Difference between revisions of "Os01g0212100"
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Revision as of 18:46, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0212100 |
|---|---|
| Description |
ATP-dependent helicase, DEAH-box family protein |
| Version |
NM_001048912.1 GI:115435237 GeneID:4325567 |
| Length |
12699 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0212100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:6111791..6124489 |
| Sequence Coding Region |
6111870..6111982,6112101..6112245,6112992..6113066,6113882..6113971,6114151..6114230 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcgaggttctggaggccggggtcggagaagccgacggcggcgatcgtcgaggacgaggagggcggcgtcctcttcctgcccacaagcaccagctcctcctcctcatccgggtttgggtacgcgagcttggagcggcagcggcagcggctgccggtgtacaagtaccggaaggccatcctctacctggtggagcggcacgccacgaccatcgtcgtcggcgagaccggcagcggaaagtccacgcagatccctcagtaccttaaagaggctggatgggccgagggtggtcgacttataggctgcactcaaccaagacgattggccgtgcagtcagttgcatcaagagtagcggaagaagtaggtgtgagactcggagaagaagttggttacacaatccgatttgaggatcaaacaaatccaggtatgaccatgattaaatttctgacagatggggtattgatcagagaaatgatggaagatcctcttctgaccaagtatagtgtaattatggttgatgaagcccatgaacgatccatttcaactgacatgttgctgggtcttctgaaaaagattcaacgacgtcggcccgacttgcgtctaatcatatcctctgcaacaattgaagcaagatccatgtcaacttttttcaacattaggcgaaagaattctatgcttgagtctgctgatcatttgcccaacccagaacctgctattctttctgtggaaggtaaaggttacacagtggaaatccattatgttgaagaacctgtttcagactacttacaggctgctgtgaatactgtacttattattcacgaaaaggaaccaccaggggatattttggtatttttaactggccaggatgacatagacgcagctgttaagatgctaaatgaagaaattcaacaccgtggaagacattatttagacctgctgattctgcccttgtactctggccttccgcggggagatcaagacctcatttttactccaacttcaaaaggtaaaaggaaggttgtgatatcaacaaacattgctgagacgtcattaactctagagggcgtggtgtatgttgttgatagtgggttttccaagcagaagtgttacaatccgatttctgatatcgagagtttagttgtcgcaccaatatccaaggcatccgcaagacaaagagcaggccgagctggaagggtgcgaccaggaaagtgctttaggctttatacagaggaattttaccttaaagaaatgcagccagaagggattcctgaaatgcaaaggtctaaccttgtttcctgcataacacagttgaaagctctaggaatagacaacattttgggatttgattggccagcttctccatcaccagaggcaatgattcgagctcttgaagttctatattccctgggaatccttgatgaagatgccaaactaacagtaccccttggcttccaagttgctgagatccctctggaccctatgatttcaaaaatgatcctttcagccaataatttcggatgctctgatgagatattgaccatagcagcatttctatctgttcaatctgtgtgggtttccatgagaggagtgaaaaaagagtttgatgaagctaagctccgttttgctgctgctgagggagatcatgtgacgttcctgaatatctacaaaggatttcatcaatctggaaaatctagtcagtggtgttacaagaactttttgaaccaccaagcattgaagaaggttattgacatcagggagcagcttgtcaggattatcaagaggtttggcataccactaacatcatgtgatagagatatggaggcagtaagaaaagctattattgctggtgcatttgcttatgcatgccatctagaggaatacagccagaatgggatgtacaaaacaataaggacctcacaagaagtttatattcatccttcttctgtgctatttagggttaatccaaagtgggtcatctaccagtctctagtttcaactgataagcactatatgcgtaatgttattgccattgaaccatcatggcttacggaagctgcaccacatttttatcagttccggacacccaatcctgcccttcactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSRFWRPGSEKPTAAIVEDEEGGVLFLPTSTSSSSSSGFGYASL ERQRQRLPVYKYRKAILYLVERHATTIVVGETGSGKSTQIPQYLKEAGWAEGGRLIGC TQPRRLAVQSVASRVAEEVGVRLGEEVGYTIRFEDQTNPGMTMIKFLTDGVLIREMME DPLLTKYSVIMVDEAHERSISTDMLLGLLKKIQRRRPDLRLIISSATIEARSMSTFFN IRRKNSMLESADHLPNPEPAILSVEGKGYTVEIHYVEEPVSDYLQAAVNTVLIIHEKE PPGDILVFLTGQDDIDAAVKMLNEEIQHRGRHYLDLLILPLYSGLPRGDQDLIFTPTS KGKRKVVISTNIAETSLTLEGVVYVVDSGFSKQKCYNPISDIESLVVAPISKASARQR AGRAGRVRPGKCFRLYTEEFYLKEMQPEGIPEMQRSNLVSCITQLKALGIDNILGFDW PASPSPEAMIRALEVLYSLGILDEDAKLTVPLGFQVAEIPLDPMISKMILSANNFGCS DEILTIAAFLSVQSVWVSMRGVKKEFDEAKLRFAAAEGDHVTFLNIYKGFHQSGKSSQ WCYKNFLNHQALKKVIDIREQLVRIIKRFGIPLTSCDRDMEAVRKAIIAGAFAYACHL EEYSQNGMYKTIRTSQEVYIHPSSVLFRVNPKWVIYQSLVSTDKHYMRNVIAIEPSWL TEAAPHFYQFRTPNPALH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>80..192#311..455#1202..1276#2092..2181#2361..2440#2700..2769#2881..2966#3690..3759#3854..3949#4823..4928#5111..5157#5234..5317#5389..5442#5641..5741#6934..7024#8179..8343#9339..9428#9531..9602#9990..10088#10215..10301#11089..11142#11899..11978#12072..12219#cactatcgctcccccatccaccacaacacggacacacggtcttccccaccggcgacgacgagaagcggcggcgcgtgccatgtcgaggttctggaggccggggtcggagaagccgacggcggcgatcgtcgaggacgaggagggcggcgtcctcttcctgcccacaagcaccagctcctcctcctcatccgggtgctcccccaaaccctaaactaaaccccccctcttccctctcgcattgtcgcgcgcgctactcgcggtttctgaaggtgtggctgctcaccgctgctctcgccgcggttggttttaggtttgggtacgcgagcttggagcggcagcggcagcggctgccggtgtacaagtaccggaaggccatcctctacctggtggagcggcacgccacgaccatcgtcgtcggcgagaccggcagcggaaagtccacgcagatccctcaggtatgtgttctaggcgtatgaatggctctcggtttcccattgcagttgccactgggacgattttcttggtgtgcggagagatctgtccgaggcatttggtcgaacacctgggtttgcttgcgtgcgaccggtgcatacgtagttgcatccgcagtttatgctgcacctgcatgcacttttgtctgggtgccttaggcagcatggtggaaggttacatttcaaaattgtgaatacttgcatgtcatgtctgactaattcgttttgattccaccgaatacctcatgtctgttccctagtaagagagactgagagtaaaaacaccttgtgtgcaagactggcctatgctatgagctctgggtgcttgactggatgagagcatgtgctatggcttggatctccagtttcattttcctgctttctgcatttaattgaatcactttggtgctattgtttgattatattcaccttctgttaatgtatgtcatattctagggacatatatcaatataaagacatatcatagtaaacatgaacaatggccttcaaatcacctagaggaatttgtttaaatgttacttactttaaaagcccatgaaaactgcaaacaacatataatctgccattgtcttctggcggatgatgttccctttccatcttcattgtatattgaatcagcactacataatttcccaccatcttactggcaaatgattttcatttctggcttcattgtattcttttatcagtaccttaaagaggctggatgggccgagggtggtcgacttataggctgcactcaaccaagacgattggccgtgcaggtatccagtgtttgcaacctttatttagttttgcagctgtctctagattctacacaaaatcatgtctttctgattgaccatctgatgatgacatgtgacattattttttcttggctacagagaactatttcactttgatctcataccatgccactgttgtgctctgttgactcatcctcattggaaatacctgcatgtgtagtccaatagttcaaataaacatggcatctgagctagaagattcttcttaagcattagagatggtatttttgcagtatgtctcacatttccacaataacttatcgaacatatgtattagactgtttgcaacagttgtccatgtggttaatgatcacaatccctatttggatttgatctttagaggtaagattatattgagttgttgtttgcattttcttaatttaaaagatgagtgtatgaagggtcaagtcaccccttctatataaggctgatgttccatctcttttcattgcccttgcggtgtcaatgcctccatgatgcagacatgccacttgggtccaggaacaccttgactaggcctatgggccaacccttaacatgcccattacagtttcactttccattctagatcatttagtggatagaatttcatgtttactgacttaaaggatgtcaactgaatgaaattttttacagtttcattcgtagatgacattcttattttcatgctccagttctgatagacctttacttttcttagattgcacctgcaaatgcttcttttttttatctgataattgccttccaactcataatgttagtaatttgaacagtcagttgcatcaagagtagcggaagaagtaggtgtgagactcggagaagaagttggttacacaatccgatttgaggatcaaacaaatccagtatgacccatttcctttttatgcctgttttttttatatggattctgcagtatgaagcattgttgtatatctacagtattccttcaccgtttgtcaatacaaattagaataaaattgttttttctctctctctctctctcctgttagtctgcttattccttacatacctggtttggcagggtatgaccatgattaaatttctgacagatggggtattgatcagagaaatgatggaagatcctcttctgaccaagtataggtatcagtttatatcaccctcaacgtcgacatgatcataagatggccattcaagtagtcaactgtccatttgtattgattattgaaccatgtttgatccaattgcacaagttttgagtgaaatactttgagtgacatattttcagtggtattaaaccctttttctagtttaagaaaatgcatgactaagctgtattatttattgtcttgcatggtttagtttctttgattcacacactaatcctctttttttttgtcagtgtaattatggttgatgaagcccatgaacgatccatttcaactgacatgttgctgggtcttctgaaaaaggttttcatctttggaatgtgctagtctgatctttccatatcttcacgtgtgaataatattttatctgtcacgatgcttgtatatttacatgaatataatcatatataccagattcaacgacgtcggcccgacttgcgtctaatcatatcctctgcaacaattgaagcaagatccatgtcaacttttttcaacattaggtcatttccttatctagtaagaattagctttgttctttcatctttgccctctgttgcttttatgtatagtactttaggaagtactaaataggtaaacacaagcaggaagttcttgataaagtgatttagttcataagactgtttggtgaataattgtgaaattcataagactgttccccaatgagacagctactatgtctgaacctcattgtaaccatagttaaggatgcagaaccaacattattaatgttccaccatcgattgctgccccttttgcagcactagatcttaccttctgtcctatgacacccatgggccaagcatccaaggggatataaaactgttacaatagtattggttggtattaaattaataccaggtatagttagcactgcagcagaatgtaaatatcagcacactggcctcaataggtttctcatgcatcatgccttcctctctcgactgtttctcatcaataacagcatgaaagtacagaaatgccttaccagggcaaatgcaccaaaatttttattcctgagaatctgagatgttttatgactgttaactttgatgcatgttcagctgtttggtgcttcattatatgcatccatcactttaataaagttcatgagatcattatatgcactctagtttgtctatcaagtttgcgtgagcagcgggtctgatatttggattttttatttcatcttctattgcatacaggcgaaagaattctatgcttgagtctgctgatcatttgcccaacccagaacctgctattctttctgtggaagtatgttctcctttcaaaatggaacacacttgagcaaaggcagcctcctttgttaccagtaaaagcataatgtaattatatttttgttttatagggtaaaggttacacagtggaaatccattatgttgaagaacctgtttcagactacttacaggctgctgtgaatactgtacttattattcacgaaaaggttagtttcttcgtgctgtctgataaataatagataattctttgtgttattattatgcttcttagtaggatttaaatgactacctagacttcaggttttacttatatcctattttagacttgattttgcctggttcattgattccttgtaacataacaatggtcattacatacttttgtaggccattttacttcccagtaaaatatttaactcgatcagattactgtctgtagtacaatgaaggtcaattgccgtaaactacaccggattaggagaagggatgcaaatgggttggcccatgggtacccatcgacccacgctagttcctttggtttataattttgcacctaatacgaactacagaactaggaaatgagagaaacacatatcttaatagagtagtgtgggtcatggggtgcccataagtgggtaaacttgcatccctaactaggagcaatatactggtacatgtagtttcatgctcagtcttgtaagcactaaaactaaaattttaccatcgcagttatcatgaagatacatgtgcccaaatcttaacaattatcctttgtagttaatagacatttgttgaaaattttaccttcactgcaagcatgatctcccccagcctctcttcaatttgaagtctttgatatcaaaatagtggtaaaagaaactcaagctgatgtgatcatagcaccacaattaaattagcatggatctccgatatttaattgcataatagtgtcaatgaaatactctgccacattcttctccatttta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