Difference between revisions of "Os03g0347200"
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Revision as of 19:35, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0347200 |
|---|---|
| Description |
Initiation factor eIF-4 gamma, middle domain containing protein |
| Version |
NM_001056632.1 GI:115452992 GeneID:4332822 |
| Length |
12022 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0347200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13028144..13040165 |
| Sequence Coding Region |
13028219..13028305,13029192..13029251,13029846..13029902,13030608..13030679,13030825..13030887 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:13028144..13040165 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagcgcgggctggaggacgctgctgctgcggatcggcgacaggtgcccggagtacgggggctccgccgaccacaaggagcacatcgaaacttgttatggtgtgctttgtcgagaatacgaacactccaaagatgcaatgtttgagtttctcctccaatgtgcagatcaattgcctcacaagattcctttctttggagtattgataggtttgataaacttggaaaatgaagatttttccaagggtattgtcgatacaacacatgccaatttacaggatgccttgcataatgaaaatcgtgacagaatcaggatattgctgcgatttctctgtggcctgatgtgcagcaaagttgtcctgccaaattctattattgaaacatttgaggcactattatcatctgctgcaacaatattagatgaggaaaccggaaatccttcgtggcaaccacgtgctgatttctatgtttattgtatcttggcttcccttccatggggtggctcagaattgtttgagcaagttccagatgaatttgagagagttctggttggtatacagtcttatataagcattagaaggcattttgatgatattgctttctcagtctttgaaacagatgaaggcaactctcccaacaaaaaggatttcatcgaagatttatgggagcgtattcaagttctttctcgcaatgggtggaaggttaagagtgttccaaaacctcacctgtcgtttgaagctcagctggtagctggagtttctcaccgtttctccccaattagttgccccccacctactatctcgcaatcatcttctgaaatagtaaaaggtcaagaaaagcatgaagctgatctgaagtatcctcaaaggcttcgtaggcttcacatatttccaacaaataaagctgagaacatgcaacctgtagatcgttttgttgttgaagaatgcatattggatgtgctacttttcttcaatggatgtcgcaaagaatgtgcattttatctggtcagcttacctgtgcctttccgttatgaatacctgatggctgagaccatattttcacagctactgttattgccgaatccccctttcaggccaatttactataccttggttattatcgacctttgcaaggcattgccaggtgcatttccttcagttgtggtaggagcagtacatgctctttttgacagaattagcaacatggatatggagtgccgcacccgacttatcctatggttttcacatcacttgtcaaattttcagttcatttggccttggcaggagtgggcttacgtcaaggaccttccaaaatgggctccacagcgtgtttttgtccaagaagtattagaaagggaaattcgcttgtcctactttgacaaaattaagcagagcatagaggatgctgttgaattggaagaactgttacccccaaaagctgggcctaacttcagatatcatagtgatgaaggcaaagaaagcactgatggccacagactctccaaggaacttgttgccatggttagaggaaggaagacacaaggtgatattatttcatgggtagacgaaaaaataattcctgtaaatggtgccaaatttgcacttgatgtagttagccagacacttctggacattggctcaaaaagtttcacccatcttatcactgttttggagagatatggtcaaataatatcaaagctgtgcccgaatgaagaaatgcagttattgttgatggatgaagtcagtgcttattggaagaacagtacccagatgattgccatagctattgataggatgatgggttatcgcctactttccaatctggctatagtcaaatgggttttttctcctgctaatgttgatcaatttcatgtttcagatcgtccatgggagattcttagaaatgctgttagtaaaacatacaatcggatttttgacctccggaaagaaattcagacactcaggaaaggtcttcaagctgctaaagaggccagtgaaaaggccgccagagagttggaggaggctaaatctattattgagattgtagatggccaacctgtgccatctgaaaatccaggaaggctaagacgacttcaagcgcgtgctgacaaagcgaaagaaggagaagtaaccactgaagaatctttagaagcaaaggaggccctccttgctcgagggcttgaagaaagcaaggaattgcttaggttactattcaagagctttgttgaagtgctaactgaacgtttgccacctatttctgctgatggagatgttcctaatttacgtgctggagacccgaatgtaaattcttcagcccgtgaccctgaagcaacaaccatggaaatagacaatgaaaatggaggagataacgatagtcagctgaatggtcaaaacaagaaaatcagtcacaatgttggagagcttgagcaatggtgtctctgcacattgggctatctcaagtcgttttctcgtcaatatgctactgagatctggtcccatattgccatgttggatcaggagattttcgttgggaatattcaccctcttatccggaaagctgctttctccggtttgtgcagacctaccagtgaagggtctcacctttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAGWRTLLLRIGDRCPEYGGSADHKEHIETCYGVLCREYEHSK DAMFEFLLQCADQLPHKIPFFGVLIGLINLENEDFSKGIVDTTHANLQDALHNENRDR IRILLRFLCGLMCSKVVLPNSIIETFEALLSSAATILDEETGNPSWQPRADFYVYCIL ASLPWGGSELFEQVPDEFERVLVGIQSYISIRRHFDDIAFSVFETDEGNSPNKKDFIE DLWERIQVLSRNGWKVKSVPKPHLSFEAQLVAGVSHRFSPISCPPPTISQSSSEIVKG QEKHEADLKYPQRLRRLHIFPTNKAENMQPVDRFVVEECILDVLLFFNGCRKECAFYL VSLPVPFRYEYLMAETIFSQLLLLPNPPFRPIYYTLVIIDLCKALPGAFPSVVVGAVH ALFDRISNMDMECRTRLILWFSHHLSNFQFIWPWQEWAYVKDLPKWAPQRVFVQEVLE REIRLSYFDKIKQSIEDAVELEELLPPKAGPNFRYHSDEGKESTDGHRLSKELVAMVR GRKTQGDIISWVDEKIIPVNGAKFALDVVSQTLLDIGSKSFTHLITVLERYGQIISKL CPNEEMQLLLMDEVSAYWKNSTQMIAIAIDRMMGYRLLSNLAIVKWVFSPANVDQFHV SDRPWEILRNAVSKTYNRIFDLRKEIQTLRKGLQAAKEASEKAARELEEAKSIIEIVD GQPVPSENPGRLRRLQARADKAKEGEVTTEESLEAKEALLARGLEESKELLRLLFKSF VEVLTERLPPISADGDVPNLRAGDPNVNSSARDPEATTMEIDNENGGDNDSQLNGQNK KISHNVGELEQWCLCTLGYLKSFSRQYATEIWSHIAMLDQEIFVGNIHPLIRKAAFSG LCRPTSEGSHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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