Difference between revisions of "BGIOSGA034967"
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Revision as of 18:18, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034967 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA034967 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034967, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034967-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034967-PA |
| Length |
24153 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:4399168..4423320 |
| Sequence Coding Region |
4399168..4399365,4399707..4399808,4403830..4404024,4404137..4404221,4405816..4405982 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:4399168..4423320 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:4399168..4423320 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGGAGGCTCAAGGTGTCGGAGGGCGGCAGCCCATGGCTGCGGTCGGTAAACAATCTCCTCGGCCGGCAAGTGTGGGAGTTCGACCCTGACCTCGGCACGCCAGAGGAGCGCGCCGATGTGGAGAAGGCGCGCCGCGAGTTCGCCGACCACCGCTTCGACCGCAAGCATTCTAGCGACCTCCTCATGCGGATGCAGTTCGCTAAAGAAAACTGTCAAAGGCTGGACCTTCTTGCTGTCAAGGGTGGAGAGCATGAAGACGTCATGGGGGAAGCTGTGTGGAGCTCTTTGAAACGGGTCAATGAAGATGGAGGGTGGGGGTTGCACATTGAGGGCCACAGCACCATGCTTGGCTCATCCCTGAACTATGTTGCTTTGAGATTGCTTGGGGAGGGTCCAAATGGTGGAGATGGATGCATAGAGAATGGTCGAAACTGGATTTTAGATCATGGAGGAGCCACATTTACGTCATCATGGGGGAAGTTCTGGCTCTCGGTACTTGGAGTATTTGATTGGTCCGGTAATAACCCAGTGCCACCAGAGTTATTACTATTGCCGTATCAACTGCCATTTCACCCAGGTCGAATGTCGTGCTATATCCGAATGGTGTATATACCCATGTCTTACGTTTATGGAAAAAGGTTTGTTGGCCCAATAACACCAGTTGTGCTAGAGCTAAGAAGTGAACTATACAATGACCCCTATGATGAGATTGACTGGAACAAAGCTCGTACTCAGTGTGCAAAGGTGTCAACCATGAAAGACGACAACACTAAGTCTTTTCTGAACAAGGTGAAGGATTTTTGGACTGAGATCACAACCAGAGAGTCGCAAGTTGTGAAAAATAACAATGCGGATGAGATTGAAAAAAACAACAAGAAGCGTTCAGGACTCTACCGCGACCTAATTGTGATGTTCGCCCTGGGTAGTGTATTTTGGAGTGGCGCGAAAAAAGCACTTTCTCAGNTAAAGGGTTGGGTTTTTTGTGTCGCCAGTGTATACATCAACTTCGCGCTAATCTCGATGATGGCATTAAATACTCTTGCTTGCTGGGTTGAAGATCCAAGCTCAGAGGCATTCAAATGCCATATTGCACGCGTATATGATTATTTATGGATCGCTGAAGACGGCATGAAGATGCAGATTTACGATGGCAGCCAGGTGTGGGACGCAAGTTTCACAGTTGAGGCCCTTGTGGCTACTGACCTTGTCAAAGAGCTTGGACCAACTCTTAAACGAGCGCATTCCTTCCTTAAGAATTCGCAGGAAAGCTATTTTCTATATGAAATTAAGTTGCTTGACAATTGCCCCCGAGATTTCAACCGCTGGTATCGCCATATATCCAAAGGTGGATGGACATTTACAACAGCTGATGATGGCTGGCAAGTTTCAGATTGCACGGCGACAGCACTGAAGGCATGTCTATTGTTATCAAGGATATCTCCTGAAATCGTTGGTGAACCACTGGAAATTGATGCACAATACAATGCTATTAATTGTCTGATGTCTTTCATGAATGATAATGGTGGCTTTTCAGCATTTGAACTCGTAAGGTCTAATACATGGCTGGAGCATATTAATCCTACAGAGGCATTTGGGCGTGCAATGATTGAATATCCGTATGTCGAATGTACATCATCATCAATTCAGTGTCTAGCATTTTTCAGAAAACTTCACCCAGGGCACCGCAAGGAAGAGGTGGAAAATTGTATCAGCAAAGGTGCTAATTTCATTGAGAAATCTCAGAGAAGCGATGGTTCATGGTATGGTTCTTGGGGGGTTTGTTTCACCTATGCCACATGGTTTGCAGTGACAGGATTAGTTGCTGCAGGCAGGACACTTGGGAATAGCGCTACAGTTAGAAAGGCATGTGACTTTCTCTTGTCAAAACAGCTTCCTTCGGGTGGCTGGGGCGAGAGCTATTTGTCAAGTCATGACGAGGTTTACACAAATCTTAAAGGCAACCGACCTCATGGTACGCACACTGCGTGGGCCATGATTGCACTAATTGATGCAGGGCAGGCTGAAAGAGATCCAGTGCCTCTGCATCGAGCAACCAAGGCTTTGCTCAACTTGCAATTAGAGGATGGAGAATTTCCACAGCAAGTAAGTAACAGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MWRLKVSEGGSPWLRSVNNLLGRQVWEFDPDLGTPEERADVEKARREFADHRFDRKHSSDLLMRMQFAKENCQRLDLLAVKGGEHEDVMGEAVWSSLKRVNEDGGWGLHIEGHSTMLGSSLNYVALRLLGEGPNGGDGCIENGRNWILDHGGATFTSSWGKFWLSVLGVFDWSGNNPVPPELLLLPYQLPFHPGRMSCYIRMVYIPMSYVYGKRFVGPITPVVLELRSELYNDPYDEIDWNKARTQCAKVSTMKDDNTKSFLNKVKDFWTEITTRESQVVKNNNADEIEKNNKKRSGLYRDLIVMFALGSVFWSGAKKALSQXKGWVFCVASVYINFALISMMALNTLACWVEDPSSEAFKCHIARVYDYLWIAEDGMKMQIYDGSQVWDASFTVEALVATDLVKELGPTLKRAHSFLKNSQESYFLYEIKLLDNCPRDFNRWYRHISKGGWTFTTADDGWQVSDCTATALKACLLLSRISPEIVGEPLEIDAQYNAINCLMSFMNDNGGFSAFELVRSNTWLEHINPTEAFGRAMIEYPYVECTSSSIQCLAFFRKLHPGHRKEEVENCISKGANFIEKSQRSDGSWYGSWGVCFTYATWFAVTGLVAAGRTLGNSATVRKACDFLLSKQLPSGGWGESYLSSHDEVYTNLKGNRPHGTHTAWAMIALIDAGQAERDPVPLHRATKALLNLQLEDGEFPQQVSNS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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