Difference between revisions of "Os01g0563000"
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Revision as of 18:53, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0563000 |
|---|---|
| Description |
Peptidylprolyl isomerase, FKBP-type domain containing protein |
| Version |
NM_001049889.1 GI:115437677 GeneID:4327922 |
| Length |
26376 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0563000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:23071910..23098285 |
| Sequence Coding Region |
23072129..23072360,23081107..23081193,23081360..23081635,23082295..23082369,23082471..23082551 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MPISHELGEPDESFYNLWKEECEELWEEEDELWGDEDVEEELSL RHPGFNKWTVQQGAAGGDHIRAKDKNFYCFEVQVHFTGELVDGTQFVSSRENDIPERF ILGQEDVMHGFNLAVSSMQPGEKAIFTIPSALTMTKAGSPASIPSNIPPNQTLRFEIE LIAMFTIIDIFKDEGILKKIVKNAEPDRKQSHSSDFVFVKYDACLMDGTSVSKSEGVE FSLTDGFFCPAFAHAVHTMKEGEEAVLIVKPKYAFGEQGRPSQGEEAAVPPDATLYVH LLFVCWIRRIGEDQAIAKKTLRIGNSQRIHTQSQAVVKVRLLGKLQDGTVFDRRGYGD DEPFEFVVDEGQVIDGLDESVMTMEEGEVAEFTIPPQHAFDAVGSDQHQFAFVPRNAT VVYKIELLSVVNVRYYVRITGETSVVHSEP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>220..451#9198..9284#9451..9726#10386..10460#10562..10642#10943..11134#16559..16648#16753..16956#17941..17972#cggaagagaatatctgcagcttgatcagttccaaaactgagatatatctgcagcttgatcagttccaaaactttagctgggcacgcactaccggcaggtatactcgatcgctttgctttaatttgcactatttaatttgtccatgccactgacagattcctcctcttggcagcagttcaaggacaaaccaatttgaaggcggctagcgccagcacaggcatgccgatctcgcatgagctgggcgagcctgacgaaagcttctacaatctatggaaggaagagtgtgaagaactgtgggaggaagaggacgaactgtggggggacgaagatgttgaggaggagctgtcgctgcgtcaccctggattcaacaagtggaccgtccagcagggtgctgcaggcggggaccatattcgcgccaaggacaagaacttttactgctttgaggtccaaggtaacaattgaatatataaacttatttttttaacataacgggtaatctcaaccttttacttctgaaggtaaccactcgctatatacctccgttaatatatgatgttggttagttcaaaatagagtaatatatattgtttgcagctccagaggtataaaacataacaaataaaggaagacaacaacatgtgaacataaataaactgatgctagcaagctctcttatactccctccgacccataaaaaaccaacttacactactacaaaacatcaaataggtatcgccagatgccagtagtgtttaaactggcacctataggccttttcccaccttcgcgggttgaaattgtaaaaaaagggcacctttaagtaataataggtgtcggttctaattaaaaaccggcatctattctattttgtgctggttatttttaaaaaccggaacctttaatattaaaaactggtacctataataaattataggtgctggtttttttttaaaaaaaccgacacctataattgagccgagccggcgggccccaccacgacgcttcgagactcgataggagataaggtcgaccgctcgctcgctcgtctcctctcagtctctctctatctcgttctctccgctctctctcccctctctcctcttctctttctcctctccctgcatggcagcggttggaggagcggcgtgcggcggcggccgcgccatcccctctgccggatctggcgagggccggcccagcggcggcagcagcgggaggcggcatgcggcggcgaggggggggatgcggtggcgacctggcggcggcgccctcccctctcgaccctctctcgctgcccacgaccgacggccgccccccccccctccgccagatccggggaggggcggcccagcggcgggaggcggcatgcggcggcggaagggaggggggatgcggcggcgggacaagaggcgatggtggcctagcggcggcgctccctccgtcggatctagcggccttgcagcaaccattttttgtgatgatttctatgatcaatgttctgtgatgatttctgtgaaatatttttgtgatgttcttttctgtcaatgattggggatgagctcgatgcatcgagcttttttttggctcgcgagtggtctaaaggtgtcggtttttaaaatgtgatttgtgccggatcactcatctgtgccgtcttcattgtgccggttgggaaaaccggcacctattagggtttcccaaccggcaccgtttaccctttctgtagtagtgttagtactaaatgtgatacattctagtactacgaatctggatattacctctgtccaaattcattgtattaggatgtgttatattcagtaatagattttttttttgagacggagggagtatatagtacccactcattcgacatttggccctgcatttattttctcaacaatttgctagtttgagtggaggatttctgtttacgtactgtatttattgtctctgtgttcagacaatttcaatcccaaaaaactcctattcatatatgagaaatgtttcagatcgactagtctctaatattatttaaaaaaacacaacgatgccatcgacatgaggagttttttttaaataatattacaaattgcaatattggtgggagggtctatgcgaaatttaaataatattacatgaggagtaatattacgatgtcaacgatgaacatagtctctaatattatttaaaaaaacacaacgatgtgggagggtctatgcgaaattttgtatatacatgaggagttcttttttttttcataatagtcatccatgtataaatctttccaaggagaaaaacaattgcaaaatctgatgaaaccgaaatgggatgaagtgttatgagctgagagtaccaacagaaacagataatactttgcacgaagttttcaactattagtaaattgtgttcataaccaccaattgttagttaccccataattcttcacgtttcgataatattaagatcaaacttttcaactttgactatccataacttttttaaaaagtagtttgaaaacaattgaaacatatatagattagttctaaaaactactataataaaagtaaatatttccaaaacataaattatggaaccggggggtgtatcaatgcttaataagttaatcaacctatcattccagattaactccaatctaaaattgttcttaattaagttaaatatagttagtggtaaaactattatctctgtcataaaataggatttctaggcttttttagggagataaataacatgctcgtgcgcacagcgcttatgactagatttcttcatcagttctgtctcggtttatttcctctcgcgctatgcacggatgacgggatggaaggagaacgattcttacataggattttcgcaagcggtgaagcaaccacttgcagaaatcatcattttttttttcaaatagatagtgcaaggatgcaaatctactgctgtactacatccacagtatgtgtcactgacatgtgggtcccacctattccgggcccacatgtcagtggcacttactgcacatgcattacagaagagaatcccaactcgtagtgcaaccgcttgtgtaaactaggaaggtagcccacgcacatgtgcgggcagctgcttgaatttttatcgttgaagcttatgtgtggttgattatttttgttgaaatattcattatcattgttctaaacctgttttcgtcaataattatttcttttacttatttagggcactaattcaagaacacacaacagagaatttcccaaacactatagtcaaagcctctagctagatgtgtatttcagatcacacccagtgtttggtacagattggcatctcaattcctaaggcctctattttcatatttgaaaacttttgggtggagcttgagggattttttgagctagtgaattcttcatggagaaatcatggttgctgaaatgatgaagaagaaagacaagtttagctacaggatgtcgcgacttcatgatttaagctgtagaacaccgcacgtgatcacttttgtgaggaaaatactctctaaacatggttatttgttagtggacatcgctcccattaaaatattaattttcggctgaataagagagataaacggtgtgaaaggtcaaaatatccctgaccccacttgtcatattcttcttcctccttaattccctttttctcccaatcccacgccgtcgtcgacgacggcgtcctaaccatgggcttctagaataacaaccgcgtcgggctggcgactctggagtcgacaggatgtgtggcatgttgaggaggcgcggcctgccacgggaagaggcggctgctgcgattgcaagggcggtggcggtggcggtggtggcaccgggtggtacttgtggagcagtggcattggtggtgggagcaaggacgacgttgtggacaacggaggtggtagcgcagccacaacgccaccatgtccttcatgtgttgccgccgcactgtgtagtcctgctccaccatagacgttgtgcaccctatcaacccccacgaactggtgccactactgccaatgccgacccgtgcaccacatgccgccgatggtgctccccacatcctcctcccgcacctcacttgatctacaccgtaactgtcgtgggcgtcgtcgcacggtgtccccgctccgctgctgtcctgactgtccccgttcctccgttatcgtcgcacactccacccgctggtcgcgccactgctcacggctcgcagtgctcaccggagaagagagaaaggagagagatagaggatgagataaggaagaagatctagaggatgaggaagacaaatgatggacaatttggtcactccacatataaatatggcccccctatcgcctcgttaacacaaatgcattattttaatggacgcggtgtccgctggcaagtaaccacatttagatagtgttttccctaaagattgagttcgtgtggtatcctacaactaaaactaagaagtcacgatgttctgtagcaaaatttgccaagaaaaaagtattacagttaaatttaagtttttgaggaagacacttaagaactggagtaaaacattgtcaaagctgaataggttgataaaaaactgtaattcagtggtggattctattgataaattagtggagtcaagagatttaaaagtagaaatagaatgggacttctgaaagctgatcagatcaaaagttttgatctacgtacctgaagtacaaacaggtctatcttctaaatgaaaaaaggggtctatgcccaaaccacatattttcctatatagcaaaatatgagtaatattgatctcaatttattgtttaattacaaattaaataacaattttaaaaattaaaaactagagattttgtttag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