Difference between revisions of "Os03g0580800"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0580800

Description

Lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein

Version

NM_001057087.1 GI:115453902 GeneID:4333323

Length

6816 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0580800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:22066857..22073672

Sequence Coding Region

22067114..22067334,22067766..22068015,22069559..22069798,22070353..22070483,22073356..22073653

Expression

GEO Profiles:Os03g0580800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:22066857..22073672 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcacacccgctgtgaacgaaggagcgagcgagcgacgatgggttcttgcacattgtcctccggcggcgtctgcgtcgtcgtcgtcctcctgtgtttggctgcttgctgcctaacgtgcgcgcgcggcgctgtcccggcgatctacgtgctcggagactcgcaggcagacgtagggaacaacaactacctgctgcactcgctgctcaaggccaacttccctcacaatggcatcgactacccggggggaaagcccaccggcaggttcagcaatggctacaacttcgtcgatttaatcgctatcagtctcggggtgcccagccctcctccatacctctctataagcagcaaaccaatgaacagctccgtatatctgaagggtgtcaattttgcttcaggaggagcaggggtgtctaatctcacaaacctggcccagtgcatcagcttcgacgagcagatagagggggactaccacagagtccacgaggcgctggggaagcagctgggcattcctggggccaaggcccaccttgccaaatcgctcttcgtcgtcgccatcggcggcaacgacatcatcaacgacctcctgctgagtcccgtcagcgagctcctacgctcccgagatgagatcgtcagcaatctggaaaataccctcaaacgccagctgcagaccttgtacgaccttgggatgcgacggttgttcttcgtggggatagcaccgctgggatgttgcccgttgatacgggagctgaaccccaccaaggaatgtgatgctcaggccaactacatggcaactcggttaaacgatgcggcggtcgtgctcctccgcgacatgagcgagacgcatccggacttcacctactccttcttcgacacatacaccgcggtgctccagtccattcgttacccagaggcacatggctataaggaggttaaagcagcgtgctgtggcctaggagataacaacgccatgttcctatgctcgccggcgagcgtgtactgcgacaaccggacgagctacatgttctgggacgtcgtccatcccacgcaggccgcggttgagaagcttatgaagattgcgtttgatggatctgcgccgttggtttccccgaaaaatatcaagcagctcactgagagttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHTRCERRSERATMGSCTLSSGGVCVVVVLLCLAACCLTCARGA VPAIYVLGDSQADVGNNNYLLHSLLKANFPHNGIDYPGGKPTGRFSNGYNFVDLIAIS LGVPSPPPYLSISSKPMNSSVYLKGVNFASGGAGVSNLTNLAQCISFDEQIEGDYHRV HEALGKQLGIPGAKAHLAKSLFVVAIGGNDIINDLLLSPVSELLRSRDEIVSNLENTL KRQLQTLYDLGMRRLFFVGIAPLGCCPLIRELNPTKECDAQANYMATRLNDAAVVLLR DMSETHPDFTYSFFDTYTAVLQSIRYPEAHGYKEVKAACCGLGDNNAMFLCSPASVYC DNRTSYMFWDVVHPTQAAVEKLMKIAFDGSAPLVSPKNIKQLTES</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6339..6559#5658..5907#3875..4114#3190..3320#20..317#agcttcagcatacacatgcatgcacacccgctgtgaacgaaggagcgagcgagcgacgatgggttcttgcacattgtcctccggcggcgtctgcgtcgtcgtcgtcctcctgtgtttggctgcttgctgcctaacgtgcgcgcgcggcgctgtcccggcgatctacgtgctcggagactcgcaggcagacgtagggaacaacaactacctgctgcactcgctgctcaaggccaacttccctcacaatggcatcgactacccggggggaaagcccaccggcaggttcagcaatggctacaacttcgtcgatttaatcggtgagtatatatccatcatcatcgatcgatcgctgcgtacacgtacgtacggccattgtccacagcgtatttttatgtcaaactgttttcatgtgctatggacgctcgcaccctacgtggaggatatgtgtcgtcctagaatgtttaagcatgattgcaaatctaagtgcctcatcttttcgtttatacttatacttatcagctaaaatttaaattttcaatcttaaatttgaagttgattttgaggtttttcatcaaagtttatttgctagactttgcttttaaatcgataagaatacgtatataaaagttttattcataaattacttttcgtttttaaatatgccgtttggcttattccatgaataagcaatggtcacctaacacaataggtgttttcggtagtgcttgctattacagcagcgtgcaggcgacagcaactaaaaacggccacagcctagcactgcagtagctagcgtttcaatcagcccctatgttgacgagagtatggtttttttttttttagtttttcagttatcaccaaatgtattcatgtgcatatgcatatgtgttttaccgatatttatgtattgtattaaaagtgttactccctctgtattttaatgtatgacaccgttaactttttaacaaacgtttgacctttcgtctaattcaaaaaaattatgtaattatcatttattttattgtgacttgatttatcatcaaatgttctttaagcctaacataagtatttttgtatttgcataacaaatttgaataagacgaatggtcaaacgttagttaaaaagtcaatggcgtcatacattaaaattaaaatacggagggagtatataatattgaaatatacaaacagtaaaatgggattttcgcaggcaccctcctaagctgcagaggcaacccaaaagggaaagcgcttgtgcaacgcttagatcagaaaatccagcttagtaggaattatttaatgacagagagttcgagtttatgaaattaaaatgaaacttccggacatggggttgcatatatactggaacttaagtctaaaattaatggaatcttccggacgaattgtttgaatcaaatagtagagagctcgaggtttgggaaaaccagatctgagccccctccgtttaatttgtacgccaatatgaacatgttggcaggtccgatccagcactgactgattgttattctcacaactaggatggtagctcgcgcattcgcgcgggcattcatgaatcattgcttaaatgtttcttttaagatatttgttagtttacaatatgtaaatttgattcatctatataagcacctatctataaagttaatcatctttatcatttaagaagacgtaggtcttaatccaaattaaagtaaggtgttgtttttatttttaattaaatgttttgggctcttatttaaaaaaaattctcaaaaaggttatttataataaatgtgttttattccttcttttaattggttcacaattgatgcaattttttatacgtacttatgtatgaatcaataaaaatatagagtagatatattctagacctcgcttcctataatatgtgtgatctatatatttgtttaaatacatttagtcaacccgagtgttaaaacccaaatttaatagtaagaaatataatattcaaagccaactatcttctgctatggcatagaacagagagaagtctattgatatgtagtcacttaaaaatgatgaagtggttatgcatggttatctcaatttaagggaaagttatgaaccacaatggttctaagaaattataaggttttctagaattggttcattttacacttttgttttattttatacaaatattattttaagttcaaatgtatgatatgacaaatagtgacatcattacaccctatgtgtcaactttttttaaaaaaaaattatcaataagcaagtaagattggtatagattttcattatttattaataaatggattatatgggacataaggctatggtaaattgatgggtttgtatactccaatatatttgcattatgtgatagataattcatttgggaacgttttatatataatgtgtgaggctctacacaaccattgtgaatacgatttgatggctaataatacatcatagagagagggaaccgaatgggtagagggaccgatatatacatgtatgtactaagtacgcatgtacatgatggaagggaggacgtggcacacgtgggcctttcaattgtttaataacaaaaatctaattagtccaccatgttttatggaaaatcaatggttgtgaatggacttgaattatttattttcgtttttcatctaatctaaataaaaaagaaaaaaatagaaaaagaagtagggtgggatgatacgtacgtacaaacgtacatgctgtacaggtacacggaccgagggataatttaagagagataaattgatttggtaattttgtactcgcaagatagatctaacggtggttgatttggtaattttgtaaaatagatctaatggttgaaaataatgggtctacccgattaaaagaaaatcaacggttagatgttttgttttttacttagaatttttaggatttatcaatacgccacgtggcgactttggagcgtttttagaagcaccacgtggcagcttgagagcgtttgtaggaagtttcatggacttttagtatataaaataaaatagaagatagatagatcttttgaaacttgacattatttttgctttatctctactcaaaaaaaaatttcgttggtgtgtgtgtgtttatatatatatatatatatctctttttgttgtctttttttttaaccttttttccacattgcagctatcagtctcggggtgcccagccctcctccatacctctctataagcagcaaaccaatgaacagctccgtatatctgaagggtgtcaattttgcttcaggaggagcaggggtgtctaatctcacaaacctggtagtactacaacttaatactagggtcgaaataaagaaaattgagtgatgtttcggtgctctctacctataatattatactaccagtatattattataggtaaaatagtaatttactaatacaataattatgatttactttgtcatttatatatgttttttcccggctaaatatatttcatcgaaaaagccaaaaaagagggaaaaagtttagttactgctaatgatgattatacccttttatacattttttgttacaatatacccctccacatttctattactgctaatagtggtagtagtacaaataaattttaacacttcgattaaatgagatcaacggttcatactgtcttccaataataatagagagcaccacactgaggctcaagaaaattttgaatatatttttagtgtaacacgaacagaatatgtatgaatcagaaatttaattacaggttacatacttattaatccatcaattaattattacatgagtatttaattctatattaattattacatgagtatttaattctagtacggcgcatgcaggcccagtgcatcagcttcgacgagcagatagagggggactaccacagagtccacgaggcgctggggaagcagctgggcattcctggggccaaggcccaccttgccaaatcgctcttcgtcgtcgccatcggcggcaacgacatcatcaacgacctcctgctgagtcccgtcagcgagctcctacgctcccgagatgagatcgtcagcaatctggaaaataccctcaaacgccagctgcaggtacgtatacttatgcttgcaaaacgatcttgcaattaaggtcaacgtaacatcaggccgggtttttgcagtttcggtttcgaaacagtaatttcagacacccccaccggccggctggaccaaaattttcgaattttctcaaatgtttatggatttagtaacatcacatcaccttcgttgctctccatacaattctccatgtgcttactactatctccatttcattttataaatcattttgatatttttttttcatttcaaactttcttaagtttgaccaagccttctacctattatatactaaaattttattaaacttcttatgaacgcttctaagccaccatgcgtcattgcttccgagtcgtcacatggcactttaataaaatagagtaatataatcatcgatttttatttaatttggtgtaccattattttagatcaataaatctatttaaaaacaaaactaccttgatctatatatattaaaaaaaacaaaaactcccactgtcccagctgcctaaatgcggcgtacacatgtatgtatgctccctccgttactatatcgctctcctctttctgtcctcgtaataattgaaattaaaattactttcacggggaaaaaaacccacatgtagacctcgacctagctaataagtccagccagctttccctctatccctttatccattaatatttatagtctattaaacaacatacaaatatttctaaaccactacgtggaactacggaattaaaaaaaaaatttgaccatcggtttctaattgatttgataggcacattattttaggtcgttagatct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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0580800, RefSeq:Os03g0580800