Difference between revisions of "Os04g0280275"

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Revision as of 19:50, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0280275

Description

Adenylyl cyclase CyaB family protein

Version

NM_001186906.1 GI:297722942 GeneID:9270702

Length

9500 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0280275, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:11925847..11935346

Sequence Coding Region

11925847..11925880,11926349..11926506,11927142..11927252,11927569..11927634,11929803..11929877
,11929952..11930128,11930220..11930305,11931881..11931935,11933727..11933852
,11933941..11934054,11934830..11934949,11935320..11935346

Expression

GEO Profiles:Os04g0280275

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgtgggataaaggttgggatgaggggtattttggtggccctagtggatcaggcaagacaagtttagctcagaagatggccaatataattggttgtgaagttataagcttggagagttattataagcctgaacaagttagggattataaatatgatgagtatagctcattggatataggtttgcttactaagaacattatggagatcagaaagaatcacaaagcagaagttccttgctttgactttgagaagtgcaaaagaaagaaattcgaggagcttcaagtctctgaggaatgtggagtgccttcctcaatcacttttgacctcactagggatcaccatgactccatgagaatgtacacaatcaagcttaagattcaaaatgactttgaccctgtgctctctcctgaaagctcacttttcgtactaaaaagtaaaaaacaggtatcttatcaagacatattgaaagtactcgatgctagtaaagcctgcagctgtgtccagaattttactgatgtgtatctaagacttcctggcataccgttgagtggacagctgacagaaggcgagtgtattagggtccgaatatgtgaaggaagatttgcactgttaatacgagagcctataagggaaggaaattttattatccagccaaaggttgattttgacattagtgccagcactgtcgcaggacttcttaagcttggttaccgagctgtggcatatattgaagcttctgcaacgatttaccaagatggaaagattcttatagaggttgatagtctacaaggtgagacaaatccgtatcttcagattaaaggaacgaacaaggaaatagtttcctctgctgcatctgcactcagcttagatgattcatacacgacaaagagctatcttcaaattattctggagagtttgccagcggatgaaaatgttcatactggtattcataaccaacaagctgctaggctacaagaacttgttgagtttatccagtcacaaggaggtagcttcaattcagatttatcttcacctacaagagaagtttcttctacagatagtgtgcttgatgatgtgcaatctaggttaaggaggcttgagagatggaatacaattaatatggacttttcgctctttgatgcgatgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MWDKGWDEGYFGGPSGSGKTSLAQKMANIIGCEVISLESYYKPE QVRDYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNHKAEVPCFDFEKCKRKKFEELQVSEECGVP SSITFDLTRDHHDSMRMYTIKLKIQNDFDPVLSPESSLFVLKSKKQVSYQDILKVLDA SKACSCVQNFTDVYLRLPGIPLSGQLTEGECIRVRICEGRFALLIREPIREGNFIIQP KVDFDISASTVAGLLKLGYRAVAYIEASATIYQDGKILIEVDSLQGETNPYLQIKGTN KEIVSSAASALSLDDSYTTKSYLQIILESLPADENVHTGIHNQQAARLQELVEFIQSQ GGSFNSDLSSPTREVSSTDSVLDDVQSRLRRLERWNTINMDFSLFDAM</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..34#503..660#1296..1406#1723..1788#3957..4031#4106..4282#4374..4459#6035..6089#7881..8006#8095..8208#8984..9103#9474..9500#atgtgggataaaggttgggatgaggggtattttggtcagttcatgcgagtaaaattatttttttttctttttctaactgaaaccctaacggactagtaaaaacagggtcagatggtggcttcgcttttgaaaaacagggtcaaatgagcaaacctgaaaaagtagggtcaatttggtagttcggcttctaaatataagcaattgtcccttatttatggcgaacaaccatctattgtgaaaatgtgtgctaaagcagacaataaacataaatgggccttctggcagattactgagcgattatttgcgccccatctgtttttttactagtccatgtatgtgaatacaagaattcttctaagaattttatattgtatggaatagattgattctgtaataataattctgttaaacttgtgcaaaaatgatatgacccacacacccagcaaattacatttactgactatgctgtcgctgtttaagttgatacactgtttatttgtaggtggccctagtggatcaggcaagacaagtttagctcagaagatggccaatataattggttgtgaagttataagcttggagagttattataagcctgaacaagttagggattataaatatgatgagtatagctcattggatataggtttgcttactaaggtgattcctttttatattgattccttttctgtattatcatgtgaattacaaattcctgtgcataactactagaatcttaaatatttcaagcatgcttccaaatttctatcttgttctaaaagtcgatgcaaggcgccgcctaggcacttggtagctgccacgattaggcattagatagtgcattaggaggctaacctactttgggcgctattgtgttgctatttttctctatgtaatatgcttgataatttcttggattctatgattggtatgtcctaggtgcccgctaggcactaggcaccagctctgctgaccctctagcacctagcgccttcttgaaccatgtttctatctatacgagatcacttgaatttagggttcaaaatctggtggtgaacaaccacattaccagataattcttgtatttacaaaactgattttaattcaacagagacagaaaattattatgtgacattaatttgccagaaatatgtattggttatattaagcattcaatagtggtgataaaattattcttactccacagcattttgcatgctgccttttcttttctggaatcatatggttgggttctatagtgcctgttaaatgacgattctcttatcgccccgcagaacattatggagatcagaaagaatcacaaagcagaagttccttgctttgactttgagaagtgcaaaagaaagaaattcgaggagcttcaagtctctgaggaatgtggagtggtaaaatacataaccatctttctctttcatattttcattgacatacattttgttatggttcagaagggacccagtatttttcatttctgggtaatattcttggtttggtaactaccatgtcacatatggaggggggttatttttatactacaatattcgttgttgcttaagaagctgtaatcccacatgatgtaatacatactatgttacttggactgtccatttttctgtcccctttctcctcccaactcatcatctccttcactgtctattgaaaccatacctctcctcttatggtgtcctaatactctatcagccttcctcaatcacttttgacctcactagggatcaccatgactccatgagaatgtacacaatcaaggtgtgcgaaagcagaatcttgtgatggagttcttgggctacttggaaacatcaatttagctctgagatcatttattgggttcaacagaagtcagaatatcagagcacgccgtttgagcaggatgctggtgcataatagaaaaagggcggaccggctgacctgctttgccagtcagctggatactgcaggactggatgtttatgttgtatgcatatttcctttgaacacatcagcgtagtagtttagatggccattgaaacaagtgggaaaaccattttttcgcatatatttggaacactgtgctcttgagccttagcaagaggcgtttctagacccaacggccatatcttagctggactccaagagaactgcggcctgtgtgttctcaataagttgctggaattccatcggaaaacgtctgtttcttttggttcaattgcgtgaacaattcttacagtcaaccgaaccactaaggttgttggttccggctttttccagtttaacctctggcctggactggtctattatactatgtgccggtggcggcgttctctgattcacaccaagtcactctctttggtgctgtaaggcgagcatccgcctttgttcacttgtatggtgctacaggcactatatttttcattgtctctggtgggcagaagatcttcaaagtgtgattaggtgtcctgtggccactctcagatatggggtctcactggtcatttcatgattagcttatgatggtccataatgccttccccaaccttcggcaacccgcttctctagttggtagtccaaggtggtcaaggagacgaagaaaggattgaactccttgattatcctagtggcatgggaaattcggaagcaccagaatgattgtcttcaataaggccatgcccagcgccgtggttgtcttgcaagcaatagcaagaaagagtgttctttggtgtacggcttgtgccagggttctcaatgagttcctgtatcggtcacttcctttggttggttagctgctcctaggagtaatctgttgcgcgtcgctttttgtgatgcctttttctttctagagggttccttcttcgtggaccgctttgttgtacgtatttctgcttcttaatgaaatgaagcattttcgagaaaaaaaaatgaagaactgggagggaaaatctagtgccaactaaaaatagtggcatatagtcaatggaattccacctgtttggtgaataatgttgttttggtgttgtgaccttttcctaaatatgcgataataatatcttatgttgaatcgcggtgttaaatgaattccatatgcaaaatattctatacgtagcaaacagaatatcagagtgaggtacatgtttaaaacttcaaacggcttcttcaaatcaagaattagtgagggcatctttctttttgtagtaagcaactctattgaagataacataaaattgtaaaaacagggtattgtagttagttattttaattcttctacttattctgtactggaaactatatgatgtggttgatagctgttatacttgactgtgagtgctgtacaagaaaaaaaatcaattagatttgatgtagcgaatacacatataaaatttgatttgatattaacctttattttgggtattttgaaccaatcaacctcaaatttcagtgataacattgtttcttatcttactcttttggactactaggtaatcttcgaaggtgtctatgctttgcatcctgctataaggaaatcactggatttatggattgcagttgtaagattttttaccctcaaaaaaaagttgtaagattttattcaaatcttgaaaaaactgtttatctagtttgatttttttttacatcataaatatctccctggaaatttactgcattctgtctagtaggttggtggagtacattctcatcttattgcaagaatacagagagacaagaatcgtgcaggcttttctatttctcagagtgaaattatgactaccgtgtttccgctatttcagcaatacatagaaccacatcttatcgatgctcatgttggtacaagaaacatgaatttgacctatttgatatatatttatcatttatggctttccattatcatgtatttagtaacttgtttggactcacgcaatgttccttctccacgtgctttgcagcttaagattcaaaatgactttgaccctgtgctctctcctgaaagctcacttttcgtactaaaaagtaaaaaacaggtaagtttgagctttatattgttcatcttattattacgttggtgattatttatctatttttgtttcatgaataggtatcttatcaagacatattgaaagtactcgatgctagtaaagcctgcagctgtgtccagaattttactgatgtgtatctaagacttcctggcataccgttgagtggacagctgacagaaggcgagtgtattagggtccgaatatgtgaaggaagatttgcactgttaatacgagaggttagtttaccttttgcataccatttatctttgtgttttcatgagacagtcaatgacaggctacgtttttcctttgttcatttaatggtagcctataagggaaggaaattttattatccagccaaaggttgattttgacattagtgccagcactgtcgcaggacttcttaagcttgggtaagtgatatgctttatgatgttaattattaatttagctgattttctagaggtctttttattgagattgtatgttttatcaaaatgtgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgtctatctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtacatggcaacttctgtcttccaacacattgtcctcactcaggctggattcagcaatggattacaactgatgctttatcatgattgattcttgctaaaatcatactaaatcatgtcagaagcatatcgcctgataaaagtttctccttgcatcatcaatctgcaattcagaatagaattcatgagttgacttttgaagccttgg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External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0280275, RefSeq:Os04g0280275