Difference between revisions of "BGIOSGA032666"
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Revision as of 17:34, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA032666 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA032666, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_33011 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA032666-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA032666-PA |
| Length |
11229 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:6267044..6278272 |
| Sequence Coding Region |
6267044..6267375,6267485..6267605,6268306..6268394,6268632..6268716,6268867..6269029 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:6267044..6278272 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:6267044..6278272 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTTCGCTGCGGGCGGCATCGACCACCACGTGGCCGTGGATGTGGAGGGGGAGGAGGAAAGCAGGAGGAGGGCGGTGGCGGAGGAAGCGGACCTGCTCTGGGCGGCCTTCGAGCGGCTCCCCTCCGCGAAGCGGCGGAGCCACGCCGTCGTCCTCCCCGATCCCGACGGCCTAGGCGGCGGCGACGGCGGCGGAAGAGGAGAAGGCCAGTTGGTGGACGTGCGGAAGCTCGACCGGCCCGGGCTCCAGCGCGTGCTCCGCCACGCGCTCGCCACCTCCGAACTCGACAACGCCAACCTCCTCCACGGCATCAAGGCCCGCTTCGACGCGGTGGGATTGGAGGTGCCGCGGGTGGAGGTGAGGTTCCAGAACCTGACCGTATCAACAGATGTCCATGTCGGCCGGCGAGCACTGCCCACGCTTGTCAACTACGTCCACGACATTGCGGAGAGAATTCTTATTAGCAGCCATCTTTTACGTCCTGACAAGCACAAGCTGGTTATTTTGGACGACGTTAGTGGAGTTATCAAACCTGGGAGAATGACGTTGTTGTTGGGACCTCCTGCATCTGGGAAGTCAACTCTTTTGTTGGCTCTTGCTGATAAACTGGATTCTCAGCTAAAAAAAAGTGGAGAAGTGGCCTACAATGGAATGGCTCTAGATCAATTTTGTGTACAGAGAACTTCTGCTTATATCAGCCAGACAGATAACCACATTGGAGAATTGACAGTACGAGAAACTTTAGATTTTGCGGCAAAATGCCAGGGCGCTAGTGAAAATTGGCAAGAGTGCCTAAAAGAATTGGTCAATCTTGAAAAGGAAAGGGGCATAAGGCCAAGTCCTGAGATAGATGCTTTTATGAAGACTGCATCATTCCGAAGAGAAAAACACAATCTTGTCTCAGACTATGTATTGAGAGTGCTTGGGTTGGATATATGTGCTGATACCCCTGTTGGCAGTGACATGGAAAGAGGTGTCTCTGGTGGCCAGAAAAAACGAGTTACAACAGGTGAAATGATTATTGGACCAAGAAAAACCCTTCTCATGGATGAAATATCGACAGGTCTTGACAGCTCAACAACCTTTCAAATTGTTAACTGCATGAGGAACTTTGTTCATGAGATGGAAGCTACTGTGCTGATGTCACTTCTTCAGCCCGCACCTGAGACATTTGAATTATTTGATGATCTAATTCTGTTGTCAGAAGGAAAGATCATTTATCAAGGGCCTATCAAGCATGTCGTGGACTATTTTAAATCATTGGGATTTTCATTGCCACCTCGGAAGGGAATTGCAGATTTTCTCCAGGAGGTGACTTCAAAGAAAGATCAAGCTCAGTATTGGTCTGATCAGTCCAAACAACACATCTTTGTTTCTGCATCAGAAATGGCAGCTGTATTCAAAGAATCCCAGTATGAGATGACCATGACTATTTCTCGACTTCCAGTGTTCTATAAACAGAGAGATAATTTCTTTCATCCCGCATGGGCTTTCTCACTTCCAAATTGGATACTAAGAATTCCATATTCCTTTATTGAAGCTGTCGTATGGTCATGTGTAGTATACTACACGGTATCAGTTTCAGGGAACATGACAGTTGGAACCAATATTCTTATTTCACACAGTCTCCCAACAGACGATCATTGGTTCTGGATTGGAGTTGGCGTTTTATTAGCCTATTCCATATTTTTCAATATTATGTTTACTCTTGCGTTGGCGTTCCTTAATCCCCTTCGAAAGCCACAGTCAATGGTTCCTTCTGATGCTGGGGATGGAAGAGATGTGCATATAAATACTGACTCCAACAAAAATACGATTGGAGAAATATTCGAGAACAATGATGGATTTGAAGGGCAGACGGAGTGCAAAAGTAAAAAGGGAATGATACTACCTTTTCAGCCACTCACCATGACATTCCACAATGTGAACTATTATGTCAATATGCCAAAGGAAATGCAAGCAAAAGGTGTTCCTGAGAAAAGACTACAGTTGCTGTCTGAAGTTAGTGGGATATTTAGGCCACGTGTCCTGACAGCATTGGTTGGTGCAAGTGGTTCTGGGAAGACGACACTTATGGATGTTTTAGCTGGCAGAAAAACTGGTGGCTACATAGAAGGTGATATCAGGATTTCTGGCCATAAAAAAGAACAGCGAACATTTGCTAGGATAGCAGGATATGTTGAACAAAATGACATACACTCGCCACAAGCATTTGTTGAAGAAGTTATGGCATTGGTAGAGCTCGATCAAATTCGGTATGCATTAGTTGGAAAACAGGGTTTAACAGGCTTATCGACAGAGCAAAGGAAACGTCTTACTATAGCTGTTGAGCTTGTTGCAAATCCTTCCATCATTTTTATGGATGAACCTACATCTGGTTTGGATGCGCGAGCAGCTGCCATTGTGATGCGCACTGTTCGAAACACTGTTGATACTGGTAGAACTGTGGTCTGCACGATACACCAGCCAAGTATTGATATCTTTGAGGCATTTGATGAGCTACTCCTGATGAAACGAGGAGGTCGAGTAATATATGGAGGTTCACTTGGTGTCAACTCAGTTGACATGATTAATTACTTTCAGGGAATTCCTAGGGTCGTTCCTATCACTGAAGGCTACAACCCAGCAACCTGGATGCTTGAAGTTACAACACAAGCATCTGAAGAAAGGCTTGGCATAGATTTTGCAACAGTTTACAAGAACTCATATCAGTTCAGGAACGTGGAAAACTTAATTGTAGAACTAAGCATTCCAGCTTCTGGCACAGAGCCTTTAAAGTTCTCATCGGAGTTTTCACAGAATCGCCTTACTCAATTCATGGTGTGCCTGCGCAAGCAAAGTCTTGTTTACTGGAGAAGTCCAGAGTATAATGTTGTGCGGTTATTTTTCACATCAGTTGCTGCTATAATATTTGGTTCAATATTTTGGAACGTCGGGATGAAGAGAGAATCCACAGAAGATATATTACTTATCATGGGTGCTCTTTATGCGGCATGCCTATTTCTTGGTGTAAATAATGCTTCATCTGTACAACCTGTAGTTTCTGTTGAGAGGACAGTCTACTATAGAGAAAGAGCAGCTAACATGTACTCGTCATTCCCATATGCTGCAGCTCAGGGTCTTGTGGAGATCCCATATATTGCAGTTCAGACACTAATATTTGGTCTCATTACTTACTTCATGGTCAATTATGAGCGGAACATAAGAAAATTGGTCTTGTACCTTATTTACATGTTCCTTACTTTTACCTACTTCACGTTTTATGGAATGGTGGCAGTAGGCTTGACACCTACTCAACACATGGCATCTGTGGTATCCTCAGCGTTTTACTCATTATGGAATCTTCTTTCTGGGTTCTTAATCCCACAATCTAGAATTCCAGGATGGTGGATCTGGTTTTATTATATCTGCCCAGTGGCATGGACCCTGCGAGGCGTCATTACATCACAATTAGGTGACGTGGACACGAGGATAGTGGGCCCTGGTTTCGACGGGACGGTGCATGAATTCCTCCAGCAAAACCTGGGATTTGAACAGGGGATGACAGGCGCCACGGTTGCCGTCCTCGTTGCGTTTTCGGTTTTCTTCTTTTCAATTTACGCCATATCCATCAAGATGATTAATTTCCAGAGAAGGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..332#442..562#1263..1351#1589..1673#1824..1986#3075..3151#3230..3374#3450..3751#3829..3934#4994..5148#5769..5925#6012..6104#6445..6572#6652..6909#7067..7357#7447..7530#8548..8681#8770..8997#9991..10162#10234..10321#10481..10647#10963..11229#ATGGCGTTCGCTGCGGGCGGCATCGACCACCACGTGGCCGTGGATGTGGAGGGGGAGGAGGAAAGCAGGAGGAGGGCGGTGGCGGAGGAAGCGGACCTGCTCTGGGCGGCCTTCGAGCGGCTCCCCTCCGCGAAGCGGCGGAGCCACGCCGTCGTCCTCCCCGATCCCGACGGCCTAGGCGGCGGCGACGGCGGCGGAAGAGGAGAAGGCCAGTTGGTGGACGTGCGGAAGCTCGACCGGCCCGGGCTCCAGCGCGTGCTCCGCCACGCGCTCGCCACCTCCGAACTCGACAACGCCAACCTCCTCCACGGCATCAAGGCCCGCTTCGACGCGTACGTAATGGGGGGCTTCGATTCTCCGCTTCGCTACAAGCGTGAGCGTCTCTAATTAAGATCTAACTGCTTTGTTTTCGCCGGCTTTCAATTTGCTGGGATTGTGCAGGGTGGGATTGGAGGTGCCGCGGGTGGAGGTGAGGTTCCAGAACCTGACCGTATCAACAGATGTCCATGTCGGCCGGCGAGCACTGCCCACGCTTGTCAACTACGTCCACGACATTGCGGAGGTATAGTGATCTGATCTATAGATTTGCTATTACGTGTTTATGTGGTGCATGGCGCGGTAAATGGGGAAAGGATTTAATAGGCAAAATAGACGAGAGCGATGCTACAACACTCCATGTGAATAAAAGTGACCGAAGTAGTAGCTTGTATTAATTAGTTTGTTGTCACAACTCACGCGAGCTTGTCTACTCCTCTTCCCTTAATGCGAAACTTAAATTAGATCACGTGTATTTACGGCTATGAGATGCAACTACATTAATTTGACTAATTGGCTGGTTGGTTTGTGACTTTGTGTGACCCTTTTGTTTCGCCCAGATGACCCATATGTATCTGTTTATGGTTTGTGGTGCACGGAAGTCAGAATTTAAACGGTTGTGGTAGTTTGGATATGGGCAGTTCTTGTTAGATCAGAGGCTGGATTTCCCATATTTGCATTAGTTGTTTTTGCTATGGAATAGTCATTCTGCATCGCCACTTATGATTATTTGCTGTCTTTGTTCGAAATAGATGAAAGCTAGCAGAGACAAAGACTACTCTATTAGCTGGTTGGCTGGCCAGTGCAGTATCACTTACTATAGTTGCCAGTTTACAACGTGGATTCTTAAATAGCTTAATTTTACTTCATTAACCATTCATCATTGTGATATTGTACTTTGTTGAACTCTTGCTGATATACCCTTTTCATCATTTACTTGTAAGCAGAGAATTCTTATTAGCAGCCATCTTTTACGTCCTGACAAGCACAAGCTGGTTATTTTGGACGACGTTAGTGGAGTTATCAAACCTGGGAGGTGAGAAACTTAGCATACAGAGAATGCACATGCATAACGCTTGATGCATTTACACTAGTTTGGAATAAAAAAAGGAAACTGTTTGTTTGCATGGCAATGTGCTTAATCTTGACATCTCACTGTTTCCCTTGGAATTGTGATATATTCTTATATATGCATGTACCTATTTGATTTTTAAGAAATGCTATTTGGTACAACTTGTTGAGTCTGTACTTTTGTTTTTGTGTGTGGTGCAAGAATGACGTTGTTGTTGGGACCTCCTGCATCTGGGAAGTCAACTCTTTTGTTGGCTCTTGCTGATAAACTGGATTCTCAGCTAAAAGTGAGTATCTCCAGCCTCAACACACGCATATACGTGTACATTTCAGTTATTTTGTCCATCTTGACTAAAGTTAATTCTGTCCTCTAGAATGAAATTCATAGTTTCTCATGACTTTTTTTCCCCCCCCAATTTGTATTCACCTTCCAACAGAAAAGTGGAGAAGTGGCCTACAATGGAATGGCTCTAGATCAATTTTGTGTACAGAGAACTTCTGCTTATATCAGCCAGACAGATAACCACATTGGAGAATTGACAGTACGAGAAACTTTAGATTTTGCGGCAAAATGCCAGGGCGCTAGTGAAAATTGGCAAGGTTGGTCTTATTTACTAGTTCATTGTCCTTTTATGACATGTTTATAATAAAAATACTACATGCTACAAATAATTCCTTGTTATTACTTCAAAATTAGTAAATTATGCCATGAAAATATAAAGAGAGGTTAAGTTAATAATATCTTATGAAACATTATTGTTTGCTCTACATGATATTTTCCTTTCAACATGTTTGGTGCGTGCACATACGCTTATTTCTGATTTGGATTATGCACACCATGTGCTTACTTCCATATATGTTTCTTAATTCTGTTGCATTTGGTTCGGTTTTGTGGTAGCTGATATATTATGTTTGACAACAATCAAAATCTCAATTAATGTTGTACCACTTTGGCCTGTAAGATAAAATGTTTCAAAGAAAAAAGTGACCCTGCTGTCAGTTGCTTCTAGAGTCTAGAGAGTGCATCCCCATAGCCATTTTCGTAATGCAAGTATTCTGTTTAATAAAAGAAGCACTTCTTAGGGGAAAAAATAACCTCCATGAAAATTTGAAATTTCTATTTTTCTGGCCATTGTTTTTATGATTGTTCAGTTTGCAGATTATGTGATGATCCATGCCTCTTATGCCAGCCAGGCACTGTAAAATACTTGCAGATGCCCTTCTATTTAGGCACATTTAATTCTCTATAGAAACTAATATGAATGGGAGCTCATTTAATATTAGCTCTGTTTTTTTAAACTTTTCTAGTAATATAACATACAACTCGGTTTGCTATTCTTTCAAAAAAAAAAGAGGGGGTGGGGGGATACCTGATCTGCATTTTTGTTCTTTTCAATGTCATGTCATTTACTAAGTCTAAAACTAATATTTGTTGTGCTGGACCATATTCTGAAGTGCTTCCCATGTCTTGTTCCTGGAAACCTTTTAGCTGATTTTCAGTGTCACAAAACATGAAGCCAATTTATACTTCTGAAATACTGTTTGTTAACAAGTAATTGTTGTAGAAATTTATGTCTCGAATGCTTGTAATAGCAACATAGTTAGGCATTTGCACAAGCTATTTTAGTTGTTTTCATCTTTTTAACTTGTTTAGGTACCAACTTACACCTGTTTTTGTCTATGTGTAGAGTGCCTAAAAGAATTGGTCAATCTTGAAAAGGAAAGGGGCATAAGGCCAAGTCCTGAGATAGATGCTTTTATGAAGGTTCGTTACCTAATTTTGTGGTTAAACTTCTTACATGCCATATTTCGTTCTGGAAAGTGATTTGTTTTGTGTGGCCAGACTGCATCATTCCGAAGAGAAAAACACAATCTTGTCTCAGACTATGTATTGAGAGTGCTTGGGTTGGATATATGTGCTGATACCCCTGTTGGCAGTGACATGGAAAGAGGTGTCTCTGGTGGCCAGAAAAAACGAGTTACAACAGGTTCCAACTACCATTACTTTCTTTGTTCTACATTACTCGTGGTACATCTCTCCTGAACGTGATGCAATCTTGCAGGTGAAATGATTATTGGACCAAGAAAAACCCTTCTCATGGATGAAATATCGACAGGTCTTGACAGCTCAACAACCTTTCAAATTGTTAACTGCATGAGGAACTTTGTTCATGAGATGGAAGCTACTGTGCTGATGTCACTTCTTCAGCCCGCACCTGAGACATTTGAATTATTTGATGATCTAATTCTGTTGTCAGAAGGAAAGATCATTTATCAAGGGCCTATCAAGCATGTCGTGGACTATTTTAAATCATTGGGATTTTCATTGCCACCTCGGAAGGGAATTGCAGATTTTCTCCAGGAGGTATTGTTTTAGTCTGCTTATTCCATAGAAGTTGGGGGCATGCTGAAGTTTACATGCAAGTAACTTTTTTTTTCCAGGTGACTTCAAAGAAAGATCAAGCTCAGTATTGGTCTGATCAGTCCAAACAACACATCTTTGTTTCTGCATCAGAAATGGCAGCTGTATTCAAAGAATCCCAGTATGGTACATATTTGGAGGCTAATCTAAGTAGTTCGTGTGGTAATAAAGATTCTGCTCTGGTTCTTCCCAGGTCGAAATTTGCAGTACCAAAATTTAGCCTTGTTAGAGCATGCTTTGCCAGAGAGCTTATTTTAATAAGCCGTAATCGTTTCCTCTACACTTTTAGGACATGCCAAGTACGTCATGACTCTCATTACTTCTTTTAATAATTTATTAGAACAATTAATTTTGTTAACTACGAGGAACATGTATATTGATTTTTACAATATATGGACTAGTCTATGAAGCATGAAATAAATTTATAGATTTTCCTGTTATAATCTGTCATAGTGGCCAATGTCTGTGAAGGTCAACCACAACAAGCTCATCCATGATACATCAAATCAGCACTATTGCAGCATGCATCAAATTTATTTGGGTTGGGAATAGTTAATACTAGAGGCTTGAAAAGTCACAATCTTAGACACTAACGATGGTAAAAAAAAGTTCTTCAAATCTTTAGTATGTTTTTTTACATTATTTTTTCACGTAACCTTTTCTTAACAGAATTTATGCTTTGTTTGTAGAATTTCATGTCATATTGTTCTAGTATTCAGCACTCAGTACTTCTCCTATTGCTTAAGTTGGCATTCAAACGCTCCCTTAAGATTGCATTCATGTTTGGTATAAAAAAGTTATTGAGGCAGAAGTACTTCAAGAATATTACATGTTGCGTTACTTTTATCTAGTTTATAAAGGGACTTGCTGTTTTATTTTTGCCATATTCTTGTCACCTGTAATTTGAACATACAGAATTTTATACATGAATGGCT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