Difference between revisions of "BGIOSGA036568"
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Revision as of 18:29, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036568 |
|---|---|
| Description |
Wd-repeat protein 48 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036568, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0165000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036568-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036568-PA |
| Length |
9923 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:3622941..3632863 |
| Sequence Coding Region |
3632765..3632863,3632488..3632646),complement(3632040..3632102,3631878..3631967),complement(3631495..3631788 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:3622941..3632863 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:3622941..3632863 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCATCGTGTTGGAAGTGCTGGTAACACGGCAGGTTCAAGTCGACCGAGAAAGGAGAAGCGCTTTACATATGTGCTGAATGACGCTGATAACAAAAAGCATTGTGCTGGGATCAACTGCTTGTCATACCTAAATGCCTCTACTTCTGGTACGAGTGATTATCTTTTTACCGGGAGTCGGGATGGTACCTTGAAGAGGTGGGAACCAAAAAATGGAGTCGCAAGCTTCTCAGCAACTTTTGAGTCACATGTTGATTGGGTTAATGATGCCATTATTGTTGGCCAAAATCTTGTTTCCTGTTCCTCAGATACCACTCTAAAGGTGTGGAATTGTTTATCAGATGGTGCTTGTACCAGGACTCTCCGCCAGCATTCCGATTATGTGATTTGTCTTGCTGCATCTGAAAAAAATAGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGTGAGGTCTTTATATGGGACCTTGATTCTTCTCTTGCTCCTGTGGCCAAATCTGTAGATGCAAAAGAGGATGAAGCTCCTAATGGAAACTCTGGGCCTGCTTTGACAACCTTGTGCAATGTAAATTCTAGCAGCAACCTTGCTTCCACCAATGGGCAATCACATGGGTACAGTCCAATCACTGCCAAAGGTCACAAAGATTCAGTTTATGCATTGGCCATGAGTGACACAGGAAACACACTTGTCTCTGGTGGTACTGAAAAGGTTGTTCGCGTTTGGGATCCCAGGACTGGTTCAAAGAAAATGAAATTGAGAGGGCACACTGACAATATCAGGGCTTTACTTCTTGATCCTACTGGCAGGTATTGTCTTTCAGGCTCATCTGATTCAATGATAAGATTATGGGATCTGGGACAGCAGCGATGTATTCATTCTTATGCTGTGCATACTGATTCAGTCTGGGCGCTTGCAAGCACTCCTTCGTTTAGTCATGTTTATAGTGGTGGAAGAGATCAGTCGGTGTACTTGACAGATTTAAGCAATCGAGAGAGTGTCTTGCTCTGCACAAACGAGCACCCGATTCTACAATTGTCCTTGCAGGATGATATGATTTGGGTTGCAACAACTGATTCTTCTGTGAATGGATGGAAAGCTGAAGCGCATGAACCCCTAAAGCTTTTCCAAAAAGGTTCTTCATTCTTAGCTGGCAATTTGTCATTCTCCAGGGCAAGGGCTTCTTTAGAAGGATCAGCACCTGTCCCTATACACAAAGAACCATCTTCAATTATTCCTGGAGTTCCAGCAATAACTCAGCATGAGATCCTGAATAATAGAAGACATGTATTGACGAAGGATACTGCTGGTTCTGTCAAATTGTGGGAGATTACTCGAGGAGCTGTTATTGAAGACTTTGGCAAGGTTTCTTTTGAGGATAAGAAAAAAGAGTTGTTTGAGATGGTTAGCATACCTGCCTGGTTTACCATGGATGCTCGATTGGGATGCCTGTCTGTCCACCTGGATACACCTCAATGCTTTTCTGCAGAAATATATGCAGTTGACTTAAACGTTGCAGGAGCACAGGAAGATCTTAAGATTAATTTGGCTCAGGAGACTCTCCGTGGTTTGTTAGTTCATTGGAGTAAAAAAAAGCAGAGATCTGGCTCACACGGCTTGTCAAATGGTGACACTTCAACAGGAAAAGATGTATCCTTGAAAAATTTGCCCCATCCAAGATCTGAGGTTGATGATGGGGCTGAAAATCATGCAAGTCAGATGCTTCCCTCATTTGAGTTTTCCACAGTTTCGCCTCCATCAATCATCACAGAAGGTTCAAGTGGAGGGCCTTGGAGAAAGAGAATTACAGATTTAGATGGAACCGAGAGCGATATCCCATGGTGGATTGTGGACTGTGTTGAGCATAATCGATTTCCAAAAGAGAATACAAAGTGTGGATTCTACTTGCATCCTGCTGAAGGGTCACCTGCACCGAACATAACACAAGGGAAACTTAGTGCTCCACGGATATTGCGGATTCACAAAGTAGCTAACTATGTGGTCGAGAAACTTGATAGACCACTGGATGGCAATGCTGACAGCACATTTGGAATGGGATTGACTTCTGGCCAATCACAATTTTCAGCGCTAGATAGTTCTTCACGGCTTGGACTAAAACCATGGCAAAAATTGAAACCTTCTGTAGAGATATTGTGTAACAGCCAGGTTTTGGCACCCGAAATGAGCTTGGCCACAGTGCGGGCTTATGTCTGGAAGAAGCCAGAGGATTTGATTCTTAACTACAAAGTGGTCCAGTCAAGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHRVGSAGNTAGSSRPRKEKRFTYVLNDADNKKHCAGINCLSYLNASTSGTSDYLFTGSRDGTLKRWEPKNGVASFSATFESHVDWVNDAIIVGQNLVSCSSDTTLKVWNCLSDGACTRTLRQHSDYVICLAASEKNSNIVASGGLGGEVFIWDLDSSLAPVAKSVDAKEDEAPNGNSGPALTTLCNVNSSSNLASTNGQSHGYSPITAKGHKDSVYALAMSDTGNTLVSGGTEKVVRVWDPRTGSKKMKLRGHTDNIRALLLDPTGRYCLSGSSDSMIRLWDLGQQRCIHSYAVHTDSVWALASTPSFSHVYSGGRDQSVYLTDLSNRESVLLCTNEHPILQLSLQDDMIWVATTDSSVNGWKAEAHEPLKLFQKGSSFLAGNLSFSRARASLEGSAPVPIHKEPSSIIPGVPAITQHEILNNRRHVLTKDTAGSVKLWEITRGAVIEDFGKVSFEDKKKELFEMVSIPAWFTMDARLGCLSVHLDTPQCFSAEIYAVDLNVAGAQEDLKINLAQETLRGLLVHWSKKKQRSGSHGLSNGDTSTGKDVSLKNLPHPRSEVDDGAENHASQMLPSFEFSTVSPPSIITEGSSGGPWRKRITDLDGTESDIPWWIVDCVEHNRFPKENTKCGFYLHPAEGSPAPNITQGKLSAPRILRIHKVANYVVEKLDRPLDGNADSTFGMGLTSGQSQFSALDSSSRLGLKPWQKLKPSVEILCNSQVLAPEMSLATVRAYVWKKPEDLILNYKVVQSR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..99#218..376#762..824#897..986#1076..1369#1508..1605#3774..3809#3941..4061#4136..4372#4829..4924#5011..5076#5269..5307#5387..5521#5778..6130#7312..7405#8901..9080#9825..9923#ATGCATCGTGTTGGAAGTGCTGGTAACACGGCAGGTTCAAGTCGACCGAGAAAGGAGAAGCGCTTTACATATGTGCTGAATGACGCTGATAACAAAAAGGTCAGTTCCACTTCCAGAGCTAGCTATCCTCAGAATCACGGATGCATCCAGTTGATTCAAAAGAATTCATTTTCAGTGCAAATGTCTCATCATGCATTCCATTGTGTCTATTTTTCAGCATTGTGCTGGGATCAACTGCTTGTCATACCTAAATGCCTCTACTTCTGGTACGAGTGATTATCTTTTTACCGGGAGTCGGGATGGTACCTTGAAGAGGTGGGAACCAAAAAATGGAGTCGCAAGCTTCTCAGCAACTTTTGAGTCACATGTTGATTGGGTATGCGTTTCTCTGTTTTTACTCCAGTCGATTTAATATTGTTATTTGACCATTACATTTTGAAATTTTACTAGCCCAAAGTTACATGATGACGCATACCATAGCAACATTTATCCATTATCGTGTTTTTTGATGATCCATTGCCACTTTTATTTGAATAAAGATGTATAAGCATCTTGCCCCAAAACAAAAGAGGATCAGATGGAAAGAAGACTACATAGTTTTCAATATCCAAGTATTATAGTTTCGGATGGAATTCTATCATTGATGGAGAAACTCATCCTTGAGGAGATTTGAGCTTAATTTTGTAACATGGACGCTTTCATTATCTCTGAAGTACTTTCTATGACTTTCTATGATTTAAGCTGATATATTTATCATGCAGGTTAATGATGCCATTATTGTTGGCCAAAATCTTGTTTCCTGTTCCTCAGATACCACTCTAAAGGTCTGTTGTTTCAGCAGTTTTTATATATTCATTTTGGATCCACATGTTTTTTAATTCCTAATTGTTTCACAGGTGTGGAATTGTTTATCAGATGGTGCTTGTACCAGGACTCTCCGCCAGCATTCCGATTATGTGATTTGTCTTGCTGCATCTGAAAAAAATGTATATTATCCAGCACTATGCTATTCTGTGGAACTACTCATTTTATCCCTTTTGTTTTACATGTTTTTTTTTTATTCTCTGCAATGTAGAGCAATATTGTTGCCTCTGGTGGCCTTGGTGGTGAGGTCTTTATATGGGACCTTGATTCTTCTCTTGCTCCTGTGGCCAAATCTGTAGATGCAAAAGAGGATGAAGCTCCTAATGGAAACTCTGGGCCTGCTTTGACAACCTTGTGCAATGTAAATTCTAGCAGCAACCTTGCTTCCACCAATGGGCAATCACATGGGTACAGTCCAATCACTGCCAAAGGTCACAAAGATTCAGTTTATGCATTGGCCATGAGTGACACAGGAAACACACTTGTCTCTGGTGGTACTGAAAAGGTATTATGTTCTTCATCTTTGAGAATGAGTATGCAAGTTTCCTTGGGGTTAGGAGGCACCATAATGTGCGAATTTCTTTGGACTGCTTTTGAGAGACCTCTCCTGTGATATTTCCTTATATGTACCTGTTTAGTGTAGGTTGTTCGCGTTTGGGATCCCAGGACTGGTTCAAAGAAAATGAAATTGAGAGGGCACACTGACAATATCAGGGCTTTACTTCTTGATCCTACTGGCAGGTTTGTGTGAAATGTTCTTGTAGATTCATCTAGACAATGATGTTTCTTTTCCTTGACAATATCCCTTAAAATTGACTTCTGTTCCCGTATTGCTGCCCCACTTCAATACTGTCATCTAAATCTATCCTAGCCTCTTATTCCACGATAATAAGTTATGGGTGTTCTTTCTTTCAATCTCCTGCAGTTACTTGTGCTCTGCATTTGTTTTTAGTATCTGTAATTCTAAATCTGTCATAATTCTGAGATATCCAAATGTTCTTCAGAGCATGAACTGTAGTTTAGACAGCCGCTGTCTATATTATCGTTCTACGTCATAATAGATTATATGTAGACAACTTCTACAATAGGTTGTCTACTTAGTAGTTATCTGTAATAGATTTGCATAATTAATGATTTGACTCTATAGATGGTATACATAGCGATTGTATTTTATTAAGCTATCCTCTCTGCTAATCAAGATACAACATCCTTCTCTCTCCGCTTTCTTTCTCTTCCACACCATCCTATGTAGCATCTTCTCCCAGACTGACATCACACCATTGTTCATGCCCAAATTGATGGCTTTCGCATTGGTAGTTGGATATGGTATTACTTCGCTCGCTAAATTTAGTGTTTGTCAAGTATTTTGGTCTTCTATCGCATTCATCATCCATGAAAGAGCTCTAGGTCAGCAGTGCTATTTTTTTTGAAACTCAGAATTAGTTCAGCACACAATATTGTTGATATATTATGGGAAAATAGCACTACAAGTGTATGATCAAGACCCTAAAGTCCAACTCCAGTTTTGTTGATTTGAAGTCCCCAACTATTCAAATCTGTGCAATCAAGTTCTTTAAGCTCTATTCTGTTGGTTTGAGCTCTCAACTATTCTGTTTGTTCATTTTAGCTCTTTGTTATCTGGATATATTTAGTTAGTACCCTTTTCTCACATGATTAACAGACTGGTGATGTAACTACAGATATGTGTCAACATGGGCAACCTGAATAGGGACACAGTCACAAACTATTACTGAAACTGTCTAGCGTGCTTCCCGATTTGATTTAGATTATTGTGGATTATTGCCACAGATTATCTACCAGGTTATAGTGATAAATTAAATATTTGAAGAAATAAACTTAATAAATAGCTTAAAATAAGTGGTCGAAGCAACACAGTAGCAGAAACTTTTTTTCTAGAAAAAAAAGTATTTTTCGAAGCATAGAACAAACAATATATGTTTCAGCAATCTGGTGAATAAGCTGAAAAGAACAGGACCTTAGAGATCAATTTTCTGCAACTCATGTTCAACAATTTGCTGTTGGGCTTTTGTGTAGATAACTTGAATAAGGCTACACAATTGTTTAGTTATCGAACTTCAGTTGCTCATCTTGCTTGTAGATTAGTAGGAATGATATAGTTTACAGTTTTAGTAGTAAAGGTGCACAGTGGGATTCAAATTAACAGGCCTAAACCTGAATGGTTTAATTACATCAAATTCAATATTTCAGGGGTTCAAATCAATGATTGGAATTTTGGGTTTGATTGCACAGAGTATTAGTTTTAGGGCTTATATTGAAGATTTTCGTTGTATTGTATACAATCCATTGAGTGCTAAGGAGTGATTGTCATGGTGTTAGATCTTCTGGAATGTGAAATATATTCCTGATATAGTTGCATCTGCATGCTTCTTAAAAGTACTTTTTTTGACCATCAGATTTTACCCCTTAACTCTTTTAAAATTTGAGATGGTTGATCTTAGCAATGGACCATGTATTATTTGATAAGCTTGCCCTGTGGAACATTTTTTTTTTTATCAATTAGCCCCCATTAAATTTCAGCAGTATTTACGTGAATGGATTCCTGTTGGATTTGACATTAACTGCTGGTGATTGTCCTAGTTACCATCGTAGTCATATTATGTGCCATGCAACCCATTTTCATGTATAATTTACTAGCAGCTTGATGATTTTAGAGGGGTTCATTTCATCGTGTGAGGTCAGCTGACTGGTGACTAAGATGGTGTGGTGTGGTTGTGGTAGCTTACATGTCATGTTTGACAGCAATATTTGGTTGCAAATGGTTAACACAAAATGTTTTTTCCTTTTATTTTATTATTATTAATATTATTATTTGGGGTTATTTAATTTGTTGAGCTAGTAATTTAATTTGGTCTGTAAAATGTTTACAGGTATTGTCTTTCAGGCTCATCTGATTCAATGATAAGGTAATTCACAGTTCTAGTCTTGCCCACTCCAGATCTTGTGTATGTGTGTATGCACACTAAAATATCTGTACTTTCACACTGATCATGAAGTCATGTAACATCTTGTCTGCACATGTTTCTGGATTTTGCAGATTATGGGATCTGGGACAGCAGCGATGTATTCATTCTTATGCTGTGCATACTGATTCAGTCTGGGCGCTTGCAAGCACTCCTTCGTTTAGTCATGTTTATAGTGGTGGAAGAGATCAGTCGGTGAGTCAAGTTTCAAATGTTGCATAATTGCTTCTTTTCTGAATTCTGAGCCTTCCTGTTTTCTTGGATGGCAGGTGTACTTGACAGATTTAAGCAATCGAGAGAGTGTCTTGCTCTGCACAAACGAGCACCCGATTCTACAATTGTCCTTGCAGGATGATATGATTTGGGTTGCAACAACTGATTCTTCTGTGAATGGATGGAAAGCTGAAGCGCATGAACCCCTAAAGCTTTTCCAAAAAGGTTCTTCATTCTTAGCTGGCAATTTGTCATTCTCCAGGGCAAGGGCTTCTTTAGAAGGATCAGCACCTGTAAGCATGACATTTGCCATCTTTCATTAATTGTATCATGAACAATAATTTTGTATTTCTTCGCAGACACACTTTTAAGTCAGTAATAACAGTTTCACATGCCATAGCGATTGTCATACTTGCGCACATTGAAGATAAAATAGGGTATAAGGGATTCTGCAGTATAAACCTTGTGAACGTAACTTTGAGATTGACTGATCTTTAAAAGTAATACACAAGCCACAACATGGAGGCTGTTGTTTGGTTTGCTGCCACATATTTGGCGTGATACAAGTCTTAGTATAGTGACCCAGCATGTCATAGACACAAATTCATTCCATGCTTTGCCACACTGAAGCAGGCAATTTCTTTGACAGAATAACTGTTGCCTGAGTAAACATAGAAAGTTTGTTTAACTATGGGCGACATTTTTATTGGTGCTTAATGAGTGCTTATATC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