Difference between revisions of "BGIOSGA026217"
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Revision as of 17:01, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA026217 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA026217, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1136_D11.106 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA026217-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA026217-PA |
| Length |
11826 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:24458821..24470646 |
| Sequence Coding Region |
24458821..24459060,24460467..24460521,24460599..24460690,24460778..24460833,24461082..24461157 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:24458821..24470646 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:24458821..24470646 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGACGACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTACCGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTCCCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCCCAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAATGCATTGGGAAATGCAGTTAATAATAGTCAGGGCAATTTGTCTAAGGTATCAGTACATCTTTTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGAAACTTGTGGATGCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGGTATGGATGTTCCCACACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATCGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTGTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGLGGGWGGGYDDDDDWGLSAEQLDQLERDAYRKLAERKASSSAASTATSPLPSAAYSPVKNSHHHPASRVSQESCFGKVESLSPSRLSQPNALGNAVNNSQGNLSKVSVHLFLHSTGVIAAKFQYHQKLVDAVHKIPKASWNGKERVWMFPHSSLSVAEEVLSTVPGIAVEVQKLDPLVKRALTASLYAGDLRDLYGKIPTDVESKLMPFQREGVRFALQHGARTLIADEMGLGKTLQAIAVASCLHDAWPVLVISPSSLRLHWASMIQHWLNIPTEDILVVLPQTGGSNKAGYRLVYSNTKGDFNLDGVFNVISYDVVPKIKDMLLDLDFKIVIADESHFLKNAQAKRTMHSLPVLQKAKYVVLLSGTPALSRPIELFTQLQALYPTVYKNVNEYGNRYCKGGFFGLYQGASNHEELHNLMKATVMIRRLKKDVLSQLPVKRRQQAFLDLSEKEMRHIRALFHELETVKIKIQSCDSQETMDSLKFAQKNLINKIYNDSAEAKIPAVLDYLGTIIEAECKFLIFAHHQSMLEAIHQHLLKKKVKCIRIDGQTPVPVRQTLVTDFQNKDDIKAAVLSIKAGGVGLTLTAASTVIFAELSWTPGDLIQAEDRAHRIGQVSSVNIYYLLANDTVDDIIWDVVQGKLENLGQMLDGQEKTLDVSQSDTRPSPSKQKTLDAYLKRCSNSTEADQPKLKNPRF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..240#1647..1701#1779..1870#1958..2013#2262..2337#3026..3092#3433..3499#4512..4578#4995..5078#5175..5216#6061..6216#6953..7030#7635..7703#7788..7853#7935..8063#8665..8721#9162..9251#9606..9671#10075..10143#10210..10314#10681..10806#10994..11052#11139..11175#11677..11826#ATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGACGACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTACCGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTCCCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCCCAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTTAGGGTCTCATCTCCTCTCTCTCTTCTTATTCTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTCCTTCTTTTGTTAAAAAAAAAACTTGGGTCAGTGAGGGTTGCATCTTCTTGCGAATTGGCATATTTTCATCTTAATACATTTCGTGAAAAATGTGTAGTGTTCGTTCTGGCAATTTCCTTATATTTCTTTTACCTAATTCGTCATAGTGAATTTTCGTTCAAACAAATGGATGGGGCTCTTGTCCAAGAATTTAGCCAGTGAATAAAATTCTTATTGACAACCATAGCCAGTGTGAATTGCAGTACGGCCTTAGCTCAGAGTTTGTATACCGTGGTAATTTTACGAATTTTCTTGTGCTCTGCAGTTGAGTTCTTTGCGTTACCGGCTATCTGTTTCAACTTTCAAGAATAGTTTTTTTCTCTGCGTTGCTGTTTCATTGAGTTCTTTATATGTCCTGCATTGCAGTATGAAAACCAAAAGCCAAAACTTTTTTGCACCTGACAAACCCAAAAAAAAATTTGGTGGTTTCTGGCAGAAGAATTAATCATGGATTTTGTGCCAAGATAATAAGTGATGGGGCCTGTTCTGTTTCCTAGCGATCTGTTAAACTTAGTGGGCCGTGTGTTAAATTGCAGCTGCACAATATTAGCACCATCAGGGGTTTCTTGTTAACTCATGAGAATACGACCAGGCAGAGCGTGTATTTTAGTATTTACTGTTACAAGACCATGATCCTGGCCATTTTCTAAATCTTCATTGCAGTATTAATTTTGAAAAATTTAAGGCATTTGATTCCATCATCATCATTTGATGTACTTGAAAACTATCTAGCATTTGATGTATTACGGGTGTGTGGCCACTTTAAAGTTTGGGATCATATGGTTGACAGGGCTTGCTTTGGTGATCTCTAGCTAAATTCACTGGCTATGGCTGTCAATAAGAATTATTCTCTTACTCACTGTGTTGTGTGGATTTTTTATTCATTCTTGAGTAGTGTTGTTTAGCACAACTTCAATATGTTTATGCCTTTCCAAAGAGTTGATTTTTACTTACCCATGTACTCATAGATTGGTAAACACAGACTCTAAAAGAGGCACCCAATTTATCCGGAGTAAGGACAGCAGTTGAGAAGGGTTTTCATATCTCCAAATTGGCCTAATCTTTCAGTTTTAAACCAACTGCCCTTCTAATTATTCTAATGTAATTGTGCAAATCTCCAGCACTTGAAATCGGTACGAATATATGATACCATAGTGCAAGAGCATCCCTGTATATGTCTGTGTTATTCACTTTATTTTATTTACCATCATTTATTATAGAGTTTGCACAATTGTTTGACAAAACTGATATTTACTCATCTCTTTTTATATCACTAACTGCCATTATGCTAATGAATAATATTTCTTAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAATGCATTGGGAAATGCAGGTATAAGACATTCTTGGTGCTTTATTTTTATTCTAATTGGACATGTGGCTTATCTCCTTTTTTGTTTGTCATTTAAGTTAATAATAGTCAGGGCAATTTGTCTAAGGTATCAGTACATCTTTTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGGTACAATTCTCCCCAATGAAATCTTTAATCAGTTGTTACTGTATTATATTGTGATCCATATATTTGACTCCTCTGTTCCTTTCCCAGAAACTTGTGGATGCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGTTTTCATTAATCTTCTACCTGACAAATTTACAAGATTTTTCTATGGCCTATCAAAGCTCAACTTGTAGTGCTTTTATGCTCTCAAAAAAATAAAAATAAAAATGCAACTCTGTAAACACATCGGGAGCCTGATATGCAACTAATAATACTGTTTTAGGAGCATAGGATCATTTATCAAGCTTGATACCTCCTGTAAAAATTGCAGCTTATTCCTGATTCTATTTTACCTTTTTCTTGAAAACTATAGGGTATGGATGTTCCCACACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTAACAGTTATTTTGTACTTCATAAAACCGACTTACTGTTTGTTGTAATGACCTCTCACCTCCTGTTGTTTTGATTAATTTATTTTACTTCCTCCTGTTTTAGTTGGTTGACCTGGGCTGCTTCTAGTTAGCTTAGCATTATTAGTAGGATTGTTTTTTAGTTTTCTATTTTGAAAATTTTCAAATATTAGAAATTCTTATATGACTGTTAACAAATCCTCTGTAATGCTTAAACAATTCAGAACATAGATGATGAAGTTGGACAGTGACTTTTATGACTTTTCTGTTCATTGCGTACATGGCTACTATTTTTATTTTTCTTTCCACAAGGAAGTTTGAAAGCTTGCATTTTCAGTTTATGCAAACAAGAAGTAAACAGACTCAAGGCATAGGCTTTAATGTGCGGTCCACTATATCATCGAAACCTTTCTAATCTTTCAGGGAATGCCTATCTGACAGTCTATAGATGGTTCAGCAATACCCTGTATTCCTGTTGACCCATGGTTACTCTATATTTTGCAGTTGATGGTCACTAATAACGGTGACCAAAAAAGTTTAATATGACTGAAGTAAATTTGCTAGTTTGCTACCTTTCCTTTACTTTATTATTGTTGTTGATATGGAGCAAAATCTAGTTTTGAACTTCTAAAGATATTCATTCTGGCCATACCTTGTACTTTCCTAGCAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGGTGAATAAAATTGAAATAGCTTTGGAAATTCCAAATCATGCTTATAAAATTGTTCTTCACTTTGTACTAATACTGTTGGAAAACAACCCAATTGTGCATGTGCCTAATACAAAAGTGTTGGTTATGCACTGTTTCTTTCTGTTCTCTCCACTAATCTACTTGGAGTTTATATTAAATGTGTTGGAGAACCTAAATAATTCTGTATGCAATACTATAGTGTAAACTATGCAATTGAGTGCAAACTTTACTTTATATTTTCCTTGGTGTTAGGCTTTGAAACTTCAATGCCTTGCCTTTTCCTAGTATTTTCTTTAGATGCTAATTTCACTTTTTTTGGAAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTATGACTATATGATGATGCAATGTTCAGTGGACTTTTTTCTCACATGACAGTGTAAAAATCATTTTTGTAGATATGTGCTGCATGTTGAACTTAATTGTCCAGAAATATCAAACATGGCAGATGACCATTAATAAATATGAGAATTTTGTCTAGTCTCTAGCATTATACTTAATGTTGTTAGTCTAGTCATACTAGGAATGTTATGTTGCAGATACTTATGGCTCAAACTGGGTATGGGGCCAGAGGACTAAGGTAGGGCACTTGCCCTCAACTAGCCATTGGCAGGGGCTATTCCTTCATGTGGTAGAGGGTTAAAGAAAAGGGGGGAAATTGTAAACTTCATTTACTAGCTAAATGCCCGTGCTTTGCTACGGATAAAAGGAAAAAAACATCATAGTATTGCCAAATAATAAAAACATATTTTCCATTGAATATGTACCCACCTTAAGTTAATTTTATATGTGGCTAACCATTTAGATTTAGTTGTTATGTACTATTAAGAAGTTCAAGGGGTGATATGTAAAAGCTACAATGGGAGCAGGTAGGTGGCGGATTCACTGTCACTACAATTGGAGTCTTTTTAAAGTAAGTATAGATTCGTTGCTTAATAATAAGAGATAAAACCCCATTGTCGTTTAGATGGGATAACTTGGAGCCTTAATAAGCTTATCTCTAAAATAAAGAAAAACTCAAGCTAATCTTATCTCTAAAATATGCCCTAGAAGGTATGCTTCACTGCCTACAGGGCCCAAACCCCATAACACAAAGCTTGAACTTTGTAAGTACCAAAACACAGGACCAGGAGCATAAGTACCATTCAATATTTGAAAAGTGTAGTACCATAACACAAAGCTTGAACTTTGTAAGTACCAAAACCCAGGACCAGGAGCATAAGTACCATTCAATATTTGAAAAGTGTAGTACCGCATGCTTTGCCATTTTTTGCACTTCGAACACGTTGCTGCTTTACAAGTTCAACACATCTTACCTTTTCTTTGATGTTTAAACAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGTATACTTTTTCTCTGGAACATTGTAAATCTCTAGTGGCTTTATATCCTTTCTATATTTATAAATAGCAGTATTTTTCTTTGCAATATGACCCAAGCTTCATTTAGCATGACATATCTGGGCACTCTTCCACTCTT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