Difference between revisions of "Os05g0513900"

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Revision as of 20:13, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os05g0513900

Description

Similar to Proline iminopeptidase (EC 3.4.11.5) (PIP) (Prolyl aminopeptidase) (PAP)

Version

NM_001062566.1 GI:115464862 GeneID:4339305

Length

6350 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0513900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:25538354..25544703

Sequence Coding Region

25538541..25538636,25538921..25538995,25542696..25542809,25543767..25543868,25543969..25544066
,25544245..25544338,25544453..25544514,25544598..25544703

Expression

GEO Profiles:Os05g0513900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:25538354..25544703 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:25538354..25544703 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gcaggcagaagcactcctcacgcgtgtttggaagagaacactacctgggacttggttgctgacatcgagaagcttagagaacatcttggcatcccagagtggcaggtgtttggtggttcatggggaagcaccttggctctcgcgtacagcgagagtcaccctgataaggtcactggcattgttctaagaggcattttcttgcttaggaaaaaggaacttgattggttctatgagggtggtgcagcagctattttcccagatgcatgggaaccatttagagattttattcctgaggatgaaaggaattgtttcatagctgcttatagcaaaaggctaacttcctctgatgctgatgtccaggctgaagctgctaagagatggacaatgtgggagatgatgactgcacatcttatccaaaatcatgagaacatcaagcgaggggaagatgataagttctcattggcattcgcaaggattgaaaaccattattttgtgaataagggatttttaccctcagactcgcatctgttagacaatgttgacaagattcgacacattaaagcttttattgtacagggccggtatgatgtttgctgtcctatgatgtctgcctgggatcttcataaagcatggcctgaagcagaatttaagatggttccagatgcaggacactccgctaacgaggttggtgttgctgccgaactggtatccgccaacgagaagctcaaaagcatgtttacaaaatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>AGRSTPHACLEENTTWDLVADIEKLREHLGIPEWQVFGGSWGST LALAYSESHPDKVTGIVLRGIFLLRKKELDWFYEGGAAAIFPDAWEPFRDFIPEDERN CFIAAYSKRLTSSDADVQAEAAKRWTMWEMMTAHLIQNHENIKRGEDDKFSLAFARIE NHYFVNKGFLPSDSHLLDNVDKIRHIKAFIVQGRYDVCCPMMSAWDLHKAWPEAEFKM VPDAGHSANEVGVAAELVSANEKLKSMFTK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6068..6163#5709..5783#1895..2008#836..937#638..735#366..459#190..251#1..106#gcaggcagaagcactcctcacgcgtgtttggaagagaacactacctgggacttggttgctgacatcgagaagcttagagaacatcttggcatcccagagtggcaggcaattctaaatgctcttcccttaagaatttgcgtcttacaggcctttcagtagtgaaacccattatttgtcaacatttataggtgtttggtggttcatggggaagcaccttggctctcgcgtacagcgagagtcaccctgataaggtgagtgatctatggccctttacatttacctgtgatgatgatacttgttgcaagtaggtgtgcaagggagctacattttagattcacactaatactttcctggatgtttgttaggtcactggcattgttctaagaggcattttcttgcttaggaaaaaggaacttgattggttctatgagggtggtgcagcagctattttcccagatggtatgtgtgtcttgttttgtgtaatggtgtttttttgttaaacactatgaactctttctttttactggtaacgaagttgccaaagtcatagagtttttgagtaggcagtttgttatgtttgcttcgatcaattcactatcttatgtgctgattgattgctgcaactttatacgggcagcatgggaaccatttagagattttattcctgaggatgaaaggaattgtttcatagctgcttatagcaaaaggctaacttcctctgatgctgatgtccaggtagatttatctttattgcttggtacatttgatccattcctttctttagttctctagttcctcggctttatatgtgatcgtaccctctactgatatttaggctgaagctgctaagagatggacaatgtgggagatgatgactgcacatcttatccaaaatcatgagaacatcaagcgaggggaagatgataagttctcattggtaagcccttttcttcttcatcattttttacgttgctatgggttgacaagcttacattaatttctttaacatcttcctacatatgtaatgtacctatatttctttgaaagtttctttacattaatttctttaacattttttttatttctttgaaagcttacattattgctttgtttttttaatgtattttgagcctccaacaagatccaagttgctaattgttcctcttggacgctattagttccaattaatatcccccatccatcccacttgttcaattccacttttaacagctatttggggaagtactatgaataaatcctaaaagtacatctatttaatactccctccgtcccataatataagggattttgagtttttacttgcactgtttgatcactcatcttattcaaaaaattttagaatttttatttatttttttgacttactttattatccaaagtactttaaacacaacttttcgttttttatatttgcacaaattttttgaataaaacaagtggtcaaacagtacaagcaaaaactcaaaatcccttatattatgggacggagggagtaataaaagcaagtttctaaaaaaatatctaagcaggacggagggagcagtgcctttgagagctgttaatttacttgtttgatgttacctcctaattccaaaaggccatctcaatgatcgttgcacaatatcagtatcaatccgctgctgatatactcatgactgctgctgttgaccatacacacttattttctcagtataccaaatcagtgtgccgtttagcttctgattacacatcccatcatattttcctattagcctgcttttatgttgctgaaatgcctatggtctcaatattttgtatttaatatccttatgtgtacttttagaatgtgtgcctttttctgatatttggtgacacatggtttacttttgcccaggcattcgcaaggattgaaaaccattattttgtgaataagggatttttaccctcagactcgcatctgttagacaatgttgacaagattcgacacattaaagcttttattgtacaggtatgtctgtcctcaagttaagttttgccatgttgcatgttatgtctgggggtgactatgagcacgtgtgctcatgtaatataactagctgggtggcccgcgcaattgcgcggctagcacctatataaaattatatatatatatatatatatatatatatattttacttaaagtttattagttatctcgttgtcttaagattttgaaagaaaaaaccttattattatcgtgtttctaattttatagtttttaaaagtcacaccagttgctacccctcatttctgttatattattctttatttgtttgctcgatttaccactatttttattcattcttcttagaacctttaaaaattagatctaaaatttttttagagtttattgttctgttggacttcttttttataatttttagaagtcccgtcaaacactgccattatactcatctacagccgtccactgcatcttctctttatgtcattgctattttaaaaatcgaacataattatcgtttagtttcatttttttactttctagaagttccgccaaaatgtcagtgactttgtcaatctattcctctacggctcgctcgctgccgccctttattgtcattgagattttaaaatcaaacatgattatcattggggtttatttttttactttttagaagcccgaacctttaaaaactggagcttatagtttttagagttgtctcgttgggtttcataatttttataatttttagaaatctcgtcaaacgctgccactatactcctctatggctcatccgccgcatactctttattgtcattgtgattgtaaaaattgaacataactattgttcgaattcattttttactttctagaagaccctcgctcgctgccgccctttattgtcattgagattttaaaatcaaacatgattatcattggggtttatttttttactttttagaagcccgaacctttaaaaactggagcttatagtttttagagttgtctcgttgggtttcataatttttataatttttagaaatctcgtcaaacgctgccactatactcctctatggctcatccgccgcatactctttattgtcattgtgattgtaaaaattgaacataactattgttcgaattcattttttactttctagaagacccaccagccatcgacggctttgctattgtactcctatacgacctacccactgcctctcatttttattgtacttgagattttaaatcaaatatgattatcgttggggtttattttttttactttctagaagtcccgccaaccgtcttgaccgattgcttcatgacctgcctgttgtccttccttgtaatcttcaaccgccaccactctgctcctctatgggcatgttacttaattaatctcgtcatgtgcttcagatagtattttctttcaataatctttatttttttatcaccaattttagttatttataaattgtattcctagttgatatcttatttttctttttctaatttcagaatttatttttatttttcgtattatgttcttttgattttttttattttttattttcaatttcagttttttcaaaattgtattcctaatttaactatctttttaatttgcctaattttggattttattttattttttattccgaatttcatctatttttaaattattgtttgggtttatttttactttctagaagtcccgccaaaccgtcagcaactttgtcattgtactcctctacggctcgcccgctgcctcccttctttaatgtcattgagattttaaaatcgaacatgattatcattgtttttttttactttttacaacttccgaacctataaaaattggacttgtagtttcattttttttatatataatttttagaagtcccatcaaacgatgccactatgcccctctacagcccgtctaccgcctactctttattgtcattgtgaatctaaaaattgaacagaactatcattagaattctttttttattttctagaagtcccgtcaaccgtcggcggctctgcaactatactcttatacaccccgcccgttgcttctcctttttattgttattgagatttgaaaaatcaaatgattatcaatgggtttttttttttactttctagaagtcccggcaaccgacttacttgtttgcttcacggcctggctgacatccctccttttaattgtcattaggattctatttagtgttttattaacaatttttatatgtcgtatcaaccgccaccactctactcctttataggcctattacttaatttatctcgtcatgtgttttagatggtcttttctttaacacaaattttagttatttataaattgtattcctaattgaaatcttattttttatttatctaatttcagaatttattttttttaacaaatagttaataccgtattgtgttattttaatgtttttattttttattttcaattcggttgttctaaaattgtattctgaactctcttttaatttttctaattttggatattattttatttttattctaaattttaattaatctcgtattgggttcgattcttcttccaatattgcttatttttaattccgaatttcagataattttaaattatatttctacttgaactattcttttattttattttgctaatttcggatttatttttatttttattccgaattttaattaatctcgtattgggttcttatatggactctcttttaatattccttattttaatttcgaatttcagctatttttaaattgtatacctacttggactcttctttccttttctaattttggattttattttatttttattttgaattttgattaatctcgtattgggttcttatatggaaacttctttcaatat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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0513900, RefSeq:Os05g0513900