Difference between revisions of "BGIOSGA029929"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA029929

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029929, complete gene.

LocusTag

OJ1116_C03.1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA029929-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA029929-PA

Length

10857

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:9521855..9532711

Sequence Coding Region

9532411..9532711,9528813..9529392),complement(9527323..9527801,9527081..9527219),complement(9526918..9526989
,9524707..9524781),complement(9524449..9524597,9524083..9524345),complement(9523582..9523708
,9522650..9522718),complement(9522375..9522564,9521855..9522248

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:9521855..9532711 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGACGACTGTCGTCGTCACCAGCCCCGGATCCGTCGCCCCTGCCGCCAGCAGTCGTCGCCGGCGCCGAATCGATCGCCCCCGCTGCCCGCTGTCCACGCCGGCGCGGGATCGGCTGCCCCACCACCAGTTGTCGGCGCCCACGCTGGATCCGCTAGCCCCGCCGTTCGCGCTAGGGAGGGGCGCCCTTGGTGCCGAATCCGCGCAAGGCAGTGCCGCCCGAGGTGGCCGTGCCACCCTTGCCGCCGTGAAGGTGAGGACGGGGAAGGGTCGCCTCGTCGTCGGCGGCAGCGGCGGCGGCAGTTTCCTAAGTATCGACTGCGGCCTGGAGGCAGATGATAGCTACCCAGACGATCTCACCGGCATCACTTATGTCCCAGACGGCCGTTACACTGACGCCGGCGAGAATCACAAGGTGACCACCATATACCGCGATGCTTGGTGGGGCCCTGACACACGTACTCTCTACACGGTCAGGAGCTTCCCATCTGCCGAGGGTCAGCGCAACTGCTACTCGCTACCCACCGACGTCCGGTCCAAGTACTTGGTCAGGCTGGAGTTCTTGTATGGCAACTACGACGGCTTGGACAGCTCGTCGCTAAAATTCAACCTTACCCTTGGTGTCAAACACTGGGACACTGTGAGTATAGGCACCACCGACGGAAATGATGGTTATAATGTTCACGAAGCGGTGTTCGTGGCATGGGCGAGCTGGGCGCCGGTTTGCCTCATCAACATCGGCCAGGGCACGCCGTTCGTGTCCACGGTGGAGTTGAGGCCTCTCGGTATCTTGCCCTACCCGGCTGTCATGGGGAATGTGTCACTCTCCCTCTATGTTCGGAGCAACTTGGGATCTAGCCCTGATGATGACAATTTAGTAAGGTACCCTGATGATCAGTACGATCGGTTCTGGTTCACAGATACATACACAGAAGCTGATCCCTTGACGACAAACATTTCCACCCAATCTACCATCCAACCTAGCACCGAATTTGCGGTGCCCTCGCCTGTTCTCCAGAAGGCCGTTGTGCCGAGTGGCAACTCCACAAAACAAGTATTCTTTTCTGACCAATTAGACGCCCTCCTTCATGACCACTTCGTGATTCTGCATTTCGCCGACTTCCAGAACAAGAAGTCCCGGGAATTTACAGTTTCCATAGACAATGGTGTGCAGAGCAGCCCATACAGCACACCGTACCTAAAAGGTTTGTCTGTCACCGGCGGCTGGTCCAGCAATTCTGAAGGAAAGTATAACTTCACCATTGCTGCAACTGCCACATCAGCTCTGCCCCCGATCCTTAACGCTTATGAGGTCTACGGTCGCATCATCCATGATAATCCAACAACGTTCTCCCAGGATTTTGATGCGATCATGGCTATTAAATATAAGTATGGAATAAAGAAGAACTGGATGGGTGATCCATGTTTTCCACCTGAATATGTTTGGGATGGTGTGAAATGCAGCGATGCAGGTGATAAAATCATGAGGATAATATCTATTGATCTCTCCAACAGCAAATTGAATGGGTCGATATCTAATTCTTTCACATTGTTTACTGCCCTCAAGTACTTAAACTTATCATGCAATCAACTTAATGGGACAATTCCAGATTCCCTCCTCAAAAACAACGGATCAATTGATTTCAGTTATGAGTCTGATGGAAATATGTGCAAAACACATGCTACTCCATCCCTGTCAAGAAATACCTTAGCTGTTTCAGTAGTGGCCCCAGTGCTGGTACTGGCCATACTTGTTCTGGCATATTTGATCTGGAGAGCCAAAAGAAAGCTCAATACTTCTTCAACTGATCTTGCCATGGTACCAGAACTCATGGGTGCTCCTGGACATATCACAAATCATTGGGACCATCTACAAAAACCTGAAAATCGCCGATTCACATATCAGGAGCTAGAGAAGTTTACTGAGAACTTCAAACATTTAATTGGGCATGGAGGCTTCGGGCATGTGTACTACGGTTGTTTAGAAGACAGTACTGAGGTTGCTGTGAAGATGCGGTCTGAATTATCTTCACATGGGCTTAATGAGTTTTTAGCTGAGGTTCAGAGCTTGACCAAGGTGCATCACAGAAATCTTGTTTCTTTGGTTGGATACTGCTGGGAGAAGGAACATTTGGCACTTGTCTATGAGTACATGTCTAGAGGCAATCTTTGTGATTATCTAAGAGGGAAAACTGGTATGGGTGAAATTTTGAATTGGAAGACACGTGTAAGAGTTGCACTTGAAGCTGCACAAGGCCTGGATTATCTACATAAGGGTTGCAACCTACCAATAATTCATGGGGATGTGAAGACGAACAACATTTTATTGGGTCAAAATTTTAAAGCAAAGATAGCAGATTTTGGACTATCGAAAACATATCATAGTGACTCCCAGACTCATATATCAGCCGCTGCAGCTGGATCTATGGGTTATATTGACCCTGAGTACTACACCACTGGTAGGCTCACCGAGAGCAGTGATGTTTACAGCTTCGGCGTTGTTTTACTAGAGATAACAACTGGCGAGCCTCCTATAATACCTGAAAATGGTCACATTGTTCAACGTGTGAAGCAAAAGATTGTCAGCGGTAACATTAGCTCAGTTGCAGACGCACATCTTGGAGGTGCCTACAATGTTAGCTCCATGTGGAAGGTTGTTAACATCGCCATGATGTGCACAACAGATATAGCTACTCAAAGGCCAAAGATGGGTGACGTGGTTGTGCAGCTGAAGGAAAGCCTAGACTTGGTGGAAGTTCATGGGGACAGGGGAGACATGGAAAACCTAGCAAGTGACACCATGTCTTCGATGTCGACATTTGGTCCATCGGCAAGATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MTTVVVTSPGSVAPAASSRRRRRIDRPRCPLSTPARDRLPHHQLSAPTLDPLAPPFALGRGALGAESAQGSAARGGRATLAAVKVRTGKGRLVVGGSGGGSFLSIDCGLEADDSYPDDLTGITYVPDGRYTDAGENHKVTTIYRDAWWGPDTRTLYTVRSFPSAEGQRNCYSLPTDVRSKYLVRLEFLYGNYDGLDSSSLKFNLTLGVKHWDTVSIGTTDGNDGYNVHEAVFVAWASWAPVCLINIGQGTPFVSTVELRPLGILPYPAVMGNVSLSLYVRSNLGSSPDDDNLVRYPDDQYDRFWFTDTYTEADPLTTNISTQSTIQPSTEFAVPSPVLQKAVVPSGNSTKQVFFSDQLDALLHDHFVILHFADFQNKKSREFTVSIDNGVQSSPYSTPYLKGLSVTGGWSSNSEGKYNFTIAATATSALPPILNAYEVYGRIIHDNPTTFSQDFDAIMAIKYKYGIKKNWMGDPCFPPEYVWDGVKCSDAGDKIMRIISIDLSNSKLNGSISNSFTLFTALKYLNLSCNQLNGTIPDSLLKNNGSIDFSYESDGNMCKTHATPSLSRNTLAVSVVAPVLVLAILVLAYLIWRAKRKLNTSSTDLAMVPELMGAPGHITNHWDHLQKPENRRFTYQELEKFTENFKHLIGHGGFGHVYYGCLEDSTEVAVKMRSELSSHGLNEFLAEVQSLTKVHHRNLVSLVGYCWEKEHLALVYEYMSRGNLCDYLRGKTGMGEILNWKTRVRVALEAAQGLDYLHKGCNLPIIHGDVKTNNILLGQNFKAKIADFGLSKTYHSDSQTHISAAAAGSMGYIDPEYYTTGRLTESSDVYSFGVVLLEITTGEPPIIPENGHIVQRVKQKIVSGNISSVADAHLGGAYNVSSMWKVVNIAMMCTTDIATQRPKMGDVVVQLKESLDLVEVHGDRGDMENLASDTMSSMSTFGPSAR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..301#3320..3899#4911..5389#5493..5631#5723..5794#7931..8005#8115..8263#8367..8629#9004..9130#9994..10062#10148..10337#10464..10857#ATGACGACTGTCGTCGTCACCAGCCCCGGATCCGTCGCCCCTGCCGCCAGCAGTCGTCGCCGGCGCCGAATCGATCGCCCCCGCTGCCCGCTGTCCACGCCGGCGCGGGATCGGCTGCCCCACCACCAGTTGTCGGCGCCCACGCTGGATCCGCTAGCCCCGCCGTTCGCGCTAGGGAGGGGCGCCCTTGGTGCCGAATCCGCGCAAGGCAGTGCCGCCCGAGGTGGCCGTGCCACCCTTGCCGCCGTGAAGGTGAGGACGGGGAAGGGTCGCCTCGTCGTCGGCGGCAGCGGCGGCGGCAGTGAGGAGGGGATGGCGGAGGCGCCGCCGCCCGCGTCGCTACCCACTCGCCGGATCCGCTGCCCCCGCTACGTGCCCGCCGTCGCCGTAGCTCTGCCGCTCCCTAGGGTGGCGGATCCAGCCTACCCAAGGGAGGCGCCGCCTGATCCGCCGCCCGCCAACACCATCGCTGCCCTTGTTCCTGGCCGCCGGCACCCGCTCTCGTAGAGGGAGAGGAAGAGGACAAAATAAAAAGAGAGGGAGAGGAGAGGTGACAGAGAGGGGGGAGAGTGATATAATAGAGGAGGTGAGAGAGGAGATGGGTTGGAAAAATTTTGAAGTAGTGGGAGCGAAAAGAGGGTGTAGGGAGATGAAAAATTTGGGGTGGTATTTTTGTATGCGGACCTCTTAAGAGGCTGTATGTTAAAATATGAGAAATTCGAATCAAATTTTATGGTACTAAATCAACGCATGTGTAAAGGTTGTAAAAACAAAGTTGTAGAACTCATTGAGATCTACTATTTTTCATTTGGTCATTTCTCCATATGAGTTTGATTGAACTATATAAAATTTAAATATCAAAATATAAGATATACTTTTTCGGGTAGTAAATGATTTCAAATGAATAAATTGTCAATAACAAAGTTGTATAACTTATCAAGATCTACAACTTTGTTTTGGTAATTTTTCTATTTGACTTTGTTTCAACAATTTGAATTTGAATTTCAAATTATGACAACTTCAGACAACATTTTGAAGTACTAAATGATTTCAACTAAAAAGTCATCAACAACAAAGTTGTATAACTCATCGAGATATATAACTTTTATTTGGTCATTTCTTCATCCGACAGAGTGATAGTTACATTGTTCATAAAATTTACACATCTCTTATTAACTTTATATAATAAAAGAGAGATATGTAATTTTTGTGAAAATGTTACTATCACTTTGTTGGATGAAGAAATGAACAAAATAAAAGTTATAAATCATGATAAGTTATACAACTTTGTTGTTGATGACTTTTTCAGCTGAAATTATTTACTACTTCAAAATATTATTTGAAATTTTGAAATTCAAATTTTTAATTGACAAAACAAAGTCACAAGAAAAAACGGCTAAAATAATAGCAGAAAGAACACAATGACATCAGTGGCGAAACTGAGGGGGGGCTGGCTGGGGCCATGGCCCCTCCCAATAAAAACAAATTTTTTTATTACCCCCATATATCATAGCAGATTCAGTGAACAAGCAACAGAGCTTCTCACTTTGTGTACATCTTTGGATCCAAGTGATTCATTCAGTTCATTCAACATTGATAAATTGTGCTCTCTAGCTTCAAAGTTCTATCCTGCTGATTTTTTAGAACAAGAGAGCCAATTTGAGATGTCAATTACGTCACTATGAACTTGATGTACCCACCAATCCTAAATTTCAAAATCTGACATCTGTAGCTGATCTTTGTCGTCGACTTTTGCAAACTATTCGCTTTTATGTAGTGGGCAATGCATGACAAAAAAAGAGAAATTGCTAATTTTTTGAACTGTCAAAAGCCGGCTGGCCCCCTTTGATTTTCTGTCCAGCTCCGCCACTGAATGACATGATAGAGCATGGTCCTAGAAACATTTAGGAAAAAGAATCTTCTAGTTTTAAATTTTTAAATTTTATTTTCGCATACGTCTCCTTAAGATGCCCGTATGGAAAAATTGAATTTTCCATGCGGGCTCTTAAGTAGCCTTTGTAGAAAAATCTATTTTTTCACATGGGCGTGTTAAATAGCCGTATACGAAAATGCCGCTTGATTTTTCCAGACGCAGCAAGTTATGTTCCGTTTTGTAAAAGTTATAGGGTCTTGTATAGAAAAACCGTTTGTGTAGCAGTGGCTGTACTCGTGTTAGAAGCAGCGGTTCGAGCGGACAGCCAGACATGCAGGTCACCTTGATTTTTCTGTTCTGTTGTCCCTTTCAGTGCAGAACTCTTACTATCTAATTTTACAAGGCATGATCTTAAAAAAAATGGTCTACGCATATACACATAATAAATGAGTGAATTTCATAAAACTATACATATTTCTTTTGAAAAAAAAGACAAAATACAGATTTAAGGTGGTGGTGTATCACGAAACTACATACATACATAGTTTACATTGAGTTCATCGTGAAAAGTCGCTGTATATATGGTAAAACTATAGATCGATAGTTAATTTAAGAAAAACCTGAAGTGGAGCTGTTCGGTGGGACTTGTTGCAGCATCCTGGCTGTGCTGTTAATAGGTGATGACTTCAAATGTAAATGTTAAGGTTATCAACTATAAAATTATAAAATTATATATCTTACTTAGCTGTACAATTTTGATATAGAGTTTGTGTCTATTTCAATTCATTTGAAAATTTTAAAGCATTTATCAATTAGATCTGATAACTTGTATCACACATATATATGACCATATAAACTATGTCAAATAAAAAATTGTTCAGCAACCACGTTGTAGATCATGTCAAGAAATATAACTTTGGCAGAAAGTTTATCTTCATCGATTTCATATAAAAATATTATTAATTTCTTAATCATTTTCACTTCGATACGCAGTTAATGGTGGGCCAGACTATGTGGTCCGTTAAGCATAGTGCCAGTTTCTATTATGAACCAGCAGTGATATTTTCAATTCATACCTTCATATCGAGAACCGACAGTGATAGTTGAAGTCGTATCATTACTGTTTATTGTTATGAACATTAGTGTTGGCTCGGAATACCGTTTCTATGTTATAATGAGGACATGCATGTTAGTAGAAAGAAGGAGGTGTAACGGGGTTGATGAGGTGGGAGAAATCAGTACCATTGAGTTGAGACCTAACATCTGGAGAATGTAGAATTAGAAGAGTATTAGACCTATATTTGTAACATTTTGTACAGAGGCTGCCTTAATAAATTGCACAAAAGAAGTTAAACAAAGAAGTTACCCCAATGGCCCATTAGGTTCTATACTAACAGGTGGAGATTAAAACTTTTCTATGCCATTTCTCTTTGGTGCACGCAATAGGTTTCCTAAGTATCGACTGCGGCCTGGAGGCAGATGATAGCTACCCAGACGATCTCACCGGCATCACTTATGTCCCAGACGGCCGTTACACTGACGCCGGCGAGAATCACAAGGTGACCACCATATACCGCGATGCTTGGTGGGGCCCTGACACACGTACTCTCTACACGGTCAGGAGCTTCCCATCTGCCGAGGGTCAGCGCAACTGCTACTCGCTACCCACCGACGTCCGGTCCAAGTACTTGGTCAGGCTGGAGTTCTTGTATGGCAACTACGACGGCTTGGACAGCTCGTCGCTAAAATTCAACCTTACCCTTGGTGTCAAACACTGGGACACTGTGAGTATAGGCACCACCGACGGAAATGATGGTTATAATGTTCACGAAGCGGTGTTCGTGGCATGGGCGAGCTGGGCGCCGGTTTGCCTCATCAACATCGGCCAGGGCACGCCGTTCGTGTCCACGGTGGAGTTGAGGCCTCTCGGTATCTTGCCCTACCCGGCTGTCATGGGGAATGTGTCACTCTCCCTCTATGTTCGGAGCAACTTGGGATCTAGCCCTGATGATGACAATTTAGTAAGGTATATATGTTCTGAATTTACTTGGATCTTGTACATCTTGCAGCTCAGCTAGCCAGTTATACGTGAACCAATATATCACTTGAAGCTGTTTTCTGATTTTATTAATTTAGCTAAACAACGCACTACAAACTGGGGATTACTGCCGGTTCCACACATTAATTACCAGCTATATATGTTTGGGAGACGACCAGCAGCGATACTGAATTTTACAAAAGAAAATAAAATGATTTTAATTCGTACAGACAAAAAAAAACAAATGCACACTGATTCAAAAATAGATTCAACATGAAATTAAAGTATCAGTCCCGTTTTTTCGTGTGAAACTGTAGTTGCACTTCGTTTGAATCATTACATATGTCATCTTGATTTAATAAATCCAATTTTGAAAAATATAAAAAAGTAATAATCTAATACCAAATATCGATTTCTTGTTGCTATGGAGTAATAATTAGTTTTTTATGATTTAATAATTTGAAGTTTAAATTAACACATATTGTGTTGTTCTCGATCGGTTCGGAAGTTCAATTGTCATGTTTGCATGATTTAATAATTGCAGTCTGAATTAGTAAATCTATACTTTCTATATAGATGGTACCCACTAACAATTATTAGAAGCTAAAGCTCAACATGCAAGGATGTCACATCATCACCCACTAGCAATTACTATTTTAGACCATTTAAAATCCCATGCAAGCATGCCACATCTTTACTCACTAGCAATTACTATTCTAGCCTATTAGAATCTCATACAAGCATGACACATCATCTACAATATTATATTATAGAGATCAACAAGTATGTGTCAAATCATCTTCCTCACATTATTTTCTTAACATTTCAACTTTCATCATTTCGACAATATTTAACATATACTAATCCATGAATCCCGCAGCAAAGCGCAGGGAATCACCTAGTATCGCGATGCATTGGTTAATGGCTAGTATTCCTAGTCAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA029929