Difference between revisions of "BGIOSGA036282"
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Revision as of 18:27, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036282 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036282, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0433500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036282-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036282-PA |
| Length |
11874 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:11227566..11239439 |
| Sequence Coding Region |
11239419..11239439,11237575..11237694,11237383..11237457,11236708..11236800,11236541..11236615 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:11227566..11239439 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:11227566..11239439 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGGTGAAGGAGTGAAGGGTTTGTGTGAGCCTAGTGGGTGGGTGGTGATGGGGATAGAAGATTACCATGTCATCGTGCTCGTTGGGGAGGGCTCCTTCGGGAAGGTGTACATGGGAAGGCGCAAGTACACTCGCCAGACGGTAGCTATGAAGTTTATCCTTAAGCATGGGAAGACTGACAAAGATATACATAATCTAAGGCAGGAGATTGAGATTCTGAGGAAACTCAAACATGAGAATATAATCGAAATGATCGATTCATTTGAAACCCCTCAGGAATTTTGTGTGGTAACAGAGTTCGCTCAGGGAGAGCTGTTTGAGGTGCTTGAGGATGATAAGTGCCTTCCAGAAGAACAGGTTCAAGCAATTGCTAAGCAGCTGGTTAAGGCACTGCATTACTTGCACTCCAATCGTATTATCCATCGGGATATGAAACCTCAGAACATCCTTATTGGGAAAGGATCTGTTGTCAAGCTCTGTGATTTTGGGTTTGCTCGTGCCATGTCAGCTAATACTGTTGTGTTACGTTCTATAAAAGGAACACCTCTATACATGGCTCCAGAACTTGTGAGGGAACAACCTTACAACCACACAGCAGATTTGTGGTCCCTTGGCGTCATCTTGTATGAACTATTTGTTGGACAGCCCCCTTTTTATACAAATTCAGTCTATGCACTTATACGGCACATTGTCAAGGATCCTGTGAAATATCCAGAAAATATGAGTGCACATTTTAAGAGCTTCTTAAAGGGTTTATTAAATAAGTCGCCTCAGAGTAGATTAACCTGGCCAGCATTGTTGGAGCACCCATTTGTCAAAGACGATTCAGTGGAGCCAGCTGCTGACAATGGAACTGTTCCTTATGAAGTTAAAGGATCTGAGGCTACCTGGAAAGCAGATGAAATCCAAACGTCCAGGAAACAACCTCCTGTTACTGATCCACAAAGTAGAAATACTGTTGAAAACAGGGAAATTGTTTACGATAAACAAAACAACAAAAAAGTGGAAGGCCCTAAGCATGCTGCTGAGGATCATCATGGTTCAGCTACTGGTCCTGAATGTTCAGCTTTAGATAAGCTGGAAAAAACTTCACAAACAGTAAAAGGTGCAAATGCCATTATTGAAGATAGTGAAGCGCTGTCAACTGCCCTCAGCCCCATCAAAATTTGGTTGAGCAATACTTCTACTTCACCCAGGGAACTGAATATTGATGATGCAAACCAATCACTCAGGATTGTAAAAAATTTAATTGAAGCAGGGTCATATCAATCTTGTGCAGCAATTGATGACATAATCTGCATGTTTCTTGAGTGTACAAGTGTCATTATCAAAACTAAGATTTCAGATGCTTACAGCTTTGCAGTGAAGTGCCTAGCCATTGCACGAAAGCTGCTTGATACAAGTGAAGGTCCTGTGCTGCAATCTTATGACAGACACTGGTCCTCTCTATATGAGCTTTATTCTCAGATTCTGGTTTCTACAATTGATCCATCTGGAAGAATCTCTCGTGAGTCGACTGCATGCCTTGCTCTGATGTTATCTCGGGTTATTTCTGGATTGAAAACAAGTATCTCCTCTGAGAGTCCAAAGCCAATGGAAGAAAATCTCATCAAGATCATCAATCATGCAAGGAGTTCACAGTTACTAGAACTCTTATGTGAGTGTCTAATAGCTTCAGGTTCAGATATAGTATCTGGGTCCACTAACATGGTACCAGCAGCTTGTGAGGCATGCAAGGCCATTTGGTATCTAGCTCATGCTGTTGACATTATGTCCCTTGGCACACATAATTTTTCATTTCCATTAGCTAACTCATGGAGACAAGTTCATGCGAAACTGGATGGTAAAATGCAAGATCAAGGATCATTGCCAGCCTCACAAAAAAAAGATTCATTATCAGATATAGACTCTACCCATCTGATAAATATATTTGTCAAATCATTCCTGGCTTCAAAACCGATGCAGGTTGCTGTTTATCACTGCTTGCATAATGGTTTGGAGTCTGCTATTCATGCTTCTCTTCAGCTAATCTCAAGAGCTTGTCTACTGGATGCTTCTTTCTGTGCTATGATTTGTGGCCCAATAAATCCATCATCCAATGTCAATGAAGTAGAACATGGTGGAGATGGAACAATTGTATCTGACATGTTTTCTCTATTGTCACTGTGTGGCTCATATTTGAATAAGGAGTCCAAGCAAAACAGTAATCAGAAATGCAGGCTATCCAATCCTCATGCCCTAGTAGTGCACTGTTGCCTTGCACTGGCAACAATAGCTGCATGCCTGAAGTCAGAAGGGAATTCTTCAGCATCAATTATCTTAACGAGTTCCCAGAAGAAACAGCGGTCCCGACTTTCTGTTCTTGCGCATCTCTCTTCAGTTGATGATACAGTCAAGAGTTGCCTCCAGCCACACTGTGCATCTGCAATGCTTGCACTATCGTCGCTTATTTCATTGGAAAATGTAGGGCAAAGTAGATCTTCTCTGTGTGAAACTGCCCTTGCATTGTTTCCTCGTATGGCAACAATACACACATTGCTGAAGCTTTGGCTATCTGATGGTAGTGAAGCACTCTGTCGATATAATGCTGGTCTGCTAAATCTGTTCGGCCTTCGTGATGGGTGTGTTGGGCTGTTGGAAACAAGACTGAAATGGGGTGGGCCATTGGCCATTGAACAAGCCTGCTCTGTTGGCATCCCACAACTCCTAATTCGCTTGCTTACTGATGGATTCTCAAAGGAACCATCTGATGAAAAAGAAGGTTCAATACACCGTAGTGGATTATCACCATTGGGAGTTGTCTGGACTCTCTCGGCTTTATCTCAATGTCTACCTGGTGGTGTTTTCCGTGAAATTTTGTATAGAAGGGAGCATGTAAAGCTTTTAACTGACCTACTGTCTGATACACACCTCAAGGCATTGGCAGCTTGGACTGGTCTTGGTGGTGGGAAAAAGGGAGTTCGGGAGCTGATAAACTCGGTCGTTGATATTTTAGCATTTCCCTTTGTTGCAGTGCAGAGTTCTCCAAACATGCCATCAACATCGGCGTCCATCAATAGTGGTTTCCTTCTTAACATTGCATCACCTGGTGGAAGAATCGGTACTGAGAATAAGGAAATGCTGAAAACTATTGAGAAAAACATGGCTCAGTACATTCAAGTTCTACTAGAGGTTAGTGTTCCCGGGTGTATACTTCACTGCTTTGATCATGTTAACATGGAAGATCTATCAAGGCCCTTGGCCATAGTGGCCAAAATGGTTGGGTATCGTCCACTTGCTTCTCAGCTTCTTAGAGAAGGTTTACTAAATCATAGCAGGGTTGAAAAATTACTGAAAGGCCCTATCGCTAAAGAGACATTGCTTGACTTCCTCATGATAGTTTCTGATCTTGCCCGGATGTCAAAGGACTTTTATGAACCAATTGATAAAGCAGGCATGGTTGGTTATTTAAAGAACTTTCTATCAAATGAGGACCCTGATTTAAGAGCAAAAGCTTGCAGTGCAATTGGCAACATGTGCCGCCACAGTTCCTACTTCTACAGTTCACTTGCAACAAATAAGGTAATTGAGCTGGTAGTTGACAGATGCTCTGACCCGGACAAGCGCACTCGGAAGTTTGCATGCTTTGCTGTAGGAAATGCTGCTTATCACAACGACATGCTATATGAAGAACTTAGACGGTCCATTCCTCAACTCACCAAGCTACTTCTTGCACCTGAGGAGGATAAAACCAAGGGCAATGCTGCAGGAGCGTTGAGTAACCTAGTGAGGAACTCTAACATACTCTGTGAAGATATTGTCTCCCAGGGCGCAATTCAGGCCCTGCTGAAGATGGTCAGTAGCTACTCCACCGTGGCTCTGAGCCCCAGCAGGAAAGACGTGCTAACAGAATCTCCGCTGAAGATCGTGCTCTTCGCGCTGCGCAAGATGTGCGACCACGCCGCCTGCCGGCTCTTCCTCCGATCGTCGGAGCTGCTCCCGGTCATCGTGCACCTGAGGCAATCGCCGGATCCAGCCATCTCTGAGTATGCTTCTGCCATCGCGACCAAGGCTTGCCACGCCTTGAGCCCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEGEGVKGLCEPSGWVVMGIEDYHVIVLVGEGSFGKVYMGRRKYTRQTVAMKFILKHGKTDKDIHNLRQEIEILRKLKHENIIEMIDSFETPQEFCVVTEFAQGELFEVLEDDKCLPEEQVQAIAKQLVKALHYLHSNRIIHRDMKPQNILIGKGSVVKLCDFGFARAMSANTVVLRSIKGTPLYMAPELVREQPYNHTADLWSLGVILYELFVGQPPFYTNSVYALIRHIVKDPVKYPENMSAHFKSFLKGLLNKSPQSRLTWPALLEHPFVKDDSVEPAADNGTVPYEVKGSEATWKADEIQTSRKQPPVTDPQSRNTVENREIVYDKQNNKKVEGPKHAAEDHHGSATGPECSALDKLEKTSQTVKGANAIIEDSEALSTALSPIKIWLSNTSTSPRELNIDDANQSLRIVKNLIEAGSYQSCAAIDDIICMFLECTSVIIKTKISDAYSFAVKCLAIARKLLDTSEGPVLQSYDRHWSSLYELYSQILVSTIDPSGRISRESTACLALMLSRVISGLKTSISSESPKPMEENLIKIINHARSSQLLELLCECLIASGSDIVSGSTNMVPAACEACKAIWYLAHAVDIMSLGTHNFSFPLANSWRQVHAKLDGKMQDQGSLPASQKKDSLSDIDSTHLINIFVKSFLASKPMQVAVYHCLHNGLESAIHASLQLISRACLLDASFCAMICGPINPSSNVNEVEHGGDGTIVSDMFSLLSLCGSYLNKESKQNSNQKCRLSNPHALVVHCCLALATIAACLKSEGNSSASIILTSSQKKQRSRLSVLAHLSSVDDTVKSCLQPHCASAMLALSSLISLENVGQSRSSLCETALALFPRMATIHTLLKLWLSDGSEALCRYNAGLLNLFGLRDGCVGLLETRLKWGGPLAIEQACSVGIPQLLIRLLTDGFSKEPSDEKEGSIHRSGLSPLGVVWTLSALSQCLPGGVFREILYRREHVKLLTDLLSDTHLKALAAWTGLGGGKKGVRELINSVVDILAFPFVAVQSSPNMPSTSASINSGFLLNIASPGGRIGTENKEMLKTIEKNMAQYIQVLLEVSVPGCILHCFDHVNMEDLSRPLAIVAKMVGYRPLASQLLREGLLNHSRVEKLLKGPIAKETLLDFLMIVSDLARMSKDFYEPIDKAGMVGYLKNFLSNEDPDLRAKACSAIGNMCRHSSYFYSSLATNKVIELVVDRCSDPDKRTRKFACFAVGNAAYHNDMLYEELRRSIPQLTKLLLAPEEDKTKGNAAGALSNLVRNSNILCEDIVSQGAIQALLKMVSSYSTVALSPSRKDVLTESPLKIVLFALRKMCDHAACRLFLRSSELLPVIVHLRQSPDPAISEYASAIATKACHALSP</aaseq> |
| Gene Sequence |
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