Difference between revisions of "BGIOSGA026591"
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Revision as of 17:03, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA026591 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA026591, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1789_C07.22 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA026591-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA026591-PA |
| Length |
6510 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:28228671..28235180 |
| Sequence Coding Region |
28235012..28235180,28234479..28234700,28234067..28234194,28233342..28233416,28233071..28233142 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:28228671..28235180 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:28228671..28235180 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAAGAAGGGGCTGCTACTGCAAGCACATCAACCCCTACAGAGGTGACGAAGATTTATTGCAACGAACAGCCAAACCAAGGAGCAGCAGACAATGAATTTGGCCAGAAGAGAAAAAGGAACCCTATAATTGTAACACCTGCTTGGTGTTATAGTGAAGCTACAACAGGAACTTTGCAGCATGAGCAAAATTCTAGTTCACATAGCAATGGTGCAAGAAGTTATGATATTTGGAAGGGACATGTTAATCCATCGTTTCCACAAAGATCCATTAAGAAAAACATACTGTTCTGTCTAGAAGGGCGTGAAGCTGGTGCCAACTGGTCTCAAACTTGTTCAAATGGAGGTCACGCTGGAAGGAATTGTGAAAGATGGAGCCCCTTTCTTGAAGGATGGAATTCACCTGCGGTCCAGTTTGAAGGTCCTGCTGTACATGTCGTGAAACAAAGTTACCTATCTTGGTGTCCGACTTCATGTGCTTATACGTCAAGCGCTCCTTCTGCTCAGCCTCATGACAGGCAAGGTGTACGCAAAGTTCTTGATGTAAAGTTTCATCCAGAAGGGTTGCCTCAGCTTGTCTCTTGCTCTAATGAGGCACCGAATGAATTGTTGCTTTTCAATCTTCTTTCTGGAAGAGCTACTCAACTTAGAGGCCACAATACCAAGATCCAGGCTACCGCATTTGCGGTGAAAGGAGCAAGCATAGTATCTTGTGGTTCTAATCTATTAAAGGTATGGGATTGCATTACAGGGTCTTGCCTCTATACCTTAGGTGGTGACGATCACAATTCAGTGGGACATACTCAAAAAATTAATGCTATGGCTGTTAATAAATGGCAATCCTGTCTTGTTGTCACTAGTGGAGCAAAAGGTGATGGTAAGCTTCTACTGTGGAATGCTTTGAGAGGAGAACTCGCTTCTGATCTAAATTCAAACTTGAGGTCCCAGGATATGGTCTATCCTTCAATTGATACAATGGAGTTCTGTAGTGAAAATCTTCTAGCATGTGGAAGTGATTGTGAATATGGAGGTTCAGCTGTGGTACAATTGTGGGATATTGAGTCTCCAGAATCGTACCTATCTTTCTCTGCCAGTGATTCTTATATTACTTCCCTTAAAACCAACCCTGCTGGCAACACCATTATCACAGGTTCTGGTGATGGGACTATTGGTCTTTTTGATATCCGTGCTTGTTCTGCAATTAATCATTTGTCAGTGGGACCTGGTTGTGAGGTCACATCTGTTTCATTTAGCAACTGTGGTACCTATTTTTCGGCTTCTAGCACATCAAACAACACACTGGTTTGGGACACAAGACTAGTTCCATTAAACCAAAGCAGGGATGTTTCACGAAGTAAAGACATGCGTTTTTTCCGGCCTTTGCATTGCCTGAGCCACGGCAAGCAGATGCCTACTGCAGAATATACAAGTCAACTGCCCGGCCATGTTGATGAGGGTGATCAGGGGGTGAATGCGATGCAGTGGTTGCATAAAGAACCTGTACTTGTTACTGTTTTATATCATAGTAAAAGTGGGTGTGCCCACCTTAATTGGCGTCTCACATATCCTCTCCCAGGAAATGATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQEGAATASTSTPTEVTKIYCNEQPNQGAADNEFGQKRKRNPIIVTPAWCYSEATTGTLQHEQNSSSHSNGARSYDIWKGHVNPSFPQRSIKKNILFCLEGREAGANWSQTCSNGGHAGRNCERWSPFLEGWNSPAVQFEGPAVHVVKQSYLSWCPTSCAYTSSAPSAQPHDRQGVRKVLDVKFHPEGLPQLVSCSNEAPNELLLFNLLSGRATQLRGHNTKIQATAFAVKGASIVSCGSNLLKVWDCITGSCLYTLGGDDHNSVGHTQKINAMAVNKWQSCLVVTSGAKGDGKLLLWNALRGELASDLNSNLRSQDMVYPSIDTMEFCSENLLACGSDCEYGGSAVVQLWDIESPESYLSFSASDSYITSLKTNPAGNTIITGSGDGTIGLFDIRACSAINHLSVGPGCEVTSVSFSNCGTYFSASSTSNNTLVWDTRLVPLNQSRDVSRSKDMRFFRPLHCLSHGKQMPTAEYTSQLPGHVDEGDQGVNAMQWLHKEPVLVTVLYHSKSGCAHLNWRLTYPLPGND</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..169#481..702#987..1114#1765..1839#2039..2110#2543..2608#2709..2820#3353..3449#4285..4444#4524..4572#4661..4743#5316..5524#5716..5785#6436..6510#ATGCAAGAAGGGGCTGCTACTGCAAGCACATCAACCCCTACAGAGGTGACGAAGATTTATTGCAACGAACAGCCAAACCAAGGAGCAGCAGACAATGAATTTGGCCAGAAGAGAAAAAGGAACCCTATAATTGTAACACCTGCTTGGTGTTATAGTGAAGCTACAACAGGTTTGTCCTTTCGCTTGGTGGAAAGATTAATCATCTGTTGTTCTATTTGATACAAGCTGAGAAGTACTACGTCCTATTGGTCCAAAACATTTTCTGTGAAAGTTTGATTTGTTATTTTGTGACTATGCTTTCATATGTCCTACTGGCATACTGGGATGCACCTAGGAATTCTGGTGTGTTGCCATTTTCTTTTCACATGTTCATCCATGGCTACATAAATTGTATTGAAGCTCTGCATTTTCATCAGCTATATGATTGCAATATTTTATATTTGTTGCTAAAAAAAAATCTGTATCTACTTGTGGTGACAGGAACTTTGCAGCATGAGCAAAATTCTAGTTCACATAGCAATGGTGCAAGAAGTTATGATATTTGGAAGGGACATGTTAATCCATCGTTTCCACAAAGATCCATTAAGAAAAACATACTGTTCTGTCTAGAAGGGCGTGAAGCTGGTGCCAACTGGTCTCAAACTTGTTCAAATGGAGGTCACGCTGGAAGGAATTGTGAAAGATGGAGCCCCTTTCTTGAAGGTATGCTTTGTTTGTTCTCTAAATAATATTCCCTCTGTTTCAATTACTTGTTCTAGGATTCATTTTTTTTTACCAAAATAATTGTCATTCTCACATCTTAGTTAGGGAACAATGTAATTTGACACAGCTCCTTAGTTAGTGTGAGATTTGCTAGAATGAGAAGTAATCTGAAACAGAGAGATTGTATTATTCAGCACTCAGCAGTTCTCTGTTACTTTGAATCTGTAGTTGTAGTTTCCTTATTTTTAATATCATAATTGATTTTTGTTGATTATTTTTATTAGGATGGAATTCACCTGCGGTCCAGTTTGAAGGTCCTGCTGTACATGTCGTGAAACAAAGTTACCTATCTTGGTGTCCGACTTCATGTGCTTATACGTCAAGCGCTCCTTCTGCTCAGCCTCATGACAGGGTATGGATCTCAAATTAATTTGCATGGCACTATGAAGTCCAAAGAGTTGTCAGCTGGCAGTTTGCTCTGGTCTTCTTTTTGGTTATGCAATTTCATTTATTCTTTTGGTGTACATTTACATTGCATTCTCCATTATGCTTTTAAGTTTTAATTCAACACACTATTTTCTAATTTTTCTTCTAGTATGCTTCCATTGGAAAAGGTGAAAAAAACATACTGTCTACATCTACATAGCTTGGCAACTTTGACAGGTTGCGATATTGACATCATCTGGCTGGAGTTGTATGTATGTATGTTGTGATGTTGACAATATTAACAGTGCTAAAGTTTTATATTGGAAAATGCAGAGGTGGGGAAAATTATTTTTGGGTGGTAGTCTTGGATGCTTCCAGAATTGAAAAAACATTTCAAAATGTTGAATATCCGGTCTACCTTTTTCCTATATCTCATTGAGGCCATGAAGAACTCATATGCAGCTCACTTAGCATATTTTTGTTGGCTCTATACATGCATTTTCGTTTAATACCAAAGCAGAAAGCCAAAATCTCTTTGCGGAACTAAATTAACGTGATTGATCGTCTAGCTGTGCTTGATTATGATAATTTTTTTTAATCTAACCTATTTATTTGTTTTCTATTGTAATGGCTCAGCAAGGTGTACGCAAAGTTCTTGATGTAAAGTTTCATCCAGAAGGGTTGCCTCAGCTTGTCTCTTGCTCTAATGAGGTTGGTAATAGAACTGTTCTTGGTGCATTATCTAGTCAATATTTTCTAGCAGAGAGCAGAAATCCGAAGAAGAGGCCTGGAAATGAGTGTGATATTCTTTCTGCGTATTTTGATGGTTACCTTTGGGACATCATTACAGTGTCTCCATAATTATTGGATTGATTTATTCATAAATCATAGTGCTATTCCATTAATTCAGGCACCGAATGAATTGTTGCTTTTCAATCTTCTTTCTGGAAGAGCTACTCAACTTAGAGGCCACAATACCAAGGTATGCTGAATGAGTAATTTGTATATTTACTAGATATTTTCTGGGATACTAAATCCATAAATACCTTTCCTCCTTTTTGCATTTTTGCTTAAAAAATATATATGCTATCCTACCTGTACCTGGGATAGAAAAAACTTTATAGAGTTTAAGTCCATGTTCATGGAAAATACAAATGATTTGTTTGTCAAATGTTCAACCATGTCTCTTCAATCCTTACATCATGTCTGTCTGCCCTGCATATGTACTTCAGTAATTAAGTGAATAATGATGTGGTACTACTGCAGCATAAGAAATTTACAGTTACAATAATCATGCACGTGCAACAAACATAGCTTTCAATTCACAGAGGCTGATTGTTTGAGAGTTTTTTTGTACTTATAGGTTTTTATTTTTTGCTTTTGCTATGCTGATTATTTTATTTTATTTCCTCAGATCCAGGCTACCGCATTTGCGGTGAAAGGAGCAAGCATAGTATCTTGTGGTTCTAATCTATTAAAGGTAACTCAAGACTTTTATTTTCTTTCTTCAGTTCTAATTGTTGCTGAAATAATTAGCAGGAAAACATTATGTTGATTTTTTTTTCATATATGGACTATAGGTATGGGATTGCATTACAGGGTCTTGCCTCTATACCTTAGGTGGTGACGATCACAATTCAGTGGGACATACTCAAAAAATTAATGCTATGGCTGTTAATAAATGGCAATCCTGTAAGCTAATTCTTTTGTCAGCCTTTCTGTACTGCATCTAGTAGATTCCTACATCTGTTCTGTTTCCGTATGACAGGTGTTAGTTTTGAATTGTGAACTTTTCAAGTGATTGATCTGATAATACGTGGGAAAGAGGCAAAACCTTGACTTAATGGGTTGTATAGGCCAATTCATTCTACGTTAGTACATTACAGTTAACAATGTGTTACTTAGCTCATCTTGGCACTTCACTGATTTGGTACCTTCCCTATGCCTGTATATAGTATTGTATTTTCTGCATACCCTCTTATACTATTGTTTTATGTGTTTCGGGATATCTATTATAAATAAAATGAATGATCACTGGGATAAAAAAATTTCTATTGGTGCCCTAAGTATTTTAGCTCTTTTGCTTTATATTTGTTACCGCGTGGAACTCTGCTTATTTGCTGTATTCCAAACCTTGTTCTGCTCCGTCAAATTCTTTATACATATCTATTTTTTATTTCTAGTTTCAGTAATATTAGTTCTCTAACACATCGCATGTTCATAGGTCTTGTTGTCACTAGTGGAGCAAAAGGTGATGGTAAGCTTCTACTGTGGAATGCTTTGAGAGGAGAACTCGCTTCTGATCTAAATTCAAACTTGAGGTAAACTGGAACTTTCCTTATTCCGTCATTTATTTGACTTTTGTTTAGTGTATGTTCTTCTTATCCCAGCCTACTCCTTTTGTCTAGCGTTGTGTCACTCCAATATTCATGCAGTGAAAAAGATGCGCGCGCTATGCGCTAATATGCACATAAGTATTTAAAGTGGTCGTATATTATTTTGAGTAAAATACAAGCTGTTTAACCACTTCTCACATGAGCTTGGAAACTAGCTCTTGGCAGTTTTGTCTATAAGGGTTAGTGAGCGAATGACACTAATGTACAATTGCACAGAACCTTATTGTTATTGAGCTGATTTTTTTTTAGTTCAGCTTAATCGGGTCCTTGGCTACATAACTAGGTAGAATGCTTTTGTTGTGCAAAATATTGTATGTCATATTTTGCAATTATACTGTTCCCCACATATAATTGCCACGCACAGTGGAAAAACTTGCCTATCATACATTCATACTATAAAATATTATCTAGTTTATGTCTTTATGATCATTTTTGTTTAAGTGGTAACACCAGTTAAAGCTAAATGCTTGAGGATTTTGAAATGTTTACTGCTATACTCATTATCTACGTATTCTCTACTAGGTAGCCTTGGGCAAAGGAAACTTCTTGGTTATCTTTATTTGTGATCCATTTATTTTTTTCATCCACTGTTAATTTTGTTTTTGCTCAATTATGCAATCTATTTATCGATAGGCGTGGTGCAAACTTAAAATGTCCCTGGTTTGCATGTCTCAACATATTATTTTTCCAGTTAAGCTTGCAAATTTCTAATTCATCTTAATGTAGCTGTCAAACCTTGTCAACTTCTGTGTTGATGTAGGTCCCAGGATATGGTCTATCCTTCAATTGATACAATGGAGTTCTGTAGTGAAAATCTTCTAGCATGTGGAAGTGATTGTGAATATGGAGGTTCAGCTGTGGTACAATTGTGGGATATTGAGTCTCCAGAATCGTACCTATCTTTCTCTGCCAGTGATTCTGTATGTACTTTTATTATTATTTTTGCTGAATGTTTTAGAGACTAGAGCTGAACACAGCATTAACACATTGTGTTTGCAGTATATTACTTCCCTTAAAACCAACCCTGCTGGCAACACCATTATCACAGGTTGTATTTTCTTTTCTGCTGTATTCAGTATACATCTATCACTGTCTCAGTATAGACTATTATATATATTGTTAGCTCCAATTTGCAGGTTCTGGTGATGGGACTATTGGTCTTTTTGATATCCGTGCTTGTTCTGCAATTAATCATTTGTCAGTGGGACCTGGTTGTGAGGTAGTCTCTTTACTGCTTTCTGTGGGTTACCAGATATATACTAGTGGGTTGTATCCTATTTTGAGTAATTTCTCTTGAATATTTGCTTTGATTTAC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