Difference between revisions of "Os03g0344700"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0344700

Description

AAA ATPase domain containing protein

Version

NM_001056619.1 GI:115452966 GeneID:4332809

Length

8996 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0344700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:12888186..12897181

Sequence Coding Region

12888756..12888869,12889724..12889828,12890011..12890070,12890174..12890312,12890423..12890607
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Expression

GEO Profiles:Os03g0344700

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:12888186..12897181 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgctatttggtgggaagactaccaaggaatcagattcatacaaaaagggtgatagagtgcggtacattggttcgttacagtcaacaggtattatccttgatggagaaagtcctccagattttggttcacaaggtgaaatatgtcttcctttcgaagagaatagatcatcaaaggttggagtaagatttgatgaacaaattccgggaggtattgatctaggaggcaattgtgaagttgatcatggtttattttgttcagttgattctttatgcctcgatgctccaggatgggaaattagatcgaaacacccatttgatgtcattattcagtttatctctgaagaaatcgagcatggtcctctagtcttatttttgaaggacacagaaagaatttgtgggaataatgattcctatcgtgctctcaagagcaagcttcaatatttcccagcaggtgcttttattattggttctcatgtacatcctgatgatcacaaagagaaggcaaatgccagttctctacttctttcaaagttcccatacagccaagcaatacttgactttgcatttcaggactttgatcgtggaactgataagaataaagaaacttcaaaggcgacgaagcatctaactaagcttttcccaaataaagtgacgatccagccaccaaaagatgaaattgagcgctcgaagtggaaccagatgctagatcgagatgttgaaattcttaaaggaaatgctaacatttcaaaaattcgctcttttctattaaagatgggcttggaaagcagtgatcttgaaacagtatgtgttaaggatcgtctcctaacaaacgaatgtattgataaaatagttggttttgctttgagtcatcaacttaagcactctacaattccagacccttcgagtgatgttcgtttcactctatctagtgaaagtcttaagcatggtgttgacatgttggaaagtgtggaatctaaccctaagagcagcaacataaggaagtcgctcaaggatattgctactgagaatgaatttgaaaagcgacttcttgctgatgttatacccccggacgaaataggtgtcacctttgaggacattggggcattggaaagtgtcaaggaaactcttaaggagttagtgatgctacctttgcaaaggcctgaattgttttccagaggtcaacttatgaagccatgtaaaggaatattactttttggcccgcctggtacaggaaagacaatgcttgccaaagctgtggctacagaggctggtgcgaatttcataaatatatcaatgtcgagcatctcttcaaagtggtttggtgaaggagagaagtttgtgaaagctgtattttcactggcaagcaaaattgctccaagtgttattttcgtggatgaggttgatggcatgttgggtaggcgtgaaaaccctggagaacatgaagcaatgcgtaaaatgaaaaatgagtttatggtgaactgggatggtctaagaacaaaagataaagagcgtgtattagtacttgctgcaactaataggccatttgaccttgatgaggctgttgttaggaggcttcctaggcggttgatggtgaatttgccggatgcatcaaatagaagaaaaattcttagcgtgatactagctaaagaagatttggcagatgatgtcgatcttgaagctgtagctagcttgactgaagggtattctggcagtgatctcaagaatctatgtattactgctgctcatctccctattaaagatatccttgaaaaggagaagaaggagaaagctttagcagaggcagaaaataggccgctgccccaatcattttcaagtaacgatgtccgtgccttacgactaagtgatttcaaacatgctcatgaacaggtctgtgcaagtgtgtcttcggattcaactaacatgaatgaacttattcaatggaatgatctttatggagaaggtggatcaaggaaaaagactactctaagctacttcatgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLFGGKTTKESDSYKKGDRVRYIGSLQSTGIILDGESPPDFGSQ GEICLPFEENRSSKVGVRFDEQIPGGIDLGGNCEVDHGLFCSVDSLCLDAPGWEIRSK HPFDVIIQFISEEIEHGPLVLFLKDTERICGNNDSYRALKSKLQYFPAGAFIIGSHVH PDDHKEKANASSLLLSKFPYSQAILDFAFQDFDRGTDKNKETSKATKHLTKLFPNKVT IQPPKDEIERSKWNQMLDRDVEILKGNANISKIRSFLLKMGLESSDLETVCVKDRLLT NECIDKIVGFALSHQLKHSTIPDPSSDVRFTLSSESLKHGVDMLESVESNPKSSNIRK SLKDIATENEFEKRLLADVIPPDEIGVTFEDIGALESVKETLKELVMLPLQRPELFSR GQLMKPCKGILLFGPPGTGKTMLAKAVATEAGANFINISMSSISSKWFGEGEKFVKAV FSLASKIAPSVIFVDEVDGMLGRRENPGEHEAMRKMKNEFMVNWDGLRTKDKERVLVL AATNRPFDLDEAVVRRLPRRLMVNLPDASNRRKILSVILAKEDLADDVDLEAVASLTE GYSGSDLKNLCITAAHLPIKDILEKEKKEKALAEAENRPLPQSFSSNDVRALRLSDFK HAHEQVCASVSSDSTNMNELIQWNDLYGEGGSRKKTTLSYFM</aaseq>

Gene Sequence

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gaggaaaaaattgaacttttaattagattacactatcctgagttgaggaaattggtattttgaagtgtatcgtcatgatttatttctatagcatgctacctggttgaccacggtttcttcattggcttgtcattccctcgggcttagtttcttattcttcaatcagaattgcatcttatgtatgaatgaattttgcaatttccttttcagtttctattaaagatgggcttggaaagcagtgatcttgaaacagtatgtgttaaggatcgtctcctaacaaacgaatgtgagtagcattcctattcatctttcttctatattgcaaatttcaataaacatgatgggtgcactgttatttttcaggtattgataaaatagttggttttgctttgagtcatcaacttaagcactctacaattccagacccttcgagtgatgttcgtttcactctatctagtgaaaggttcactctaatctttatttcttctccacaatgccaacaaagttctctttatccagtgcatcaatgtgtatattgtccactgcagtcttaagcatggtgttgacatgttggaaagtgtggaatctaaccctaagagcagcaacataaggaagtcgctcaaggtgatatactttgtattagtgtatctattttgacactagtttattctacaccttgggaatagtgttatagctccgaaatggctattgcaactgtagcactgagagcctgagaccagtcttcttcaccttctctggtcaatgcatgcctgaacgtgtagtgttgcagcattatatcttttaaaatgcatggagcttatgaatcttgctataacaatttcaggatattgctactgagaatgaatttgaaaagcgacttcttgctgatgttatacccccggacgaaataggtgtcacctttgaggacattggggcattggaaagtgtcaaggaaactcttaaggagttagtgatgctacctttgcaaaggcctgaattgttttccagaggtcaacttatgaaggtagatagtatcctccatattgcatagttttcaccataatattctttaggaggtattgtgtattcatttatattctgctccagtatgaacttgtcccctgttggactcagataaacttcagttagtcagtagcagatgctgaaatcttgatatagtcacatagcttttgatcaatttggagttggtcatgacaatttcctaccttttctttattgggacctatccattttataaacctaatggcaattcatgccaaattggattggaacaaggataagatatgatttattgttgcaagttggttatgaatggatgggggtactacttttggatagtggaattttttatttccattttatttgatagtgaactgacttttgttattgcttatgttgtgccagccatgtaaaggaatattactttttggcccgcctggtacaggaaagacaatgcttgccaaagctgtggctacagaggctggtgcgaatttcataaatatatcaatgtcgagcatctcttcaaaggtattttactaaatgattgctattagtccatggttttgtttttgcattttgggcatctgaaacattgtgtaccattaccacagtggtttggtgaaggagagaagtttgtgaaagctgtattttcactggcaagcaaaattgctccaagtgttattttcgtggatgaggtaagtaaattgtaattgatcaatcacaacgcctttctgaattccctgtgatgtttgctttctagtttatcttcttcatcttgtgttgtataggttgatggcatgttgggtaggcgtgaaaaccctggagaacatgaagcaatgcgtaaaatgaaaaatgagtttatggtgaactgggatggtctaagaacaaaagataaagagcgtgtattagtacttgctgcaactaataggccatttgaccttgatgaggctgttgttaggaggcttcctaggcggtgagtatcatatttttcattcattttaagatttgaactgtggtgctaattttatgatttttagataattgacttgactatgcatgtgttttggtatatgtattgcttaggttgatggtgaatttgccggatgcatcaaatagaagaaaaattcttagcgtgatactagctaaagaagatttggcagatgatgtcgatcttgaagctgtagctagcttgactgaagggtattctggcagtgatctcaaggtactactgttgcattcatagaagtagttccactgctgtgatattgattcctcaaattgaatgttgcttgttgagttgactcctggccgtaatcatttttcagaatctatgtattactgctgctcatctccctattaaagatatccttgaaaaggagaagaaggttagtttttaacctccacttttatatttgtttttcctagtatatgtataccttggggtttcaataaatatttattggattagtgatgaaatcagtggatttaatatactgagggatgatcacataaattaaatatttaatatgaaccgcaatttaacttcacatgtgctgtccacatgcaggagaaagctttagcagaggcagaaaataggccgctgccccaatcattttcaagtaacgatgtccgtgccttacgactaagtgatttcaaacatgctcatgaacaggtatgatccataataaataagaacttgctttcaagtactcgtgctgtgatgtacatacatactaccatgatttttcttgttaaatgcctgaatcaagaatttcaagaaaaaagagtaaacctcagttttttttaattatttaatggtttgcaaaaagtaagagatagacgaaccacgggaatctgtatttcttgactttctagagcagaggttttatgacaccatgaatattataacatgtgcaaagcatcctggctgctgtcttaagttgaaacccttcacgggcaaccaaacgggggaaacaagtatctttcaggtatggcaggggcagcgatgatcctccatcccctgtccctgtttcctgcggagacccaattaacgggcatagggggccagatgtaatgcaacttatgcatgtctaaaagtccaattgtgccatgtttagtggatgaataacaatagtgtccttgtcatgtactccatagattagtagatatatagcatatattaatataaagtgtggaggttatttattaattacgtatatgattagaggtgtgagtggtttttttaagtggggacggggggccacggggattaattccccgcacagaggcggggatggggaaacttctctgcggggggttggaatgggatgtattccccggtggggaataccctgttgccatctctagtactgggttgtaagaattcagaataatcagcaaccattcttaactccgaaaaaaaaaggagtacgaaaactagttgtaaattatgcaatttataaccagcagttgttatccatgatcattgaaatacattatgttgctaactttgtatgtttgttataggtctgtgcaagtgtgtcttcggattcaactaacatgaatgaacttattcaatggaatgatctttatggagaaggtggatcaaggaaaaagactactctaagctacttcatgtagctgaagttcattccaatgtacatatatatcagaagcattaggacaaacaatggtgattggaggcaaaagttttgcagattcactacagtaaaaaaagaactgtactatctgctagacatcagaagaattaacaacagttcatatcgaggcggatgggataagacattcaatcgtcgccatggtgtgggctgtcgattttggcgaaagaggaagatgggattcgggatgtggcttacaaattgcctgctgtggtggacctgggggtagtgacggcaacatatcaccatccgcaaaaatagattacatttctagtccccatagtcaggtcaggcagccagttccgagaatgacatctcttaccgggccggttggttcaccgtcatttttctcatttcgtgacagcgattcaaatttttttaggttaaagttgtgcctgtgcaattgtacagtatgagcatccaggccaattaacttgttattgcggtcaccgcaaaattcattttaaacatgtccgttgttactccatttgtcgactgtctaccaggttttggtactgcccctttactgatc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0344700, RefSeq:Os03g0344700