Difference between revisions of "Os01g0549200"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0549200

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001185481.1 GI:297720096 GeneID:9270056

Length

12550 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0549200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:22146050..22158599

Sequence Coding Region

22150954..22151014,22151422..22151533,22151627..22151678,22152719..22152811,22153800..22153946
,22154044..22154145

Expression

GEO Profiles:Os01g0549200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>DILITGAHRKVNTNKADKVATQNYVSTRLRYSLRAYTSVLYLHI PDNFRIVLRGHDVESHNVINDLMYPECVLYKPQIAGLAELSAITTIGFVKGAPEIDVQ GFNVYHKNRLIAPFWKVANNSYGKGRGVVGILEANFIKPTHDKQDFEKSVLYQRLESR LKEMTYEYWQVCTVHGMLAIHMCRCMIS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7586..7646#7067..7178#6922..6973#5789..5881#4654..4800#4455..4556#agacttagagagagaggtagccctaacaaacacaaacacccgcttcccccttcgccggcgatgcggtccaccgccgccgccgccgatgtgatcgatctctccagcgacgacgacgacgaggtgcccgtccccagcaccagcgccgccgcagccgcagccgcgcgccgcgtcgcgccctccacgtcccctcgcgacgtcacgccgtacgcgctcgtcgatgtgaagcccgcgctgctgtacccgctccagccaccgggcgtcgtcgtcggtggcagcggcgcgctcgtgcccgtgaaggaggagctcccggtgctgacgccggtgcccctgctggccgcgggctattccccgtccaccccctccaccaaggtcgccctcccggcgccgcgcctctgccgccagttctggaagtcgggcgactacgtcgtcgcccagcgcaaccccgacgccgatgcacccggtaagctaaggctagctaagcacctagggttctcccatttcgcttcgcttcttagctttccgtttggattttggtggaggcaagtttgacggtttgaagaggctgactgatatggggttgcgattcggtgctggtgtatgtgcaggtgggcggaaccgacttcggattaatcccaggttcctgcactcgaatgctacttcccacaagtgggcttttggtggtatgagaattgacaaatcttattagtggaaacaactccattttaggcaatgacttgattctaatacctttaattcgttcattcgttcgcataattgcaaccaagtttctactaacggtatttcctttagtaagaagttgtgatgtgtagtgtgtatttagttgcattggatcatatttcttgtttgccgaacagcaccaatcaatttctagttgtaaacatgtaatttggctaaagtaaataaaacttttacttcttaaggaagtattaacttcagtataaacaaattgaatattgtacatgttttgattatttttgaggatttaaaatcgtctttgccatgtaaaacgctgtgaagcccgtctttgctggcacggctctactttttgagctcaggatctggtaccataacaaacaagtggactactctatatgcggccgttatatacctacttatattattgtgtatctataaaaatgtgttagcgtttttataacctaacccgtcatgcaggtatttgcggttccattatattattctcttaaagtaatcaatcatattaggacattgcattgcattatatggcactattttcccactgatttatgttcagtattatgcttatcattttttcagccattgccgagcttcttgataatgcaattgacgaggtaattaacaagcgcacccagttccaaacttccaatggctaaaatatattgatattatgtatgatttattatcccactatctctatcaggttaacactggggcaacatttgttcgtgttaatgaatttacaaacccacgagatgggagttcctcattgttaattcaaggttggcagattcagtaatataaatatatgcagatcctctaagttcatagaaaatcttaattggataagtgagaaagacctgtgtttttttcacatgtgctagatgatggagggggaatggatccagaggcactgagacgctgcatgagctttggattttcagataagcagtccgatgctttaatcgggcaatgtatagccttgtgtactttttctgcagttctttggaaaattgatatctagaacccttcttttggatttactgctgtttgttgtatcagatggaaatggattcaaaactagcacaatgaggcttggagcagatgtgattgtttttacacaaaaccaaaataactggtatacctccttttctaattctggaagtttggttgttcaatgttacaccagaaaaagcattctgtgatgtcaccatggtattttgtaatgtaataaactctgagggactacctggaaatctaacaacacagcttagggatagaagagaagcaaaatcaaacagcagttatgacttataagtgcttaaacattatgtcaaaagaaataagtggccatacaaccttttgcaacgttttcattctgtgggttctagaagaaattgtttgcatacagttgctttaacttttcttattgtgtatctggaaacaactgtaagtgaaaactaataggagaattatgcattttatatgttactttctgcatgctgctggccagtcaaacatttatcatccgatcccactaagcctttttgcccagtctggtttattatgtaaaatttctgtccaccctggttcatatatctatttaattatcttttttgtgtctgtagggtgccaacaagaagtatcggtcttctttcatacacatttttgatggaaactggctgcgatgatgttttggttccaacagtaggttcacaaatgctttgacattttaaaaatgagtgatcattggtcaatatgtgtagttttatttcacccttgtgacaccctctttctcatgcaggttgattatcagtatgatatatcaacagcttcgtatactcagatgctgcgtcatgatcagaagctcttctcttcaaatttagcgatcctcttgaaatggtccccttttgctagtgaagctgagttgctcaaacaagtatgttactaaagtttcattactttgttacataatgtcatatactgatatttatataaataacgtgttgaagaagttatggaaggagagaattccttgtattcccttgaaattacagccaattccttccatacccctgagttttggtcatttcattatatacccctgaatattggttttgatccctcccatatccattctgtcaattgaccattagttgtccatttaatggcagtggaaaagcccgttttacgcttggacacagaaagaatgtagaaattttgtgaagtgtattttggaaatatagaagtttgttgtgtgactataatatcataactttgctgtatgttgctgtgtttcacaaatttatttcaatatatatatatatatatatatatatatatatagtttttaaaaatatgtgtagcattttttttttaaaatgtacaaaacagtgatactggtcttgcatttcttgtacataatgtcaataatagacgctaaatctattatatatagcataaaaattagctgtacatatactctttttagaaagacaaatattaaattttcttagtcgttatctaaaaagtaaactttgctgtgaataatagttctcacaacaaacttatagttttgtacatcaaactccaacacttcgaacaatatgctccacgaatttatacatttcttctttcctaagggcaaaatggacttcttcatagctattaatcggtcaactgatgtaatgggtatggaagggatcaaaatcaaaattcagaggtatagaagagagtgagaaagggcatggaaggaaagggctggaatttcaggggcacgcaaaaaattctcttatggaagatacatcgatacatcaggctgatacaaaagaggatgtatattttagtgcatgcaggaaactccatatgttgagtttcctgtatagtagtctttagcccctaaatgacttataaaaaagattttgctaattctttaagtcattggaagttttggtaaataaaatattgaaatggttgaagatcattttttcaatgcaatatacatacaccagaactgaaacacggtatgaatttatgttatgctgaaaattatgactattatttgtggcaaaagatttattgatgcattacgggtcatttctttaaaattgaaccaaacacttctctttgttcatatcaattccttttccccttctatagcatatattatatatattttggtagatttccattgtttaaaacaatcttatcatcctacttgagattttttttctagtttgttcaagtgatttttacttgatacagtttgatgatatcggagagcatggaacaaaaataattgtattcaacctctggttcaatgatgatggggatatggagcttgatttcaactccgataagaaggtaagtaatgctggcatattttagggctctattgggcgctgtccaatgatatgtgtttaggagcttctatgcttcagtatgtgggaatttgaaaagttgtaatgcacaaataaatggtgagttccactcattgcgtgtttcaagtcgtgcaaaacttatcgaagggggtgaagtatggaagcacttccccaacccccaccccacccccaccaaatcacatggcacatttgtgggcacgtttcagatacaccatcctccttccaactttctcatatagttatatgactggtttatacataagctgtatgtattacgctaagttgtaattgatcaattcgtatttaatattttaggatatcctcattactggggcacacaggaaggtgaataccaacaaggcagataaggtcgcaacacagaactacgtttcaactcgactccgttattctcttagagttaagtattgatccccatttactagtttgctaaaatcagttttactatttcattgtgctgatatgtttatttttgtttctatctgaatttgaacaggcatacacatctgtcttgtaccttcacattcctgataatttcagaatagtcttgcgtggacatgatgtggaatcacataatgtaataaatgatttgatgtatcctgaatgcgtgttgtataaaccacaaattgctgggcttgcagaggtacgtgcaactcacatttgtgaagcaatactatgcattttcacccattttgatcaatgggataccatcttacaggcttgtttttctgaacttgtttcatctcattaactactttctggc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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0549200, RefSeq:Os01g0549200