Difference between revisions of "Os04g0252200"
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Revision as of 19:49, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0252200 |
|---|---|
| Description |
CPSF A subunit, C-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001186884.1 GI:297722898 GeneID:9266269 |
| Length |
26705 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0252200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:9935720..9962424 |
| Sequence Coding Region |
9936263..9936377,9937346..9937713,9940756..9940941,9945364..9945537,9945630..9945758 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>QLLACSKGPFAWHPTSGHVLCRAISLSPNSVCSFRPLNQVLSSM ADQESVHHMDNDVTSTDALHKTYTVDEFEVRILELEKPGGHWETKSTIPMQLFENALT VRIVTLHNTTTKENETLLAIGTAYVLGEDVAARGRVLLFSFTKSENSQNLVTEVYSKE SKGAVSAVASLQGHLLIASGPKITLNKWTGAELTAVAFYDAPLHVVSLNIVKNFVLFG DIHKSIYFLSWKEQGSQLSLLAKDFGSLDCFATEFLIDGSTLSLVASDSDKNVQIFYY APKMVESWKGQKLLSRAEFHVGAHITKFLRLQMLPTQGLSSEKTNRFALLFGNLDGGI GCIAPIDELTFRRLQSLQRKLVDAVPHVCGLNPRSFRQFHSNGKGHRPGPDNIIDFEL LAHYEMLSLDEQLDVAQQIGTTRSQILSNFSDISLGTSFL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>26048..26162#24712..25079#21484..21669#16888..17061#16667..16795#16074..16300#15350..15427#14271..14292#gcatttaaggatgcaaaaataacttgtttggagtttgatgatgctatccatggcctgcgtactaggtatgcatactgtttcctcattctccttttataatcgttaaattattgattcttgattactgtgaatatagtccccatttgcaaaattgtagattttgtaacagatgtatgtggtaacaatgcaactaatgtatgtcaaactttaccactgggacattgggatgacctttgaatcacacgagcagcaagcaaattgatagcaacttagcaagttattaggataagagtatccccttgggaccagcttacatgtcaagtaacgaaccaatgaagtaagctgtaaggatctaggagtcttttcaaagacccctagcctttggagtggagctagtgtgacgaactagagtacatttagaattttggcaccaaggaaactgccctttaaactgttgctcaggctgcatttataggtctgaccgtctgagcaggatacataagaaattacatgtgggtggccttaataaaggtgtctatggcctgggtgtacattagacattttcttatattcggtgcatggatcgttcccacggggagccatggactgtgtctatagcgaggtcgtccctggctattgagccaggaatgaagaacggaccactgtgtctcttaactggactcagtgtttggtagtcaaaggagtcttctctgtccttaatgaattgcatgtgggtgaatccttcttctcttggtagcttgtcggatggcctttgatggtcaatgtgtcttcaatatccaaagggcttggtcattcatcgatcgttgagggtgccagttgggaccatcccgcaaaacctgctaatcggaaaattttgaatgatacagaggctgtttctaactagcgttattcactttttctgccttttttctaatgtagataaaattgaaaactccatctctttagtgcaactattttgctatcttttccttgctacaggctgatgcgctatcagtatttcattatcattcttgatgtttcagttcaatgcactgctttgagggcccagaatggcagcatctgaagagaggcagggaatcatttgcttggggtcctgttataaaggctgatcctcttggaagatgtggtgctgcacttgcttatggacttcagatgattattctaaaagctgcccaggtgatatttccgtgatgtatcacatatttttgtcttgaaatatatatattttgtcccatctctatctcttattacatttctcattaccatcaggttttcattatgccaacacttgctctaagaatatgggcccatttagaaatgctagtgctatggatagtgattacttgtctggatcagtagattacaaatattttactctcctccaacgttgtgtgtttgattgataatctttggtatttttgtacatattaggttggccacagcttagttggagaagatgaacccacctgtgcattgagttctactgctgtttgtattgagtcgtcatatttgattgacttacgagctttagatatgaaccatgtcaaagattttgcttttgtacatggtgagataagatctgttttgcacatactatatcgcagactacacacatttgttttttcatgtttttctataatcatgttgaactttttatgtatgctgttgtgtcatgatacttgtatgcttattttctatcatccttttagagcttgtctctgattattttcatgtcgattctgctgaccttatgctttatgtctattacatatttgcctcttttaaaatattctgatatcttttatctttttgtttaatcattatatatgattgttgctgatgcattgtacagcttacacttgtataattttgtgttccacatcttacaagtggtgtcgcatgtcaacaacaaataagaattaggtagcttgaattttcatttttgctccctacacattttgtttttatttgtatcgaaaattacaccttttgttttgcattctatattgaatcttttaaatatttagcttgttaaatactccctccgtcccaaaatatgttgattctagcccataatatttgttcaactaagttgatttctatccctttatctaccctccgtccacaaatcatggagttttgtggccactggcatatatatattaacttggttggaatctataagaaggcaaactttgcaatgtaatttcatattcctcgttaaatcattgaaatgtttcgcttgtgaagtactgatgtcttgtaagctgtaagtttagtatttaatttacagtttgacacatgattttgttgtaggagatatttccttcctgtgacaaaataaagtctcagacatagtggaaattgatactggtgctggatctgcatatcatgaggagtctccttttgcattccatttatatattcatcactagtgctacaactatccaaatgtgaaaccttgctattcatgctgttttccatttatgatttctttaggttatattgagcctgtgttggtcatacttcatgagcaagagcctacatgggctgggcgtatcttatcaaagcaccatacatgcatgatatctgcatttagcatcagcatgactctaaagcaacatccagtgatatggtctgcagctgtaagtgtacaagattgctcctaagcattgtcttttctgtctttggtagcttattcctatgttctttcggcaataaattttggcgttcagagtactagaatgtactaaggtggcttgtggtattcactaaataattacttatttcttttgcatagaacacggtaggtttatctgtgattggtaaatgttccgaatttagataagttatcaaattttgctctatttcaggactaatcctagtattcaagtccctcattttaggtcagcaataccgcattgaggtgaatggtattgattttagtggtgctatcatttctgtccatagatcaaagttgacatactatgatcgcgaatcctttttttttttcttgttgattgctcaattgtattacatattttagggattccattgcgtttaagcactggatttatttgactctatatataacttcttgccattacaaaataatatacttaccattacaaagtgtttgttcctttcagaatctgccccacgatgcataccaacttcttgcagtgcctccccctattagtggtgttcttgtgatctgtgcaaattccatccattaccatagtcaggtttgatccctttaaatactcgtggtgaaggcacatactttattttgatttgctgaacgtggatcattgatttgaagttctctttgttattgtagtccacatcgtgttctcttgacctgaacaatttctcatcacaccctgatggcaggtactgtttgtatatgttaaatgcaaagtactaattggattacgatagtttgttctttttctcggatcacatacaaatgggccctgtttctgcttaactactacacggctacacacatatcagtggtgcagtaccatcacaatcacataccaagatcaccaatgtggatacctgatttaaaagtgataagctcaagacgtgtagtgtggtctcttcttatatggttgtccatagaaaataagattaaaataaccatcttgaacttcccctaggtcctagcaacctaattatttaatttttttggaagattatgtttgaagctacatacttttaaatccattattactaaaggtgttaactgagacattagcacagcatttgagcccatcttgatgtactggtaaacatgtgaactgagtaattcgtaaggtgaaattactagaaggtgcttgctgttgattatgggtgattgggtgtgcataacacacctcattgtacttatttggttgtaaaaaggtagtcaaatctactgtactggcatgcttttcttgctgagagcaaatcttacatgaaaatagtgggttgatccaaaaagatatagaaaacctgcgaaatatggcacatatactactccggcagcagtgttatacctatcaatattgaatagttgattattcttaagttctgtagtctataccgtattgatattgcttagcttctttctttttcagtagatttgtatgctggtaaccttctgttcttttgctggctttgcagcccagaaatttctaagtcaaatttccaagttgagcttgatgcagctaaagcaacttggttgtccaatgacattgtaatgttctcgacaaaggctggagagatgctgttacttacagtggtttatgatgggcggtatgataattctatggttcattgtcctattgtctgtgctactgttgttcagagttgatcattacatgttcttttattctttttacagagttgtgcagagattagatcttatgaaatcaaaagcatctgtcctcagttcggttggttacctatgtacttctgtgcttatatgcttccttttttagatattgctcttttttaagtttactaacctatttatggacaggctgtgacatctattggaaactcattcttcttccttggtagtcgtctgggggatagccttcttgtgcaattttcctactgtgcatcaaaatctgttttgcaagatttaacaaatgaggtgtgtactgagatatctgtgttgatttactttttatctttgaagtaaaacatttcactacatgtcggatacctatatttttggaacaacacctgaaatgagttcttttttactgtcattatagaaaacatgtaactagagatgcaatatttctgtacttgtggttttgaaaatttgaacccaataattcaccattgggcttgaatgcaatgattt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