Difference between revisions of "Os03g0570200"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0570200

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001057053.1 GI:115453834 GeneID:4333285

Length

10488 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0570200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:21438056..21448543

Sequence Coding Region

21438056..21438165,21438265..21438440,21440822..21440925,21441006..21441164,21441378..21441517
,21441882..21441971,21442562..21442630,21443955..21444176,21445835..21445953
,21446037..21446152,21447718..21447806,21448450..21448543

Expression

GEO Profiles:Os03g0570200

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:21438056..21448543 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggtgggagttagggtttccaccactccagccatcagtggtctctaccattggagacctctccgcctggccagtctctgcacatcagattgcaatattgaaaagggagtcaacagaagacccttgtatgagagtcatcctttatcatcattttcgtggacaacaactgacaatatggatatggtattacatggcaaaaaggatgagttgcatgatatatttgagagtgcactcaagtccagtgatttgaagggtctgcatgctgaatgccttacggatatgtggattggcagagacagatttgctttcattgatctgagtgcagggccatttgcctggggccctgctgttggtggggacggtgttcgtactgaacttagtctacccaatgttgcaaagactattggggctgttgcagatcttgttttgttcataaaaatatcagtaacctacagatggaatcctcgcaaattggatttgtataagtcaaaagtttcagcagcaaaaaggaaaagaaatattgaatacaccctgtcagattcctcagccatggctgtaaatacgactgttgatttatggtttgaacaatgcacatttacagcatgggatggtgggagggcagagggtttcttgagcatggaagttacagaagaagaggctgaagctaaattacaagatacaatcagagagattctcatcttttggcgagtagatatcctattggcagagattgatgtatacgaactttttgccttcaagcattgtgttggaagaagggtacagcttgccctttgcaaagaacttgatgagagaaggcatgatctgaaaagtgaactggagggttacaatactggagattcggatgatattaataagaagaaagctcttgatgcattgaataggatggaaaagtggaacttatttaaagatgttccagaggaacatcatagttacactgtggctcgtgattcattcctcgcacaccttggttccgtgttatggggctctatgaggcatgtaattgctccttctgtttctcatagggctcaccattactatgataagttgttgtttcagttgtactttgtgacacaagagaaagtcaggaacataaagcagttgcctgttaatgtaaaatcagtcacagagggccttagttctgtgctactacaattccagaagccaatgttcagtcaacacatgttgtcgttatcagaggatccagccttgattatggcatttgcaatggcgcgtcgtgcagctgcagtcccacttctgttggttaatggtttctctaagtcaacagtccatacatatcttgattctgccattctccaacatcagctacagaggttaagcgagcacaacttgctcaaagctacccctagcgtgtttgtggtaatccaagctatagttaacgagggtgcagtttggtgctgggcaggagattcaaagctcccagagctgtttgctagcctgtacctttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVGVRVSTTPAISGLYHWRPLRLASLCTSDCNIEKGVNRRPLYE SHPLSSFSWTTTDNMDMVLHGKKDELHDIFESALKSSDLKGLHAECLTDMWIGRDRFA FIDLSAGPFAWGPAVGGDGVRTELSLPNVAKTIGAVADLVLFIKISVTYRWNPRKLDL YKSKVSAAKRKRNIEYTLSDSSAMAVNTTVDLWFEQCTFTAWDGGRAEGFLSMEVTEE EAEAKLQDTIREILIFWRVDILLAEIDVYELFAFKHCVGRRVQLALCKELDERRHDLK SELEGYNTGDSDDINKKKALDALNRMEKWNLFKDVPEEHHSYTVARDSFLAHLGSVLW GSMRHVIAPSVSHRAHHYYDKLLFQLYFVTQEKVRNIKQLPVNVKSVTEGLSSVLLQF QKPMFSQHMLSLSEDPALIMAFAMARRAAAVPLLLVNGFSKSTVHTYLDSAILQHQLQ RLSEHNLLKATPSVFVVIQAIVNEGAVWCWAGDSKLPELFASLYL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10379..10488#10104..10279#7619..7722#7380..7538#7027..7166#6573..6662#5914..5982#4368..4589#2591..2709#2392..2507#738..826#1..94#atggtgggagttagggtttccaccactccagccatcagtggtctctaccattggagacctctccgcctggccagtctctgcacatcagattgcagtgaggctcagaaccgtggcctggataacaaccggagttggtgaagaggtggcagctgacgaggggaaacactaacccttatccatggctcatgatattgtgttgatgaattgaaccttgtattccaatgggtcatgggccaaagtataatacaataggtttacaagcacatgtgcacaagacacgctgtactagaatataagtgcacagctatacataaagatatagatatagcaaaaggggaaaaagatggcagccatctgtcatttggaaaaagatggcagccatctgtcatttgtccaatcatttacagtgcgcattggtgcatgcttagtgaatatatgtcgttctacatcacaaaacattctttggaagccctaggatgaactatttagggggcttaatctgcagtgtgatttttgtgaactgtgtttccagttgagaaacagtatgctgttgttcaaatgtgtgtcgtgtgaacacaaggtagatccttttgtagtcacaacctacaaggacactgtttcaattcagttttttctctcactgtagctgtatgcccagttttgatatatttaactgcaacatgcagtagctcctttagttattttccttttggtacttatctccatctatgaatcagatattgaaaagggagtcaacagaagacccttgtatgagagtcatcctttatcatcattttcgtggacaacaactgacaatatggatatggtatttttaatgttacatttctgtattctttacaaaatcattttggcctgcatcaacgtgttattttttggtcattgtgttggccattccaaacatttcatctgtgttcaaccttggccgtaactaactttgttgatgaagcttgaggttgcataacatagtcaaccacaaagctaatcaaatattgacttgcttgctactaactccctccgtctcaaaataaatcaacttctagctacgaacctggatataggttatgtccaggtttgtagccagaagttgatttattgtgaggcagagggagtagctaattactccctccgcttcatattattagtcgtttgacttttttcctaatcaaacttctttaagtttgaccaaatttatgtaaaaatatattagtattttcaacacaagacaaacatattataaaaatgtatttaatgttacatttaatgaaactaatttgatatttcaatgttgctagatttttctataaacttggtcaaacttaacaaagtttgactagaaaaaaagtcaaatgacttataatataaaacggagggagtagttcattagacggttacattgtttttccgtacatgcatgtattcagagtgcttagacttttcatctaatgaattcaagaaagtgttatatactgcaactggtttatacaacttgccatgtattagaagttgcacttgaaattttagagttcagttctttggtttgaaggtctaaaaatgaatattttgttgctagtatagtatggaatagcaccaattttgatattcaactgcttggaattaggaactgcagtactgcacacatccttcttgacttcaagtactgacttttgttgacacttggaattaatgaattaaaaaggatactgtatgcccattggaatttggaattgattagaatgcatgatacaaagttatgaaggcgaacattcatcaaaaagttttaatgtataaacctagcggaatgcttttattcaaattctttaacagggggattggtcaaagaagtgaaaggaagccttaagcaattttgagctgttgaaggaaggaaagagcaaagatgatactccctctgttcccttttgatcatcgtattgcaaaaaaatgaaaattccattttgatcgtcgcattacggtggggaggcgatgaaaatcccgggaaggacgttaatgacacttcctaatgaacactgcatgcatctgattggtcagtctatgcggcatgcaaaactgattaggagctgctgcatgcatggatttaatatgctcacaactgattggccagccatacggcatgcaaaattgatggcgctgcattcacggatacgaaacgctaatgcatgttttcgatgctgattaagtgctccgcaggattgtcttggtattgatgcacaaaccatatatgaagatcaattaggaatggagggagtattgtttatgacaaagctgtccaggtgtcacattttttgttggtacactaaatgaaatatctctatagttgcgtgtctaacatcacagtatcacatgctcttgtaggtattacatggcaaaaaggatgagttgcatgatatatttgagagtgcactcaagtccagtgatttgaagggtctgcatgctgaatgccttacggatatgtggattggcagagacaggtctgctgttgtttcatttcatgaatagttaaaatcttagagttaggctagttcctcttcttctaaccaaactttattttcagatttgctttcattgatctgagtgcagggccatttgcctggggccctgctgttggtggggacggtgttcgtactgaacttagtctacccaatgttgcaaagactattggggctgttgcaggtcacttcatttttgtcatcaggccttctctacctattcaaattcagttactgcctagtgttatacaatttgtatagtgtgctgtgtcagtatttcttttgtttaaaaagtctcgttagttttcctttgtatagtgtgctgtgtcagtatttcttttgtttaaaaagtctcattagttttccttagtggcctgaacggaactaattcatctctagaatcataagaagttttttagtaccccaggtcaaaagtgaagtttttgtaaatccttttttgactaaaatggttgtttcttgtgatgatttctgtgttctccctcattattcatgattggacgctatcttagacaactcagtgtatgcatattggttttggcattagtttttgtagtagcaccaggcacttgaatcttttacctgtataattttatttattggcctaatttgcttttttttttttacttcttcaaatttaatactcattccatatgcacttgcaatgtcctagaacaaaaaagagagaggacaatttagcattgatacaaagctagcatttttaacgggtcctgtgttgtgtcaatagattattcatggtaaccaaacatgggtagtcatgttattatattaactcgttatacccaagcccgtttacattaatctaaattatatactaatcgcacacaaaaagaaactgtacactcattatgttattcaattatattatattaaggcattcttgctctacttgtttcaaacgtcataaattgttgattcaacaaacttgcagttatttttcttaatatgttagactcagttgcttcatatttcttagttgttaacgttgccatgaattaatgggatatggcaatcacattaaatgagcccatgccaattttcttgtgtctattgtaaacgaaaaccacataagttgtattcatttcgtcatgtttcaaattttgatagttctatagaagtaatgtcatcctgattattaatatcagtgaagggcaatacctcaagaagacaacctgtcaactgtgtggcagaatcatagttgttaaacctgggctggtgatcgaactgttgagtccatcagttcacctggttagaccactggttcaccggttcggccactggttcaaaaggaaataataaatatattttccttagtcttggtttgctcaaaagggttaagtttaatctattttacctctcataccaaccgactgccttgcttggctgttttggtcctcgggtatgcaatgggaggtccctaggttgattccctccgcgcgcctgtgggcaaattgtttagaaaatttgttctacccggttcgaagtgcaaaaccgcctggtttaaccccctgttttccaggtcgcattctagtctttcaatcagaccagactggactaggctctggttccggttttttactgtcgaaccctggtccgttctggtttaataactaggggcataatagatattcagaatccgtaattattcagctacgaccagcccatctggtcatgttatttgcactgttgttgctctgattataatcacaaggattacattataaagctattttattacaatttaaaatatttatacaaagatgatagtaaatgataaaaatcactataacttatccatcgcagatcttgttttgttcataaaaatatcagtaacctacagatggaatcctcgcaaattggatttgtataagtcaaaagtttcagcagcaaaaaggaaaagaaatattgaatacaccctgtcagattcctcagccatggctgtaaatacgactgttgatttatggtttgaacaatgcacatttacagcatgggatggtgggagggcagagggtttcttgagcatgggtaatgaagccgaattgctgaagctaaacaatgccctagagtttggcattcagtgaattaccatattcttgtttggtgcaactactttagaagttttgttatttggcaagctgcttttcttttgatttaaattgcaaaagataatagtattactttccgaaaatgtggagcaaataaagtgaaaatgactgttgaatacatttttttctagcgttattttgattgccaaaacaaactataatgattctatttttttattttccattgtatctggaagaataatcacaacggagcacagcacaacaaccacaaactgagccttttgtatttctctgtgtattaacatatcaatgaatacttgattcatgtttttactacaatattttgggacttgctattttccttgctgattcccaggcatccagcaaaccagtagggctagaactaagtaacctaattatctggacaatgggctggcaaatcattgtttttttcctttcaataattttctacatgcatacctgataaatatataactctgaaacagtgctggtcaaattttaacatgtcaaagtaaacggtggcaagtattcatgaattgatagagtagcatctgatacttgcgggtccaaacataacgctgtgttgaccccttttggagaagcatggacaaaagctctggggatgctttatgtgcatgaggattagacacaagtgaatttgggtggtattagactgtgtctgtgtggggtggatgtaggcctatgtggagcatgtattgtggattttcaccatcacttatcttggtatgcttagctttgacttttggggtggaacagggtgagtgcgactccatagtcaaattgctgggcggttagtggtggcttatatgacagcaggttagttccataatccatttatagtctggaatatggaacagttcataatgcttgacaatccaaatattgcaactgcatattagcccttttgatggaagtggctgtccaagcgtgttgctagctttttatgggctatgggtgtaggctcatttcttgaatatggaacagttcataatggttgtcagtccaaatattgcaactgcacgttagcccttttggctaaagtggttgtccaagcatgttgatagtagctttttatgggatatgtgtgtaggctcatttctggtggggctaggcatagcagggctagcaagttttgcaatttgacaatttatttctgtaacacttaaacatgtatacaatgtgtttgctctgtactgagattccctttgtggcactaatttatgattgttattcttatgcagaagttacagaagaagaggctgaagctaaattacaagatacaatcagagagattctcatcttttggcgaggtatgctggatttctcttagaatgcactggatattaacaatctattcgtttataaattattttttactactcaatctcataggctaaatgatggtacttattcttgtaatctccatgttaggtaccgtagattttcaaggtgcacatgttgcttataccaattccttttctttctcttgcccctagctcttattttggagggtggttgtaaagttcaattgagatcagtagagtgagagctttgagatcagaactgtagagaagagaggatgcagaaatattttggcagcttggaaatattttgctctgtattctactaaatacctttttttgctagacctattgacgattcaaaatacaagtggtcccattaatcattacaactagcacatcactggcaacgatattccacaaaatagtggcatcccaagtcccaactgatgttaacactatagacaacaagtttcttcttgcaatcttgtttgttgtgtaactttcccttttggttctgtatattgttatgacatcttgaactagctcttgacttagtttatctgatgccattttgggggttcagaattaccatgcagtagatatcctattggcagagattgatgtatacgaactttttgccttcaagcattgtgttggaagaagggtacagcttgccctttgcaaaggtacttttcatggccataaatttgggtgttccttttaattattcacattactacatagtggtagactttacttgtagttgatatttttgagttatatgcacttgagctactgtttgtaccatacatgaaagacattccttatgtttctctccaatcattacaacattgtttttattgttttgtcctttggccatgttttctcacaagttgttgatgccaataagctattcagtgttcttttctttgctgagatcttcagtttatggtagttgctgggcagccttgtactgttcataaaatttaattgggtttatcagaaagaccttcccttttaactagaacctttatttttcttcaaatgtagaacttgatgagagaaggcatgatctgaaaagtgaactggagggttacaatactggagattcggatgatattaataagaagaaagctcttgatgcattgaataggatggaaaagtggaacttatttaaagatgttccagaggttagctttgtccaacagcttctacgacacaacataaaaagaacattgtaaaatcagtttctatagcaaaacatttccctaataagcaggacaactaaaaacacatattcactgtgcaattgtgcatgcaattactgaagtctaatatttaattgttaagataacagaattttaatcgtacttctaatgacgaagttcaatcacatgtgccaggaacatcatagttacactgtggctcgtgattcattcctcgcacaccttggttccgtgttatggggctctatgaggcatgtaattgctccttctgtttctcatagggctcaccattactatgataagttgttgtttcagttgtactttgtgacacaagaggtaagttcaaggggcaacttttatgttgcttatattctaattcaatacagttatctctcacattttttaacgttatgcagaaagtcaggaacataaagcagttgcctgttaatgtaaaatcagtcacagagggccttagttctgtgctactacaattccagaagccaatgttcagtcaacacatgtatgtaaccttcatcttgtaaatttttggtttgtagtcctgcaaagcaattaacttaccaggggtttaataatattcataatggaagttatatgtgaatgtcatctgcacctggctagttttttattgtggcagtctgacttcctaattcctattgtatgtctgcaagtccaatataatgctagatcaaactcatttagagcacaatactgatcataaaagtattagaaagattagaccacgccaatgatttgtatccatttagtgtttgatttgttgatacttgtgctgtgccctgaccctgtgggtaaatgatctcaagtctgtatggtgggtggtcaatttgataaaaactaaggcttggggctatggctatggttcacgaaggcagaaggaacagataatcactgtgcaggggatgggtgcatctgaaatcaggagatattagaactgagggagttcagagatcactgaaagctgtaccctttatgaggccctaataaacaatatctaatactccctccgttttttaatagatgacgccgttgactttttctcaaatgtttgaccattcgtcttattcaaattttttttgcaaatatataagatataaatcacacttaaagtactatgagtaataaaacaactcataacaaaataaattataattacgtaaattttttgaataagacgaatggtcaaacatgtgagaaaaagttaacggcgtcatctatttaaaaaacggaggtagtacatggaaatcaactggcaagtcttatgtctaagtggcttaaggccaaagcaaggagctaacacgaaagtcgaaactcactgttgctgagctgttgcctttgataccttggccacatgagcgaccgcggacaactcagttctctacccaaacaagccaatgggcggtggattggaattgtaattctttggtttcgtttggaagatgaaaacagttacttagtatactctctattagtgactggtctaatcatgtaaagtgctctctttttccatcattataattcttgtagaattttaggagtgacctaagcaaaattacttgcatatttgaatatggaatgtacgttctgttggtaccaaaccattttgtctcattacacttgttgaacttgggtaggtataagtgatcatagaagaccaataagcatgtgtacgtgagaagtttgtattcaataagccctattctatcttgaataatttcataaaggcttatagatgtaagctaaggacaattctatctattggatgaatgatattttatttctgtttgacatatacaagttactcatgtataaaaaatacaagttattttgtataaccatgtaaagaacatatacatacattctcactagtggtacagcacctatataagttgtctgatggatttgttcttctgtgtcttttaccaacattactagtaattcttatgtacttgcaaagttgcaagttgttatgcatacccttacaggttgcaaactaatttattagtcatatgtacttagtttagttagttacaaatcaatcatttgcagtggcggagccaggattttgacttgggaggagcctacgagtcttggagggggcctaatacactactacctccatcccataatataagagggattttgggacggatggagtattacttaagttaactaggtgattccctgcgttttgctgtggaaatttctaagtaacttttaatatttttttaataattgaggtaaaagtaaaaattatattagatattaacaacaaataaaaccggtttgttaaactatgtttagagagatacatttagattatatgagattgtaaatgaaatatgatatcccgcactttgattatatggatgaatgtatgctaagtactataaaaatgatgaatatatatatatatatatatatgttaataatattgtgaaaaataatgtgaaggaagatgattggatgttgatttgtagaattcaatgaattatagatgacgttgcatgcatgcttaagttttgtatgtaattactggtagtggatgatgaggtggcatgtgtgcatgttgagctttagaattagtgggttataactttatagtaagatagtattgcc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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0570200, RefSeq:Os03g0570200