Difference between revisions of "Os02g0773400"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0773400

Description

Ion transport domain containing protein

Version

NM_001054803.1 GI:115448976 GeneID:4330882

Length

11052 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0773400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:33535584..33546635

Sequence Coding Region

33537074..33537508,33538140..33538325,33538684..33538782,33539378..33539515,33540644..33540901
,33543377..33543640,33543794..33543939,33544130..33544207,33545114..33545243
,33545408..33545654,33545742..33545904,33546238..33546412

Expression

GEO Profiles:Os02g0773400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgtctgaccaggagagagatgatattcctatgctactaagaaatgttgagctaccaacgtttcctcctagaagtacatcaatgtgcataccagttagggatgatgaatacgaagaagacacatttgtaccccatactggtcctctgtttgttcagccaccaacacaaactgcagcagcgggcattccatttacaaatacaccagatatgcctcctcgacctccacaaggaaaacaagtcaacaagccacatgcgataatgccagaagaaattggaggaaacaggtggtcttatagtgggaatgttccaaagaatgaacatttgatgatgtctggacctttgggacaatgtgacgatcctgattgtgtcaactgccctcctgcttgtaaaaacaaaaggcattttcacagaggatcaagtacattggacagtaagttccataattttctttgtgagcatggtggtggatggaagaaggaaattgagcgtttcctttcacgcattccagttatgaacccacatgcaaaagttgttcagcaatggaatcagttctttgtgatatcatgcctggttgccatattcattgacccactatttttcttcctattatcagttcaaaaggataacaagtgcattgtgttgaactggcattttgctacagcacttgcagttgtgagaagcgtgactgatgctatttattttctacacatgcttcttcagttcagactggcttatgtagctccagaatcgcgagtagtgggagctggagatttagtagacgagccaaagaaaattgctgtccgttatcttcgtggatattttttactcgacttcttcgttgtgcttccactccctcaggtgatgatattgctggtcatccctaaatatgttgggttatcaactgcaaactatgctaagaatttactgcgtatcactgttcttcttcagtatgttccccgcatcatcagatttgtaccattgcttggtggtcagtctgactcatctgccaatggattcatattcgagtcagcgtgggctaactttgtgattaaccttctaatgtttgttttggcgggacatgttgttggttcatgttggtacctatttggattgcagagggtcaaccaatgcctacggaatgcttgttctgcatcaaaaattccatcttgtgatggttttatagattgtggacgtggcattaatattgggaagcagaatcaactaagcagacagcagtggtttaatgattcagcctcaacagcttgtttcgacactggagacaacggtttccactatgggatttatgaacaggctgttttgctaactacagaggacaatgctgttaaacgttatatatattcattattttggggtttccagcaaataagtacgctagctggtaatcttgtcccaagttattttgcatgggaagtcctgtttactatggctattattggtttggggctgttgcttttcgcattacttattgggaacatgcaaaattttctccaagctcttggaagacggagactagaaatgcaacttaggaggcgtgatgttgaacagtggatgagccatagacgcctgccagaagatttaagaaggagggttagacgcgcagaaaggttcacctgggcagctacccaaggggtgaatgaagaggagcttttaagtaatttaccagaagatattcaaagggacatacgccgtcatttctttagatttcttaacaaggtccgattattcacattgatggattggcctatcttggacgctatatgtgacaaactaagacaaaacttgtatattagcggaagtgacatcctttatcaaggtggtccagttgaaaaaatggtcttcatagtgaggggaaagctagaaagcatcagtgcagatggaagcaaagctccgttacatgaaggtgatgtatgtggagaggagctcctgacatggtacttggaacactcttcagctaacagagatggtgggagaatgagattccatggtatgcgtttggttgctattcgtactgtaagatgtttaacaaatgttgaagcttttgtactaagggcaagcgatctcgaagaagtaacttcacaattttcacgattcttgcgcaatccacgagtgcagggtgcaatcaggtatgagtcaccctactggagaaccattgctgcaacgcgtattcaagtcgcatggaggtatcggaataggcgattgaagcgagctgggatgtcgaagttgaacgatcaatcttataattctgcattggaacgtggcgcgcgtgaatgtgatgctcgtcagcatgggcgggtatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSDQERDDIPMLLRNVELPTFPPRSTSMCIPVRDDEYEEDTFVP HTGPLFVQPPTQTAAAGIPFTNTPDMPPRPPQGKQVNKPHAIMPEEIGGNRWSYSGNV PKNEHLMMSGPLGQCDDPDCVNCPPACKNKRHFHRGSSTLDSKFHNFLCEHGGGWKKE IERFLSRIPVMNPHAKVVQQWNQFFVISCLVAIFIDPLFFFLLSVQKDNKCIVLNWHF ATALAVVRSVTDAIYFLHMLLQFRLAYVAPESRVVGAGDLVDEPKKIAVRYLRGYFLL DFFVVLPLPQVMILLVIPKYVGLSTANYAKNLLRITVLLQYVPRIIRFVPLLGGQSDS SANGFIFESAWANFVINLLMFVLAGHVVGSCWYLFGLQRVNQCLRNACSASKIPSCDG FIDCGRGINIGKQNQLSRQQWFNDSASTACFDTGDNGFHYGIYEQAVLLTTEDNAVKR YIYSLFWGFQQISTLAGNLVPSYFAWEVLFTMAIIGLGLLLFALLIGNMQNFLQALGR RRLEMQLRRRDVEQWMSHRRLPEDLRRRVRRAERFTWAATQGVNEEELLSNLPEDIQR DIRRHFFRFLNKVRLFTLMDWPILDAICDKLRQNLYISGSDILYQGGPVEKMVFIVRG KLESISADGSKAPLHEGDVCGEELLTWYLEHSSANRDGGRMRFHGMRLVAIRTVRCLT NVEAFVLRASDLEEVTSQFSRFLRNPRVQGAIRYESPYWRTIAATRIQVAWRYRNRRL KRAGMSKLNDQSYNSALERGARECDARQHGRV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1491..1925#2557..2742#3101..3199#3795..3932#5061..5318#7794..8057#8211..8356#8547..8624#9531..9660#9825..10071#10159..10321#10655..10829#gtggttggccgctgttgatcggtgcaatctcccgacgtctcgaggaggaagaagaagaacacgtcgggttagttcgatttctcttcatttttttgttcatttttttctgcgcttttccgcggcgatgtggtagagtgggggagtaggggtttgatgcttccagaggagtcggagaggcgatttttatgggatttttttttgttggcggcggtgcgtgccctcgcgttcagccagggtagccacctcccgccgccgtctgtcttccctgaggtcgccgcctcgttgcttcgagtcctactttgatttggaagccgatgagttcgtggttttcctggaagtaattgaattgttttttttgtatgcgaatctgggtgttagatttggtgaagtgcaatgttttgctggtgtttggtgattttgatgataagatagatgattccactgaagcaatgggggtgtagcaaatgagtggcggcggcgaggatgaatgaaccaatgtttttcccttgattagatgactccaccgccaacctagtgtagcttgctcgctgcagccaggtgccgccattgctcaagctgcttaaggagggcactgacgatgccctggaggctaccacacgcctgccctggctgcttggcttcaatcttcaagggtcaatcgaacctccatcagaggagaacggtagattcagattgaggaagagcacactatttcagtggtattttgagagaaccaaaggctttctattggtatatatcacaatgtgcaagttcaagtgatatatacccctttttatattaaactatttattagttattttctctcttcgttcatctcatacattggagtattggacacaactagtcttaaagttgttgcagctgtatttgctgtctttattggtttgcacttcttagttccaattcagcagtccgtattcagtaatgctataggtttcccttctataacaagtgcaaaatgtctttatctcatttcaggttctctgttctttgggggactcctacagatgtaattggttctgtaagttggggacctaatcaggtgaacacttgattgtgataggcttgtcaccattgttagatatgcagcaggttactgacacaacaggggctgattttgtttggccaatctacatgtggattctctaccgcagagtgtattttcatgctgtatcattctagtggccattataggttaataactttatatttctatctaaggtggttgtttcaaacactggcattcagtaatgtgtttttacattcctgaaaatgttctgaaaattttcgttattgttatgctgacattgtgctacaaatataattccaacatgagtattgatattgattggagtcgttactctctgaagatagataatgttcttttatacaaaagtatgcaaactttcttgcttgtgtcattgaacttgattttctattacaatggatgttgatttcagggttaagaaatgtctgaccaggagagagatgatattcctatgctactaagaaatgttgagctaccaacgtttcctcctagaagtacatcaatgtgcataccagttagggatgatgaatacgaagaagacacatttgtaccccatactggtcctctgtttgttcagccaccaacacaaactgcagcagcgggcattccatttacaaatacaccagatatgcctcctcgacctccacaaggaaaacaagtcaacaagccacatgcgataatgccagaagaaattggaggaaacaggtggtcttatagtgggaatgttccaaagaatgaacatttgatgatgtctggacctttgggacaatgtgacgatcctgattgtgtcaactgccctcctgcttgtaaaaacaaaaggcattttcacagaggatcaagtacattggacagtaaggtggtcttacttccctctttttgtaggaatgcacaaaacattaaaactatatgattttatctgaacctgatagttgtggctggattgcgcaacatttttctagtaaaatagcatagtattgatacatacttcacaatcatcataagtgatctggattcgagaagcctagtacttctgaattataaagtagagaacacaagtctaaaagaaacataaaagataaaaggcaaaaaaaaaaaaacagagtatagaatgcacctctacatagatgagaggtaatattagttgatatttatcttcttcttatataaaaatctcctagtaagcaatcaacatttggctacagataactcaattttaagcatcaaaatttctatttcaatcttcaatggaaaataacagccaatattgctggaggtagcgctgtagcggaagtaccccgctattgttattgcggctgcaattgtggccattgtgaatgctatttagtaccttggttcttagttttttttttgtctagttagatttcttcaacataatgatcaaagcacttcttaagagcgcttaaagttactgactgtggtattgttgtattgaataatctaatctgttttcttttgctctcttgaagttccataattttctttgtgagcatggtggtggatggaagaaggaaattgagcgtttcctttcacgcattccagttatgaacccacatgcaaaagttgttcagcaatggaatcagttctttgtgatatcatgcctggttgccatattcattgacccactatttttcttcctattatcagttcaaaaggtaactagttcacttgaagatgctagttcatatccatctgtcaaaagcctacaactttcttgtacacttcatttgttgttgcaccttgtttgtgagtttgtgagctaatcttgtgtaatttttcttactcctgttgcagcattctattctcctatcggttaactgttctaagtgttgatatcttgtgtaatggattgaaagggtcaaataagcctaaaaggggaggggggaaggaataggcgattaaaacttttaagtagatgcagaagcagtgcttttcggaaattccgaaaatctcagatactccgaagatcaaagctgacctgcacttacttttgttccctttttttttatgcaggataacaagtgcattgtgttgaactggcattttgctacagcacttgcagttgtgagaagcgtgactgatgctatttattttctacacatgcttcttcaggtcagtacatcattgcttttgctattctatagaaggttctataattcatgttccatgatagggtatggttccacattttataaaattctttcataaataacatggtcactaaggcatcagatggaaggcagtttgattatattttggttctttggtatgcatattaggacaagtatatttgttgagtgatcagtagttttcttctaaaaatgccaaattagatactggttttttgtgagtataacttgcactttttatctgttgacaatatgtgagaaaaggctcagccgctcaggttcaatattcttgtgtcctggtatcatgttttagtaactaacagtaatgcattgtttgatcttcagcggatgatttatcatatctccatgatcaaatagttgtgatatctttttaccctttgtttgttaattgtaatggtttgtcatgctttgactccattctggtatcatgttttagtttgatttatcatatcttgtattttattttattttgcatctatttgttcctgtccagttttaaccccaagaaaacatattatcaacttttgaccgttttattttttgcatttctctttcagttcagactggcttatgtagctccagaatcgcgagtagtgggagctggagatttagtagacgagccaaagaaaattgctgtccgttatcttcgtggatattttttactcgacttcttcgttgtgcttccactccctcaggtaacttgttttatccttctgagttgatgtggctaaattttgacattaagcttcatttttcttctttatccctgatggatgacttattatctaggctgaagttttcctttatcattctatttatatttttatattgctttggtactcctcttcaagtcggtagcagaaggcaaacttgttcttagggttatgataattattttttagggtaggtcaaacaaataaaagagttagctactgggaacgcactatacatcctggagagtatgttggagacctggcacaagcagcataggagttaggaggtcccagctatccatccagctgttgaaaattgcttttcttgtttgcttggcttattactttgcatctgccatggctttgtggaccggtggccacaactgaatgcttgcgattggcaagtgctagtgatccatgttcatctttttcatgcacacagcaaattcattgccctatgtagctagtgttatggacctatcatgaacagatcaagagcatttctttcagttctcttcacgtgcacaatagaccacattatccttttaagctataaacttgtgatctccactattgatgtactttaaaatacataagcttcatctaaggagtattggttcaagtccccgttgaaaatatatgctattgaacctttcaggtttattttggtagtttcttgttggtctcagagtatttgccaatgtatttaagccaactagaaattgacaagaagtcaaaaagaagttgctgtttagcattgaaaatactatggatcttgggcatgataatgactaattgattattccatacttgtgaccttagcagattgaggatgagtctcatgaaattgatcatgcagaggaacaccttagctaggctggcaattctttgttactttc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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0773400, RefSeq:Os02g0773400