Difference between revisions of "BGIOSGA030734"
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Revision as of 17:24, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030734 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030734, complete gene. |
| LocusTag |
P0465E03.10 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030734-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030734-PA |
| Length |
11667 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:12949508..12961174 |
| Sequence Coding Region |
12949508..12949652,12950508..12950617,12950924..12951089,12951230..12951330,12951450..12951522 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:12949508..12961174 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:12949508..12961174 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGTGGGCGACGGTGCAGCACCTGGATCTCCGCCACGCGGGGGGCCGCCGGGGGGCCTCCGCCCGCCCGCTGCAGCCGCACGCTGCCGCCTTCCGCGCGTCGCAGGCCATCGTCGCCGTCGCCATCGGCACGCACGTCGTCGAATTTGATGCATTGACTGGAAGCAAGATAGCTTCGATTGACCTTGGAGCTCGTGTTGTTCGTATGGCATATAGCCCTACTGCTAGCCACATTGTCATTGCTATTCTTGAGGATGCTACAATCAGATCCTGTGATTTTGCCACTGAGCAGACGCTTGTGCTGCACTCACCAGAGAAAAAAACCGATCATGTTTCAATAGACACGGAAGTTCATCTTGCATTGACACCTCTTGAGCCTATTGTATTTTTCGGTTTTCACAAAAGAATGAGTGTGACAGTTGTTGGGACTGTTGAAGGAGGGAGGCCGCCAACAAAAATAAAGACTGATCTTAAAAAGCCTGTTGTTAACCTGGCTTGCCATCCTCGCCTTCCTGTCCTGTATGTAGCTTACGCTGAAGGATTGATACGCGCTTATAACATCCAGACATATGTTGTTCACTACACCTTGCAACTTGCTGTTGACAGTACAATTAAGCTTGTCGGAGCGGGTGCTTTTGGATTTCATCCAACCCTAGAGTGGATATTTATTGGTGATAGAGGTGGCACTCTCTTGGCATGGGATGTATCGACGGAGAGACCAAGTATGATTGGAATTACACAGGCTGGTTCCCAGCCTATCACATCTGTTTCCTGGCTTCCGACACTACGGTTACTTGTTACAATTTCAAAGGATGGGGCACTTCAAGTATGGAAAACACGAGTTATAATTAATCCTAACAGACAACCTATGGAAACTCATTTCTTTGAGCATGCAGCTATTGAAACAATGGATATCACGAAGATACTCACTCTTCAAGGTGGAGAAGCAGTGTACCCTTTACCTCGAATAAGAAACTTGGCAGTGCACCCCAAGTTTAATTTGGCTGCAGATATGTCTGGGACAGAAGCTGCAAAGAACAAGGCTGCATACACAAGAGAAGGGAGGAGACAACTTTTTGCTGTTCTTCAGGGAGCCAGGGGATCGACTGCTGCTGTTCTGAAGGAGAAACTTTTAGCCCTGGGTTCATCTGGAATTTTAGCTGAGCACCAGCTCCAGGCTCAGCTGCAAGAGCAGCACTTGAAGGGCCAGAGTCAGCTAACTATTTCAGACATTGCAAGGAAGGCTTTTCTTCACAGTCATTTCATGGAGGGACATGCTAAAAGTGGTCCAATCTCTCGTTTACCACTCATTACAATTTCTGATTCTGGTAACCTTTTGCGAGATGTTCCGGTTTGTCAGCCATTCCATCTGGAGCTGAATTTCTTCAACCAGGAGAACCGCGTGGTTCAATATCCAGTTAGAGCTTTCTATTTGGATGGATTTAACCTAATGGCCCACAATCTGTCATCAGGAGCTGATAATCTCTATAAGAAACTTTACTCAACGATACCTTCAAATATGGAATGCCACCCCAAGAACATTGTATACAGTCCTAAACAGCATATGTTTCTTGTTGTATTTGAATTAAGTGGACCAAATGGAGTAGCTCATGAAGTTGTTCTTTACTGGGAGCAGACTGATCTACAGACAGTAAACAGCAAAGGAAGTTCAATAAAAGGTCGAGATGCTGCATTTTTAGGCCCGGATGATAATCAATACGCTATCCTGGAGGAAGATAGAACTAGTCTGAATCTTTTTAATCTCAAAGCAGTAGCCACAAAGGAAGCTCTTGAAAATAATGCTGCAGTGCTTGAAGAAAACACATTTGCTGATAATGTTACCAATCCGACAGAGCGCCAGGGTCCTATGCAGTTTACTTTTGAATCAGAGGTTGATCGCATATTTTCTGCTCCACTAGAATCAACCATGTTGTATGTAATTTCGGGAAAGCACATTGGACTGGCGAAGCTCCTACAGGGATATAGGTTATCTGCAGATAATGGGGTATCCATCACCACGAAAACGGAGGGGAAGAAATTTATCAAATTGAAACCAAACGAGTCCGTTCTCCAGGTTCACTGGCAAACAACTCTAAGAGGTCCTGTTGTAGGAATATTGACAACCCAGAGGGTAATGATAGCCTCTGCTGATCTTGACATACTTTCAAGCAGCTCAACAAAATATGACCGGGGTCTTCCATCATATCGCTCAATGTTGTGGGTTGGACCAGCACTTATCTTCTCTAGTGCAACTGCAATAAGTATGCTTGGATGGGACAACAAAGTTCGATCTATCCTTTCTACTAGCTTCCCTCGTTCTGTGTTGCTTGGTGCCTTGAACGACCGCCTGCTGCTTGTAAATCCAACAGATATAAATCCAAGACAGAAAAAGGGAGTGGAAATAAGAAGCTGTCTAATAGGGCTTCTTGAACCTCTTCTTATTGGATTTGCTACGATGCAGCAATACTTTGAGCAAAAACTTGATCTTTCAGAGGTGCTATATCAGATAACCTCAAGGTTTGATAGTTTACGTGTCACTCCAAGGTCACTGGACATATTAGCTAAAGGACCCCCTGTTTGTGGAGATCTTGCTGTATCACTATCCCAAGCAGGCCCTCAGTTTACCCAAATCATGCGGTGCAATTACGCAATCAAAGCCCTCCGGTTCTCTACTGCTCTTTCGATCTTGAAAGATGAGTTCCTGCGTTCCAGAGATTATCCTCAATGCCCTCCAACTTCTCATCTGTTCCAGCGTTTCCGGGAGTTGGGATATGCATGCATAAAGTATGGTCAGTTTGACAGTGCAAAAGAAACATTCGAGGTTATTTCTGATCATGAGAGCATGCTAGATCTGTTTATATGCCACCTGAATCCTAGTGCATTGCGACGCCTTTCACAGAAGCTGGAAGAATCTGCTACAGATTCTGAGTTGAGGCGTTACCTTGAGAGAATACTAAGAGTTCGTTCAACTGGATGGACACAAGGTGTCTTTGCAAATTTTGCTGCAGAAAGTATGGTGCCTAAAGGTCCGGAATGGGCAGGAGGAAACTGGGAAATCAAAACACCTACGAACATGAAGAGTATACCTCAGTGGGAGCTTGCAGGAGAGGTCATGCCCTACATGAAGACTACCGATGCTGGTATTCCATCTGTCACTGCAGATCATATTGGTGTTTACTTGGGCGTGATGAAAGGCCGAGGTACTGTAGTGGAAGTAAGTGAAAAGAGCTTGGTTAAAGCTATTGCAGCAGCCAGTGGCGATAATGCGAGACCAGCATCTTCTGAATCAACACAGAAGAATGTGGCAAATGCTGGGGGTGATTCAGTTGGTGATACTCTGGCCAGGCAGCTAGGGGTCCAAATTGCTTCTGCAGATGAACAGGCAAAAGCAGCAGAGGAGTTCAAAAAGACTTTATATGGTGTTGTTGATGGTGGAAGTAGTGATGAAGATGAGTCTACATCAAAGACTAAAAAGATACACATCAGGATACGTGATAAGCCTGCTGCATCTACTGTTGATGTTAACAAACTGAAAGAAGCCACTAAACAGCTAGGTTTAGGTCCTCCAATCACTAGGACAAGATCGTTATCAGGGACGCCTCAAGAGTTGAACCAGGCTCCTATGCAGCCGCCAGGTCTCGCACCACCTGCTGGTCCAGCAATTCCAAATGCTGCAGTTGATCTATTTGGTACCAATGCTTTAGTAGAACCACAAGCTTCCAGTGGAGCCACAGGTCCTGTAATTGGTGGCATGGGAGTGACGGCTGGACCTATTCCTGAGGATTTCTTCCAGAATACTATTCCATCGCAGCAGCTTGCAGCTCGACTACCCCCACCGGGAATAATTCTGTCACGAATTGCTCAACCTGCTCCTGGAATGAGTGCAGTTCGGCCTGTCCATAATCAAAACATGATGGCTAATGTTGGTCTTCCAGATGGTGGGGTCCCACCACAGGCACCGATGCAACAGGCACAGTTTCCTCAGCAACCAGGCATGCCTATGGACCCTATTAGTCTACCTGATGGTGGTGTTCCCCCACAGAGCCAACCTCTTCCCTCACAACCCCAGGCTCTTCCTCCACAGCCACATGGCTTTCAACCTGCTATTCCTGCCATGTCGCAACCAATTGATCTTAGTGCTCTTGAAGGTCCAGGACAGGGAAAGCAGGCTCCTCGCCCCCCTGCACCTACTGCTGTGCGGCCTGGACAGGTTCCACGTGGTGCTCCTGCAGCAGAGTGCTACAAGATGGGTCTTGCTCATCTTGAGCAAAATCAGCTTACGGATGCTTTATCTTGTTTGGATGAAGCATTCTTGGCCCTTGCAAAGGACCAGTCACGTGAAGCTGATATCAAAGCGCAGGCCACTATTTGTGCACAGTATAAGATAGCTGTTGCTTTGCTACAGGAAATTGCTCGCCTACAAAGGGTTCAAGGAGCTGGTGCGCTCAGTGCAAAGGAGGAAATGGCCAGGCTATCTCGCCACCTTGCTTCCTTACCTATCCAAGCTAAGCACCGGATTAACTGCATCAGAACTGCCATCAAGCGAAACATGGAGGTCCAGAACTTTGCCTATGCCAAGCAAATGCTCGATCTCCTATATTCCAAGGCGCCCCCATCGAAGCAGGATGAGCTCAAGAGTCTGATCGACATGTGTGTCCAGAGGGGGCTGACAAACAAATCTATCGACCCATTCGAAGACCCCTCTCAGTTCTGCGCCGTCACCCTCAGCCGCCTCTCAACCATCGGTCATGATGTTTGCGATCTCTGTGGTGCCAAATTCTCCGCTCTTTCTGCACCAGGGTGTGTCATCTGTGGTATGGGGAGCATCAAGAGATCTGACGCACTTGCTGGACCTGTGCCTTCCCCGTTTGGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEWATVQHLDLRHAGGRRGASARPLQPHAAAFRASQAIVAVAIGTHVVEFDALTGSKIASIDLGARVVRMAYSPTASHIVIAILEDATIRSCDFATEQTLVLHSPEKKTDHVSIDTEVHLALTPLEPIVFFGFHKRMSVTVVGTVEGGRPPTKIKTDLKKPVVNLACHPRLPVLYVAYAEGLIRAYNIQTYVVHYTLQLAVDSTIKLVGAGAFGFHPTLEWIFIGDRGGTLLAWDVSTERPSMIGITQAGSQPITSVSWLPTLRLLVTISKDGALQVWKTRVIINPNRQPMETHFFEHAAIETMDITKILTLQGGEAVYPLPRIRNLAVHPKFNLAADMSGTEAAKNKAAYTREGRRQLFAVLQGARGSTAAVLKEKLLALGSSGILAEHQLQAQLQEQHLKGQSQLTISDIARKAFLHSHFMEGHAKSGPISRLPLITISDSGNLLRDVPVCQPFHLELNFFNQENRVVQYPVRAFYLDGFNLMAHNLSSGADNLYKKLYSTIPSNMECHPKNIVYSPKQHMFLVVFELSGPNGVAHEVVLYWEQTDLQTVNSKGSSIKGRDAAFLGPDDNQYAILEEDRTSLNLFNLKAVATKEALENNAAVLEENTFADNVTNPTERQGPMQFTFESEVDRIFSAPLESTMLYVISGKHIGLAKLLQGYRLSADNGVSITTKTEGKKFIKLKPNESVLQVHWQTTLRGPVVGILTTQRVMIASADLDILSSSSTKYDRGLPSYRSMLWVGPALIFSSATAISMLGWDNKVRSILSTSFPRSVLLGALNDRLLLVNPTDINPRQKKGVEIRSCLIGLLEPLLIGFATMQQYFEQKLDLSEVLYQITSRFDSLRVTPRSLDILAKGPPVCGDLAVSLSQAGPQFTQIMRCNYAIKALRFSTALSILKDEFLRSRDYPQCPPTSHLFQRFRELGYACIKYGQFDSAKETFEVISDHESMLDLFICHLNPSALRRLSQKLEESATDSELRRYLERILRVRSTGWTQGVFANFAAESMVPKGPEWAGGNWEIKTPTNMKSIPQWELAGEVMPYMKTTDAGIPSVTADHIGVYLGVMKGRGTVVEVSEKSLVKAIAAASGDNARPASSESTQKNVANAGGDSVGDTLARQLGVQIASADEQAKAAEEFKKTLYGVVDGGSSDEDESTSKTKKIHIRIRDKPAASTVDVNKLKEATKQLGLGPPITRTRSLSGTPQELNQAPMQPPGLAPPAGPAIPNAAVDLFGTNALVEPQASSGATGPVIGGMGVTAGPIPEDFFQNTIPSQQLAARLPPPGIILSRIAQPAPGMSAVRPVHNQNMMANVGLPDGGVPPQAPMQQAQFPQQPGMPMDPISLPDGGVPPQSQPLPSQPQALPPQPHGFQPAIPAMSQPIDLSALEGPGQGKQAPRPPAPTAVRPGQVPRGAPAAECYKMGLAHLEQNQLTDALSCLDEAFLALAKDQSREADIKAQATICAQYKIAVALLQEIARLQRVQGAGALSAKEEMARLSRHLASLPIQAKHRINCIRTAIKRNMEVQNFAYAKQMLDLLYSKAPPSKQDELKSLIDMCVQRGLTNKSIDPFEDPSQFCAVTLSRLSTIGHDVCDLCGAKFSALSAPGCVICGMGSIKRSDALAGPVPSPFG</aaseq> |
| Gene Sequence |
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