCAAGAAAAATATTTGTGTCGGATGTGGAGAAAAGAGCCACTATATCAGATATAGAATTATACCATCGTGCTACAGGATGCATTTTCCAGAGCATCTGAAGAGCCATCGTTCACATGATATTGTACTTCTTTGCGTAGACTGCCATGAAATTGCTCATTCAGCAGCTGAGAAGTACAAGAGGCAAATAGCCAAAGAATTTGGGGTGCCGCTTTTTGTACAGAAGATATTAAACTCAGGTGATATAAGTTTAATAGCTGGTGCATCATTATCTGAAGATAAATCAAATGGAACAGGTGTGTCTCCTTTGCAGCTGAGGACTGCTGCAATGGCCCTTTTAAGACATGGATCCAATATGCCTTTGAAGAGATGTGAAGAGCTAATGCAGATTGTGAAGTCATACTATGGTGGTAGGGATGTGACTCCTGAAGATCTTGAGATGGCATTACTTGTTGGCATGAGTCCCAATGAGCGAAGGCGACATTCAAAGAAAAATGGTTTTTCTTACCGATCCCAGGCTCAAAATGTTATTAGAAAAAGCAACAGCAACGGCATTGTTGAGAATAATGAACATGATCCAGAAAATGGATATGCTGAGCAATTTTCTAAAAATGGAGTTGAGAATAACAGTCATCCAGACATTGATGAGAATAACAATCAGCTAGGTATTGATGAACATACCAGTCAGCCAGGCTCTGGGGGTAATAAGATACATGGTCCAACTCTGAGCAAAGAAAGCACAATCTATCCACCCCGTATGGCTAATCCCATTTCTGACTCTAGCATGGAGGCAGACACCGTGCAGCAAGCAAGCTTAGGTGGTAATCCTGCAAACGGTGATCTTGACAGGGATCCATGCGGCAGTAACAATTCTAACCAAGCCATTCCCCAAAACGGTGACAAGAAGATCTCCCTGTTAGGTCATGGGCATCACGGTAAACAGGTCGTGGAGCTTTTGCTTTCCAACGGTGGCGAGGAGGCCATTAACCAGTTCAGCCAACGGTGGAGGCAGGTCTTCGTAGCTTCTCTTCACCCTCGTTATTTGCCTTCGGGCTGGAATATAAAGCACAGTGGACGGCGGGATTTTGGCGATTTCAGTGTCTACAAGCCATCAAAGAAACCTCCTGCTGCAGATCAATCCGAGACTTTAGCTGCTGCTGCTGTTGTACCCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPTANLRSRAAAAAAAAACLAALAVAALLHRRRRRGRARAPASPGLLGGRRGRRPRRACEEEEKPQARFRRVVADNSYSAFKHLRRQGAGPVGSGHHGSEAQPTSQESSQKVHPFEEEITSLLNNPPDFQNFMPGDRCPEMSTSYNWVETDAQLEDLARLLDDEKAFAVDTEQHSLRSFLGYTALMQISTQKADYLIDTIALHDVMSILRPVFANPSICKIFHGADNDVLWLQRDFHIYVVNMFDTAKACEVLSKPQKSLAYLLELYCGVTTDKTMQREDWRLRPLTPEMIQYARCDAHYLLYIANCLASELHAKTYDASDSPNDKINFFFEASHRSNMDLVWKICAWRDLMARMHDESLRYVLSDQAIASLAVSVPRGPTEVCSAILETETSNSTVYPSLPPPSPIVVAHAEELRYLIEDITVSMDAIFKNLLEKYKDPSRLCRLSVFNYNLVSQLSLKQKNMFSFASSGEKLLMAPTNKKASRELFIKKFSCKSPVYHNCRIYASDGRLLCYCDRKKLEWYIQRNLAKLIEDNPPAIALLFEPKGRPEDEDNDFYIQSKKNICVGCGEKSHYIRYRIIPSCYRMHFPEHLKSHRSHDIVLLCVDCHEIAHSAAEKYKRQIAKEFGVPLFVQKILNSGDISLIAGASLSEDKSNGTGVSPLQLRTAAMALLRHGSNMPLKRCEELMQIVKSYYGGRDVTPEDLEMALLVGMSPNERRRHSKKNGFSYRSQAQNVIRKSNSNGIVENNEHDPENGYAEQFSKNGVENNSHPDIDENNNQLGIDEHTSQPGSGGNKIHGPTLSKESTIYPPRMANPISDSSMEADTVQQASLGGNPANGDLDRDPCGSNNSNQAIPQNGDKKISLLGHGHHGKQVVELLLSNGGEEAINQFSQRWRQVFVASLHPRYLPSGWNIKHSGRRDFGDFSVYKPSKKPPAADQSETLAAAAVVP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..319#1223..1464#1545..1643#3331..3414#4195..4281#5309..5429#7100..7164#7363..7401#7633..8141#8227..8725#8882..9564#9766..9868#ATGCCGACCGCCAACCTCAGGTCGCGCGCCGCCGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCATGCCTCGCGGCCCTCGCGGTGGCGGCTCTCCTCCACCGCCGGCGCAGACGGGGTCGCGCTCGCGCGCCAGCCTCGCCCGGCCTCCTCGGGGGACGGCGAGGGCGCCGCCCGCGCCGAGCCTGCGAGGAGGAGGAGAAGCCGCAGGCCCGGTTCAGGCGCGTGGTCGCAGACAACTCCTACTCCGCCTTCAAGCACCTGCGCCGCCAGGGTGCTGGACCGGTTGGCTCCGGCCACCACGGCAGCGAGGCCCAGCCGACGTCTCAAGGTGTGGTCACCCTGCTCCTGTTTCTTTTGATCTCGGCATTGCCTTGCCCTTGTAGATGTGTGGTTGTATTGGGAATTCTGCGAACGGTTGGTACGCTAAGGAGACTAAGGCAGGATTAGGGGGGACGTAATAGCGTGTTGGTTCTTCGGGGAATTTCGTCGAACATTTTGAGTGCAAGGTTGCTCCGAGCTTGAGGATTGACTATGGAGATCTGGACCTGTCTCTTTGCATACGGGGAACATAAGGAAACGATTGCTTAGTTGATTGCACAGCGTGTTAGTCCTTACTTGGCATAGGAAGGGGCCTTCATGATGCCAGTTCCCTTGTTGGAGCTTCGTCAGGTAGTTATCAACGTGCACTGAAAACACAACGTGGAGCTTCGTCAGGTAGTCCTTACATTGCATGCTTTGTCTATTTCTTTATCAATGCATTACTGTACATCATCACACCCTTACCCATAATATTTGGTACAGTTAGTGCATCTCTTGTTTAGGAATTAGGATTCCTAGTTAGACAAAAATTAAAAAGGTGGATCGATCAAAATTACTACTTCACGAGGACTTTTATTAACTTTACCAAAGATTCCTACTTCTCAAATATTATGAGTTAGTAAGTTTACTACAAGGCTGTACTGCACAGCCTTGGCTCACAATATTTGGTACAGTTACTGCATCTCATGTTTAGGGACTCCTAATTAGGCAAGTAAATTGAAAAGATTGATCGATTAAATTACTACAAGTGCATAAACCGTTATTGATAGTTAGTAAGAGGAGATGCTGAAAGCACAAGTGCCTGAGTTTAAGTTTGATTGCATGAGTTTTCACCTTAGTCTCTATGCGCATACTGCAAGCGAATTGACTGCACATTGAGTAGGTGACACATTTCCTTTTCTTATCGATACAGAGTCATCACAAAAGGTGCATCCATTTGAGGAGGAAATCACTTCCTTGCTGAACAACCCACCTGATTTTCAGAATTTTATGCCTGGTGATCGATGCCCAGAAATGAGCACTTCATACAATTGGGTCGAAACAGATGCTCAGTTGGAGGACCTGGCTAGGTTGTTGGATGATGAAAAAGCTTTTGCTGTTGATACAGAGCAACATAGCCTTCGGTCATTCTTGGGATACACTGCACTAATGCAGGTAACTGGTGGTGGATACCTTCTTATTGCTCTGTTGCTTATTGGCCTGTTAAGATTATGACATATAAATATCATTTTTAGATCTCTACCCAGAAGGCAGATTATTTAATAGACACAATAGCGCTGCATGACGTGATGAGCATTCTACGACCAGTTTTTGCCAATCCTTCAATCTGTAAGGTTGTGCATCTCTTATATCTGATATCACTGGAAACCATTAGTTTTCATTTTCAGTTCTGCTTAAAGTGATTTTGCCACTTACCATTTGTATTTTTGAATTGTGATGGATTTGCATGTTGTCCAACTTTGGAAGCTCTAGAATTATGGAATGTGCAGTACAGATGATGGTGTGAATTTATTTACATGTTATTCCAATAAAGTTTAAATTACACTTGTGATTACAGAGATAGGGTGTAGGAGAACATGGTGTAAACAAGTTGTTTCCACCAGCATCACATTTGTGTGCACCCTTGGTACTAAGATTACTATAAAAGATATCTAGAGAAGTTCAGAGATTGATTCTTTCTGGTTAAAGAGCTGAGCCATGGTCCATGGTCCATAAATAAAACAATGTAAAAATGCCTTTTAATGATTATATTTTCACCATAACACATGATTCACATTGTCTGATGTGCAGGAGGGATTAAGCCTAGAGCTTTCATAGTTCATCCCTCCTAAACGTGGTTTCTTTGACAGTCTAATTTCCTGTTTGTATCAAGCTTAAACCCACTAAACTCTAATTTATGATATCCATAAGATGGTGGATTGTTCTTTCTCAGCCATCATGAAAGATAATTATGTGTCTCTGCATTAGAGGTAGTAATATATTTTTTTTTTCCAAGAATCATGCTGCGTTGTTGATACTGCAGGGCCAGGAACCACTATACACAAACAACCAAAATATGGAAGTTTGAAGGACAATAAGTTAAAAGTTTTTTCAGCCAATCCTAATAAGACATGTAATTTCTATAGAAGCTGGGCCCCGAACACTCTAAATGAACGAATGCTGAGTTTGGTATTTGGCCTAACAAATCAATCCAACAAACCTAAAGCCCTTAAATCTTCTTGTAAATTTGAATTTCTGGAACATGGGGTCCTAACAGCATGGATGATTTACATGGTACGGTGGGTGTTTGGTTGATCAAGATAAGATTGCTGAATGAGTCCATCAGTGTTCTCATAGACATTTTACTATTTTGCCCAGCGATGGTCCGTTTACCCTTGGCTCTTCAGAATCAATGCTATATGAATCATTTGGTTCTTGTTTTTTCCTTTCCTGTCTGGTTATTATTAACTTTTTTCATGTATTATTCTTTGTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTGTTTACTCTTCTCTGTCTATTACTCACTATCAAACTGATGATCACACTTTAGCAAGTGAACATTTGGACATTGGTAGAGTTTTAGTTATCGATATGTCTGCTTGATATTTCACCATGGAGAAAAATAAACCACAGTGAAGCAAACTTTTACAAAGCCGTATAGACATCCTTATGTATATGAACTGATGCTAGCTCTAACCCCTAGACTACGGTTTTGAGTTGTTTCATTACCATCCTTGCTCCCTTTTCTTTTTCTGTCCTTTGTGCATATGGAACCTTCAGTATTGTCTCTGGCACTTGATAGTCTCATGAATTCCTTCAGAGCTCATAACTATTTTAGCTTGTAATCTCATTTCTTTGCAATGTAGTGGCAGAGGCCTTTTTTAGACACCTACACTAATTTCTAATGAGTTTTTGACTAATAGCCAAAATCAATTGCTGTATAATCGTCTCAGCAGAAGATCTGTGTTGCTTTCTTTTATTAAATGCAGTTTCATTTTCCTTCTCCCTACTTATTTGTCAGATCTTCCATGGAGCTGACAATGATGTTCTTTGGCTTCAGAGAGACTTTCATATTTATGTTGTGAATATGTTTGATACTGCCAAGGTAAGTCCCCCTACAGTATGCATGTCTTGGATGAAACATCTAATACCATTCCGCAGAGATTTCTCCAGCATGCGAGCGAACTGTGCCTGTTTTTTGTCGCATATAATGTTTGCTTGCCATGTCTTTTCACTGTAGCAAGTTACATGCCATACTGTACGTAGATATGGCAATAGGTCATGAAACATCATTTTACTTGGACATCTCATTAGATGTGAGCATATTTTACTTTCTTTAATGTAATGAAAGAACATCAGCAGTGCCAATCAACTGCTGACCTACATTTGTGTGCTTCCCGTTCATTTTTGCATTAGTGGTTATAGTTTTTTCATGGGACAACATAATGAGCTGCTAAGCATCATCACCAATATTATGATATGTGATAGTTTAAAGTTCGTCACGCTTGATTACAATTTCTTATGTTTCAATTTTATATATTTGATTTTAGCTTCAAGTTTCAACCAGAAATGTTTTCATGGTTTAAGCAGGGGAAATGATTTCATAACTGGTTTACTGCAATATGAAAAGATTTATGGATTTACAATGTGTTTACGATGAAAACATCTTTTTTTGGTACCAGTTCCTATAATCTAGAGTAGAGATCACCTTCTTATGAATATTTTGGTCATTGAACATTGGTTGTTTAATGGCAACTTTGCCCCTAAAGTTATTCACCTATGCTATCTTAGATGTTCATTTTTTTTTCACCGGACCTCACTTTATTATTTATGTTATGCATGTATGCCCTTTTCTGAATTGCCTTATGAAAGTAATTTATTGCAGGCATGTGAGGTTCTATCAAAACCACAGAAGTCATTAGCATATTTGCTTGAATTATATTGTGGAGTGACCACAGACAAGACAATGCAGGTAGGCCATTTATTAAGGTTGGCTTGCTAAAGCCACTAAAGTGTTTTCATCAGCTTATTTACTGGTTTGTTTACTGTTTAGTAGCTGGTTAGCTTTCATCTGCCGCCTCAATTTTTACATGATTACTTCTTTTTAGCACTTTAGACACAATGGTGCACAGGGTGCTACAAAATGTTTAACCATGTTAGTTACAGAGAATCTTTGCCAATTCATTTAGAGCATTTGTGTTGCACTTATTTATGAGCTTAGCAAGATATATGTTTAGCTTTTGTTGAAGCTTTCATGTCCTAGAAAACATTAGTTGCATAAGCTCATGTTATGCATTGTTGATTGTGATTTCAGAATAATAATGTAGCAGTAGGTTCTTTCAAATTCATTTTTGCACCTATGGAAGCTCATGTTATGCATTGTTACTCTGATTTCAGAATCTACTGGTGTAGCAGTAGATTCTAAGTCATTTCTGCACTATCTGTTGTTACAAATATTAAGCACCATTACTGAAATAAATGATTGTTGACCTAAATACCTAATGGTGGTCAGTGGTACTAAACCCTAAATTGTGGTGGTTTTCTGAATT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TGTACCCTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA025792