Difference between revisions of "BGIOSGA028734"

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Revision as of 17:14, 22 July 2012

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA028734

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028734, complete gene.

LocusTag

OsI_29366

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA028734-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA028734-PA

Length

14853

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:22672667..22687519

Sequence Coding Region

22672667..22672943,22673257..22673399,22673902..22673976,22674142..22674195,22674282..22674347
,22675436..22675494,22675604..22675680,22676384..22676509,22677122..22677156
,22677940..22678040,22678142..22678237,22678739..22678803,22680004..22680075
,22680988..22681155,22681239..22681441,22681546..22681612,22682523..22682698
,22683220..22683321,22684082..22684129,22685865..22686008,22686116..22686211
,22686467..22686568,22687433..22687519

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:22672667..22687519 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:22672667..22687519 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCACGATCACCTTGAAGCCGCCGGCGACGGCGGCGGCGGCGGGAGGGGAGGTGTCCGAGGTGGAGCTCTCGGAGGCGGGATCGCCGGATGTCGGCAGCCAGAGCAGCGGGAGCGGTGGGAGCGGGCGGAGCACGGCGGGGTCCTCCGGGTGGGTGTACCACCTCGGCGTGAACTCCATCGGCCACGAGTACCGCCACCTCCGGTTCCTCGTCATCCGCGGCAAGACGGTGGCCATGTACAAGCGCGACCCGAGCAAGAACCCCGGAATCGTCGGGGATGCATCGATAGATGCGACTGCTATCGAAAATGCGGCTTCAATTGGTTTGGATGATGACAACCGTGTCATTTACAGTAAGAAACTGATCGTTTCTGCATTTGGGGCTGTTCTGGGTTGCAGGTTTTCTTTGGTTCTGCTGCAACCTATCCGAAAGGGTGTTGTAAGTCACACTCTTATGGTGGAGGAGCTTGGTCGCCGGATTACTAGCCATGGGGAACTGTATGTCTTGCGGTTTTACAATCGGTTGGATCAAACAAAGAAAGGAGAGATTGCATGTGGGGACCCCGGTGAAGCTAGGAAATGGGTTGAAGCATTTGAGCAGGCAAAACAGCAGGCTGATTATGACCTGATGACGAGAGGGGTTAGTTGGAATAGATCCCAGAATGAAAACGAGCTTAATCTTGATGGGCATCGACCACGTGTAAGGAGATATGCACAAGGCTTGGGGAAACTTGTACGAATTGGTAAAGGGCCAGAAAAGCTCTTGCGGCAGTCTTCAAATCTTCAAAGCCATGAGATAATTAATACAAACTTTGGAGGCGATTCTGGAGATGCATTCGAAGCACACGAATGGAGATATGTTCGAACATTTAATGGTATAAGAATTTTTGAAGATATTGCAAACACAAAGGGTGGAAAAGGGGTACTTCTTAAGTCTGTTGGTGTGGTTGGGGCGAATCCTGATACTGTATTTGCAGTGGTTCTCAGCTCTGATAAGCATAAGCGATATGAGTGGGATATGCTGACTGCCGATTTGGAATTGGTAGAAACAATTGATGGATACTATGACGTGGTTTATGGAACCTATGAACCTAGATATTTAAGCTGGTGGAAAACAAAGAAGGATTTTGTTTTTTCCAGACAATGGTTTCGTGGACAAGATGGGGCATATACCATTTTGCAGATTCCTGCTTGTCACAAGAACAAACCTCCAAGGCATGGCTACGAGCGTACAAAAATCAATTCCTCAACATGGGAACTAAGAAGGTTGAACCCACCAGGATCATCAACTCCGAAATGCCTTGTTACTCATATGTTGGAAATGAGCCCAAGTTTTTGGGATAGATGGAAGAGAAGACATAACGAGAATTTTGACAGAAGTATTGCTTTTGCTTTGCTCAGCCAAGTAGCAGGTCTAAGAGAATACTTTGCAGCAAATCCAGCTTTGACATCTGATTTGCCTTCAACAGTAGTGAAGCCCAAACAGTCTGATTCTTTGATCATCCAGAGTGAACTGGATGATTCTGAACTTAATGATGAATTCTATGATGCACTTGCTAGAGGCGAATCCTTTGAAGATGAGGATAGTGATGACGATGATGATATGATTCCTAAGGCTGGAAAAGTGAAGTTCAAGAATATTTCATGGGCTATCGCAGGTCTTGCTATGAAACCGACTAAAGCTTCGGTTGAGAAGAGTGAATTGGTTACAAATTCAACTCCGGTAACTATTGATTCAAACCATTTCCATGGCACCCTTCGACGAGCGAAAAGTGAGAATGACCCAAACTCTTGGAGTGAGCCTGGTGGAGAGAAGTTCATGATAAGAGGAAAGACTTACCTGACAGATTACACTAAGGTTGTTGGAGGTGATCCCCTTCTAAAGCTTATTGCTGTCGATTGGTTTAAGGCTGATGAGCGTTTTGATTCAGTTGCCTTACACCCCAAGAGCCTCGTTCAGTCAGAAGCTGCAAAGAAGATTCCCTTCATACTGGTCATAAACTTGCAGGTTCCAGCGAAGCCAAACTATAACTTGGTCATGTACTACGCAGCAGAAAGGCCCGTGAATAAAGATTCTCTGTTGGGAAGATTCATTGATGGAACCGATGCGTTCCGAGATGCCAGATTTAAACTTATACCAAGCATTGTTGAGGGTTATTGGATGGTAAAACGTGCAGTTGGAACAAAAGCTTGTCTTCTGGGAAAAGCAGTAACATGCAATTACCTTCGCCAGGATAACTTTCTAGAGATAGATGTTGACATTGGTTCTTCATCCGTTGCACGGAGCATTATTGGTCTAGTCCTGGGATATGTCACAGGCCTTGTTGTTGATCTTGCTATTCTAATTGAGGCAAAGGAAGAGAAAGAGCTGCCTGAATACATTCTTGGCACAGTTCGCCTAAATCGTGCGAATCCCGACTCTGCAGTACCCATCTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATITLKPPATAAAAGGEVSEVELSEAGSPDVGSQSSGSGGSGRSTAGSSGWVYHLGVNSIGHEYRHLRFLVIRGKTVAMYKRDPSKNPGIVGDASIDATAIENAASIGLDDDNRVIYSKKLIVSAFGAVLGCRFSLVLLQPIRKGVVSHTLMVEELGRRITSHGELYVLRFYNRLDQTKKGEIACGDPGEARKWVEAFEQAKQQADYDLMTRGVSWNRSQNENELNLDGHRPRVRRYAQGLGKLVRIGKGPEKLLRQSSNLQSHEIINTNFGGDSGDAFEAHEWRYVRTFNGIRIFEDIANTKGGKGVLLKSVGVVGANPDTVFAVVLSSDKHKRYEWDMLTADLELVETIDGYYDVVYGTYEPRYLSWWKTKKDFVFSRQWFRGQDGAYTILQIPACHKNKPPRHGYERTKINSSTWELRRLNPPGSSTPKCLVTHMLEMSPSFWDRWKRRHNENFDRSIAFALLSQVAGLREYFAANPALTSDLPSTVVKPKQSDSLIIQSELDDSELNDEFYDALARGESFEDEDSDDDDDMIPKAGKVKFKNISWAIAGLAMKPTKASVEKSELVTNSTPVTIDSNHFHGTLRRAKSENDPNSWSEPGGEKFMIRGKTYLTDYTKVVGGDPLLKLIAVDWFKADERFDSVALHPKSLVQSEAAKKIPFILVINLQVPAKPNYNLVMYYAAERPVNKDSLLGRFIDGTDAFRDARFKLIPSIVEGYWMVKRAVGTKACLLGKAVTCNYLRQDNFLEIDVDIGSSSVARSIIGLVLGYVTGLVVDLAILIEAKEEKELPEYILGTVRLNRANPDSAVPI</aaseq>

Gene Sequence

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