Difference between revisions of "BGIOSGA031992"
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Revision as of 17:31, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA031992 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031992, complete gene. |
| LocusTag |
OS10G0395100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA031992-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA031992-PA |
| Length |
23499 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:11579478..11602976 |
| Sequence Coding Region |
11602848..11602976,11602547..11602690,11597594..11597739,11597367..11597523,11597000..11597058 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:11579478..11602976 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:11579478..11602976 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTCTTCCGCCCCGGCACCGCTGTGTGGGTGGAGCACCCGGACCATGCGTGGGCCGAGGCCGTGGTCGCATCCCCCGCCTCCTCCTCGCCGTCCTCCGTTACTGTCACCCTCGCCGGCGGCGCCAAGGCTGTGGTCGATGGGAAGAAAGTCCTGCCGAGGGACACGGAGGCCGACCTCGGGGGCGTCGACGACATGACCAAGCTGGTCTACCTCCACGAGCCTGGGGTGCTCTGCAATCTCGCTCGGCGGTATGGGTTCAATGAAATCTATACATACACGGGGCGTATTTTAATCGCAGTAAACCCCTTTGCGAAGCTACCTCATCTTTATGATATGCACATGATGGAGCAGTACAGAGGCGTGCAGTTTGGTGAATTGAGTCCACATGTTTTCGCTGTTACAGATGCATCATACAGAGCTATGGTTAGTGAGGACCGCAGCCAGTCCATATTAGTCAGTGGAGAAAGTGGTGCTGGAAAAACAGAGACCACAAAGCTTATTATGCGATATCTTACTTTTGTTGGGGGCCGTTCAACAGGTGATATAAGATCTGTGGAGCAACAAGTTCTAGAATCAAATCCACTGTTGGAGGCATTTGGTAATGCACGGACGGTGAGGAATGATAACTCCAGTCGCTTTGGGAAATTTGTTGAGATTCAATTTAACAAATCAGGTAGAATATCGGGAGCTGCAGTTCGAACTTATCTTCTGGAAAGGTCTCGTGTTGTACAGATATCTGAGTCTGAAAGGAATTACCACTGTTTTTATCAACTTTGTGCATCTGGGCAGGATGCAGATAAATACAAACTTGCTCACCCTAGGAACTTTAACTACCTAAATCAAAGCCATACATATGAGTTAGAAGGTGTCAACGAAGCAGAGGAATATTTGAAAACACGGAGAGCAATGGATATTGTTGGTATAAGTTTTTCTCACCAGGAAGCCATATTCCGAACTGTTGCTGCTATCCTTCATCTAGGAAATATTGAATTTTCTCCTGGGAAAGAGTTTGATTCATCTGCTATCAAGGATGAAAAGTCTAAATTCCATCTCCAAATGGCTGCTGATTTGCTCATGGTTGATGGAAGCCTTTTGCTTTCAACTCTGTGCTATCGCACAATTAAAACTCCTGAAGGAAACATCGTCAAGGCAGTTGACAGTTCTGCTGCTGCAATTAGTCGTGATGCTTTGGCAAAGACTGTATATGCTCAATTGTTTGATTGGCTTGTTGACAATATTAATATGTCCATTGGACAAGACATGGAGTCGAGGGCACTAATTGGGGTATTAGATATCTATGGTTTTGAGTGTTTTAAATATAATAGTTTTGAGCAGCTGTGCATCAACTTTGCGAATGAAAAACTTCAACAGCACTTTAATAAGCATGTTTTCAAGATGGAGCAAGAGGAATACAAAACAGAAGAAATCAATTGGAGCTACATTGAATTCGTTGATAATCAAGACATATTGGATCTCATTGAAAAGAAACCAATTGGGATTGTTTCACTTCTGGATGAAGCATGGCTCTTTGCTTTGCAACAAGACGACCCATCAAAATCATCTTATAAGTTTTCTTCTATAGCTTCTCGGTTTAAGCAACAACTCCAAGCGCTTATGGAAACACTCAGCTCAACAGAACCTCACTACGTTCGTTGTGTAAAACCAAATTCTCTGAACTATCCTCAGAAATTCGAGAATGGAAGTGTACTACAGCAACTACGTAGTGGGGGTGTGCTTGAGGCTATTAGAATAAGTCTTGCTGGTTATCCAACAAGGAGGACATATACCGAATTCATTGATCGCTTTGGACTTCTTCTTCCAGAACATATGGATGAAAGGTTTGATGAGAAATCGCTGACAGAAAAAATACTAAGGCAATTACATCTTGAGAACTTTCAACTTGGCAGAACAAAAGTTTTTCTCAGGGCTGGCCAGATTGCTGTTTTGGACTCCAAACGTACCGAGATTCTGGAAAAGGCTGCCAGGATAGTTCAGGGTCGCTTTCGAACCTTTGTTGCTTGCAAGGAGTTTCATTCTACTAAGAAAGCTTCTGTTTCTCTCCAAGCATATTGCCGAGGGTGTTTGGCACGAAATTTGCTTGATGCTAAGAGACAGATAGCAGCAGCTGTTTCAGTAGAAAAGTATGCTCGGAGATGGTTCTGTCGGTGTGAATATTTGCATCTCCGTTCTTCAGCTCTTGTTATCCAGTCTGGTGTTCGCTATATGCTAGCAATCCAGAAATTGCTGCAATTGAAGAATAATAAAGCTGCTACCATTATCCAGGTTCAGAGTATGCACCAGAATATTTATTCACATGTAGCATATACTGTTAAAACTATGTTCTACATTGGTGCTCTTAGTCCATATTGCCTAGTGGAAAATTTTTCAAGGACTGAACTTATTTTCAAGGCTGCATATGAGACTGGAGCTTTGCGTGAAGCAAAAGGGAAACTTGAGAGGAGCTTGGAAGATCTTACTTTGCGATTCACCCTAGAAAGGAGGCAGAGGGTAGCTGCAGAAGAGTCGAAGGCGCTAGAAGTCTCTAAGCTTCTCAAAATCGTGGAATCATTAAAATGTGAGTTGGAGGCAGCCAATGAAGAAAAAATTAATGGTTGCAAGGAAGTTGCATCAATGCAACAACAGTTAGAGTTATCAATCAAGGATCAAGAACTTCTTCACAGCAATCTTGCTCAGATAGAAGAACTAAAGAGGGAAAATACTTTACTAAAGGGGAAGAATGCAGAAATGGAACAAGAGCTCTTGAAAGCCCAAAAATGCAGCCATGATAATATGGACAAGCTTCATGGCGTGGAAAGAAATTATCTGCATCTTCGGGACAACTTGAAAAACTTGGAGGATAAGATCTCAAATTTAGAAGATGAGAACCATTTATTGAGGCAGAAGGCTTTAAGCTTATCTCCTAGGCATAGCCGCACCATGGAATCTTCACCTGTAAAGATCGTGCCTCTCCCGCACAACCCGACAGAGTTAAGAAGATCAAGAATGAACTCAGAAAGACATGAGGAGTACCATGAACTTCTACAGCGGTGCATCAAGGATGATATGGGATTCAAGAAGGGAAAACCAGTCGCTGCATGTGTCATTTACAAATGTCTTCTCCATTGGGGAGTATTCGAGGCTGAAAGAACAACTATTTTCGACTTCATAATTCAGAACATCAATACAGTTCTGAAGACAGAAAATGAGAATGATATTCTGCCTTACTGGCTAGCCAATGCATCTGCCCTTTTATGTCTGTTGCAAAGAAACTTACGGTCAAAAGGATTCATCGCGGCGCCTTCTAGATCTTCTTCAGATCCTCACTTATGTGAAAAGGCAAATGATGCTCTCAGACCACCTTTGAAAGCTTTTGGACAACGGAATAGCATGTCGCATATAGATGCTAAATACCCAGCTATGTTGTTTAAGCAACAACTAACTGCTTCCTTGGAGAAGATATTTGGCTTAATCCGTGACAATCTTAAGAAAGAGATATCACCTCTTTTGAGCCTCTGCATTCAAGCACCAAAACTTGCTCGAGGAGGCAGTGGAAGGAGGTCGAGATCGCCTGATGTGACCTTGCAGCAACCAATAAGTGCTCACTGGGATCGGATTATAAAATTTTTGGACTCATTGATGGACAGGCTGCATAAAAACTTTGTGCCTTCTTTTTTCATTCGCAAGCTAGTAACTCAAGTTTTCTCCTTCATAAATGTACAATTGTTCAATAGCTTGCTCCTACGACGGGAGTGTTGCACATTTTCAAATGGAGAATATGTGAAAACTGGGCTCTGTGTACTGGAGAAATGGATTCTGGATGCTACAGAAGAGCATGCAGGTGCAGCTTGGGATGAGCTAAAGTACATCAGAGAGGCGGTTGAATTTCTGATTATTGCACAGAAAAGCAAAAGGACTCTTGAGCAGATTAAGAAAAATATTTGTCCGGCGTTAAGTGTGAGGCAGATATATCGTCTATGTACGATGTACTGGGATGACAAATATGGTACCCACAGTGTATCAGCCGAGGTTGTTGCCAAAATGAGGGACATGGTGAGCAGCGATGCACAAAATCCAGTGTCAAATTCATTTCTCTTGGATGACGACTTGAGCATTCCTTTCACGACAGAGGAGATAGCAGAGGAAGTACCGGACATAGACATGTCAAACATCGAGATGCCCTCATCACTTCGTCATGTACACTCTGCTCAGTTCCTGATGCAGCACCTTCAGACAACGTACCCGCTAAGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLFRPGTAVWVEHPDHAWAEAVVASPASSSPSSVTVTLAGGAKAVVDGKKVLPRDTEADLGGVDDMTKLVYLHEPGVLCNLARRYGFNEIYTYTGRILIAVNPFAKLPHLYDMHMMEQYRGVQFGELSPHVFAVTDASYRAMVSEDRSQSILVSGESGAGKTETTKLIMRYLTFVGGRSTGDIRSVEQQVLESNPLLEAFGNARTVRNDNSSRFGKFVEIQFNKSGRISGAAVRTYLLERSRVVQISESERNYHCFYQLCASGQDADKYKLAHPRNFNYLNQSHTYELEGVNEAEEYLKTRRAMDIVGISFSHQEAIFRTVAAILHLGNIEFSPGKEFDSSAIKDEKSKFHLQMAADLLMVDGSLLLSTLCYRTIKTPEGNIVKAVDSSAAAISRDALAKTVYAQLFDWLVDNINMSIGQDMESRALIGVLDIYGFECFKYNSFEQLCINFANEKLQQHFNKHVFKMEQEEYKTEEINWSYIEFVDNQDILDLIEKKPIGIVSLLDEAWLFALQQDDPSKSSYKFSSIASRFKQQLQALMETLSSTEPHYVRCVKPNSLNYPQKFENGSVLQQLRSGGVLEAIRISLAGYPTRRTYTEFIDRFGLLLPEHMDERFDEKSLTEKILRQLHLENFQLGRTKVFLRAGQIAVLDSKRTEILEKAARIVQGRFRTFVACKEFHSTKKASVSLQAYCRGCLARNLLDAKRQIAAAVSVEKYARRWFCRCEYLHLRSSALVIQSGVRYMLAIQKLLQLKNNKAATIIQVQSMHQNIYSHVAYTVKTMFYIGALSPYCLVENFSRTELIFKAAYETGALREAKGKLERSLEDLTLRFTLERRQRVAAEESKALEVSKLLKIVESLKCELEAANEEKINGCKEVASMQQQLELSIKDQELLHSNLAQIEELKRENTLLKGKNAEMEQELLKAQKCSHDNMDKLHGVERNYLHLRDNLKNLEDKISNLEDENHLLRQKALSLSPRHSRTMESSPVKIVPLPHNPTELRRSRMNSERHEEYHELLQRCIKDDMGFKKGKPVAACVIYKCLLHWGVFEAERTTIFDFIIQNINTVLKTENENDILPYWLANASALLCLLQRNLRSKGFIAAPSRSSSDPHLCEKANDALRPPLKAFGQRNSMSHIDAKYPAMLFKQQLTASLEKIFGLIRDNLKKEISPLLSLCIQAPKLARGGSGRRSRSPDVTLQQPISAHWDRIIKFLDSLMDRLHKNFVPSFFIRKLVTQVFSFINVQLFNSLLLRRECCTFSNGEYVKTGLCVLEKWILDATEEHAGAAWDELKYIREAVEFLIIAQKSKRTLEQIKKNICPALSVRQIYRLCTMYWDDKYGTHSVSAEVVAKMRDMVSSDAQNPVSNSFLLDDDLSIPFTTEEIAEEVPDIDMSNIEMPSSLRHVHSAQFLMQHLQTTYPLR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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