Difference between revisions of "BGIOSGA030915"
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Revision as of 17:25, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030915 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030915, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0054F02.17-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030915-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030915-PA |
| Length |
11063 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:16048500..16059562 |
| Sequence Coding Region |
16048500..16048554,16049517..16049690,16050536..16050717,16051153..16051258,16051549..16051625 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:16048500..16059562 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:16048500..16059562 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGCTGAAGCCCGGGATGTCGGCCCTCGTCACGGGCGGCGGCTCCGGCATCGGGAAAGCACTTTGCATTGCTCTTGCACAGAAGGGTCTATTTGTGACAGTTGTTGATTTCTCTGAAGAAAATGGAAGAGAAGCCGCTTCATTAGTTCAAAATGAAAATAAAAAGTTTCACGGAGATCTTAAAGTTCCAAGTGTTATGTTTATTAAATGTGATGTTACTAATGCAGGTGATCTTTCTGCTGCCTTTGGAAAACATGTGGACACATATGGTGGACTAGATATTTGCATCAATTGTGCTGGAATTGCCATCAAGACACTAGTTTATGATGATAGATCTGATGGAACTAGCACATGGAGGCATGCTGTAAATGTGAACCTTGTTGCTGTTATTGATGGTACTCGCATTGCAAGTCAAATTATGCGATCTGGGAAGAAGCCTGGTGTCATAATAAATATTGGTTCAGCCGCAGGCCTTTATCCTATGAACTTTGATCCCATATATAGTGGAACAAAAGCTGGCGTTGTTATGTTTACAAGATCACTTGCTCCATTGAAACGCCATGGTATACGTGTCAATGTACTCTGCCCTGAGTTTGTTCAAACTAATATGGCAGAGCAACTAAGTCGTCGAATAATAGATGTAACTGGTGGATATATAAAGATGGAAGACATTGTTAATGGTACATTTGAACTTATAAAAGATGAAAGCAAGGCTGGTGCTTGCCTTTGGATAACTAAACGAAGAGGGATGGAGTACTGGCCAACACCAGAGGAACAAAGAAAGTATATGCTCAATCTTCCCAAGTCAAAAAGGATGTTAACACAAAATACCTTTTCGACTGTCCAAACTCCTGAGTTCTATGAGAAGATAGTTGTTCACACACTTAGCCATAATTTTCGCGATGCTACAAGACTTGAACGTGTGCGCTTGAGATTGCCGGTTGAACCACACAATGCTCTGGTCAAAATAATATACGCTGGTGTAAATGCTAGTGATGTTAACTTCAGTGCTGGGCGTTATTTCAGTGGTGGTGCTAAAGAAACTGCTGCACGCCTTCCGTTGGATGCCGGTTTTGAGGCTGTGGGCATCGTTGCATCTGTTGGAGATTCAGTGAACCATATTAAAGTTGGCAGTCCTGTAGCCCTTATGACTTTTGGGGCCTATTCTGAATTTACTCAGGTTCCAGCCAAGCATCTTCTTCCGGTGCCAAGACCAGATCCAGAGGTCGTTGCTATGCTAACATCAGGATTGACTGCTTCAATTGCCCTTGAGAAGGCAGGCCAAATGGCATCAGGGCAAGTTGTTCTAGTTACAGCTGCTGCTGGTGGAACAGGACAATTTGCTGTGCAGCTCGCAAAACTAGCAGGCAACAAGGTTGTTGCCACATGTGGTGGCAAATGTAAAGCTGCACTTCTGTCTTCCTTAGGAGTTGATAGAGTTATCAACTACCAAAATGAAAAGATCAAAGATGTTCTGAAAAAAGAGTTTCCAAGAGGAGCAGATATCATATATGAATCGGTTGGTGGGGAAATGTTTGACTTATGCTTGAATGCACTTGCAGTCCATGGACGCCTTATTGTAATTGGTATGATCTCCCAGTATCAAGGAGAGCATGGATGGAAGCCACGGAACTACACTGGACTATGTGATAAGATTCTTGCTAAAAGTCAAACTGTGGCTGGTTTTTTCCTAATCCAGTATGCTCACTTGTGGCAAGATCATCTTGACAAACTTTTTGACCTGTATGCCTCCGGAAAGCTAAAGGTTTCCCTTGACCCGAAGAAATTCGTGGGTGTAGCTTCTGCGCCTGATGCGGTAGAATATCTTCATTCTGGCAAGAGTGTTGGCAAGGTTGTTGTGTGCATTGATCCGTCATACAGTCAGACCCTTGCTAAGCTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MELKPGMSALVTGGGSGIGKALCIALAQKGLFVTVVDFSEENGREAASLVQNENKKFHGDLKVPSVMFIKCDVTNAGDLSAAFGKHVDTYGGLDICINCAGIAIKTLVYDDRSDGTSTWRHAVNVNLVAVIDGTRIASQIMRSGKKPGVIINIGSAAGLYPMNFDPIYSGTKAGVVMFTRSLAPLKRHGIRVNVLCPEFVQTNMAEQLSRRIIDVTGGYIKMEDIVNGTFELIKDESKAGACLWITKRRGMEYWPTPEEQRKYMLNLPKSKRMLTQNTFSTVQTPEFYEKIVVHTLSHNFRDATRLERVRLRLPVEPHNALVKIIYAGVNASDVNFSAGRYFSGGAKETAARLPLDAGFEAVGIVASVGDSVNHIKVGSPVALMTFGAYSEFTQVPAKHLLPVPRPDPEVVAMLTSGLTASIALEKAGQMASGQVVLVTAAAGGTGQFAVQLAKLAGNKVVATCGGKCKAALLSSLGVDRVINYQNEKIKDVLKKEFPRGADIIYESVGGEMFDLCLNALAVHGRLIVIGMISQYQGEHGWKPRNYTGLCDKILAKSQTVAGFFLIQYAHLWQDHLDKLFDLYASGKLKVSLDPKKFVGVASAPDAVEYLHSGKSVGKVVVCIDPSYSQTLAKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..55#1018..1191#2037..2218#2654..2759#3050..3126#3827..3914#4662..4851#5692..5818#5923..6003#6154..6255#6381..6476#6618..6692#7085..7204#7658..7786#8101..8178#8669..8755#10840..10926#11013..11063#ATGGAGCTGAAGCCCGGGATGTCGGCCCTCGTCACGGGCGGCGGCTCCGGCATCGGTGAGGATCGATCGCCTCTTCCCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGCGCGTCCACGGTTCACGAAAGCCCCTGGTCCTGGGGTCTGGACGCGCCTTGCTGTTTGTACGTATTGCTGTTGGATGGGATTGGGTGATGCTTAGTTTGTCCATGGCTCGCGCGCTGGTCGGTCTGATTTTGTGCCCCAATCATCAGTTCATGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCGTGTGTTTTCTAAATTCTAATGGTGCGAGAAATGGGGGAGGAGCGGCTAGTTATGCGGGGTGGTACTTGGGATCGGAGGTGAACAGGTGATGATGGTCCATTGATCCCTGTGATGGGTGCCTTTCTGGAAAGCGCTGTATGATGGTTGTAGCATTATTAGCAAACGGAGGAGGTTGAGGGCTTGTACTTGTAATGCTTATGGTTCAATGGTTGTGTTAGGCAGGGTGAAAGTGAACTTTGAGCGACACACCGACGCAATAACTTGTTGTGTATGATTGTTATGCCCCGTACATAATACTACGGAGGAATTAGTCTAGTAGCTAGCAGAGTACCTCACATTTCCCCTTTCTCTTTTCGTTGTCCCTGAAACTGAAAGGATAGCGGGCACCCGGTATGCTCCTGCTGGCAACTGTCAGCATGTCACTTGTATTGTTGTACTCTGATTTGGTACCTTGTATATGCTGTCATTTGTATGATGAATATAAATGAATCCCTGCTGTTTGTTCAGTATCAGTGTCAAATTTGAGCAAATAAATGTGTTGGGGAAATGCAACAACTAGTATTTAAGTCCGCACTCATGAAGTTTGCTACTAGGATATATTTGCTGACAACAAGTATCTTCTCACATTCATGATTTAATTGGTTTTCTGCAGAGTAGATGAACACTTCCAGCATATTCTTATAATGCATTGACTGAATATTCTTTTAAAATTTTCCAGGGAAAGCACTTTGCATTGCTCTTGCACAGAAGGGTCTATTTGTGACAGTTGTTGATTTCTCTGAAGAAAATGGAAGAGAAGCCGCTTCATTAGTTCAAAATGAAAATAAAAAGTTTCACGGAGATCTTAAAGTTCCAAGTGTTATGTTTATTAAATGTGATGTTACTAATGCAGGTAAGAGTCTTGATAAGGACAATTAATTTGTTTGTGTACCTCGTTTTCGAGACCACACTTGTAGCTGTTTTCCTGGTGCTAAATGCTTTGATAACAATCAACACACATGTCAGAACTAAAGTAATTTAAAAACTTGGCAGATATCAAAAGACTGGCGAAGTGTGATAATTCTTTAGAAGCCAATTGTAACATAGTGTTTTTTACATAACATATAATTCTTTGACTTCTAAGTACTACTACGTACTAGCTAAAATCTGTTCTGAAACGCTAATTTAAAAGGCATCCCTGCAGTGTTTCAGAAGTATGATAACTATGATTTAACACCTAATGATTAACATGGTATTGCTTCCTTTTGGTTTTAAAAAGTACTCCCTCCATCGCATAATATAAGGCGCCCACGCATTTCAAGATTCCACCTTCAAAACATTTTGACCAATATTTAGTATAACATGAATTGAATTTTACTTGCTAAAAATTATATCATTGGATTGACATTTGAATTTACTTTCATATGGTTATAGTTTTGTTACTACAAACCTTATAATATATGAGAAATTATAAAACAAAGATTAGTTTTGGAGACCGTGTCAAGTTTGACAATGCCTTATATTATGGGATAGAGGGAGTAACATATTTCTATTAGCTATGCCTTATTTGTACCATTTTTCTGTGTGAGAGAGCACCAAATCCTTTGTCTCGTTGGACTGGAACTCAGGATTTCTTGTTGTAATTGTATTGTTTTGATTTATTTTATCATTGGATTTCCAATTGCATGTAGTATAGTTTCAACTGTTAACTTAAATCACAATCATGAAAAAAATGTGCATTTATTTTATCATATGTAGGTGATCTTTCTGCTGCCTTTGGAAAACATGTGGACACATATGGTGGACTAGATATTTGCATCAATTGTGCTGGAATTGCCATCAAGACACTAGTTTATGATGATAGATCTGATGGAACTAGCACATGGAGGCATGCTGTAAATGTGAACCTTGTTGCTGTTATTGATGGTACTCGCATTGCAGTAAGTCTATCAGGAACTGGTTGAATATAATTCACTTAAACAGTTACTGCTAGACCAAGTGATTGATGCCTGTCTACTATGTTTGGATGTATTAACATATGATTAGGAATGGCACATATGGTTTTTGTATCTGTTGATCCATTTGTGGAATACAGAAGGGGGTTATTGTTTTTTCTTTCTTTATTTATTTTCATCTATTATTATCAGAGGAAGTTAAGTGGTAATAGACTTTCACAATGTAACCTGTCCATAGAGTTTCTTTGAGAGAATGAACTAGAGTAGCATTTTGGATCAATGACAATTGACAAATCATGCCAATTATTGATATTTGGATTCTTCGTTGTGCATTTCTTCTCAACAACTAATATGTTTAGGATGCTATTTTTTTTAGTTCATGCAAGCACCATATATACTTACAGTTATTTTTTTCACCAGAGTCAAATTATGCGATCTGGGAAGAAGCCTGGTGTCATAATAAATATTGGTTCAGCCGCAGGCCTTTATCCTATGAACTTTGATCCCATATATAGTGGAACAAAAGGTGCATATACAATCACATATATAATTCTTATTTTTTGGGCAGAAGATTGCTGTTGCAATGAAAGTCCAACTTGGATTATAATTTGATCATTTATTTGTGAAAAATAATATGCATGCTAACTGTTTATCTAGATGGTTCAAGATACTTTGCAATTACAACTTGTACATGATCCACATGTTGATAAAGATATATGGCCAACTGTATTTTCCAATATTAACTCCACATTCATTTTATATTGTCAAATATGTTTTTCACGCTATGCCACTGTGATCGCAAATATTGTATTTCAGCTGGCGTTGTTATGTTTACAAGATCACTTGCTCCATTGAAACGCCATGGTATACGTGTCAATGTACTCTGCCCTGAGGTATGAATATATTACATAACTAGAGGCAAATATGAAATATTTATTTATTTTTGTCATTTCTGACTCATAGTATTCCAGCATATGTATTCTGTCCAAAACTTGTGAATTTGCTGATATGTTTGGTAGTATATCAGAATATTAACTTGATGATGGTACAACAGACAGCACACCCAGCTGTGCTCTCTGTTACATAAGTTCTTATTACATAGAAATATTACTAGAATGATCACATAAAGCTTTCCATAGGGCCTCCTCTACTATTTCTTAGAAAAAGAAAGACGAAAAGTGATTGGTCACTACTTGGATTCTCAAGGACCAGGAGCAGATATCCTTATGACCATCCGTGCACCCATTAAAATTGCAAGCCTTATATAACTCTCATTTTTAGTTGTGGTAGAGTTGTATGAACATGTAGTATTGTAGTTGAGCTCACAGGTAAAATTAACTAAGTGGGCAAAAGTTGATGATAATTGCATATGAGAAAAACCGTGGATATCTGGAAAGAGTTGATATCTGCAACTTGATAATTTCCAGATTGCAGAATCTCCAAGTCATAAATTCACATGGCTTCAAATTTATCCTAAACAAACTGTTCTATGATTCTATCATTGTCTCATTATCAAACGCTGGATGCTGTGAAGGCAATGATGCTCCATGATCATTATCAAACATGATCTATTTTATGGTTTGTTATGTGCAGTTTGTTCAAACTAATATGGCAGAGCAACTAAGTCGTCGAATAATAGATGTAACTGGTGGATATATAAAGATGGAAGACATTGTTAATGGTATGTTTCTCTTACCTTTTTGAGCAGTAGGTACGTCTGTATGTGTGTTCTCCACTTTTAACCTTGTGACCATAATTTGTGTGTCACAGTTTATACAGGCATGTTCAACATTCTGATGAATAATTCTATTGCTTTTGTTGAGATGGAATGCTTTACTTGTTGAATCAAATGTAGACATCTGCGCACATTTAGCTATGTAAAAGATATGTGATTCCATTATTTTGATTTGAGCAAAGACATAAAGTTTGAGGTCTATAAACTTCCATGAGTATTTAACTTTAGTCTCGGAGCTTGAGAGCTATTCAACTAGGTCCTTCAACTTATAAAATCAAGTGATATCATCACTACTTTGTTCGCATACCCATTGATAACCATATGAGCAACTGAATGTATAAATTTCCGCAATGAAAGGAGATCACAAATATGCGATAGACTTTACTGGCATGCAAATATCTAAAACCTGATATCCTGGTCTGTAAAATGGACATAGCTTTTCTTGGGATGGATCCATGTGCCTATGCCAAATGTCCCTGTCAGGTTGGTATTGTGTTTGACGGGACTCGACTAGTTGACCTCCTTATACCACTGAATGTGTTTAGGGACCTAAGTTCTCAATCCTAGGGGGTCAGGTAATACACCTATGCAATTTTAGTTATCTACTGTGGTATTTTAACCCCTATTGATGCATACCTCTTGTTTACCCTCTCTTTTGGTTTGCTGAAAAGAACCCATTTTTATTTGGATTAGGTACATTTGAACTTATAAAAGATGAAAGCAAGGCTGGTGCTTGCCTTTGGATAACTAAACGAAGAGGGATGGAGTACTGGCCAACACCAGAGGAACAAAGAAAGTATATGCTCAATCTTCCCAAGTCA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