Difference between revisions of "BGIOSGA031619"
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Revision as of 17:29, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA031619 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031619, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_34174 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA031619-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA031619-PA |
| Length |
11485 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:17774612..17786096 |
| Sequence Coding Region |
17785947..17786096,17784345..17784421,17784016..17784079,17783837..17783907,17783636..17783713 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:17774612..17786096 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:17774612..17786096 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCCGGGAAGAGCTCGTCGGCCTCCAAGGAGGACCAGTACGCGGCGCTGCGGGAGCTGTACCGGCCGCACATCGACTCGTTCGACTACTTCATCGACGAGGGGCTCGACAAGATGCTTCAGTCCATCCGCCCCGTGGAGATCACCTCAAAGCTTTGCCATCTAAGAGGTGCAGATTCTGAAAAATTGATTTTCCATGGTGAAGAGGCAACAGAAATGGGCGGGTACTTCATATGTGGTGGGATGGAGAGACTTGTACGGATTCTTATTTTACAAAAACGTAACTATCCTATGGGCCTGATCCGTGGCTCTTTCGTTAATCGTGGTGCTGGGTACACTGACAAAGCAGTGATCATAAGATGTGTCCAAGATGATCAGTCCAGTGTGACAATAAAGCTGTATTACCTCCTAAATGGCAGTGCAAGGCTTGGGTTCTGGTTGGGAGGCAGAGAATTTCTCCTTCCTGTTGGGATTGTTCTCAAGGCCCTAATTGATACTAGTGACCGGGAAATATTTACAAGCTTGACATGCTGCTACAGTGATCATTATGAAAGAGGAAAGGGAGTTGTCAGCACTCAACTTATTGGTGAAAGGGCACAAATAATTCTTGATGAAGTCAGAGACCTGTCTCTTTTTACTCGCACAGAATGCTTGTTGCATCTTGGAAAGTACTTCCGATCTGTGATGGAAGGATTTGAGAAAGATGATTTTGAAACTGTTGCTGAGGCAGTTCTTAAGGACTATATTTTTGTTCACCTGCAAAACAACCATGACAAATTTAATTTATTGATATTTATGCTGCAGAAACTTTATGCGATTGTAGATCAAACTGCGTCACCTGATAAAGCTGATGCTCTACAGTACCAGGAAGTTCTCTTGCCTGGCCACCTGATAACAGTTTTTCTAAAGGATAGACTTCAAGATTGGTTGAGAAAGTCCAAACGGTTAATTGTTGAAGAGGCTACAAAAAATAAAAGCTTTGATCTCAATGACTCACAGGAGGTCAGGAAATTTCTCAGTAAAACTTCAGCATATGTTGGCAAAGCTATTCAGAGTATGATAAAGGTCGGAAAAGTAAATTCACAATCAGGGCTAGATCTGCCACAGCGAGATGGGATGACCATTCATGCTGAACGGCTCAACTTTCATCGTTATATTTCGCATTTCCGGTCTGTGCATAGGGGTTCTAGTTTTGCTAAAATGCGTACGACATCTGTGAGGAAGTTGCTTCCAGAGTCATGGGGTTTCCTCTGTCCTGTTCATACACCTGATGGAGAGCCTTGTGGTTTACTGAACCATATGACTTCCACATGCCGTATTTCATCCTTTTACAACTCAGAAGGGGCAACTAAAGATTTTCAGAAAATAAAGATGTCACTTATTGCTCGTTTGGTTGGCGCTGGAATGGCCCAACTGTTGCCGAGGATAGAGCGAACTGGTCCTCCAGAAGTCCTACATGTCCATGTGGATGGATGCATTGTTGGTTCCATCGCTTCTGCTAAGATTGAAGAAGTAATTCCAGAGGATTTGGAAGTGGGTTATGTACCCTTAAGCCATGGTGGGGCTTATCCTGGACTATACCTTTTCACCAATCCAGCTAGATTTCTTCGTCCGGTCAGAAGTCTCTTAGGTCTATCCAATGGAGGGCCAAATATTGAGCTGATTGGACCATTTGAACAGGCATTCATGGAAATACGATGCCCTGATGGTGGGGATGGTGGAAGAAACAAATTATTTCCTGCAACTCATGAAGAAATCCACCCTACAGCCATTCTTAGTGTAGTTGCAAATTTGACACCTTGGTCTGATCACAATCAAAGTCCTCGGAACATGTACCAATGTCAGATGGCAAAGCAAACCATGGGATTCTGTGGCCAAGCTCTAAAATTCCGTACTGATGTAAAAGCATTTCATCTACAGACCCCTCAGACACCAATTGTCCGGACAGCTACATATAGCAAGTATTGCATGGATGAGTTCCCATCCGGAACAAATGCTATTGTTGCGGTGCTATCATACACAGGGTATGATATGGAGGATGCCATGATTTTGAATAAATCCGCTGTTGATCGTGGGATGTTCCGTGGGCATATTTTCCAGACTGAGTGCATTGATTTATCAGCAAAAAGTAGAGATAATGTTACGGAGTTCTTTTGCAAGAGTAATCTTTCGAGGGACACTACCGCTGCAATCGAATCAGATGGCCTTCCTCGGATTGGAGAGAACATATTTCCAAATGAGCAGTACTACAGCGTCTGTAACAATCTCACTGGTACAGTAAGGCCTATCAAACTGAAGGGCTCAGAACCTGCAGCTATTGATTATGTTGCTGTCAATGGGACAAATTTTAAGGATCGTCTACAAAAGGCTAATATTCGTCTGCGTCGCGTGAGAAATCCTATAATTGGTGACAAGTTCAGCAGCAGACATGGTCAAAAGGGAGTTTGTTCGCAGTTGTGGCCTGATATTGATATGCCATTCTCTGCTAATACTGGGATGAGGCCAGATCTCATCATTAATCCCCATGCATTTCCTTCACGAATGACTATAGCAATGCTCTTAGAGTCGATAGCAGCAAAGGCCGGAAGTCTGAAAGGGAAGTTCATTGATGCAACGCCTTTTGCAAGCTCAGTTAAAGAGAGATCAAATTCCATTGTGGATGAACTGGGACCCATGCTTGCTTCTTATGGATTTAATTACCATGGAACAGAAATTCTATATAGTGGAGTTTTTGGCACTGAGATGAAATGTGAGATTTTCCTTGGACCTGTATATTATCAACGCCTTCGTCATATGGTCTCAGACAAATTTCAGGTTCGTACCACAGGGCGAATAGATCAGATCACAAGACAGCCAATAGGAGGAAGGAAATACGGTGGAGGGATTCGGTTCGGTGAGATGGAGCGAGACGCGCTTCTCGCTCATGGTGCCTCTTACCTCCTACATGACAGGCTCCATTCCTGCTCCGACTACCATATCGCGGACGTGTGCTCCATCTGTGGGAGCTTGCTGACGGCGACGGTGATCAAATCCGAAAGCCAGAAGAAAGCCAAGCGCGACATGCTCGGGCTCCCCACCGTAAAACCTCCCAAGAACTTTGCCTGCCAGGCCTGCAAAACAAGCAGAGGGATGGAGACCGTCGCCATGCCTTACGTCTTCAGATACCTGGCCTCCGAGTTGGCGGCCATGAACATAAAGTTGGAGCTTCGGCTCAGCAATAGAACAGAGCATCCTACTACTACCAGCGAAGAATCCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGKSSSASKEDQYAALRELYRPHIDSFDYFIDEGLDKMLQSIRPVEITSKLCHLRGADSEKLIFHGEEATEMGGYFICGGMERLVRILILQKRNYPMGLIRGSFVNRGAGYTDKAVIIRCVQDDQSSVTIKLYYLLNGSARLGFWLGGREFLLPVGIVLKALIDTSDREIFTSLTCCYSDHYERGKGVVSTQLIGERAQIILDEVRDLSLFTRTECLLHLGKYFRSVMEGFEKDDFETVAEAVLKDYIFVHLQNNHDKFNLLIFMLQKLYAIVDQTASPDKADALQYQEVLLPGHLITVFLKDRLQDWLRKSKRLIVEEATKNKSFDLNDSQEVRKFLSKTSAYVGKAIQSMIKVGKVNSQSGLDLPQRDGMTIHAERLNFHRYISHFRSVHRGSSFAKMRTTSVRKLLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLLNHMTSTCRISSFYNSEGATKDFQKIKMSLIARLVGAGMAQLLPRIERTGPPEVLHVHVDGCIVGSIASAKIEEVIPEDLEVGYVPLSHGGAYPGLYLFTNPARFLRPVRSLLGLSNGGPNIELIGPFEQAFMEIRCPDGGDGGRNKLFPATHEEIHPTAILSVVANLTPWSDHNQSPRNMYQCQMAKQTMGFCGQALKFRTDVKAFHLQTPQTPIVRTATYSKYCMDEFPSGTNAIVAVLSYTGYDMEDAMILNKSAVDRGMFRGHIFQTECIDLSAKSRDNVTEFFCKSNLSRDTTAAIESDGLPRIGENIFPNEQYYSVCNNLTGTVRPIKLKGSEPAAIDYVAVNGTNFKDRLQKANIRLRRVRNPIIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPDIDMPFSANTGMRPDLIINPHAFPSRMTIAMLLESIAAKAGSLKGKFIDATPFASSVKERSNSIVDELGPMLASYGFNYHGTEILYSGVFGTEMKCEIFLGPVYYQRLRHMVSDKFQVRTTGRIDQITRQPIGGRKYGGGIRFGEMERDALLAHGASYLLHDRLHSCSDYHIADVCSICGSLLTATVIKSESQKKAKRDMLGLPTVKPPKNFACQACKTSRGMETVAMPYVFRYLASELAAMNIKLELRLSNRTEHPTTTSEES</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..150#1676..1752#2018..2081#2190..2260#2384..2461#2552..2597#3012..3192#3279..3331#3417..3490#3583..3700#4468..4552#5768..5880#6768..6895#6971..7050#7140..7339#7471..7635#7711..7875#7998..8072#8647..8750#8833..8908#9532..9654#9764..9907#10221..10433#10605..10838#11042..11485#ATGGCGGCCGGGAAGAGCTCGTCGGCCTCCAAGGAGGACCAGTACGCGGCGCTGCGGGAGCTGTACCGGCCGCACATCGACTCGTTCGACTACTTCATCGACGAGGGGCTCGACAAGATGCTTCAGTCCATCCGCCCCGTGGAGATCACCGTCCCCAACTCCCCCACCACCCTCAGAAATATCCTTCCTGCTTTTTTTTTTTTTACCTTTTGCTCGTCGCTTACAGTTCAGTGGACCAGTTTTTTGTGTGCTAGTACGAATTTACCAGTTTTTCCCCACCCAGCATCCAAAATTCAATTCTTATGTGCTACGAATTTACCTTAAGACAGCTCTCGTGCTTTCCGAACTTAGCTGACAAGTTGTTAATAAAGCCAACACCCAGTAGTTCCAACATAGAGTTACTAAGGCGCAGGTTTGAATTCGTTTTCACTCTCTTACGAGGACACCAATAGATGAGGTTTGGAAGGACTGCTATATTTGTGGATGCTAATTGTTTGTGTACGGAATGAACTATGGAAGTAACTTGGTTATCATCTCATTTTCCCTTAACCGTCGTCTATACTATCCTTGGAGAAAGGTCATCTGTTCCCACCAAAGAGGGATGGTCGGTTGGATGCACCGCTCTACCCCCAGCAGGTTTTGCTATATGGACTTATCAAATCCCTTTACATATCATTTTCATTTTAAACACAAGACATTTGTTTAATCTATTGAAAACTTTGGACGTTCTTTCCTGTTTTTCTTTGGATGAGCAGTGCAGGCAGGCACGGACGACGTATCATGGGGAATTTAAAGTGGATACTTTCATCCAATGTAATGACGGACCAGCTGTCAGGCAAACCTTCAATTTTGGTTACTTGCCTATTATGTTAATGGTTGTTACCCCTTCTTTGTTGTACTTCTTATCACATTTTTTTCGTAAGAACTTCTCTAGGTGGATTTTGGAACTTGAATGAGCGGCTGACAGCTTAGTTGAGTAGTAGCATCCACATATGAGTGCAGCTTGTTATCTGCTTTTAGGATCTAGCTTGTGTTTCTACAATTTTACATTAGTCTGGCACCCCAATAAGTCTTGGTTAAGTTCACCTGTCTCTTTGGTACAAAAGCTACTTCTGCTTCTTCAAGTCAAAAAATGAAAACTAAGCTATCTAATATGATATAGTTACCTGGAAAAAAAAGAGACTTTTCTCTATCAGTTGGGTGGAAAGAATCAAACATTATGCACTTTATTAGTGTCATGATGTTTTGTCAGTTTATAGCTTTATAATAGGCCAAAAATCTAAATTAATAAGCATGATTATGCAGTTTTTGCGGTTCAGTGCTGCTTTACAATTCTGACACTAAAATGATAAATAATAGCTGCTTTGAATAATTTATAATCAGTTGTTCGTGAAAGCTGATCTGCAATTCTGCATGCATCATACTATGCTGCAATTCTGTAGAGTTAGGAACACCCAAAGCATCGATATTAAAAAAAGTGCAGATACATCACATTTTGGTGGTAGCCATAGACAACTATTATTGTTTCTTCCTTCTGGAAGCTATGCAGGATTCATTTCACGTTCCACTTCTCTCTACACCACCTTATTTGTTCTTATTTGACTGATGGTTTTGATTTAATTAGTGTGAATTGTATTCTATTCTTGTTTATGATTTTATGCTCATGCAATTCCAGTCAAAGCTTTGCCATCTAAGAGGTGCAGATTCTGAAAAATTGATTTTCCATGGTGAAGAGGCAACAGAAATGGGCGGGTGAGTATGTTATGAACTTGTTTATTTGTTTACATTCTCTTAATTATGTCATCTTCTTCCCTTTCTATCATTTCTTAGTACACCGATCATTTAGTCTAGTCATTCAACTTGTTAAGACTACCTGTGGATCTTATTGATCGATTCATTGTGTTATGATTATATCACATTCACTCTTGATTCTTCTACTGTTACTGAACAAATTTTTTGACACTGTTTCCTATGTTAGTGTATTCATTCTGATGCATTTTGTAAAATTTTCTTTCAGGTACTTCATATGTGGTGGGATGGAGAGACTTGTACGGATTCTTATTTTACAAAAACGTAACTATGTAAGATTACTCAGCTTTTCTTTTAGATTTATGTTGCAAGGCTAATATTAGAAAAAAAAAACCCAGAGAACATTATGGCAATGAATGGTTTGGTGTGAATTTTTTCAGCCTATGGGCCTGATCCGTGGCTCTTTCGTTAATCGTGGTGCTGGGTACACTGACAAAGCAGTGATCATAAGGTGCCATATACTTGTCTATAGCTGCTTATGTTACTGAGTTTTTTTGCTGTTGCAAGTATACTTGTCTGTGTATCTAGTTGTACCTTTTTTATGTTATAATCCATATCTAGTTTTTTTTGACAGATGTGTCCAAGATGATCAGTCCAGTGTGACAATAAAGCTGTATTACCTCCTAAATGGCAGTGCAAGGCTTGGGTTCTGGTAAGTTCTGCACTGGCAAATTGTGAGTGGAAATGCTTGAGTTTCTTTTTAGTTTTTGGAACTTGATTCTTGAATTTGTGCAAAATTCAGGTTGGGAGGCAGAGAATTTCTCCTTCCTGTTGGGATTGTTCTCAAGGTATATATTTCCTTCATGGGGCTTATTGTTTTCTAACTGGAAATTGAGTTAATAAGCTTTCTTTGTGCATGATCAAGTTTTACAAATCATTGCTACTATATATTGTTGGATGATGATGCAATCTACAGTGACGACCTCAAGCCCTTTCTTGAAATATTCCATATTTTTCATTTATTGAGTAATTAAGCTGTATTTTACAAACTTTTTTTTTGTTCTAAGCGTTTCATTAATCTTTCCTCTTTCTGTAGTTTATTCTGTTACCTTACCAGATAATTTGATTTATACTCTCACTATTTTATTTAAAAAGTAATATTTTGATTGTGCTTCTATTCTTTGATATTTAGTGTAGGTTGGCAGTATTCTTAATGTAACTTTAACAGTACATTGACCTGATTGTGAATTTACAAATGATAGGCCCTAATTGATACTAGTGACCGGGAAATATTTACAAGCTTGACATGCTGCTACAGTGATCATTATGAAAGAGGAAAGGGAGTTGTCAGCACTCAACTTATTGGTGAAAGGGCACAAATAATTCTTGATGAAGTCAGAGACCTGTCTCTTTTTACTCGCACAGAATGCTTGTTGCATCTTGGTATCTGAGAGTTTAATTTGTTCTATTTGCACAAATTTTTGAATCCTTCTTAGTCACTGACATCGATAATTATCTTTGAAATGCAGGAAAGTACTTCCGATCTGTGATGGAAGGATTTGAGAAAGATGATTTTGAAACTGTAATATTGGATGTTTAATCTGCATTTGTCTTTGCATGTTGTTGAAATTTGGATCGCTTCACTTTGGTCATTCCACATTGTGTAGGTTGCTGAGGCAGTTCTTAAGGACTATATTTTTGTTCACCTGCAAAACAACCATGACAAATTTAATTTATTGATGTAAGTTGAAGTTTTATTGCTCTTTTCTGTGAATTTCTATCCTTTTGAACCTCTTTAATGATGTGTATCTCTTATTACTTTTCACTTCTTAGATTTATGCTGCAGAAACTTTATGCGATTGTAGATCAAACTGCGTCACCTGATAAAGCTGATGCTCTACAGTACCAGGAAGTTCTCTTGCCTGGCCACCTGATAACAGTTTTTCTAAAGGTCACTAAACCCTCTGCCGTCAAGCTCATGACCTTTTTTTTTTCCTTTTTGAAAATCAACTCCATAGTACTACAAAAATGGCATTCAATGTTATGTGCTTAGTAAAAACAATACTATAACATAAAATAGCATAAGTTTTTTGTCTTAACCTTTCTACCCTTGTTCAATTCTCTGCCTCTACCTTCTCTGTTACATATTTGCATGGACTGCTGGACCATGACCAATTGACCAGTGTTAGTTACAAGATGGATGTTTTTAAACTGCTTGGAGCTGGTGCTGATGTGTTCCTTCAAGCATAGGTGCTAAGGTAGAACAGGTCATCCAGCACATACTATGTTGACAGCTTGAGCTAGTAGTCCTTTGCGTGCATATTGACTACTACCTCCGTCCCAAAATATAAGGGATTTTGGAATCCCTTATACTTTGGAACGGAGGTAGTACTTATTTCACGCTCCTAGTATGGTACAGAAGATCTAGGTTATTAACAGTGTAGGCATGGTAGTGGTTACAGGTAGTACGAAGATGTTTTTCACCCAATTTTGCTAAGGTAGTGAGTTAAGTCATATTTTGCTTCGCACTTTTGCTGTGCCTTTGAGCTTATTTTTTTATTCTATTTGTTTCATCTTTGTTCCCTGTGAGCATCGCTTGACGCTGGTTCTTTGATGTCCTATTTTATGGCTGAGATTTTGTTGGTGTTGCTTTTGATTTCTTTTCTGACATCCAGTTCTGTTTTCCTAACTCTTGTTTTTCTTTCCTATCATCTCCAGGATAGACTTCAAGATTGGTTGAGAAAGTCCAAACGGTTAATTGTTGAAGAGGCTACAAAAAATAAAAGCTTTGATCTCAATGACTGTATGTTTACTCTATCCATGTTTTTATACAGGAACCCTTTTTAGTTGACCTGTGTTTCTGAAGTATACTACATCGATACTAGAATCCACTAATGATCCATCAGCGAGTGAATGCTAGTGATCTTTGCATTCATATGATCCAACAAGTCTTCATATGG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