Difference between revisions of "BGIOSGA034174"
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Revision as of 17:42, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034174 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034174, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_35748 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034174-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034174-PA |
| Length |
16456 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:7685171..7701626 |
| Sequence Coding Region |
7701370..7701626,7700869..7700983),complement(7700492..7700599,7698503..7698726),complement(7697981..7698176 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:7685171..7701626 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:7685171..7701626 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGACACGGAGGAGGAGCGCCGTCTAGGGCGCGGGTCGGCGGGGGCGGAGGCGGGGGCCGATGGGCAGGAGGACCCTGACGGGGATGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGTACGAGTTCTGCGACGCCGAGGAGGCGATGCAGTGCGTGGAGATGGCGGAGCGGAGTGCCCCCGACGCCGGCGTGCATGACTACGAGGCGCTCGCCGCGCGCAAGCGCAAGGCCCTCGCCGAGGAGCGAACCGAAAGGGATGCATCTTCAAAGAAGCCAAGGCAGGATGGGCTTTCAGAAGTGGAAGCAGCGACTGTGTTTGACCAACTAATGGAAGGCTTTGGCCTTCGTAGGAAAAGAAGGTCCAAAGATGCCAGGAAAAGGGGAAGAAAGAAAGGAACAAGGAATAAGTACAGTCCTGAAGTTACTAAAAAATTGGGTGATGCCACACTGCTTTTTACAGAGAGCAGATTTAAGGAGGATGACAGTAACCTTTACCTTGTCTACTCTACTAAACTGCAGGCAATTCCTATATTACATGAGGTTGTGCGGATCGCGCCGAATTTGTCAAATTCATACCATCTACTTGGTAGCATTTATAAAGAGTGTGGTGAACTAGATAAAGCCATAAACTTTCTAATGCTCGCTGCATATGTTTCTCCAAAGGATGTATTTTTGTGGAAGAAACTCATTGACATGGCATTGAAAAAGGAAGATGCTGCTTTAGCAAGACACTGTGTTTTAAAAGCGATGAGAGCAGATCCTGAAGATGTAGGACTGAAGTTTGATTGTGCTAATATATATCGCGCTTTGCGTGACTATCAGAAAGCTGGAGAGATATACGAGCAGATAGTCAGAATTTATCCTTCAAACATTGTTGCTCGTAAAGCAGCAGCACAGATGTACAGGGACTGTGGTCAAATTGATAAAGCTATTAATTTATTGGAGGATTATGTGAATGCTCAAACTACAAACATCGACTCGAATCATCTGGATCTACTGATATCCCTTTATCTGAGAAATAATGCCTATAATGAAGCATTGAGGCTGATTGATAGAGCACATATAGTGTTTGGATCTCAACACAATTTGCCAGTACAATTGCAGGCAAAAGCTGTAATCTGCCATGCTTATCTTGGAGATATGAAGCATGCCGAGGTGTTTCTTCAGAATGTGCATCTGGAGCGTTCAAAAGATAACACCGATGTGATCAAGGAGGTTGCTAGCACTCTCGAAAATTTAGGACAATATGAGTATGCAATAAAGTTTTACCTGATGATTGAAGATGTTGCTGTTCATAATGATGGTAGTTCATATGTGAAAGTTGGTCAATGCTACATGGTCATAGGGGAGAAAAGGAAAGCAATTCCTTACTTTCAGAAAGTGTCTCCTGATGATCGGGACAAGGCTAACACCGATGAGAGCGATCTCACCTTTATCCCTGTTTCAGACCCTTATCCTATCCATGAATCAATGTCCATAACATATAAGATTGTGAATTTGGAAGCCTTGCAAAGAATGGAGGACAACATTGATGTGCGAATAACTTTATCCTCTCTTTTTGTTGATGTGGATAAGAGTGACGAAGCTATTGTTTTGCTTTCTCCTCCTAACAATTCAGGGTCAAAGTCTGCTACAGATCAACCGAAGCCATGGTGGCTTGATGGGAAAGTAAAGATGCACCTTGCGAACATATATTACAATAAAGGCATGTTCGAGGACTTTGTGGGCACCATTCTTATACCCATTCTTGAAACACTGAATATTGAGTATGCTAATCGAAAGGTGAGGAAAGCTAAAAAACTTCCAACTAATGTTCTATATGAAAGAGCCAAAGTGTTAGCTGAACAACGTCCAGAAAGCGTGTTTCAAGGATTAAGGCCAATAGCATCACCGGCAGAGTTACAAAAGGCAAGCAGAGCAAAGAAGTTGCTAGAGAAAAGAGCAGCTTCGAATGAAGATACGATAAAAGATGATCTGCTTTGCCAAACATTAGCTTTGCTTCACCGATACTGGGAGGCTCTACAAGTTATCAACCGTACTCTTAAACTTGGAAATGATACTCTCGCTGATGAGAACAAAGAGGAGCTCAGATCCTTGGGTGCTCAAATAGCTTATAGAGCTCCAGACCCTAGACATGGCTTTAATTATGTCCGCTATGTAGTTCAGCAGCATCCATATTCCCTTGCTGCATGGAACTCATACTACAAGGTGACATCAAGAATAGAAGATAGGTTCTCACGTCATCATAAATTTCTTCTACGGATAAGAGAAGAAAAGACTGACTGTGTTCCTCCTATAATCATATCTGGCCATCGATTTACGGCTATCAGCCAGCATCAGTCAGCTGCTCGTGATTATCTGGAAGCTTATAAATTGAACCCAGAAAATCCATTTATAAATCTCTGTGTTGGATCTGCTCTAATTAATTTAGCCCTTGGCTTTAGGCTTCAGAATAAGAACCAGTGCATCGTTCAAGCTTTGGCATTCCTCTTTCGATATCTGCGTCTTTGTGACAACAGCCAGGAAGCCTTGTACAACATCGCTCGGGCGTATCATCATGTTGGCCTCAACACCTTGGCAGCAATTTACTACGAGAAGGCTTTAGCCGTTGAGGTGAAAGATTACCCTATTCCCAGGCTTCCATACGAGGAGAATTCCTGTGCCCAGCAGGATCTCAAGCCAGGGTATTGCGATGTACGAAGAGAAGCTGCGTTCAATTTGCATCTGATTTACAAGAAAAGCGGAGCAGATGATCTCGCCAGACGGATTCTTAGGACTTACTGTACTATTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDTEEERRLGRGSAGAEAGADGQEDPDGDEEEEEEEEEEYEFCDAEEAMQCVEMAERSAPDAGVHDYEALAARKRKALAEERTERDASSKKPRQDGLSEVEAATVFDQLMEGFGLRRKRRSKDARKRGRKKGTRNKYSPEVTKKLGDATLLFTESRFKEDDSNLYLVYSTKLQAIPILHEVVRIAPNLSNSYHLLGSIYKECGELDKAINFLMLAAYVSPKDVFLWKKLIDMALKKEDAALARHCVLKAMRADPEDVGLKFDCANIYRALRDYQKAGEIYEQIVRIYPSNIVARKAAAQMYRDCGQIDKAINLLEDYVNAQTTNIDSNHLDLLISLYLRNNAYNEALRLIDRAHIVFGSQHNLPVQLQAKAVICHAYLGDMKHAEVFLQNVHLERSKDNTDVIKEVASTLENLGQYEYAIKFYLMIEDVAVHNDGSSYVKVGQCYMVIGEKRKAIPYFQKVSPDDRDKANTDESDLTFIPVSDPYPIHESMSITYKIVNLEALQRMEDNIDVRITLSSLFVDVDKSDEAIVLLSPPNNSGSKSATDQPKPWWLDGKVKMHLANIYYNKGMFEDFVGTILIPILETLNIEYANRKVRKAKKLPTNVLYERAKVLAEQRPESVFQGLRPIASPAELQKASRAKKLLEKRAASNEDTIKDDLLCQTLALLHRYWEALQVINRTLKLGNDTLADENKEELRSLGAQIAYRAPDPRHGFNYVRYVVQQHPYSLAAWNSYYKVTSRIEDRFSRHHKFLLRIREEKTDCVPPIIISGHRFTAISQHQSAARDYLEAYKLNPENPFINLCVGSALINLALGFRLQNKNQCIVQALAFLFRYLRLCDNSQEALYNIARAYHHVGLNTLAAIYYEKALAVEVKDYPIPRLPYEENSCAQQDLKPGYCDVRREAAFNLHLIYKKSGADDLARRILRTYCTI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..257#644..758#1028..1135#2901..3124#3451..3646#4142..4399#4644..4790#6051..6129#8217..8339#8526..8639#8714..8877#9942..10060#11312..11387#12395..12521#13582..13696#14619..14809#14899..15011#16187..16456#ATGTCGGACACGGAGGAGGAGCGCCGTCTAGGGCGCGGGTCGGCGGGGGCGGAGGCGGGGGCCGATGGGCAGGAGGACCCTGACGGGGATGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGTACGAGTTCTGCGACGCCGAGGAGGCGATGCAGTGCGTGGAGATGGCGGAGCGGAGTGCCCCCGACGCCGGCGTGCATGACTACGAGGCGCTCGCCGCGCGCAAGCGCAAGGCCCTCGCCGAGGAGCGAACCGAAAGGTGATCTCGTTGAACCTGCTCCCTAAGATAATTTCTCTTTGCTAAGTAGCTTTATAATTATATTTCGTTACAGTTTGGTGTAATTCCACTGATGCTACTGTTTTTCTATACTCTAATCTTCTAGTCTAGTAGTGGTTTCATGAGCAAATCGTGCATTTCTTCTTAAAAGATATCTTTGTTTTTTTCTTTTCTATTTAGTTTTATCAATCACCTCTCCTCATGTCATGATCTTTGAACTTGCGAAGTATAATTAAAGCTTGTTTTTGTCTTTGCGTTCTGTTTTAAGTTGTCTGTTCCAGGCATTGTATCACCTCCTCATCACATACCGTGTTGCAAAGCAATTGCATTTCCTGAGTATACATTTCAATGTCTTGGTCATCATCCAGGGATGCATCTTCAAAGAAGCCAAGGCAGGATGGGCTTTCAGAAGTGGAAGCAGCGACTGTGTTTGACCAACTAATGGAAGGCTTTGGCCTTCGTAGGAAAAGAAGGTCCAAAGATGTATGGTACCATTTTTTTAATTTGTCAGCACAAATGATGCAAAAAAAATTCCCTTGTAGCATTGACTACGATGTGCACAACACAAGTATATTTTTGTCTTGAATCTTATAGAAATGAAATCTTTGTAGAAACTATTCTTGAGTTGATTTGGAAAATATTTGGTGTAAATGCCTAAGTTTTAATTTACACTTGAGATTGAGTGTTGTTCTCAATGCAGTTCATAAGTGATCAACATAATTTTTTACTTTTTATATTTTCATTTTCATCAGGCCAGGAAAAGGGGAAGAAAGAAAGGAACAAGGAATAAGTACAGTCCTGAAGTTACTAAAAAATTGGGTGATGCCACACTGCTTTTTACAGAGAGCAGATTTAAGGAGGTCTAATCTCTATCTTTCTTAGTCTAATCAATAGTTGTTGGGGGATATTAATTACATGCTCTATGTTTGGATAAGTGGTTTGAAGGACGTTTATTGTGTATTTGTGTTGTTGTGGCAAACTCAATTTTTCTAGTGGCAATATTGTGACTGTTGCTTCTGATTTAGCTAAAGACTGGAAGTTCTCTTTTTTCTTCTTGTCATTCATAAGTTGCATGATCACTAAATGGATCAGCTGGATGATTTGGAATTTTGCATGTTCATTTGACCTCGTTGTCTACTATTGGTACAAACTTTTGTTATGGAGTATGCTTTGGAATTGTTTTCACCTTAATCTGTCCAAGTTCTCAGTGTCTTCAAAGATTATATGAGCTGGTCTCCACAAGGATTATTAGTAATTGATCTGCTTATGCTTGATTATAATCTTGTGTAGTCGTGTTAATCCAAGTACTAGGCGCTGGTCAGGTGGCAGGCTGGGGCTCTGTGCCTAACTATTGATTAGGTGTGCTAGGCATGAAAACTTGGCTAGGAAGCGTAACAGGCAGGATATTTTACTAAGGAAACAAGATTGAGAACGAACAACCTTTTTTTAGTTATTCTAGAAACTAGATCGGGGCATGGCAGTTTCAAGGGGTGATAAGGTCTGCACCATCATGCAGTCACCTCATCTTCATCAAAGATGTGAATGCCATGTGAACACATTTCTGTTCTCCAAGGCTTGTGTGTCATGTTTAACTCTTGTTGTAATTCCTGTTCCCATCTTTCCTTAGGAACTGGAGATGATCAATGAACATAAAGTTGTGACTTTTCGTCTTGCTATTTCTTGACTATTCAAGTTTAGATATTGGAAGTCGCTGAAATACGGAGCGGATTTCTGATTCTGGAGTTCTTATGAGCATCTGATGAACCACTTCTGAAGAAACAGATTTGTGGAACACCAAAAAATAGGCTTGGTTTATTATATCCATTTGAGTTAGAAGTTTCCTTTGTTTATAAGAATAGATGCAATTGCTCGCTGATGATTAGAACAATTAAGAGTTTTGCTCCATTTGGTCAGATTCTTACTGGAGATGAGTTTCCTGTGTTGCAAGAATTGCTTTATAACACATACTTTAAGTTTTCTTATTGATTTCCTGTTGGTTTCTTGGATAAAACACAGCTCAGATATACTGTTCTTGGAACAAGACAGAAAATGTTAAATTCATGAGATTCCGCATTCAACCATTATCTTTGCAGTCAATTTACATATACCAATAATTTCAAGTAAATGAAGATTAAAAAAAAATCCAGGTAATGTTAATCCTTAATCATCAAACAAGACAGCCATCCATTTGATTGAGGGTATTTCAGAAATTTCAAACCTTCAGCTACAACCAACAGATCAATGAAAGGGCAGGTTGTCAAATACACAGCCTTAGCTTGTTAAGACTCATAATCCTTTGTGAAATCCCACCTTTAACCAAACTACAATTTATTGTGGTAGCAATGGGGGTTGCTAGGTGAAACTAATTGTTGATGTAAGGAAAGTCCGGTTCATCAGAAAAACCAGCAGTGTAAATAGTATCACTGCCAGTTTGACTAATCTAGTTGTTACAGACTCATTTGTTCCAGAACCTTATGACCAAGAAACCTGGGGTTTAGTAACATTAGGCATGAAAGATAGGGTTCTGTGCAGTTATGACCATAAAATATGTGATTTCAATACTATAGAATTTTTAGAAATTTTTACAATCTAACTTTATCAATTTCTATTATGTTGTTTGATTAGGATGACAGTAACCTTTACCTTGTCTACTCTACTAAACTGCAGGCAATTCCTATATTACATGAGGTTGTGCGGATCGCGCCGAATTTGTCAAATTCATACCATCTACTTGGTAGCATTTATAAAGAGTGTGGTGAACTAGATAAAGCCATAAACTTTCTAATGCTCGCTGCATATGTTTCTCCAAAGGATGTATTTTTGTGGAAGAAACTCATTGACATGGCATTGTGAGTTAATGCTAATCCTTTTTCCTTTTTCTATGTTTCATTTTTTTAATTCTATTCATAAACTTTTAATTTGTTACAGTAGTTAGCTTGATTTATGCAGAGTACAAATGTTGCATTCAGTAATATGGTCTCATCCTCAGACCTCAATTTTGCTTTTATGTTTTATGATACTAATTTTCAGGAAGCCTCTAGTTCTTGTTAATACATGAACCCAAAGTACCTTAATTGCTGATTACCTAGCATAATTTTTTCTTGGAGGTAAGGCATACAATGGCCAGAAATAATAATATAACGGACCATATTGACTACTTTATTATATTTGTCAGGAAAAAGGAAGATGCTGCTTTAGCAAGACACTGTGTTTTAAAAGCGATGAGAGCAGATCCTGAAGATGTAGGACTGAAGTTTGATTGTGCTAATATATATCGCGCTTTGCGTGACTATCAGAAAGCTGGAGAGATATACGAGCAGATAGTCAGAATTTATCCTTCAAACATTGTTGCTCGTAAAGCAGCAGCACAGGTTTATTTGCTTATAACAATTCTTGCGTTATTTTGTGGTGCATATAAATTACAAATTGATTTTAGCTTTTATGGGCTAGTAGCGTTGGTGAATGAGGTTCTTCCTGGTAGCCAGCGGCAGGGAACCATTGTAGTCAGGGACAAGAGGGAGATACAGATATAATGATCTTTCATGCCTCTATTTGAGTCAATGAATACAAACATATAGGTCCCTAGACATGCATGTAAACAAGACCAATTAGCACCATCCAAACAGGACACTTATCTCTATTTAGCTTAAGGCACAAGCAAGTATGAGGGCTCTTAACTTCTATAGACTCTTGGACTCCTGGATGCCAACTGCTAAGACTTGACTCTAGACACCTGGATGCACATGACACAACTAAGAACTCATATATCTGAACTGCTATCTAATCACTGAAGCCAGTACATAACAATATGGACTGCTGAGTTAGTTCTAGACTTCCACTTATTGCTTTGTGACTTTTTTGTCCAGATGTACAGGGACTGTGGTCAAATTGATAAAGCTATTAATTTATTGGAGGATTATGTGAATGCTCAAACTACAAACATCGACTCGAATCATCTGGATCTACTGATATCCCTTTATCTGAGAAATAATGCCTATAATGAAGCATTGAGGCTGATTGATAGAGCACATATAGTGTTTGGATCTCAACACAATTTGCCAGTACAATTGCAGGCAAAAGCTGTAATCTGCCATGCTTATCTTGGAGATATGAAGCATGCCGAGGTTTGTCCCAGTTCTGTTCCATTATAGCACACACTTGACATAATTTATCCTTGATTAGTCAAAACCCACCTTTTGCTACCATTGGTTTATTAGACACTATAAATCCTCGATATGACTATAAATTGCTCTGATAACAGGTTGTACTCTGCAAGATTAGATTGTGCTTGTGTATATACTGTATCCAAGACTACTTCAACGTATAGTTTTGAGTTTCTTAGTTATTGAATTGGTATTACTTGTGCAGGTGTTTCTTCAGAATGTGCATCTGGAGCGTTCAAAAGATAACACCGATGTGATCAAGGAGGTTGCTAGCACTCTCGAAAATTTAGGACAATATGAGTATGCAATAAAGTTTTACCTGATGATTGAAGATGTTGCTGTT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