Difference between revisions of "BGIOSGA034544"

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Revision as of 17:44, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA034544

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034544, complete gene.

LocusTag

OsI_35010

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA034544-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA034544-PA

Length

7425

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:1393589..1401013

Sequence Coding Region

1400932..1401013,1400305..1400345),complement(1399821..1399881,1398424..1398542),complement(1397068..1397155
,1396265..1396350),complement(1396074..1396181,1395170..1395258),complement(1394486..1394529
,1393589..1393602

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:1393589..1401013 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:1393589..1401013 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCACGTGGAAGCCTACGAGCGTGGAAACATGACCGAGAAATCTGAGTCGTCACGCTCGCGCCTTAGCAATTCCATCTTAGGTTTGCCAATATCATCGTTATTTCCCTTCTTATACTTCATGATAAGAGACTTGCATGTTGCAAAAAGAGTAGAGGACATTGGATTCTATGCAGGTTTTGTAGAGTTTGTCAAGCAACACACTGGTCCAGCTAAAGATAAGAGCTTATTTAAGAATTGGCCATTAATGTCATCTATTGTTCTCTTCTGCATTGTCTCCTTCGATGACATGGCTTACACAGAGATATTTTCTCTATGGTCTGAAAGTGACAAACAATTTGGCGGACTAAATTTCTCGTCTGAGGATGTTGGTCAAGTTCTTGCAATTACAGGTGCTAGCATACTTATATACCAGACATTTATCTACCCACATATTGTGAAAGTTCTAGGAATAATCAACACTTCTCGTGTTGCAGTAATTCTTTCTATGGCACTTCTTTGTAGTTATCCTCCTATGACATATCTCTCAAGACCTTGGTTGTCCATAGTAGTAAATATTGCATCGATGCTTAAAAATAACTTTGTGCCCCAGCATCAAAGAGCAACGGCAAATGGCTTAGCCACCACTTTAATGTCCTTCTTCAAGGCATTTGCTCCAGCAGGAGCAGGCATTCTGTTTTCGTGGGCACAAAAACGCCAACATGCGTTTTTCTTTCCAGTGGCATTTGATTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHVEAYERGNMTEKSESSRSRLSNSILGLPISSLFPFLYFMIRDLHVAKRVEDIGFYAGFVEFVKQHTGPAKDKSLFKNWPLMSSIVLFCIVSFDDMAYTEIFSLWSESDKQFGGLNFSSEDVGQVLAITGASILIYQTFIYPHIVKVLGIINTSRVAVILSMALLCSYPPMTYLSRPWLSIVVNIASMLKNNFVPQHQRATANGLATTLMSFFKAFAPAGAGILFSWAQKRQHAFFFPVAFD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..82#669..709#1133..1193#2472..2590#3859..3946#4664..4749#4833..4940#5756..5844#6485..6528#7412..7425#ATGCACGTGGAAGCCTACGAGCGTGGAAACATGACCGAGAAATCTGAGTCGTCACGCTCGCGCCTTAGCAATTCCATCTTAGGTGTGTAAACGTAATCGTGCACACCGTGGACCCATGGTTGCTAAGTATTAGACGGACCCTATTATGTTTGCATATCCATTTTTTTTCCATTTCCACCAGCATTGCAAGATGTGAATGCTTTATCAGTCATTTCTAGTTCACCTGAATTTATCTTATAGAGGATTATTTTGTACTACCTCCATTTTTTCTTTTTATATAGATGACTCATTTGACTTTTGGCATAATGTTTAATCATTCGTCTTATTTAAGAATTTAGTATAAATATGAAAAAAATATGAGTCACATAAATTTTATGAATAAGAGAAATGGTCAAATGTCACGTTAAAAGTTAAAAAAATAAAGAGAGTATTAGTGTCTAAAATTAAGGGGCTAAAAGGAAAGTTCAAGCTTGTAATCGTTGGTCGAACTATTGAAGCAAAATTCTAAATTGTTGTTTCTTGCATCTCTTTTGCATCTTTATTTATCTTGTCATTGGCTTAGCTTGTTCCATTGATGCGGGCCTGTGAGCTTTTCATGGTAGATTTTTAACCTTTCATCCTTACAATATTTTTTTTTACTGAATTCCATCCTTATAATTGAATTTCAGGTTTGCCAATATCATCGTTATTTCCCTTCTTATACTTCATGGTATGTATTTATGATTGTAAAATTTACAATAGCACCAAAAGTATACTCTACATTGTATAAGTTTTAGTGTAAATTAGCTGTTTCTATTTCTCATTAGCGGAATTTGTACCTTGCATAATTTTATCATTTGGTTCCATGAAATGTTGTTCATCATTCATGTAGCAATTCAAATTTCTCTAGTTTCCATTTATATTAACTAGTTTTTTAGTCTTGGAAACGGAAATAACAGTAAAGTTACCACCTAATTCCTAATTCTTCAAGCTATGTATAGTCATATATATGTTGCTATGTATACTCATACTCATATGTTTTGGCTAATCATTGTTTGAATAAAAGGTAAGCTCATAGTTTAATTCTCTTCTTCACAATAGGTAAGAGATTATAACATTTATTTTTATTGTATATTTCTCTTGTCCACTACAGATAAGAGACTTGCATGTTGCAAAAAGAGTAGAGGACATTGGATTCTATGCAGGTTTTGTAGGTAAGCAATTATAATGTCTGTAATACCAAAGGTCATGCTTTTACTTAGTAGTGACAAATGTTTTTTACACCTATTTATCTATCGCAAACATGGCATATTATAATTCTCAACCTATTAGGTGCGTCATATATGTTTGGTAGAGCTTTAACTTCCACTGCTTGGGGGATGGTAGCAGATCGTATTGGGAGGAAGCCTGTTATCATTTTTGGAATTTTTTCAGCCTAAGTACTTTTTAGTTCAGTTCCGATTGAACCAAGTAAGTAATGATTTGTATTACCTTCTTTATATCCACCTATGATTACTTTACCTTGTGTTGTGAAATCAGATTTGTATTCAATACTCTCTTTGGACTAAGTACACACTATTGGATGGCAATAACTACACGATTTCTTTTAGGTTCATTGAATGGCTTACTTGGACCAATAAGAGTACGGTGATTAAATTATCTAAATTCATATTTTCTATCCACTATTGAAATACTATAACTAGCTAGCATACTGCAACCGGGCTTTACAGGCTTATGCCGTTGAAGTTTGTCGACCAGAGCATCAATCCATTGGATTGTCATTGGTATACTACAAAGTTCTATAATATTTTTTACTATAGTTATATTGCACTTTAGATTATGACACTCTTTTTATATGATTAGGTTAGCACATCATGGGCAATAGGTCTCATTGTTGGGCCAGCTATCAGTGGATATCTTGCACAGGTATCCTACTAAATTTTAATACCATATGAGTTGTGTGCATGCTTAAACAATGCATTGACGCTATTATGATGCTTTTGTTTCATTTGACAGCCATCAGAAAAATATCCAATTCTATTTTTAGCAAACTCATTATTTGGAAGGTATCGTTGTTATAGGAAATATAATTGTTCTAGATGGTATAACTCCTTAAATGACTGATTCTTGAAAATCTTTCCTTAGGTTCCCATATTTTCTACCTTGTTTATGTATATCGATCTTCTGCTTCGTTATTCTCATAAGTTGCATTTGGCTCCCGGTATCTGCACAACTAGCCAATTTTATTCTTATTGATATTACTTTGGGCACACATAATTCTTGTTTTTATGCTTCCCTTAGCTAAAATTTATCTTACGTACTAAAATACAAAAGTTAATTAATATTTTGCTAATACTTTCAGGAAAATAATGTGTTTTCATTTCAAAATAATGTGTTTCATAAAATTTTAGGAAACACTACATAAATATTCAATAGAAAGAACTGAGATTGTAAAATTGGATCTTTGAGTACACATTTGGTTGACTCCGAAGAGTTTGTCAAGCAACACACTGGTCCAGCTAAAGATAAGAGCTTATTTAAGAATTGGCCATTAATGTCATCTATTGTTCTCTTCTGCATTGTCTCCTTCGATGACATGGCTTACACAGAGGTATGTACCAAGTATGTCTAAACTAATGGTGTAGTATTTCCTAGCTAAATGAGTCCAGATGTTTGAACCCAATAATGGGACAATTTGAACCATGCCACACAAATTTTGCGAATAATTGAGGAAAAGTTGCCCTGTTTTGGGAAATATCGATTAAACACTTCACCCAATTACAAAACTAGGGTATAGTGTTATCACTATAAATAATGCTTCTATGTTTATGTAAGAGAGATTTAATTTACTTCAAAAGGGCCACATGATTATTTAATCATTATAAAACAATGTTTGAAATATCATAAATATTTAATTGAAATATCTATTTCTCACCATGCATCCACTAGATCCTAAAACATTTTTATTATTTATACAATCATTTTTGTGTTATATAGAATTATATGTTGAACAAGTAATAATTTAATTTTGTAGATATTGTAAAAAAAATTGTTGATGAGACACATCCCATCTTCATCCCCAGCCATGTGTATAACAAGATAATAACATTTAGTTGAAGGACACACACTTATTAGTTCATGGAAAACAATGAAGCACATACAAGTTTTATTATAACATATAAATTTAATCAACAGAGGTAACCTACATGCATAATTGATATAATTTCTTTCTTTTACTTGCAAGTTGTGAACCTACATATGTTCTACCAATACGCCTTGAGGCCCTTGAACATTCTCGTCCTAGGGGAGTGCCCCCAAAGAACTATTTAGTAACATTAAATATTTTCTATTTATATTGGTGCTTAACATTCAGTCAAACTTTTAAAACTACAGCATTGATTTTATTTTATAGCAAGTTTATAAAAACTATTAAGTTTATAATACTTTGGAAGTGCTTTTAAAGGCAACTCTACACATACCATATTTGTTTTTTTATAATGAACCATTTAAGAAATTACCAATGGTCACAATTTCACCACATCTTGTCATTAATACGAACATAGACAAATGAATTACTCGATTTCAATTTTGTTCCTCTCCACCAATGAAATCATAGGGAAATTACATATAAATTGAATGATTAGATTAGGATAGCATGGATATGTTAATATATCTCTACTACTATATGTTTTATTATAACTGTATAGAATATTTTTTTTATTTGCATTTTTTTCTCCTTTGTCTTGGGAGTTCTCTTCTTACGATGATTAATTTCATAGCATCCTTTCTATAGAAAAATATGGTGCACACGTTATTTTGAATTTTTTTTCAGTAAAGTTGTTTTTTCAACCTTTGATGATAATTGAAATCAAATTTTAGATATTTTCTCTATGGTCTGAAAGTGACAAACAATTTGGCGGACTAAATTTCTCGTCTGAGGATGTTGGTCAAGTTCTTGCAATTACAGGTACATGTCAAGTTATCAAATTGGTCAATATTCTTGCATTCTATTCAGGGTAGCTAAATACACTATACAAAGCTTTACTGATATGTATTTATATTTAAATGAAGAGCAAGATGCTTTTCTACTGATGCGTGACAATGCATAAATGATAACTTGGTATAACATGGCCAGAAATAAATATTGGCTACATAACATCGCAAAAACTTGGTAATTAGCTGTTGGACACTTAATGCACAATTTTATTATATTTGGTGCAAATGGAGAGAGAAGCAACACGGAAAATACAGATTTGCCTTTGTATCGATCGGCTTGTAAGACGATTCGGACTGGTTAGAACTAGATCCAATCCATTCTCACTCCCTCGATGCAGTTCATTCTCACTCCCTAGTCTAGGTTTGGTTCGAAATTGACCTGATGGGGTTAAAAAGAAGCATGCCCTATGGACAAACTTGTCTTTTCTAAAAAAGTTATCTCCATTTGGACTAGATATAACAAAAAAACAATGTGTTCAATGTATGTATAACGGCTAATTACTGTGTTTTCACGATGTGCTGTAAGAAATACATTTTCTTTGAGTATCCTACAACAAAGACTATAAATTTTGAGTGCCTTATAGCAAATTTTGCCAAATTGTTTATACAATATCAACTTTTCCTATTTTGTTTAAGTTGTAGAAACCATATTTAATGGTATATTCTCATATCTTCTTTTATATCATAGGTGCTAGCATACTTATATACCAGACATTTATCTACCCACATATTGTGAAAGTTCTAGGAATAATCAACACTTCTCGTGTTGCAGTAGTAAGTACAAGTTCCCTTGATTATTCAATGAAAGTTTTATCTTTAATTTTATTTTAGTAATGTTTGTCTCTTATTTGTTGCAGATTCTTTCTATGGCACTTCTTTGTAGTTATCCTCCTATGACATATCTCTCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA034544