Difference between revisions of "BGIOSGA033909"
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Revision as of 17:41, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033909 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033909, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_36279 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033909-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033909-PA |
| Length |
9343 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:15451795..15461137 |
| Sequence Coding Region |
15460990..15461137,15460787..15460860,15460364..15460509,15458889..15459582,15458623..15458760 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:15451795..15461137 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:15451795..15461137 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGGCACCGATGGCCATGGTATTTGCAATGGCCATCGTGGGGGAGATTGGATCATATACCCTCACTTCAGATTGGAAATTAAGGATTTACCTTCCCATGCCAATGACGTGGGGTAACCATGGTCAATTACATGGGGGTCAGGAGGATTCAGTAGCCATGAAAACTGTGAAGTTCAGCATTGCTGGATCAGTCATGGCTCCAGTGAGGTCGCATCAGAGGTTGCTCCAATGCATACATTCTCTTTGGAGAGGACAAATCTCTGGCAGTCTTCCTGATCAACTTGAAAGTGCTAAAAGCAAGATGAGTGATGAAGATGTCCAACAAAACAAGACAAGAAAATTGTTGGAGGAAATCCGACTGAGTGGGTACAACATCATTGGTCTATCTTTATCTATTCAAGGGGCATTTTCTGATCTATTGGATATTTCATCTTTCAGTGATGCTATCTTTGAAGATTTAGGGTCAATGGAGTTTAGGCATTTAAGCAAACTTATCAATCTTGTTTTCGTTCCTTTGGTAACATATTGTCCTTCCAAATTCTGGAAGAAGTGGATGTTGAACCTACTACGACCCTTACTTGATCACTGTGAGGATTTACTTTACTATGCGTGGTTCAGCCTTATGCACCATGGCCGAGCTAAAGTTCCTTATTACTTCGGGAAACTCTCTGGGCCAACAGAAAACATTGAGAAGTTTGAAGATACTCAACTTCTTGAGTTCACCCGTGAAGTGTCTCATTTGCTGGGAGTTTTATCGTCTCCAGAATCAAACAATGGGCTTTTACATTATCTTTTAACCCATGATTGTCTTGGGAGTTCAAGGATGAGCTTGTTTGGGTATTGGGTGGATGATGAAGCAACTACAAGTGCTATTTCCTTTTGCCTTGCTATGGTCCGACTTGCAGGCAGTACCGACAATGAGAGGTGCAAGCTATTTGTTGCAGATGAATTGCTTCCATCTATAATTCGGCGCTTAGATGATCAACTACCATGTGCAATGAGAAACCTAATTTTCAAGTTCAACTCCAGTACAAATGATACTGTTGATAAGGATCTTATTGACCTGATGGGGGGAGAGAAAGGCAATGCTTATGTTGAAAATAACTTTACATGTTGGTTGGCAAAGCAAAAGGAAGATCTCCGTGCAAAGGCATTCTGTTCTGCTCCAATGGAGTTTAATGGGGAGTGGAACTGGGAGTTTGAAGATGAATTCCAAAGGTATCTTCCAGTTTATTTTAACATGTTGCAAGAAGTTGATGCCATGGACGACAGTGCAGAGGGTGATTGTTCGGGCATGAATGCTCTCCTTCAGAAATTGAATCCTCAATTCCGATCCAAGTATGCCATTTACAGCAGTGAGCACCCTTATTTGAGGGAGATCTCACGTATGCAGAAGGGTTCTGACCGTTCTTATAGTGTAATTGAACGTCTTGAAGAAAACTTGGAGATACAATCCACTTTTGATGCTTATGAAGTGGATCAGTCGGTTGGTGAACACAAGGACTTGCTTTTGCAGATAGTTGGTCAATTAACCAATGCAAAAGAAAACAAGCAGTTTCAGCCACTGACACCAGACCCTGGAGACTTTGCGCCACATTTGAAGCCTTATGCACGTTTCTACATTCAGACTAAGCTGAAGATGTCCATGTCAGTTTGGGGCTTAGCACTGCCTAGAGCCCTCCACACAATTAATTGTATCAACTTTGGCATACGTATAAGTGTTATTTACCTACCAACATGGCTAACTATTCTTAGTGGAAGTGAGAATGATACTTATGCTAGGGCTGCAATGCAAATCCATTTGCACGAGGATTATGACAACTATCTAGCTTCTGGTCAACTGGATAGCTATATCTACTCACATGTCTCAGAGGATTTTTCTGATGAAGATGTTGAAAATAATGCAGTGCCACAGAAATTCTCAGTTTTGGACCATGATCTTATCCATTTATCTCTCAAGCGAAGAGCTCAGATTGTGGATATGCATAATCAAGTATGCACATACTCGAAGTGTCTAAGAGACCTCCTTGAAAATGAGTCGCTTAAAGATCGTCTGATGAGTTTGATGAGTGAGCTCAATGCTGAAGGTTTTTTTGACATCGACAGTAACTCTGTCAATTGGGACAATGAGTGTTTCTCAAAGCTTGTAGAAAAATTCAAAAATGAAGTTTTCACAGGACATTCCCTTCCCAGGCGTTACACTATTCAAGGAATTATTGATTATTGGGCAATCTTACAAGAGAAGGATAACACTTGGCAAACCTTTGAAAAGGTTGTTACTGGAACTTCCACTAAATTGATTGCATATCTTCCACAGTTTTGGAGGGATACACGATATTATAAACATGAGTACTATGACATCGTCAGGGAACCCTTAAAAAAGGACTGTTGTTTCATTGGCACGGGTTGGAAAACAGAATATCATAAAACAATGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVAPMAMVFAMAIVGEIGSYTLTSDWKLRIYLPMPMTWGNHGQLHGGQEDSVAMKTVKFSIAGSVMAPVRSHQRLLQCIHSLWRGQISGSLPDQLESAKSKMSDEDVQQNKTRKLLEEIRLSGYNIIGLSLSIQGAFSDLLDISSFSDAIFEDLGSMEFRHLSKLINLVFVPLVTYCPSKFWKKWMLNLLRPLLDHCEDLLYYAWFSLMHHGRAKVPYYFGKLSGPTENIEKFEDTQLLEFTREVSHLLGVLSSPESNNGLLHYLLTHDCLGSSRMSLFGYWVDDEATTSAISFCLAMVRLAGSTDNERCKLFVADELLPSIIRRLDDQLPCAMRNLIFKFNSSTNDTVDKDLIDLMGGEKGNAYVENNFTCWLAKQKEDLRAKAFCSAPMEFNGEWNWEFEDEFQRYLPVYFNMLQEVDAMDDSAEGDCSGMNALLQKLNPQFRSKYAIYSSEHPYLREISRMQKGSDRSYSVIERLEENLEIQSTFDAYEVDQSVGEHKDLLLQIVGQLTNAKENKQFQPLTPDPGDFAPHLKPYARFYIQTKLKMSMSVWGLALPRALHTINCINFGIRISVIYLPTWLTILSGSENDTYARAAMQIHLHEDYDNYLASGQLDSYIYSHVSEDFSDEDVENNAVPQKFSVLDHDLIHLSLKRRAQIVDMHNQVCTYSKCLRDLLENESLKDRLMSLMSELNAEGFFDIDSNSVNWDNECFSKLVEKFKNEVFTGHSLPRRYTIQGIIDYWAILQEKDNTWQTFEKVVTGTSTKLIAYLPQFWRDTRYYKHEYYDIVREPLKKDCCFIGTGWKTEYHKTM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..148#278..351#629..774#1556..2249#2378..2515#2598..2678#3219..3335#3582..3677#3999..4067#4140..4226#5618..5743#6313..6411#6503..6589#6673..6753#8147..8227#8306..8401#8485..8538#8648..8692#8795..8860#9290..9343#ATGGTGGCACCGATGGCCATGGTATTTGCAATGGCCATCGTGGGGGAGATTGGATCATATACCCTCACTTCAGATTGGAAATTAAGGATTTACCTTCCCATGCCAATGACGTGGGGTAACCATGGTCAATTACATGGGGGTCAGGAGGGTAAATCCTCAATTTCAGTCTAAGCGGAGGGTATATGATCAAATTTTACCCAGGGTGGTGGCGGCATAGTGTAGCTCAGCGTCAGTGGTCTTTGGACACTATATCACTAAGTAAGCGGGCATGGTTCAGATTCAGTAGCCATGAAAACTGTGAAGTTCAGCATTGCTGGATCAGTCATGGCTCCAGTGAGGTCGCATCAGAGGGTTAGCTGGTTAGGGTGGATAAGGAAGTATCCTCCCAAACCAATGGGTGGGGATTTGAATCGTGGAGGTGTTGTTTTTGTTGTCCTCAAATCCAACTGGAATTGAGCTCCAAAATCTATTCCTGTTCCTATTCCATCCTAACTGCAATATTTACCTAAGCCCAATTCCAATTCCCTAGTTCATGTCTTAATTGCATAGACCAAACGGTGTTTAATATTGTGTGCCTTTGAGTCGTTCTTAACTATCATACTAACTGTGTTAATTGTCTGATTTACAGTTGCTCCAATGCATACATTCTCTTTGGAGAGGACAAATCTCTGGCAGTCTTCCTGATCAACTTGAAAGTGCTAAAAGCAAGATGAGTGATGAAGATGTCCAACAAAACAAGACAAGAAAATTGTTGGAGGAAATCCGACTGAGTGGGTGAGTTTGTTGCTTATAGCATTTCATATATGTTATTTTGATTGCCTTTTTCATCTATGTAACCTCTACTTTTATTGACTTAATTATTGGTAATTTATTGTATTTTTTTGTTAGATTCAATGATTGTAGTTGGTCATAATTTGTGCATTATTTTTCATGTCCACATACTTGTCTTCAACTAGTAACTATTGTACTAGGAGAATGGTATTTGGGGTCCATGTTACACTATTAGACCAATGGCTCTGATGTATGATGATTAGTTGGAACTTGACAGATTTGTACTATTTGGTTTTGTACTTGTGAATTTGAAACATGATTCTAGATGTTCCTATTCTTGAAGTGTCATGGTCCTGATGGGACAGTAGAAGCGATCTGCGGATCACAATATCTCTTAAATAGAGATTGGCACTAACAACTTGAACCTGAAAGAAAATAGAAAATGAACTAAAACGAAACTTGGTATCCTACAAATTCGAGATTTAGGTGATAATGCATCTTTTGTGGGATGCTTCCCATAAGCATGGTCTAACATGGATGGCTTATTTATTTGTCCATGTTGTCTTGCATCATGCAGTATGTGATTATTTTCATTCTGTATTTCAACTATTTGTAATATTGTGACTTACTCATTCTTGAGAACATCTAATGTGATACATGAGGATGTAATTTTAGAATACATGTATTTTAGTCGAACTTATTTATGCATATATTATTATAAATTGGCTCTGTGGAGTTGTTTTCTTATCAAACTTATATTTGGATATGCTATGCCATGTCACAGGTACAACATCATTGGTCTATCTTTATCTATTCAAGGGGCATTTTCTGATCTATTGGATATTTCATCTTTCAGTGATGCTATCTTTGAAGATTTAGGGTCAATGGAGTTTAGGCATTTAAGCAAACTTATCAATCTTGTTTTCGTTCCTTTGGTAACATATTGTCCTTCCAAATTCTGGAAGAAGTGGATGTTGAACCTACTACGACCCTTACTTGATCACTGTGAGGATTTACTTTACTATGCGTGGTTCAGCCTTATGCACCATGGCCGAGCTAAAGTTCCTTATTACTTCGGGAAACTCTCTGGGCCAACAGAAAACATTGAGAAGTTTGAAGATACTCAACTTCTTGAGTTCACCCGTGAAGTGTCTCATTTGCTGGGAGTTTTATCGTCTCCAGAATCAAACAATGGGCTTTTACATTATCTTTTAACCCATGATTGTCTTGGGAGTTCAAGGATGAGCTTGTTTGGGTATTGGGTGGATGATGAAGCAACTACAAGTGCTATTTCCTTTTGCCTTGCTATGGTCCGACTTGCAGGCAGTACCGACAATGAGAGGTGCAAGCTATTTGTTGCAGATGAATTGCTTCCATCTATAATTCGGCGCTTAGATGATCAACTACCATGTGCAATGAGAAACCTAATTTTCAAGTTCAACTCCAGTACAAATGATACTGTTGATAAGGATCTTATTGTTCTCTGTGAAGAAATATACATCTATATTTCCAGCAATTTGTACCCACAAAGCCAGGCAAGTGACAATCAGTTGAATTTTATTTTTTAAATTGATCACTATTCTGACTGTATGCTTAATCGTACTAGGACCTGATGGGGGGAGAGAAAGGCAATGCTTATGTTGAAAATAACTTTACATGTTGGTTGGCAAAGCAAAAGGAAGATCTCCGTGCAAAGGCATTCTGTTCTGCTCCAATGGAGTTTAATGGGGAGTGGAACTGGGAGGTTGATTCTCTTAACTTCAATTTATTCTTTGACATCTCAATGTTGAACCGTCATCTGGGTTGGTATTGGTTTTGAATTCCAGTTTGAAGATGAATTCCAAAGGTATCTTCCAGTTTATTTTAACATGTTGCAAGAAGTTGATGCCATGGACGACAGTGCAGAGGTATTGTAACAGATTGAACTAACTTGGTTGCACAAGACCTTTATTTAGTAACGCAAGTAGTTTATGAGTGCTAGAGGAATTAGTGGTTGTACCTTCCACATTTGTACTTGTTTGGGGGTGCTTCTGAAATTGATAGCAAGGTGGTAGATATAGTGCTGGGGATGGTGGATGAAAAACAATGAGGTTGAGTCAATGAGTTGGAACGGAAGCAAACTTGATTGGCTTCAACCAGAATCAACTGGGCCGACTTGAACCTTGTCAGCTGCCTAGAACCCTTTTAGTTATGCTCAGCTGCCTTGGTGGCTTGCTGTAAACTGCAGCCTTGCTGTATGGCCATACTGTTTTCGTGGGTACACTCTACAGTGTTTCAATGTCACAATTTTTATGAACGTAGTAACCAAGATAATATGGGGTGATTTTCCATTTCTTTTTTGTATAAAATGGAGTGGGTTTCCAGTGTTCATTAGTGTTTCTTGATTTGTTTATAAGATTGGTTTCTGGACGTAAGAAAGTACAATTTATATTTGTCTACATATATAGGGTGATTGTTCGGGCATGAATGCTCTCCTTCAGAAATTGAATCCTCAATTCCGATCCAAGTATGCCATTTACAGCAGTGAGCACCCTTATTTGAGGGAGATCTCACGTATGCAGAAGGTATATAAGCTGCTACTTCAACTTCCAACTTATGTATTTGTCATATATGCATATTCTAATGATATTGTTATTTTTGTTAATGAAGCGGAAATTTTGTTCAATGAATCAAGTCAGACATTACAAAAAAATGTACGATCTTCTTGGCAAACTCATCACTCTCAAACCATATATCAAGGTATTTTCCTCACCTTTGTTATTGTCAACGAGTTCAAAAACAGCATGATCTATATCTAGTTTTCTTTACAGGGTTCTGACCGTTCTTATAGTGTAATTGAACGTCTTGAAGAAAACTTGGAGATACAATCCACTTTTGATGCTTATGAAGTGGATCAGTCGGTTGGTGTGAGTGTTTGTCATCTTAATTTATTTACTTTTTTATAAGAGGCTTATTAATGTGGGCACCATGTTTTCTGTGAAGTACTTGCAACATTCTTGTTTGGAATCCCAAACAGGCAATAAATATGATATTGCTGTTGCCTCTCCTCTCAAGTCTGAATATTTCTTCTCCTGCCAGGTCCTACTTTGTCATGTGCTGTATTTCTGGGAGCCTCGATTTCATCCTCTGATACGAGAAGTAACTTATGGGTCTTTTAGAGTACTATATCTTCATCCATCCATTTTATGATTGTTTTTAATGGCCTGCATAATGATCTGACTGTTTAGGAACACAAGGACTTGCTTTTGCAGATAGTTGGTCAATTAACCAATGCAAAAGAAAACAAGCAGTTTCAGGTATGCATATATACATATCATATGGGAATCTTCTTGGAACTTCATTGAAATCTGATTTTCACTTTCCTCTAGCCACTGACACCAGACCCTGGAGACTTTGCGCCACATTTGAAGCCTTATGCACGTTTCTACATTCAGACTAAGCTGAAGATGTCCATGGTATTGTATAAAGTATTCATGTCCTTTATTCCTTTGTCAACCATTTAATTGATTTTTTATATTTCTCTGCTCATGAGTAATATTTAATTAGTTTTAGTCGAGCAAATAAATATACTTTTCCTAGTTCATTTTTCATATGCTAACCATTCTTTTAAACTTTGGAGATACTATTTCTTGGTGGAATAAAATCGAGTCAGAATGAAAACCAAAAGCGACATATCATGCCACTGTCACAATTTCTTTCTGATGAAGGTTATCTCCTTTGAAAGCTACTGTGCCTGGATGAACAACTATGCCCATGAATGTCTAAGAATATAAATTAAACAATTTTATGATGAAATTATGTTTTGCAATTTGATGTGGTGAACTCCTTTACAGGAATACTTATTCCAACAGGTCTACTATGGCAACATCAGCCACTCCACCTGGCACATGAGGCCTGCACCGGGTGCATGAATTAGTTATGTTTGTTTGGGATCGTTTTCTTAGTGATATGGGTTTGCGTATATTAGAGTTATGTTAGTTGATTGGTTCAATAAGTTAGATGG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