Difference between revisions of "BGIOSGA027238"
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Revision as of 17:06, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027238 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027238, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28676 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027238-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027238-PA |
| Length |
9360 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:13304926..13314285 |
| Sequence Coding Region |
13314208..13314285,13313939..13314195,13313161..13313398,13312936..13312995,13312755..13312844 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:13304926..13314285 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:13304926..13314285 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTCGTCTGCCTCCGGCGACGAGGCCTCTCGCTCCTCCGGCAGCGTCCGCCCCGCTCCCTCCCCCCTCTCCCGCGCCCGCGCAGCAGCCCACCCCGCCTCGCCTCCCTCCGCCCCCTCTCCGCCGCGGCGATGGGGGAGAACTCCGCCGCCGCCGCCGGGAAGGGGAAGGAAGCGAAGGGGAAGGCGACGGCCTCGTTCTCGGCCTCGGCACCGAACGTCGAGCCCGACGTGGCCTACCTGGAGGCGGTGACGCAGAAGCGGATCCGGCAGTTCGAGGAGATCCAGGCCAAGCAGGCCCTCGAGCGCCTCAACATCGGAGGCGAGCCCATCAGGATAACTTTGCCAGATGGTGCAGTCAAGGACGGAAAGAAATGGATCTCAACCCCTATGGATATTGCTAAGGAGATATCAAGTGGATTAGCAAATAGCTGCTTGATAGCTCAAGTGAATGGAACACTGTGGGATATGACGAGGCCACTGGAAGGTGATTGTGAATTGAAGTTGTTCAAGTTTGATAGCAATGAAGGGCGTGACACCTTCTGGCACTCAAGTGCTCATATTCTTGGAGAATCTCTTGAGAGGGCATATGGCTGCAAGCTGTGTATTGGGCCATGTACTACAAGAGGGGAGGGTTTCTATTATGATGCCTACTACAATGATCTGACATTGAATGAGACGCATTTTGGTATCATTGATGCCCAAGCGCAGAAAGCTGTTGCGGAAAAACAACCATTTGAACGAATTGAGGTCTCCAGGGCAGAGGCCCTTGAAATGTTCGCAGAAAATAAATTTAAGGTTGAAATCATTAATGAGTTGCCTGAAGACAAGACCATTACAGTATACAGATGTGGTCCTCTAGTTGACCTTTGCCGTGGGCCACACATCCCCAATACTTCCTTTGTTAAAGCTTTTGCTTGTCTTAAGGCATCATCGTCGTATTGGAGAGGGAAAGCAGATCGAGAGAGCCTGCAGAGAGTATATGGAATTTCTTTTCCTGATTCTAAACGTCTCAAGGAATACAAACATCTGCTAGAAGAGGCTAAGAAGCGTGATCATAGGCTATTAGGACAGACCCAGGATCTCTTCTTTTTCCATCAACTTAGTCCAGGAAGCTGCTTCTTCCTTCCACATGGTGCTATAATATACAACAAATTGATGGATTTTTTGCGACAGCAATACAGAGATAGAGGATATCAAGAGGTTTTGAGCCCAAATATTTACAATATGCAACTCTGGGAAACCTCTGGACATGCTGCAAACTACAAGGAGAATATGTTTGTTTTTGAGATTGAGAAACAGGAATTTGGTCTCAAGCCAATGAATTGTCCTGGCCATTGCCTAATGTTTGAGCACAGGGTTCGTTCATACAGAGAATTGCCTCTCCGGATGGCTGATTTTGGAGTCCTTCACAGGAATGAGCTTAGTGGTGCGCTTACAGGTTTGACACGTGTCAGAAGATTCCAGCAGGATGATGCCCATATTTTTTGCAGAGAAAGCCAAATCAAGGACGAAGTTAAGGCTGTTTTAGACTTCATCAATTATGTTTACGAGATATTTGGATTTAAATATGAATTGGAGCTATCAACGAGACCAGAAAAGTACTTAGGTGATATTGAAACCTGGAACAAAGCAGAGCAACAGCTGACAGAAGCCTTAAATGAGTTTGGAAAGCCATGGCAGATCAATGAAGGTGATGGTGCCTTCTATGGTCCAAAAATTGATATTGGTGTGTTTGATGCCCTCAAGAGGAAATTTCAGTGTGCAACTCTACAGGCAATCCTAGGTTCTGTTGAAAGGATGTTTGCTATTCTTTTGGAGCATTACAATGGTAAATGGCCCTTGTGGTTGAGTCCTCGCCAAGCCATTGTTTGCTCCATATCTTCCAATTCAGTGGAATACGCTAAACAGGTCCGTGCTAGGATACATGAAGCTGGTTTTCATGTTGCCATCGATGAGACAGACAGGACAATACAGAAGAAGGTACGGGAGGCTCAATTAGCCCAATTCAACTACATTCTTGTCGTTGGTGCACAAGAAGCAGAGACTGGACAGGTCAGCGTCAGGGTAAGGGACAAAGCTGAACTAGCCACAGTGAGCATTGATGACATCATCACACGTTTTAAGGAGGAAGTAGCAGCTTACAAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLVCLRRRGLSLLRQRPPRSLPPLPRPRSSPPRLASLRPLSAAAMGENSAAAAGKGKEAKGKATASFSASAPNVEPDVAYLEAVTQKRIRQFEEIQAKQALERLNIGGEPIRITLPDGAVKDGKKWISTPMDIAKEISSGLANSCLIAQVNGTLWDMTRPLEGDCELKLFKFDSNEGRDTFWHSSAHILGESLERAYGCKLCIGPCTTRGEGFYYDAYYNDLTLNETHFGIIDAQAQKAVAEKQPFERIEVSRAEALEMFAENKFKVEIINELPEDKTITVYRCGPLVDLCRGPHIPNTSFVKAFACLKASSSYWRGKADRESLQRVYGISFPDSKRLKEYKHLLEEAKKRDHRLLGQTQDLFFFHQLSPGSCFFLPHGAIIYNKLMDFLRQQYRDRGYQEVLSPNIYNMQLWETSGHAANYKENMFVFEIEKQEFGLKPMNCPGHCLMFEHRVRSYRELPLRMADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCRESQIKDEVKAVLDFINYVYEIFGFKYELELSTRPEKYLGDIETWNKAEQQLTEALNEFGKPWQINEGDGAFYGPKIDIGVFDALKRKFQCATLQAILGSVERMFAILLEHYNGKWPLWLSPRQAIVCSISSNSVEYAKQVRARIHEAGFHVAIDETDRTIQKKVREAQLAQFNYILVVGAQEAETGQVSVRVRDKAELATVSIDDIITRFKEEVAAYK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..78#91..347#888..1125#1291..1350#1442..1531#1742..1816#2144..2272#2355..2444#2944..3032#3126..3222#3337..3423#3527..3611#5017..5111#5212..5244#5570..5656#6600..6692#7261..7353#7518..7652#8659..8730#8980..9051#9265..9360#ATGCTCGTCTGCCTCCGGCGACGAGGCCTCTCGCTCCTCCGGCAGCGTCCGCCCCGCTCCCTCCCCCCTCTCCCGCGCCTGCTCCCGCTCCCGCGCAGCAGCCCACCCCGCCTCGCCTCCCTCCGCCCCCTCTCCGCCGCGGCGATGGGGGAGAACTCCGCCGCCGCCGCCGGGAAGGGGAAGGAAGCGAAGGGGAAGGCGACGGCCTCGTTCTCGGCCTCGGCACCGAACGTCGAGCCCGACGTGGCCTACCTGGAGGCGGTGACGCAGAAGCGGATCCGGCAGTTCGAGGAGATCCAGGCCAAGCAGGCCCTCGAGCGCCTCAACATCGGAGGCGAGCCCATCAGGTGAGCCCCGTTCTGCGATTCGTTGTGAATTTGATGTAGTTAAGAAACTGGGAGGGCTTTGATTCGGAAACCGTAATGCTTGCGGCGCGTTATAGATGAAAATGGAGTTAGATACTACATGGATGGCAGATGTCTCAGGCATTGAGATGTAGATATAGGCATATAGCACACCAAGGGAATATCCTCGATAGCCATGCTTTGTGCTGCATAATTTGGAGTCGGATTTTGAGTGTTGGGAATATTTGAATGTCGATGCGACGACAAAATGGGCGCTGCGCAAACTGCATAATAATGCCATAATGTTATTCAACTTTAACATCCATCTGTCTTTAATAAGAAAATAGAGACGGCAAGCATTTCTTCTGCCTAAATATTCTAATATAGAAAACCCTTGATTATATGGTGCTTAGGTTTCCTTTTCTCAATGTACCTTTGCTAGTTACAATACAAATGTGGCACACTGTGACCTGCAATGTGCAGCACAATGGCAATGGCAATTAATTCTTCTCATGTGATTTTTTTCCCGGCAACTTTCTTCAGGATAACTTTGCCAGATGGTGCAGTCAAGGACGGAAAGAAATGGATCTCAACCCCTATGGATATTGCTAAGGAGATATCAAGTGGATTAGCAAATAGCTGCTTGATAGCTCAAGTGAATGGAACACTGTGGGATATGACGAGGCCACTGGAAGGTGATTGTGAATTGAAGTTGTTCAAGTTTGATAGCAATGAAGGGCGTGACACCTTCTGGCACTCAAGTGCTCATATTCTTGGAGAAGTGAGTTAAAGCTTCATAATTTCCTTGTATCATGTTTTTTTCTTTAAGCAAGTTGTATGGTTGTCTCTTTTTCTTTTTTGTTTACACATCGAGTGATTTTGCATGTCTCTCTGCTATAAGTCCTTTTGAATTCAGTATTTTCTAATTGAAGATGCACTTTTGCAGTCTCTTGAGAGGGCATATGGCTGCAAGCTGTGTATTGGGCCATGTACTACAAGAGGGGAGGTATTGAATTAATCAAAAATCGTGTTCAGTGCAAGAAAGATAATAAGCCCTCTTAGTGATTAACATAATGTTTCTACTTTTACCTGTTAAGGGTTTCTATTATGATGCCTACTACAATGATCTGACATTGAATGAGACGCATTTTGGTATCATTGATGCCCAAGCGCAGAAAGCTGTTGCGGTATGCTCTTATTTTGAACTCATTTTAAAGTTTGTGTTTACCCTTTTTTGTGGACGCTACTTAGCAGTTTTACTCTTTGACTTATTTGATATTAATCTGTCATGAAGTGTGATATCGTTATTGGATTCCATGATTATGCCATGTTTTCTTTGTAACGTAATTGGAATCATCTATCTGCTAACTCTTGGTTTTTAACCCAACATGGTGCAGGAAAAACAACCATTTGAACGAATTGAGGTCTCCAGGGCAGAGGCCCTTGAAATGTTCGCAGAAAATAAATTTAAGGCAAAATTCCTGATTTATGCTTGTTCTTGATCTTTTCTTGTACTCTAACAGTCCCATTGTTTCGCTTATTCATATGCTTATCCGAATTGCTTATTAACAAACAAAAAAAAAATCATTTGTGACTAAAACGACTCAAAAGCAAATGCTGTAAAATAAACTATAATGAAAGAAACAAGAAAAAAATTAAATTAAATTAAGTTCTAAATTTCAAAACTTGACTTATAAGCATAAGCATAAGCGAATTAATGAGGCCCTAAATATCTATTTCTGCTTATATCACATTTGAGATTTTATTAAATTTTTTATTTGTTTGAATTGTGTTTCTAGGTTGAAATCATTAATGAGTTGCCTGAAGACAAGACCATTACAGTATACAGATGTGGTCCTCTAGTTGACCTTTGCCGTGGGCCACACATCCCCAATACTTCCTTTGTTAAAGCTTTTGCTTGTCTTAAGGTAATTCTTTGGTTGTCTTAAGCTTTTGCTTGCCAATATTTTTATGGAACTATCCAATTTGTACTTGCATGTAAATATGTAGGCATCATCGTCGTATTGGAGAGGGAAAGCAGATCGAGAGAGCCTGCAGAGAGTATATGGAATTTCTTTTCCTGATTCTAAACGTCTCAAGGTATAGCATATGATTTTGGCTATTGTTCAGATATGGGCGTTCATTAATTAATGTGGAGTCTGTTTTTGTGCTATCATGTCTGTGCTACTGGACACAATAATGTACCCTCTATGTTTGCATTTTAGACACTAGAGTATTAATATTTCATTGTGATAAGATTGGAGTTGATTTGGCAGGAAGTTTAGCGTGCACTACATGGCATGTAAATTGCACAAAATATACAACTATATCTCAAAAGTGTATCTATGGGCTCTGTGCTTTGGTGGAGGTTGGGGTTGATTTGCCCAACTGAACAACAATTGTCATTACAGAAGTATATGGTTTCTTTTTATTAGTCAGTTATTACGAATTTCTTCAATTAATACATGGTTAGGTTCAGACAGTGCAACCCTTATCAGCTATTTTACAAGTTACTAATTCCTAAGTTCTTTTTTGTCCATTTGTTTTATCACTGGTACACTATGGTTTTCATATATGTTTCCTGCTCAATAATCCATAGGAATACAAACATCTGCTAGAAGAGGCTAAGAAGCGTGATCATAGGCTATTAGGACAGACCCAGGATCTCTTCTTTTTCCATCAACTTAGGTAACTCAAGGTTTTCGGTTTGACTTTTTCATATCTTAATTTACCTTGGCTTCTATTCTGCCTCAGGATGTTTGATTCACTTTGACTGTGCAGTCCAGGAAGCTGCTTCTTCCTTCCACATGGTGCTATAATATACAACAAATTGATGGATTTTTTGCGACAGCAATACAGAGATAGAGGATATCAAGAGGTGGGCATTAATTTGATTGGCTGGTCAATCTTTTGTTCAGATTATGATTAGATTACTAGATTGTGGGCATGCATTTCCACTGTTTCTCGCTGTTCATGATGTCTGTATTTTCAGGTTTTGAGCCCAAATATTTACAATATGCAACTCTGGGAAACCTCTGGACATGCTGCAAACTACAAGGAGAATATGTTTGTTTTTGAGGTAAGTCTAGTGTGCAGAGGATTTGCTCTGTACATATTATAGATTACATTTTGGATGAATTACGATCTTTATTACTGGGTGCTTGTTGGTCTTATTCTTGCAGATTGAGAAACAGGAATTTGGTCTCAAGCCAATGAATTGTCCTGGCCATTGCCTAATGTTTGAGCACAGGGTTCGTTCATACAGAGGTAAATCTCCTTCATAATGGCATAGTTGTATCACAAAATGTATCTCTTTTATCAAGTGAAAATTCCTGCTGTCAAAGTAATCGCTTCAACCTTCTGCCTGTATGAACTGTTTTTCTTCTATGATTTAATTCTCCCTCTATTTCTTTGATATTGTGCATGCACATTTATTATCTAGTGGCTTGTGCTTTCTCATTAAAATTTTCATAAACTGAAAATGTAGGCAGCAAAAACAGTTCCTTAGTTGTCTGGCAATTAAACTAGGGGTGGGCATAATTAACCGTGACGAAGAACCGAACCCGAAATGGCCCAAACTGGAATCCAGTAAAAATATCGGGCTTCAGCTCTCAATAACTGAATTTAGTCCTGTTATTTTGGTTATTAGGCTCGGGTAATTGAGAAATCGAAACATATCAATAAGCCTTATCCAGTTCAGCCCAAGAGAGAAAACCCTAACTTCCCCTCACCTCCCCACTCTTAACTCCCCAGTCCCCACTTCTCCTGCCACTACCCCGACTCCTCCCACACACGGCAAACGCTGCTGTTGCCGCCCCGCCCTGGCTCCCGCCTGTGCCCCCACAGCACGCTGCTGTCTCTGCAACACTCTGCCTCCGTTGCCGCAATTCCACGCCATCAACAGTGGGGACTACCTTCACCAGAGATCTCAAGGAGGCGCTCGGTGCTCTGCCACGCCGGAGAGCTCAAGGCGGCGGTTGCTGGGGAACCCTGGTGTCGCCACCGTTGTGAACATGCGGTTCCCTGCCCGTGGTCCCCTGATGGCAGCGGATTTGGTGGACACGTCTATGCCCGCTGGCTACATCTCGTGCTCTTTGCTCCAAATTGTGTTGATTTGAACTTCATCTATGTAGGGGATTGTGCATAGATCTAATTTGTGTTGATTTCTGTTGATTCTATGGCTGATTTTGGGATTATATGAGTTGATTCTGTGGCTGATTTGAGTATTCTATGATTTCTTTTTGGATGTGTAAAACAGCAGTTGTAATATCTTGGTTAGTTTGGTCACGACCGGAGACCGAACTGAACTAGCTGAAACCGAATTCGTCAGTATTCATTTTTTTTTCCAATGTGTTTCGGTCTCTATTTTCAGATGACCGAACTTTTCAAAACACCGACGAACTGAACCAAATGCCCACCT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