Difference between revisions of "BGIOSGA035202"
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Revision as of 18:20, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA035202 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035202, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0433200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035202-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035202-PA |
| Length |
10137 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:11355146..11365282 |
| Sequence Coding Region |
11355146..11355295,11357516..11357674,11357772..11357883,11357968..11358087,11359686..11359843 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:11355146..11365282 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:11355146..11365282 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACCCACCACGCCCGCCGCCTCCCCGCCGCCGCCGCCGTCCTCCTGCTCGTCCTACTCGCCGGCGGCTCCGCGGCCGACGACGCCTCCAGCGACGACGACGCGGGCGTCCCGCCGTCGCCCGGCTGCTCCAACAAGTTCCAGCTGGTTAAGGTGAAGAATTGGGTAAATGGAACTGAAGGTACAATTGTTGTTGGGTTGAGTGCAAGATTTGGAGCCTCCGTGCCTCGAGATATTCATGAAGCTCAGAAAACATTTGCTGTCCTTGCAAATCCACTTGATTGTTGTTCCAATTCGACATCAAAGCTAACAAATTATATTGCTATAGCACAACGTGGAGAATGCGCTTTCACTGCTAAAGCAAAGATTGCACAGACTGGAGGTGCAGTTGGTTTACTAGTTATCAATGATAATGAAGAACTTTACAAGATGGTTTGCAGTGACAACGATACTTCCATTAATGTTACAATACCTGTTGTAATGATACCACAGTCAGCTGGAAAAAAGATGAAGGGCCTCTTGGATCAGGGAGCAAGGCTGGAGGTGCAGCTATATTCACCAAATCGACCAGTTGTAGACCTTTCAGCATGCTTCTTGTGGATAATGGCTATAGGAACCATAGTTTGTGCTTCACTCTGGACTGAATTTGTTGCATGCGAGCAAGTTGATGAGCGTTATAATCAGTTGACACGGAAGGATGGGCCTAATTCTGGAACAACCAACAGAGAAGATAAAGAAATCTTCGAGATCAGTGCCAAGGGGGCTATTGTTTTTATTTTAGTAGCTTCAGTTTTCCTCCTCCTCCTCTTCTACTTCATGTCTTCTTGGTTCGTCTGGCTGCTAATTGTATTATTCTGCATTGGTGGTATTGAGGGTATGCATGTTTGCTTGGTCACACTTCTCACTAGGATTTGCAAGGATTGTGGACAGAAGACTGTACAACTCCCCTTTTTTGGGGAGGTGTTGACCCTTTCTGTTCTGATTGTACCATTTTGCACTATCTTTGCAATTCTTTGGGCTGTCTATCGGCATGCTTCTTTTGCTTGGATAGGCCAAGACATCCTTGGAATCTGCCTGATGATAACTGTGCTTCAAATGGCACGCTTACCAAATATCAGGGTTGCATCAGCTCTTCTTAGTGCTGCATTTGTGTATGATGTTTTCTGGGTGTTCATTTCACCTCTTATATTCCATGAAAGTGTCATGATTGCAGTTGCTCGTGGTGATAACTCTGGGGAAGCAATTCCGATGCTCTTAAGAATACCTCGTTTCTTTGATCCATGGGGTGGCTATGACATGATAGGCTTTGGTGACATTATTTTCCCTGGATTGCTAGTTGCATTCAGCTACAGATTTGATAGAGCAAGCAAAAGGGGCCTCTTCAATGGGTATTTTCTATGGCTGACGGTGGGATATGCTGTTGGCCTTTTCCTTACCTATCTTGCGCTCTTCCTGATGGACGGGCATGGTCAACCTGCGCTGCTGTACCTTGTTCCATGTACATTAGGGCTTATTGTTATACTTGGTTGGTTTAGAGGTGAACTTCATGATCTATGGAATTATGGTAGAAGTCAAACAGAAAATTTAGTCGACGAACCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATHHARRLPAAAAVLLLVLLAGGSAADDASSDDDAGVPPSPGCSNKFQLVKVKNWVNGTEGTIVVGLSARFGASVPRDIHEAQKTFAVLANPLDCCSNSTSKLTNYIAIAQRGECAFTAKAKIAQTGGAVGLLVINDNEELYKMVCSDNDTSINVTIPVVMIPQSAGKKMKGLLDQGARLEVQLYSPNRPVVDLSACFLWIMAIGTIVCASLWTEFVACEQVDERYNQLTRKDGPNSGTTNREDKEIFEISAKGAIVFILVASVFLLLLFYFMSSWFVWLLIVLFCIGGIEGMHVCLVTLLTRICKDCGQKTVQLPFFGEVLTLSVLIVPFCTIFAILWAVYRHASFAWIGQDILGICLMITVLQMARLPNIRVASALLSAAFVYDVFWVFISPLIFHESVMIAVARGDNSGEAIPMLLRIPRFFDPWGGYDMIGFGDIIFPGLLVAFSYRFDRASKRGLFNGYFLWLTVGYAVGLFLTYLALFLMDGHGQPALLYLVPCTLGLIVILGWFRGELHDLWNYGRSQTENLVDEP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..150#2371..2529#2627..2738#2823..2942#4541..4698#5333..5509#5677..5711#5805..5961#6770..6823#6917..7009#7384..7523#8626..8696#9850..9933#10043..10137#ATGGCGACCCACCACGCCCGCCGCCTCCCCGCCGCCGCCGCCGTCCTCCTGCTCGTCCTACTCGCCGGCGGCTCCGCGGCCGACGACGCCTCCAGCGACGACGACGCGGGCGTCCCGCCGTCGCCCGGCTGCTCCAACAAGTTCCAGCTGGTAACGCGCGCCCCACACCCCCCCCGCCGCCCCCAATCCGTTCCCGTTTTTCTCTTCCTGATTTTGGTCAGGGTTTGGTGGTTGGTGGTGGTAGGGTGCTTAGCCTGCTGGTTGGCTTATGGGGGTGACCTAGTGGGGAAGGGATGGGGATCTCTCTTTGGTTGTGGAGGGGGGGATTTGTGGATCTGCTGCCTCCGTGAGTGCTGGTTAGTAATGGCAGAGGACCTTGAGAATTTGGTTGAGTTGTTCCCAGATGGATTGTGATGCTGGGTAAGGAGAGGAGGAATTTCCGAGCTGCACGCTTTAGTTGTGTACTGGAATTATGGATCCAGTTGGACTGTGATTTCGTTTCATTATGGAGTTCCATTTAGTTCATTTCTGATAGCTTGAACTAAAAATGATAGTTGATCATGTGCCCTGTAGAGATAGCATTGATTTCTTGCCACTTTTTGGTTGACTTAGCTGATTATCTCTAGAAATAGCCACTTTAGACCGAATTGGTCTATTTCTTTTTTTTCATTTTATATTTTTGGAAAAGCACCAAACGATGTACCTGTTTTGCGCCTGCTGTCCATGACGTATCATGTACTTGGTCCGGCTTGAACCATCGAACAGCTGAACCCGTTCCCCTCCTGCAGGAACCATTGAACAACTTTCTCAAATGATGAGAAAAAAACGAATAGATTTTACAAGAAGCAAGGAAGATAGTAACAGAACATGTTACCAGGCGGACAGTGGCATGACCCATGGCAACAACGGTTATGGTGGCGAAGGATACAAGGAGGCAGTACAGAAATAACAAGCGTTGGGCTGGGCTGCAGTGGTGTGTACTTGTCCTCGCTCTGGTCCTCCAGGCGGTCCTGCTTCGTTGACATGGTGCTGCCACTGAATCGCCTTGTAGATTAGAGAGATGAGATGGGCTCAGCTGCTTGATGGTTTGAGCCGGACAAGCATATGATGCATTGTGTCTAGCAAGACTGCAAGAGGATAACGGATGCACCACCTGGTGCTTAGCTTAGCAAAGAAAAGGGGGCAAAATGATGTATTTCGGATTTTCGGTGAAAAGTGGCAATGTGTTAAACCAACTAAGAAGTGGTAAGAAAACAATTGGCCTCCAGAGAATGGCAAATCCTAGAGTGCAATCTCTGAACAGTGGCATATGATCGATTATCCCAACTAAAATGTATTTTTCAGTTGCATGGTCACTTCTCACTTCAGGTGGCATTGGTACAGAGTAATGCAGTGGCATTGTCTGGAGGCAACACAGTGACTACATGTGGTACACAGAAGCAGGGGCAACTGCTGCATATAGACATCTTCACATGACTAGTCGTGAACCATGAACCAAGAAGATAAAACAAGATATTTTCTTGAACAATTTTTGTCACCATAGTAGTTATCTTGTCCCGGTGGATTGAACTGTGTAGGGCTTACCCTTTAACCTTTCACCCTTGTCATTTAAATGTTCCACAGCGTACTTGTGAAATTTCACCATGGGTCAAGCTCTCAGTTCTATTCCTGGTGTTTGCAAACAAAGACCCAAGTAAAATATTGAATTTAAAAACTAACAATATAGTTCTTATTTACTGTTGATGCCGTTCTGTCATATAAGGCTACCAAGTGCACATGCCAATCTCTTTCTAGTAATGGAATTTTGATAGGCTTGGATAGTTCAAGGGTGCCATTTAGGCCATCTCATTGTTTTGGGGGTTTAAGTAGACAGACAACCAACAATGTTGAGGGAGTTAAACAATCTTTTTCCTTCTAGTGATGTCTATGGTAGTCATTTTGCATGAGACTCATATACTTGCATGTACCCTGTTGGTGCGCAATAAAAGTTACAAAGAAAATTACCTATACTTTTAGGGCCCCTTTTATTTGAACGGAAAATGTAGGAATTTTGGAGGACTCCAATCCTATGGGAAAAAAAAATCCTATGAAAGCCTTTGAAGTAAAGGATTGAATCCTATCCTATCCTTTAAATTTTTTATGGAATGGGTAGTCCTATAGAGATTTTGGAGGAAAGTTAGCAAGAGGTCCAACCTCTTGGAAAAAAAATCCTTTGAGTCTAACTCTCTCATCTGATTCCTACGTTTTTCTTGTGGTTCAATCAAACGGTCATTCCTGTGTTTTTTCTATTCCTCTGTTTTTCCATTCCTGTGATTCAAAGGGGTCCTTAAGTTTTTCCACAAGGGTTCTCATCCTTGAGATTTTATCCAGGTTAAGGTGAAGAATTGGGTAAATGGAACTGAAGGTACAATTGTTGTTGGGTTGAGTGCAAGATTTGGAGCCTCCGTGCCTCGAGATATTCATGAAGCTCAGAAAACATTTGCTGTCCTTGCAAATCCACTTGATTGTTGTTCCAATTCGACATCAAAGGTTTGATTTTAACATCAACTATAATAAACTTATTAGCAAGTTTGGTTCTTTGAATGACTGCTGTAAATATTTTCTAAACTAATTCTCGCTTTTGCAGCTAACAAATTATATTGCTATAGCACAACGTGGAGAATGCGCTTTCACTGCTAAAGCAAAGATTGCACAGACTGGAGGTGCAGTTGGTTTACTAGTTATCAATGATAATGAAGGTATGAAAAGGTTAATATGAAATATATTATTATATATATCCTGTTAATATAGTCGTATTTATCTGTTAAACTTCATTCTTTCAGAACTTTACAAGATGGTTTGCAGTGACAACGATACTTCCATTAATGTTACAATACCTGTTGTAATGATACCACAGTCAGCTGGAAAAAAGATGAAGGGCCTCTTGGATCAGGGAGCAAGGCGTAAGTCAGTTAGTTACACATTCTTAATTATCCTCAGTAATGCTAAGCTTCATTCATATTTCTTTTTTCCTGCTTATGTTGCCAATTGGTAGGGTTTAGTTACTTAAACATCTCAAGCCTTTTACTTCCATGGTTCCATCTACTGTGATGGCCAATTGCATTTTTCATCAGGTATATGTTGTCTGACTAAAAACAGAATTAATGTTGGTTTGAATTCATTCTAACTTATATTTTTATATTTATCCAGTATGGCAAAGAAACATGATGCAATAAACCATATTGTAAGAAAATCCTCTTGGCAATACATCAATTAGAGTACTGAGCGCTTAATATTCCAATATTGTACTAAGTTATCAACTGTACAAGGCAATTATCTGTGTTGACTGTTGAAGTTTTAATCTCTCGAGCATGCCGTCCCGTGCTCTCTTGAGCGAGTTAGTGCCTGCAGATGAGCTGATCTTCAGGTGTATTGGAAAAAAAAAAAGGAAAGGAAGAAATCGGCTTTAAGTAGAGTTTGCTGGGACCATTTTGCAGATTATAAATGGAAGAATTTTGGCATACTAGTTAAATGCCTGTGCTTTACTATGTATAAAAGGAAAAAAAATCATAATATTGCCTAAAATAAATAAAAACATATTTTTTATTAAATATGTTGCCCACCCTTTTGCTTTTGGGATACTCACCTTAATTTTGGGTATCCATTTAGATTTAGTTGTCATATAATATTAAGAAGTTCAAGGTGTATTATGTAAAAACTACAATGGGAGTAGGTGGGGTGGCATATTCACTGCCATCACCATTGGAGTACTTTTAAAGGAGTCTAGAGATATTCGCTCATCAGGTTCGTGAATCCTGACCCTGGATCTTTCTTTGAAGTTCTACTTTTAATGTCATCTAACTTATATCCCAAACTTCAAATATGTCAAAACCAACATTTTCTAAACAAAGATCATATGAAAAAGAAAGACAAATTGCTGATATGACAGCTTTTCACTGATAACTAAAACTGTGTGCATCCTGTTTTGCATTTGGTTCTGGGTTTTAAAACCTTTATCCATACCAATGGAGTGAACAATTTCTGCAGTCTAATTTATTGCTAGTAAAGGTTGACACCTAGTATCTAGGTAGGCGAGTAGCAAACACGGAAGGAGCAATGTGGAGGGATCTTGAAGCAAAGCAGCAGCTGGCTTGAAATAGAGCGACCTGCTTGAAGCAGAATAATCAGCATTCCAACAATATGGTGGACTGGCAGGCAGAGCTGGTGGTGGAGAAACTCATGGCTATGCTAGATCTCCAAGCTGGTGACGGTGCAGCTTCCTCTCTAGAAGTCCTGGTGCCTTATTTGCTCTCCAGAAATCCTGCACGCTACCTTTTGAGATAACAAAATGGGCAAGCTTCCCACCTGGACCTGTGTGGACACATGCATGCACGCTCACACAAGCCAAGTCGCTCAGTTGACTCCCTGTATAAATTGGAAATCTGTGTTGGGTGCTGTGATTGCATAAATGTTGACTAGTTGAAGTGAAATTGTACTTTTGAATTAGTAGTTTATGGTAATACAAAGTATGCATGCTAACAAGAATGTTCTTTTGCTGCAGTGGAGGTGCAGCTATATTCACCAAATCGACCAGTTGTAGACCTTTCAGCATGCTTCTTGTGGATAATGGCTATAGGAACCATAGTTTGTGCTTCACTCTGGACTGAATTTGTTGCATGCGAGCAAGTTGATGAGCGTTATAATCAGTTGACACGGAAGGTTTTGACTTTTGTGCTTTACCTTTCTATCCAAATTATGTCATTTTAATTTTATATTTTCACACACATATGGTAGCACATTCATACCCATTTTCTCTTGGTACCACTCTACAATTTTTATTCTTACGATGTGAATA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