Difference between revisions of "BGIOSGA030402"
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Revision as of 17:23, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030402 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030402, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_30620 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030402-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030402-PA |
| Length |
13962 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4514398..4528359 |
| Sequence Coding Region |
4514398..4514688,4515497..4515733,4515984..4516061,4516385..4516561,4517156..4517293 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:4514398..4528359 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:4514398..4528359 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGGATTCGGCGGGACGTGCAGGGTGGCAGCGGTGCTCGTCTTCACCGCCTGGATCGCGCTCACGGCGCTCACCCGGCTGCTCCGCCCCGTCCCCAACGGCTGCGTCATGACCTACATGTACCCGACCTACATCCCCGTCTCCACCCCCAAGAACGTCTCCTCCGACAGGTACGCCCTCTTCCTCTACCACGAGGGCTGGAAGCAGATCGACTTCCACCACCACCTCAGCAACCTCAACGGTGTCCCGGTTCTCTTCATCCCAGGCAATGGCGGCAGCTACAAGCAGGTCCGATCTCTGGCTGCTGAATCCTTTCGAGCATACCAAAATGGTCCACTTGAGCCTACCTTTTATCGGGAAGCATCTACTGCATTTTCAGTAAATGAACTGGAGGGTTTTTCAATCCCATCAAGATATGGCCGTATGTTGGATTGGTTTGCTGTTGACCTTGAAGGAGAACACTCTGCAATGGATGGACGCATACTTGAGGAGCATACTGAATATGTTGTTTACGCCATTCACAGGATCCTTGATCAATACAAAGAATCTCATTTAGCACGATCAAAGGGTCGTGCTCAATCCTCTGACAACTTGCCATCCAGTAATGATTGCCTGTCCAGGTACCCTCCCATTGCTCTGCAGCCATCTCTGGGTCAGTTTTTTTTGCGTGTCAATGAAGAATGGAGAAATGGATACAAGACAGGGTTATCACGCACCAGCAGTGCAAAACTCTCAAATGTTGTTGTTGTCTCTGTAGCTGGAGGCATCCATGATTATCAGGTTAGGTCAAAGTTAGCTTCGCTGGATGGAATTGTACCTTCTACTCATGGTTTTATGGTAGGGAGCTCAAGCATGAAGAATGTTTGGTTATCCATGGAACATCAGTCTATCCTCTGGTGCAATCAGTTAGTTGTACAGGTTGCACACACACTTCTTAGTATGGTAGATCCTTTGAATGGACAGCCATTTTTGAGTTCACAAAAAAGACTTTTTGTATTTGCAAAAATGCTCCAAAGTGCAGTTCCGCAGTCTTTGAGTTGGGTGGCTCCTGTTTCAGGTGTTAAGCCTCCAAATCTGATTGCAAGTGGTAACAAGGAAGCTAGTGACTTGCAGCAAAAGGATTCACTTTCTTGCCCTCCATCTCTTCAATGGACAAGTGATGGCCTTGAAAAGGACCTGCATATTCAGTTAAATTCAGTTACTGTTTTAGCAATGGATGGCAAGAGAAGATGGTTAGATATTAAAAAACTGGGATCAAATGGCAAAGGGCACTTTGTTTTTGTAAGTAATCTTTCTCCATGTTCTGGGGTGAGGATTCATTTGTGGCCAGAAAAGGATCATTCATCTGAACAAAATGGAGTACCTGCCAGCAAAAAGATAGTGGAAGTTACATCAAAGATGGTCCAAATACCTGCAGGACCTGCACCAAAACAGGTTGAACCTGGGAGTCAAACCGAGCAACCACCTCCTACTGCATTTCTTCTGCTTAGTCCAGAAGAAATGAGTGGTTTCCGCTTCATGACTATCTCAGTGGCACCTCGACCGACAATTTCAGGTAGACCACCTCCAGCGGCATCTATGGCAGTAGGACAGTTCTTTAATCCAGAGGAAGGGACGAGTGCACTTTCTGCTGCCCGAATTATTGGCTCCAGCTATATTCCTGAAGAAATATTTTTGAAGGAGGACCACCCACTGGCTTTAAACTTGTCGTTTTCTGTGAGCCTTGGTCTTCTACCAGTTATATTATCTTTGAGAACTGCTGGATGTGGAGTAAAAGCTACTGGCGACCAATTGGAAGCTGAGAAAAATAAACTTTGTAAACTGCGGTGCTTCCCACCTGTTGCTTTGGCTTGGGACCCTGTATCAGGTCTGCACATTATTCCAAATATTTACTCTGAGACTCTAGTGGTTGATTCTTCACCTGCCCTTTGGGATTCACATCAAGGGACTGAAAGATCTACTGTGCTTGTCCTGGCTGATCCACATTGCTCATATGAAGTGAGTCTTCGTGTTTCACTTAGTGCTGCAGCAAGCAGATTCTTTTTGCTGTACTCATCACAGATTCTTGGTTTCATGATTGCTGTAATGTTTTTCGGCCTGATGCGGCAATCATCAGCATGGGAACATGATTCTTCTGTGCCGTCTGTTTTGTCAGCTATAGAGTCTAATCTGAGGCTGCCTAGAGCATTCATGTTCCTTTGCTTCATACCAGTTCTTCTTTTTCTTGCCTTTCTTGTTTTCACCAGAGAGCAAAATCCTCCACTTGGAACCTTCCTGCTAGTTACCATGATGTGCTACATAGTTGCTAATGGCTTCACAATTTTATTGATACTAAGTTCAAAATTGATTCTTTATGTCGCTGCTATTCTTCATGTCTTCATCAAGAGGCGCTGGCAATCATGGGAGGATGGTACTCAATCAATGATTGTTCGCCACTTCCTCACTCTCTCATTACCATTTCAGTCGCTAAAGATAATTAAAAACAATCCAAGTATAATTGTAGCATTTGCTACAATACCACTTGTCTGCTTAGTTCATCCAGCAATTGGTCTTGGTGTATTACTTCTCTCACATGCCTTCCATGCACACTCCACCCTTTGCAGTTTCTTAGCAGCTTCATTTCGCAGTATCACTCAGAAAAAGGATTTGTATAAATCCATGGGTGATAATATTATTCTGCCCGAAAATAAACAAGATGGCCTCGAGCAACTTCTGCCGATGGATGATAGCCCAACATCTGTTAAAAGTTTTACTGACTGCCAATTGGAAGTATTTGACTGTCGGCATGGGATCATGATCTTGCACCTTCTTGCCACTCTAATGTTTGCACCTTCTCTTGTTGCTTGGCTACAGAGAATCGGAATGGGTCAAAATTTTCCATGGTTTGTGGATTCAGTACTTTGTGTTGGCACTATTCTGCATGGACTTTTCGGATCACCACCAAATGTGAGCTGTATATCTTTCAAGCTACCTGGAAGGAGAGGGCGAGATGTTGGACTAAGCTTTCTCTACCTTGTAGCTGGATATTATTCATTTGTTAGCTCAATGGCTCTGGCTCCTTATAGGGCGCTCTATGCATTGGCAATCATCGGTTTCATCTGCTTTGCTTCCAGAATTATTGAAACAAGAAGTACGCGCCACCGCGCCCACCGCCGCCAGGGACGGGCCGGCTGCAGCACCGCCGCTGGGGACGGACCGGAGGCGGGGACAGTGATGGTTTGCACAGGGGAGGAGGAAGCAGCGGAGGAGGTGACGGCAAAGTCGGAGACGGTGCCGTTGCATGAGGCGAAGGAGGGGAGCTGCACGGCCATCATGGCGATGGCTGGCGCCTGCGGCCGGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGFGGTCRVAAVLVFTAWIALTALTRLLRPVPNGCVMTYMYPTYIPVSTPKNVSSDRYALFLYHEGWKQIDFHHHLSNLNGVPVLFIPGNGGSYKQVRSLAAESFRAYQNGPLEPTFYREASTAFSVNELEGFSIPSRYGRMLDWFAVDLEGEHSAMDGRILEEHTEYVVYAIHRILDQYKESHLARSKGRAQSSDNLPSSNDCLSRYPPIALQPSLGQFFLRVNEEWRNGYKTGLSRTSSAKLSNVVVVSVAGGIHDYQVRSKLASLDGIVPSTHGFMVGSSSMKNVWLSMEHQSILWCNQLVVQVAHTLLSMVDPLNGQPFLSSQKRLFVFAKMLQSAVPQSLSWVAPVSGVKPPNLIASGNKEASDLQQKDSLSCPPSLQWTSDGLEKDLHIQLNSVTVLAMDGKRRWLDIKKLGSNGKGHFVFVSNLSPCSGVRIHLWPEKDHSSEQNGVPASKKIVEVTSKMVQIPAGPAPKQVEPGSQTEQPPPTAFLLLSPEEMSGFRFMTISVAPRPTISGRPPPAASMAVGQFFNPEEGTSALSAARIIGSSYIPEEIFLKEDHPLALNLSFSVSLGLLPVILSLRTAGCGVKATGDQLEAEKNKLCKLRCFPPVALAWDPVSGLHIIPNIYSETLVVDSSPALWDSHQGTERSTVLVLADPHCSYEVSLRVSLSAAASRFFLLYSSQILGFMIAVMFFGLMRQSSAWEHDSSVPSVLSAIESNLRLPRAFMFLCFIPVLLFLAFLVFTREQNPPLGTFLLVTMMCYIVANGFTILLILSSKLILYVAAILHVFIKRRWQSWEDGTQSMIVRHFLTLSLPFQSLKIIKNNPSIIVAFATIPLVCLVHPAIGLGVLLLSHAFHAHSTLCSFLAASFRSITQKKDLYKSMGDNIILPENKQDGLEQLLPMDDSPTSVKSFTDCQLEVFDCRHGIMILHLLATLMFAPSLVAWLQRIGMGQNFPWFVDSVLCVGTILHGLFGSPPNVSCISFKLPGRRGRDVGLSFLYLVAGYYSFVSSMALAPYRALYALAIIGFICFASRIIETRSTRHRAHRRQGRAGCSTAAGDGPEAGTVMVCTGEEEAAEEVTAKSETVPLHEAKEGSCTAIMAMAGACGR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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