Difference between revisions of "BGIOSGA030331"
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Revision as of 17:22, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030331 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030331, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1178_D01.11-2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030331-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030331-PA |
| Length |
17522 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:2704064..2721585 |
| Sequence Coding Region |
2704064..2704351,2705310..2705358,2705458..2705659,2707230..2707398,2707608..2707673 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:2704064..2721585 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:2704064..2721585 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGAAGTCCTACGCGTCGGCGAGCTCCGGCGAGCTCGGCGTCGTGGCGGGTGGTGGGGGCAGGTCGGTGCGGGTTATACCACTGCGGCATCCACAGGAGGCGGTCGCTGGGTCCTCGCCGTCGTGGTGGTCCGTGGTGATGGTGAAGGCGCGGGGAATGGGGCCGCGGGATTGGGCGGAGGCGGCTCTGCCCTGCTTGTCGTGGATGCGGACGTACAGGTTGAAGGAGGATCTGCAGGCCGACCTCGCCGCTGGCATCACCGTCGGCGTCATGCTCGTGCCCCAAGCAATGTCATATGCAAAGTTGGCTGGGCTTCACCCAATATATGGGTTATACACAGGCTTTGTCCCGCTATTTGTCTATGCAATTTTTGGCTCATCGAGACAGTTGGCAGTGGGTCCAGTGGCTCTTGTCTCTCTTCTAGTTTCTAATGTCCTCGGTGGTATTGTTGATTCATCTAGTGAGCTGTACACAGAATTAGCCATATTATTGGCATTCATGGTTGGTGTATTAGAATGCTTGATGGGATTGCTAAGGCTCGGTTGGCTTATTCGATTTATTAGCCATTCTGTCATATCTGGCTTTACTACTGCTTCAGCTATTGTAATTGGTCTGTCACAGATCAAGTATTTCTTGGGCTACAGCGTTACGAGAAGCAGCAAAATTATACCACTTATTGAGAGTATAATTGGAGGAATAGATCAGTTCTCCTGGCCACCATTTGTAATGGGATCAAGTTTTTTTGTTATTCTTCTCATAATGAAAAATCTAGGAAAATCGAATAAAAGACTGCGTTTCCTAAGAGCTTCTGGTCCCCTTACAGCAGTTGTGTTTGGAACAATTTTTGTGAAAATTTTCCATCCATCTTCCATATCAGTGGTAGGTGAAATACCGCAAGGTCTTCCCAAATTCTCCATTCCTCGAGGATTTGAGCATCTGATGTCCCTAATGCCAACTGCAGTACTTATTACTGGCGTCGCCATTTTGGAATCTGTTGGTATTGCTAAAGCTTTGGCTGCGAAGAATGGCTATGAGTTGGACCCCAATAAGGAGTTATTTGGGCTTGGTATAGCAAACATATGCGGTTCATTTTTCTCTTCATATCCTGCTACAGGTTCCTTTTCTAGGTCAGCTGTGAATCATGAAAGTGGAGCAAAAACTGGTCTATCTGGAATCATAATGGGCATAATAATTGGTGGTGCTCTCTTGTTTATGACACCCTTGTTTACGGATATACCTCAGTGTGCCTTGGCTGCAATTGTTATTTCTGCAGTCACTAGCCTGGTAGACTACGAGGAGGCTATCTTCTTGTGGAGTATTGATAAGAAGGATTTCTTTCTATGGGCAATCACATTCATTACAACATTAATTTTTGGTATTGAGATTGGTGTTCTTGTTGGGGTCGGATTCTCATTGGCCTTTGTAATCCATGAGTCAGCAAATCCTCATATCGGATATATTGCCGTCGACTTGGGACGGAAACCAGGACTGCACTTTGCAATCCAATCCTCATGGTTGCGTGAATATGAGCTTAATCTCCCAAATTCAAACCGTGGACCTGATGTCGGAAGAGTGTACTTTGTGATCCTCGAGATGTCCCCTGTTACATACATCGATTCAAGTGCTGTTCAGGCTCTCAAGGACTTGTATCAAGAATACAGGGATCGCCATATCCAGATTGCAATAGCGAACCCAAACCGGCAGGTACACCTGCTGCTTTCGAGATCGGGCATCATAGACATGATTGGTACTGGGTGGTGCTTCGTGCGAGTGCACGACGCTGTGCAAGTATGCCTCCAGAAGGTGCAGAGCTCATCATCAAGTTCCATAAAGCTGTCGCCACAGGCATCAGGGGACCTAGCTGACTCCGTTACCACTCCAAAGGTTCAACAGCGGTATAGTTTTCTAAAGAACCTCTGGAAATCACAGCTCTCCGACGACGGTTCCGACAACAGCAGCCGCTGGGCGGAGCCATCGCCGTCGACCTCGCTGGCGGACAGCGGTAGCACCGCGTTCCAGTCCGACCTCTCCGCCGGCTTCAGCGCGCGGCGGCCTGAGCTCCCCGGCGGCTGGCGCGGCGCCGCTGCCCCTATTAACGAATGGGCTGGAGAGCAGGCAGGGACATCGCGCTTGCGGGGCCTGAGACAAGAGATGGGACTGAAACAGTTGTTGCCATCGGATGCGCAAGCAACGACGATCTGTTGTCGAACGTCCCTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEKSYASASSGELGVVAGGGGRSVRVIPLRHPQEAVAGSSPSWWSVVMVKARGMGPRDWAEAALPCLSWMRTYRLKEDLQADLAAGITVGVMLVPQAMSYAKLAGLHPIYGLYTGFVPLFVYAIFGSSRQLAVGPVALVSLLVSNVLGGIVDSSSELYTELAILLAFMVGVLECLMGLLRLGWLIRFISHSVISGFTTASAIVIGLSQIKYFLGYSVTRSSKIIPLIESIIGGIDQFSWPPFVMGSSFFVILLIMKNLGKSNKRLRFLRASGPLTAVVFGTIFVKIFHPSSISVVGEIPQGLPKFSIPRGFEHLMSLMPTAVLITGVAILESVGIAKALAAKNGYELDPNKELFGLGIANICGSFFSSYPATGSFSRSAVNHESGAKTGLSGIIMGIIIGGALLFMTPLFTDIPQCALAAIVISAVTSLVDYEEAIFLWSIDKKDFFLWAITFITTLIFGIEIGVLVGVGFSLAFVIHESANPHIGYIAVDLGRKPGLHFAIQSSWLREYELNLPNSNRGPDVGRVYFVILEMSPVTYIDSSAVQALKDLYQEYRDRHIQIAIANPNRQVHLLLSRSGIIDMIGTGWCFVRVHDAVQVCLQKVQSSSSSSIKLSPQASGDLADSVTTPKVQQRYSFLKNLWKSQLSDDGSDNSSRWAEPSPSTSLADSGSTAFQSDLSAGFSARRPELPGGWRGAAAPINEWAGEQAGTSRLRGLRQEMGLKQLLPSDAQATTICCRTSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..288#1247..1295#1395..1596#3167..3335#3545..3610#3731..3838#4928..5035#5114..5179#9207..9267#9395..9522#10520..10561#10877..10993#11083..11134#12065..12125#12958..13043#13196..13272#13369..13620#17232..17522#ATGGAGAAGTCCTACGCGTCGGCGAGCTCCGGCGAGCTCGGCGTCGTGGCGGGTGGTGGGGGCAGGTCGGTGCGGGTTATACCACTGCGGCATCCACAGGAGGCGGTCGCTGGGTCCTCGCCGTCGTGGTGGTCCGTGGTGATGGTGAAGGCGCGGGGAATGGGGCCGCGGGATTGGGCGGAGGCGGCTCTGCCCTGCTTGTCGTGGATGCGGACGTACAGGTTGAAGGAGGATCTGCAGGCCGACCTCGCCGCTGGCATCACCGTCGGCGTCATGCTCGTGCCCCAAGTACATTCTTTACCCTCGTGATTCGCAACATTTCGTATTGCTATGCACGGCTTCAACTGTTCCTAATCCTGGTTATCAAACGGGAAAGATATGGTTATATTTGTTAATTACAAAACTCATTGCCTCGAAACATGATGTAGAATGTCCTTGTAATTACCTGATTTTTTGGCTACTGATTGAACATGTTAATCTCCAGGTTATTCTCTTGCTTGTCTAGTTAGTTTGTCATCATATCGCCAGGAACAATTACATAATTGTTTTTTGAAGTTATTACAGTTTACTGCTTGGTGGTCGCTAGTTCTAAGATCTAATTATGTCAACTGTAGTATGACTGGATTATTGAAGTATAGAATGGATGAGTGCCAATTCGTCTCCTAAAAATGGTCTATTGCACACGGCGCTATTATTTAGTGGATCCAACCATCTTTTCATGCTGGCCCGGAATAAGATAATCCCAATTTCCATATATGGAGTTATTTTCAGCAATGCATTCAGCTATAGATGGAAAGCTCTATCGAACATGTAGCTTGCTTACATATCATTCGGCTACCCCTTCTGTTAACACCATTGCAAATTGCAGTTTGAGGACTTAGGTTGGTTTGCCTTCTGACAAATACTGAATTTTCTGGACATCTTTTCTGGTGTTTCTGCTTAATAAGTTGCAAACTGGTGTATATCCTTCACATAGGCTGAATTTGCCAAATGGAGAACATAAATTAGCCTTATTTTGGGACGCATTTGTTCAACAATTTCATTTCTATTCATGAACTTTGGTGCATGAGAATGTCAACATCTTTGACAGTTGACACTTGATAGTCCAGTCATCTGAATTTTATCTTAAGTCTGTCGAAACTTTTTAAAAGTCTTCCGATACAAATATGCAATGGTCAAAGTCCTGAAAATAATAACCAAAAAAATGCCAGAAATGAAAATATTAATAATTAGCATTGTATTGTAGGCAATGTCATATGCAAAGTTGGCTGGGCTTCACCCAATATATGGGTTATGTAAGTATTTATATCTTTTGCAACTCCTGTCTTTGTAGTTTTTTATATTTGTATGTCTTTGAGCTTAATCGTTAGTATGCTATTTCCATGGCTGAACAGACACAGGCTTTGTCCCGCTATTTGTCTATGCAATTTTTGGCTCATCGAGACAGTTGGCAGTGGGTCCAGTGGCTCTTGTCTCTCTTCTAGTTTCTAATGTCCTCGGTGGTATTGTTGATTCATCTAGTGAGCTGTACACAGAATTAGCCATATTATTGGCATTCATGGTTGGTGTATTAGAATGCTTGATGGGATTGCTAAGGTAATTCTATTCTACTCTGGGTAGCTGGTGTTCTTTTTTAAGTCATTTTACAGTAGATAAGACATAATTTAAGAAGTATGGACACATCTACACATATTCCTTTGGAATTTTACACTTATGAATATTCAAGACAAATGCTTTATTGTCTCAGCATTATAGCTATGACTATAGCTTAAAATTTTGGACCACCAGCCGCATATCCTTATGCTTTTCACCATGTTCTGATGATATATCCTTTACAAGATTTTTTACTAAAGCTATAGCTATAACTTGTTATCCCATATGTTCATGGAAAGTGATCATGAAGTTCATGTAGAGGGCAACAGTATATAGGTCCTGCTACTTTTAGAGTGATACTAGGATCATTTCATGGGTACAAAGGTGTTCTGCTCTTGTGGGGCTCTGTTTTTTTGGGGCTCACATAAACAAATTTGTTGTCTAACAGTCATGTGTGCCAATACAAAAGCAGCAAACGTTCATAGGAAAAGCTGATATATCACAACCAGATATTTTTGAGGATTTCATGACTATTTCATGATGCACTGAACAACTGTCGTGTCCTTATGTTATGCACACATGCTAATTCTGTGGCCCAATTCATCGCTGTTGTAGTGCACCGAAAAACATTACCATGTATGTATTTCTTGTATTTTATATTCTCAAGAAAATGATTGGATTGAACATTAAAAGTTTGTGCGTATGCATCTATAGATTCTATACTTCCTAAAATGAAGGCACTGGCACCACCATTACCTCATCAATTTCATTTTCTGCAAATTGCTCCCTGGATTCATTATGATTACACACTGGACTTTCCATATGTTGTTTTTTTTTTCTTATTTGTCCTTCAAGATCATAATTTAATACAAAAAGGTCTAAGATGATTGAATTGTTGTGTATATACTAGTAATATGCCCATACTAAACGCTACGGTGTAATTCTATTTGTCTTTAACAACGTTTAAAATTTCATCTGTATATATGTAGTGTGTGAATGAATTTTCAAAAATGTATGTGAACATTTAGCGAACCTATATACATTTAGCTAGTACCGTTATTTTTCTCAAATACGCAAGAGAATTGTGTATCACTGCATTAGATTTAAATATTTAAGACACCCACTGCTGTGGTGATGGAAAAGGAAAGGAAAATAACACCAAAATCCTCCAAAACCAAGAGGACGTGACCAAAAACACCAAAAAAATTCAGTAATAATCTTTAGCCACCATTCACAAAAACACCAAGGAGAAATGATCTTTAGCCACCATTCACAAAAACAACCATCCTCTGGTTGTGGTGAAAGATCTGTCCGACCAAGCCGATGAAAGAGGAGATACTAAACTTGTCGTGAGAAGATACAACCTATCAAAATATGTTGAATGGTTTCCTCCTCTTGGTCACATAGCGGACAGGTACTTGGATGGGGCATTAGCTAGTAACATATTCATGCTCTTCCATGTTTGCACACTTCAAACTATCTTCTAAGTTTTAGGGGGCAAAACCAAAATCATTTAGATATGCTTAATTTTTACTATAGTTATGTTGCCAATGATATGTGTTCTTATTTACAGGCTCGGTTGGCTTATTCGATTTATTAGCCATTCTGTCATATCTGGCTTTACTACTGCTTCAGCTATTGTAATTGGTCTGTCACAGATCAAGTATTTCTTGGGCTACAGCGTTACGAGAAGCAGCAAAATTATACCACTTATTGAGAGTATAATTGGAGGAATAGATCAGGTGGGCTTTGCTGTATCTGTACGATCAGCTTATAGACTGTTTATTTTCCCATTTAAATTTTTCTATGCACAGTGCATGTTCCAATGTAATCCAATTCTTCAGGTAAAAAGCATACATAATTTGAAATGTTTCTGTCAGATCATAATACGCTTTTTGGTATTTGAACTACATATTTTTCACTAACTTAATATAGCAGTTCCATTTTGCAGTTCTCCTGGCCACCATTTGTAATGGGATCAAGTTTTTTTGTTATTCTTCTCATAATGAAAAATCTAGTGAGTTTTTAATTTCTTTCTTTATCAGTATGGTTCTTCTGTTATTTTTTTTTCTGGAAACATTACAATCAAGGGGAGACTTCTATTTTTTTTTACCTTGAGAAGCGAAACTTTTTTCAGGGAAAATCGAATAAAAGACTGCGTTTCCTAAGAGCTTCTGGTCCCCTTACAGCAGTTGTGTTTGGAACAATTTTTGTGAAAATTTTCCATCCATCTTCCATATCAGTGGTAAGAAACACCTACATTATTCTTTATATTTCTTACTCTTAGATGTTACAAAATATGAGCAATGGAAGTACTTTATAATAAGAAATTTACTCTGATCACAACATTATCTACTTCTATGAATTTATGTCTATGAAGTGGGTTATTATACTACACTTACCAATCTTTTCTCCCTTATCCCTTAGAATATTATTTACACTAAAAAGTTGTGGTTGCTTTTTCCAATGGAATTACTTGATTCGTTGTTATTGAATGAACAAGTATAAGTAAATCTTATTAATTGTGGTACAATAGTCTCTTAGCTATGGTTCTCTAGTTTAGAGCTTTACTTTGTTCGTAAATTGAATTGTTATAGACATTCATTCATGGATAAGGTATTGTCCGAAGATCGGGATAAAGGCGGGATCTCTCTTGTCAGCACCGAGCTTGTCCCAGTTGTCCATAGACTCTTATCAAGCTAGACCTAGCTTTATGATTATTTATTGCTTAATTGGTAGTGGGTTACATGGGACCTTTTTATAAGGAGGGTTTCTGAGCTACAGTAGCATGGGTACTATTCACGTGAATCCGTGAGCAGCTTACCCCCTAATAATACAATCTCTACATCCTTAACAAACCATTTCTTTAGTTGCTAACCAAACGGATATGTTCCTAATTAATCGAACTCATACCAATCAACGAAACTAACGATATGTCTTGGGAATAACTATGCAATAGGTATTATTATTCTTCGTTATAAAAAAGTAGATACTATTATTCTTGAAGGTAAACTCCTAAGCATATTACTGCAGTTCATGGTAGTGTTTGCTACATTATCAACACCCACAAAAGAATGTTTTTCATTATCATTTGACTCTTTTTTTTTGTTATATGATGCATTGATGCTTCTTATATTCAAATGTGCGTATAAGATATATTTTAGTTGTTCTTTGTATTTAGTT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