Difference between revisions of "Os02g0749500"

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Revision as of 19:23, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0749500

Description

Exocyst complex component Sec6 family protein

Version

NM_001186223.1 GI:297721578 GeneID:9268086

Length

11389 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0749500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:32387893..32399281

Sequence Coding Region

32396905..32397162,32398979..32399281

Expression

GEO Profiles:Os02g0749500

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>aaaacaccacgccatcttcacgatctccgtctcccatccccgcctcgccgcgccgcgccctcctcctcctcctcctcccaccccgccgagcactcacccgccgcctcggtttcgtgcgcctctgcagcggcaggccgggggcgcggggcagcggttggcgtcggccgcggccgtgctgtcatggaggatctgggcatcgaggcgaaggaggcggccgtgcgcgaggtggcgaagctgctcccgctcccggagctcctctcctccattgcctccatcaaatccgactacctcgcgcggcagcagacaaatgatgcacagctcagtacaatggtagcagagcaggtattccttgacatctactatgaactgccaaacttattagttttaatgctattgttaatgctttgctcgagttacggtttctgctactatcatttgcattcccccctcaatgtttgtctgttggattatagtttttctgtatgtgcatattttatcacttataggttgagcaagcccatgctggcatcaatgctcttgcactatctcaggaaacaataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>KTPRHLHDLRLPSPPRRAAPSSSSSSHPAEHSPAASVSCASAAA GRGRGAAVGVGRGRAVMEDLGIEAKEAAVREVAKLLPLPELLSSIASIKSDYLARQQT NDAQLSTMVAEQVFLDIYYELPNLLVLMLLLMLCSSYGFCYYHLHSPLNVCLLDYSFS VCAYFITYRLSKPMLASMLLHYLRKQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2120..2377#1..303#aaaacaccacgccatcttcacgatctccgtctcccatccccgcctcgccgcgccgcgccctcctcctcctcctcctcccaccccgccgagcactcacccgccgcctcggtttcgtgcgcctctgcagcggcaggccgggggcgcggggcagcggttggcgtcggccgcggccgtgctgtcatggaggatctgggcatcgaggcgaaggaggcggccgtgcgcgaggtggcgaagctgctcccgctcccggagctcctctcctccattgcctccatcaaatccgactacctcgcgcggcagcaggtgatgtgatccctccctcgaaacccgattcgcgccaaacgtagcggaatttctgaagtgtttggttgatagattcggcgaactctgatagtcatctccattctccttctgagtgacctgtcgcattgaactgatttgtttttcgctctgagctctgatgcgtcgcttgtgatgtggctgcaatttagtggtgtgggtcgcggcaggatcctatctctcagcttctagcacttagattaaccagcatcaggtagttatttgtttgttacggtgaaatgcttgaaaattaggctggttcaaattcgttgctgatcagtgcaatcacaaattgtagtactgtgcctgtgaagtggtgaggtgtgcggaaatcctgatccggtacccgtgatatagttgtccctgagacttccgtcgaattctaataaaattttccatggtttctgaaaatactttgctaccctcagaattttgtggtggctaagttgcagatgcaaagtgctaaaaaattgtgttgctcggtgaaccctgatggattatatgcagcatctatgcagattagctattcctggtctaatgttcatatcagcagttactgtgcaagcaaattcgttactattcatatggtttgaaaattaaactttagtatacagataaggatagtagagagaagaaccagggaaaaaaaaacaaggagatggcatggtttagaccttttctattatttccttttacttacgtttttcagtgggcccacttgctacttttatcctaaggcatacctataattgtggtgccatatttttcatcaaaaaacagtcaaattgtttttacagtcacatacaacaaaaaaatacaaatgtaagtaggaattaattatagtgtaactaagatgtaattgatatgtaagtagtatgtaattacggtgtaatagatatagtggctactggtgatcctcttcgtttctcatcatgataatgatgaataatgaatactgatcaatcggtcatatcaacatgcatgtttggtagactggcagaaatgttagaaggctcaggaggcacgagcaagtttcgagaaaggaagccaagaaaagaagtaaaacgcatgcgtgaatgctcagcaaacacaaatctctataccatcctaaagctgaaaattcaactgtgttttgtgaaaaaatttgtcaccataattatagcaaatcagaatgaatattcaagggaagagatttcaatccttgcgtttacaataaaattgattgctggacttcttccaaagctaaatgacatttgaccatctaatgcgtgcatctatcctcaaacatcctgctgatcacaacaaggcttagtttctccttattgattactccacacttgcgtgtagctttgtacagtgtactccaggatttgtttttagcctttttggtcctatgtcgacggtttatctcaatgctattgttcctcacattcttgatggttgttatctcttaccaaagggtttcaaaacatactaattaagcaaaggtttgtgttagacttgattgggcatttcttaaaaaggtttgggcagagttgtctcagttctcagatatggctgggatgttcggcaagcttaaatgtagacatgcaagtaaattataaaacatggctaagtgtatgtgcgtatgtgctcacacccattttgtaatgcatatattggcatatgcatattatcttcagtgagatattatgagcatgtttaccattttgtaaagcatatattggcatatgcatattatatacctctggatttctaactgtcttctataaattctcagacaaatgatgcacagctcagtacaatggtagcagagcaggtattccttgacatctactatgaactgccaaacttattagttttaatgctattgttaatgctttgctcgagttacggtttctgctactatcatttgcattcccccctcaatgtttgtctgttggattatagtttttctgtatgtgcatattttatcacttataggttgagcaagcccatgctggcatcaatgctcttgcactatctcaggaaacaataaacaaactacgcgagaacttcatagatatagacaagtaagctaaaatatttttatctctacattttcttatgctcttgcatgattgatatgctagatcacttccttgaggttatatgtttctcctcatttctcagtcctgtttatcataaatgtctggcaggttgtgccaggagtgtcaaacattaattgagaaccacgacaagattaagcttcttagcaacgcaagaaataacctgaacacaactttaaaggtgtgctgaccttactttagcaataacaactgtattaaggttgtacttgcttgttttttactaacgttcttatcaatacattaagctaaccaagttatcgagcacgaaaatttcatctgacatgttgattgtcaatgcctattaggatgtgggaggtatgatgtctatttctgttgaagcagctgcagcacgcgactcgctaagtgatgataaagagttaattcgcacttatgaggttctatttttccctctttggatcactgatcaataccatgattgatattatagctctttttttaaatcaggaattgatcatagttatatcctacttgcctgactttgctgtttgatcttatttgttgaaattagagattaacagctcttgatggaaagagacgttttgctttagctgctgctgcatctcacaaggaagaagttggtcgattgaggtggtgtttctcccctgaaactagctaatattaatgattattcaatgcatacctgcctcctcccccccccccacgcccccaccctttaacgtccccattgtctttctcgttagaataatgtaaagcattctgagcagaagtaatactactgcaatcagaaaattatctgaagaaaatcagacttatgatcctatgttgattctactatattatgaaacgactgtagaagatccaaaatagaacaaggtatataatggctcaatgactcttaaggaagaaatgcagaaatgatcttctctacatattacagtatgatagcaaatactgttagggttaacaagggattttaatctttcttctagtttgtagtgcaatgaagtatatatctataatttgcttgattattgtcttctccacagagagtactttgaagatgttgatcgttcatgggaaacatttgagaaagcattgtggggccatgtcactaactttttcagactttcaaaagataggtactgccttttattacgattcactttgtctttgctatttaacatggtaaatgaatgaattgtcttattgtttttatatgaattgcactgcctttctatttaacgcatatctgctacaaatgctcctgtattaaactcactatcttttttctttgtgcagccctcagacgttagttcgagcaataaggtatgcatgaactatttaatatctactttgatcattttgtacagtcaattgtgaaagctgaatgtttggaccagctcatagtttgatacttgttgcccatcaatttcttctgtggagcaattattccccctggcttcctccctttcagttcacttgttgaatgaaagactatttattgatttattagggaaataatacataaatacaagctgatcatttgagatttagaaaattggcttgattcttttttcttatttagtttctaggtaatgggcacttatatatcttgcacataatccttaaattcattcttatgttagggttgttgaaatgcaagagatcctagatcaacaagttgcagaagaagcagctgaggctgagggtgcaggtgctatggcgacaatagcaaaccagcgtagaactgcaaagtatgcttcttcctttctttgcttcacacatgtttctgtacttccagtaggtgctaggtagtatgatatattgatattatatctttcatgtttcagaggatcaaagaaataatgtatcctaggatacaaaatttgtcatgtccctttactttcatgctgatataactgtactgaagatatgagtactaacgcacttcttgtccatatcagcatctgtgcatctgcgcacctgtaaaggtggcattaaagtttttacatcatgcttttcatatataatatctttaataccagagactggctaccagatcaacaaattcaagctattgtacgggactatgggtgtaactaacttggttgtctgctatggtctgcatgaattgctttactattgtcatgatgacttgtataactgttgttttattcaaattatctctagatatctattatcaaccaacaaccaatgtgagaaccactcaaatagtaattattaaaccattttatttattatactgactgctcatagttctgactcatccttgcccaactgtagcaggaaaggtggaggagcaacatctaccccaagaagcactcaagataaatcaaaggtccagggaaagggctacaaggacaaatgctatgagtatatcaggaaggctgttgaggctcgcttcgacaaactgctcaccgaggtagtgcttaaatatatcctggacttaagattttattgtgtggtcatcacagtccatgcagttagcagcaagtag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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0749500, RefSeq:Os02g0749500