Difference between revisions of "BGIOSGA034077"
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Revision as of 17:41, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034077 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034077, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_35952 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034077-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034077-PA |
| Length |
11307 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:11234880..11246186 |
| Sequence Coding Region |
11246053..11246186,11245808..11245953,11245529..11245728,11245321..11245423,11244438..11244475 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:11234880..11246186 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:11234880..11246186 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTGTGCGGCTCTGCTGCTGCTGCTTCCTCCTCTTCGTCACCATCGCTGCCGCCGGTGGCTCCCTGACGCGGACGAACGTCGCGACGCTGCCGGGGTTCGACGGCGCGCTGCCTTCACGCCTCGAGACCGGGTACGTGACGGTCGACGAGGAGAACGGCGCCGAGCTGTTCTACTACTTCATCGAGTCGGAGGGCGACCCCAGCACCGACCCCGTCCTCCTCTGGATCACCGGCGGCGACCGCTGCTCCGTCCTCAGCGCCCTCTTCTTCGAGATTGGGCCGTTGAAGCTGGTCATCGAGCCCTACAACGGCAGCTTGCCGCGGCTGCACTACCACCCTTACTCGTGGACAAAGGTCGCCAGCATCCTCTTCGTCGACTCGCCGGTCGGCGCCGGCTTCTCCTTCTCAAGGGACCCTAAGGGGTACGACGTCGGCGACGTCTCTGCTTCGATGCAGCTCATCAAGCTTCTCCGGGAGTGGTTCACTGAGCATCCGCACTATCTCTCAAATCCGTTCTACGTTGGAGGAGACTCCTATGCCGGAAAGATCGTCCCGTTTATCGTGCAGAAGATCTCGGAAGATATTGAAGCTGGCGTCAGAGCGACGTTTAATCTGAAGGGCTATCTGGTAGGTAATCCGAGTACAGGGGAACGCATTGACCTCGAATCAAGAGTGCCGTACAGCCATGGAGTCGGAATCATTTCAGATCAGTTATATGAGATGATAATGGAGCACTGCGAAGGTGAGGATTATGACAATCCCAGCAACGTGATTTGCCAACAAGCTTTGGCTAGGTTTGACAGCCTACTACACGAAGGTTCGAGGGCCCAAATTTTGAACCCAAATTGCATTTATGTGTCCCCCAAGCCAAATCATGAGACAATCGACAGAAAGATCTTGAAGGAGGAGCATGGAGGACTAAAACATCCACCTCCTCAACCTTCAATAAAATGTGGTGTCTATGCCAACTATTTGTCATATTTTTGGGCAAACAACAACTTTACACGAAGAACTCTAGGAATCAAGAAGGGCACCATAAATGAATGGGTTAGGTGCCACGAACATGATCTACCATACAACATCGACATCAGGAGCAGCATAAAGTATCATCGAAATGTTACACTAAAAGGTTACCGTGCTTTGGTATATAGTGGTGACCACGATGCTGTTGTGCCATTCCTCGGGACACAAGCCTGGGTGAGATCATTCAACTACCCAATTGTGGATGACTGGAGAGCCTGGCATATCGATGGCCAGTCTGCTGGATTCACCATAGCATATGGAAACAATTTGACATTCGCTACAGTAAAGGGTGCTGGACACACTGCACCAGAGTTTGAGCCGGAGAGGTGCTTTGCAATGTTTAAGCGTTGGATTTCCAGCATACCACTATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVRLCCCCFLLFVTIAAAGGSLTRTNVATLPGFDGALPSRLETGYVTVDEENGAELFYYFIESEGDPSTDPVLLWITGGDRCSVLSALFFEIGPLKLVIEPYNGSLPRLHYHPYSWTKVASILFVDSPVGAGFSFSRDPKGYDVGDVSASMQLIKLLREWFTEHPHYLSNPFYVGGDSYAGKIVPFIVQKISEDIEAGVRATFNLKGYLVGNPSTGERIDLESRVPYSHGVGIISDQLYEMIMEHCEGEDYDNPSNVICQQALARFDSLLHEGSRAQILNPNCIYVSPKPNHETIDRKILKEEHGGLKHPPPQPSIKCGVYANYLSYFWANNNFTRRTLGIKKGTINEWVRCHEHDLPYNIDIRSSIKYHRNVTLKGYRALVYSGDHDAVVPFLGTQAWVRSFNYPIVDDWRAWHIDGQSAGFTIAYGNNLTFATVKGAGHTAPEFEPERCFAMFKRWISSIPL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..134#234..379#459..658#764..866#1712..1749#2216..2317#2424..2507#6747..6899#6989..7060#7155..7276#8394..8507#8672..8717#11224..11307#ATGGCTGTGCGGCTCTGCTGCTGCTGCTTCCTCCTCTTCGTCACCATCGCTGCCGCCGGTGGCTCCCTGACGCGGACGAACGTCGCGACGCTGCCGGGGTTCGACGGCGCGCTGCCTTCACGCCTCGAGACCGGGTGAGACAACTCAAGAATCATTCCCCCATCTGCTCTGACGATTTTCCATGCTCCCTGCATCAGTATAGGTGAGAGGTCCTGTGGTGTCACTCTGTACAGGTACGTGACGGTCGACGAGGAGAACGGCGCCGAGCTGTTCTACTACTTCATCGAGTCGGAGGGCGACCCCAGCACCGACCCCGTCCTCCTCTGGATCACCGGCGGCGACCGCTGCTCCGTCCTCAGCGCCCTCTTCTTCGAGATTGGTCAGCAACCCAACAACAACAAGCCTCCTTGTCTAGAGTGTCAGGCGTGGTTCATCCCGTTGCAATTATTACCACGCAGGGCCGTTGAAGCTGGTCATCGAGCCCTACAACGGCAGCTTGCCGCGGCTGCACTACCACCCTTACTCGTGGACAAAGGTCGCCAGCATCCTCTTCGTCGACTCGCCGGTCGGCGCCGGCTTCTCCTTCTCAAGGGACCCTAAGGGGTACGACGTCGGCGACGTCTCTGCTTCGATGCAGCTCATCAAGCTTCTCCGGGAGGTAATTCATTACTACCTGGTTTTTTTTGGTCCATTGGTTCCAGGTTTTCAGCGTACTTGGTTCTTGCTAGCTCTTGGTTTAATATCTCGTTTGACTCTGATTCAGTGGTTCACTGAGCATCCGCACTATCTCTCAAATCCGTTCTACGTTGGAGGAGACTCCTATGCCGGAAAGATCGTCCCGTTTATCGTGCAGAAGATCTCGGAAGGTGCTGCAATAATGTTACCTTGGTTACTCTTTAAATCTCAAAGGAATATACTCTTGTTTTCTTATGTGTGATCTAAATAGTTATATAAAAAAATCATTTTATACCACTGAATTTATTCAACGATTTATTATTGACTTCATCTCCATCTATGGTATATATATCTCCAACTTTACTTTTTCTATAATATATCATTGGGGCTGATACTTTTCAAAAATGATGCTTAAAATGCCTTAAGACTTACAAGAGTTGACTATTGATTAAGCAACATGAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTACTGTACATAGTCTTCTTACATAATATAATATAGATGTTTTTTTTATAACTAATATAGAAGTGATATATTATAGAGAAAGACAAATTCGATGACCAACTGTTGAACTATAACAAATTTAATGGCATAGAATAGATTTTCTCTGAAAAATAAAACTATTTTGACAAGTTAGATTAATGTCATAAAATTTTAAATTTGATTTTACAAATTAGCGAAACAAATATGACGTGAGCACACGTATACGTAATCCATTCTTTTTGGTATGAGTTACTGATACTGAATTTGAATTCCCACATATTTGTGGATAAATATATTATTAGTAGTGTGCCTGTGCTAATATATCCTCTAATTCTTTTTCAAATTCTTTCACAACTATTTAAATACAAGCAACAACGAGGGGAAATTGCCTAGGATTAAAATTCCATTTCCAGATTTCTACAGGATCTCTTTTCAAGATCGATCAGTTCGCGCACCAAAAAGCTTGACAATTTTGTGCTCTGTTTTCAGATATTGAAGCTGGCGTCAGAGCGACGTTTAATCTGAAGGTAGAGCTCATGTCTTTTTCTATAAAGCTACAACTCCCGGTTAATATATATATTTGAGGTGTTAGTGATAACTAGGGTGTCCATCGAACATTAAAAAAAAACAAAAGTATATTTCCTATATCAAGATATAGTTGATTATCAACTTGAGACCAAGAGATAGTTTAAAACCCCTCATTTAGCAATGGATAGACAACCTGTATCATGATCTGTAAATACTGCAATTTTACTAACATGTTATAATATATACAATATAGGATCATGTCCAACATTTTCTCTTAAAAAAACATATACTTCATCCCTCCTTAAAAAACCTAGAAACGGATAAAACCTAGAAACGGATGGTAGTCTGTCCAGATTCATACTATTAGAAAATATCTTATCCAATTCTAAGTCTCATATTTTATTACGGTAGAGTAGTTGATTAATGATCTAGCGGCAATTAATTTTATGTTCGGGAGATTGTCAGGGCTATCTGGTAGGTAATCCGAGTACAGGGGAACGCATTGACCTCGAATCAAGAGTGCCGTACAGCCATGGAGTCGGAATCATTTCAGATCAGTTATATGAGGTGAACAGTCGAACACGCGGCTCACAAAATTTAATTATGTCCTAAATGATTCCTGCGTGATCTTTGTTAACTCTGATTGCACATGCATCACGTGGTTTGTCTGAAGATGATAATGGAGCACTGCGAAGGTGAGGATTATGACAATCCCAGCAACGTGATTTGCCAACAAGCTTTGGCTAGGTTTGACAGCGTAAGGAGACAAGTACACTCTTTTTTTTTCCTCGATTGTATTAGTTGAATTTTCATATTATCGAAAAAACTATTTAGTTGCATTTTTATATTATCGAGAAAAAGAATTTCTTGGATAATTCTGTCTGAATTAACTTATTAACTACGAATGTCTAAAAAAATGGCGTTTTCTGTGTTTCTCAAGAATATCTAGTCCTTTTAGTGTAATTTATTCTTTTTGCAGACAGTAGTAACATATATACAGTAGTAACATGTATTACTCACACGACAGCAAATACATATCCACGTGTCCATCCTGTATGTAGGACTAACACTTTTGCCCCTTTGGAGCAAAATATGCACCTGCTGTTATAAACATACATAGACCCTGTTTGGATCCGGAGAGCTATTAAATAGCCCTCCGGAATCTTGCTATTTAGGAGTATTAAACGTAGATTACTGACAAAACTCATTCCATAACCCCTAGACTATTTTGTGAGACAAATCTAACGAGGTATATTAATCCATGATTTGCTACAGTGACGCTACAGTAATTAGCCGCTAATCATGGATTAATATACATAATTAGATTCGTCTAGCAAAATAGCCTAGGGGTTATGGAATCTATTTTGTCGTTAATCTACGTTTTTAATTAATACTTTTAAATAGCAAGATTTCAGAGGGATATTTAATAGCCCAGAGGATCCAAACAAGGCCATAACAGAGATTTGCTAACCAGCTGAATGCCCGTCTTTTGATAGAAAAGAAAATATGTGCCCGTATTAATGTGTTATCTTGCTATAGAGAATATTGACCTTAATCTAATTTTATATGTGTAGACTTGATTGTTTGTAACTTAAACTTTGTATGATTTGGACCTTAGTTTTCGGGCACATAATATATAGGTAGTCCCAAATAAATAGCATTCACGTGTACTTCTCAAATTGATGAATTTTAATATTTAAACTAAGAAGGTGGCCAGCGCGTATGCATGGGCATCCATATTATTTAAATGTAATATTATATTTTGATATGTATTATAATTAAGGGCAACTCAAAGTCACACGTATCTTAAAAACCATTCATCGAAATTTAAATAAATGATGGATTTAAAAACCATTCATCGAAATTTAAATAAATGATGGATTAAGGTCACATGACTTTTGAATCAATTTAATGATAAACTGCCGTAGCTAATTATCACTTCTACCATCCGTACACATAGAGTGTAATATGGCTATAAGCAAAACTTGTGAGACTAAGGAAATCAAAGTTCTTTGTGTTGAATCATTTCATGAAGGCACATGATACAGTGACAACCAAATTAAGGATAGATTATATGTTGGATTTTTTTTCTACGTAGAAGTTCAACTAGTTCAATTTTTTACACAGTTTTGAAGAACTTTAAAGGTATGTTAGAACACATAACACCCACACAATTGCTTGGCTGGTAATGCAAAATATTAGCAATTGTTTCAAGCTAATTACTTTGTTTTTTCATGCTTGATTGTTTTCTTTGAAACAACATTTGTTTGAAATAAGATCAATAGTGTATAAATTTGATTAGTGTGTGTAGTGTACTTATAAATTTTGAAGTGTTCTATAGTAAAGTTTGCTTTTCTCATGTAATCCAATTATATCAAAGAATATAGTTTTACCATGTAAATTATAATCAATAAGTTCAATATAATTTATATCATCATAATTAATGAATCTTATTTAAAAAATATGACTACTTAAAAAACTATGGTTCGCTTTTTTTTTCTCCTTATTTACTGGTGCCTTTGTCTACTCGGAATCAAAGAAAAAAGTAACACGTCATGCCATAGTTGATATATGGCTATATGCTATTTATCAGTACTCTATGTCCACTCATTGCTCAGTAGTGTCTTCCACTCACCAATCATCTTGTGATAATCATATAGACAATATTTGTCTATTTGTTTAGTTTACCTAAAGGGCAACACCACATTACTCCTTTCTCATGCATGGTCGTAGACTCTAAAATGATTTGCCCAAAGCATGTTCTTCATTAACACATGTAACTAGAACATTAATTACATAATATACAAGTGTGGCACACTTGGTAATTTCGTTCTAGTTTCACCCCTGTTCTGGAAAAAGCGCTTTAGGAAACAATATATACATAATTCTTTTTCTGAAACACATCATTTAGGAACTTGGGAAATGTGCAAATGAAAATCCAAAATCCATTAGGTAATCAACCCTTCATTTTAGCTTACACTGAGTTGCATTTTGCAAAAACTTGACCCACTGGACTTGATTATTTTCCTTTTGAAACACACGTCCAATTTGTTTTCACTTTATTAACAAAACAATCATTATTGATTGATGATTGGATGTGT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