Difference between revisions of "Os06g0645400"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0645400

Description

Aminoacyl-tRNA synthetase, class 1a, anticodon-binding domain containing protein

Version

NM_001188000.1 GI:297725130 GeneID:9270869

Length

12363 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0645400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:27209891..27222253

Sequence Coding Region

27218737..27218880,27218966..27219069,27219487..27219550,27219884..27219972,27220048..27220189
,27220592..27220655,27220740..27220807,27221054..27221176,27221259..27221324
,27221512..27221617,27221731..27221822,27221898..27221999

Expression

GEO Profiles:Os06g0645400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcaggcacttgtaacaacttgtgtggcgatggctccatttacacccttctttactgaaactctctatcaaaacctacgaaaggtgtcaactaaaccagaggatagtattcatttctgcagtttcccttccacaactggggagagagatgagcgtgttgagcaaagtgtaaacagaatgatgaccatcattgatcttgcccgcaatattcgtgaacggcataacaaagccttgaaaacaccactgaaggagatggtgattgttcatcctgacaatgaatttcttgaagacataacgggaaagctaaaagagtatgtcatggaagaaatgaatgttaagactgtcactccatgtaatgatcccatgttgtatgcttctctccgggcagaacccaattttagtgtgctaggaaaaagactgggaaaggacatgggcaaagtgtcaaatgaagtgaagaaaatgacacaggaacagatcttagcctttgaacaaagtggagaaatttcattctttggtcattgcttgaagttagacgatattaaggtgatccggcaatttaaacgtcctgcaaatgtggcagagaatgaaattgatgctgcgggagatggtgatgtgttagtcgttttggatcttcgagctgatcaatcattgtttgaagctggagttgctcgagaggttgtgaacagaatccagaagttacgaaagacagcgcaacttgagccgacagacttagttgatgtatattacaaacctatggacgatggcaagaatactctagtagagattgtgcagtcacaggatcagtatataagggatgctcttggcaatccactaattccaaagatggcggcgccaccagatgcagtaatgatctgtgaggagtctcacaatgtacaagacatgtcgtttgtcatttacattgcaagggtttctccagtggtcacagatgatctccttgtccatgccgctggcaaccgtgagcattttgatgcattaaaagtatatttactgtcaaggtctatttccagattgaagaatgaattccaggctgggaatggcaagattacggtggatttcattgaaggcttcccaccaattgatctccagctgggaaaacatgtttttcttagtacaggagatttctacctggctactcgttcttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MQALVTTCVAMAPFTPFFTETLYQNLRKVSTKPEDSIHFCSFPS TTGERDERVEQSVNRMMTIIDLARNIRERHNKALKTPLKEMVIVHPDNEFLEDITGKL KEYVMEEMNVKTVTPCNDPMLYASLRAEPNFSVLGKRLGKDMGKVSNEVKKMTQEQIL AFEQSGEISFFGHCLKLDDIKVIRQFKRPANVAENEIDAAGDGDVLVVLDLRADQSLF EAGVAREVVNRIQKLRKTAQLEPTDLVDVYYKPMDDGKNTLVEIVQSQDQYIRDALGN PLIPKMAAPPDAVMICEESHNVQDMSFVIYIARVSPVVTDDLLVHAAGNREHFDALKV YLLSRSISRLKNEFQAGNGKITVDFIEGFPPIDLQLGKHVFLSTGDFYLATRS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8847..8990#9076..9179#9597..9660#9994..10082#10158..10299#10702..10765#10850..10917#11164..11286#11369..11434#11622..11727#11841..11932#12008..12109#agcgaagagaaggagaagcacgcacgcagcacgtgaacttccagctctaaacccttccccctctcttgttccaagcccctcctccccttacccccccgccgccgccgccgccgccgcctcatcacccgaaaccctagccccattcgccgcggtcgccgcctcacccgaaaccctagccccattcgccgccggggtcgcggcctcaggagcggaggccatggaggacgtctgcgaggggaaggacttctccttccccgcggaggaggagcgcgtgctcaagctgtggtcggagctcgacgccttccacgagcagctccgccgcacgaagggcggcgaggagttcatcttctacgacgggcccccgttcgccaccggcctcccgcactatggccacatcctcgcgggcacaatcaaggacgtggtcacccgccaccagtcgatgcgcggccgccacgtctcccgccgcttcgggtgggactgccatggcctccccgtcgagttcgagatcgacaagcagctcggcatcaccaaccggcagcaggtgttcgacctcggtatcggcaagtacaacgagacctgccgcggcatcgtcaccaagtatgtcgccgaatgggaggccgtcgtcacgcgcacggggaggtggatcgacttcaaagacgactacaaaaccatggacataaatttcatggagtccgtttggtgggttttctcgcagctctgggagaaagacctcgtctacaagggtttcaaggttaaatttctgatctcacgcctgattaggttttgagtctcggggtttgctttgcatatttattatgatttagttgctacaaagtggacaagctgaggcggtagggaacctgaaattttatggtattcagaagtatgcaatggttaactgtattttttattagaatttggaatttatatgtgtggagaatggaattgttctggtatgtctcaatgagaagaatgaatagcagagtttaggttacatggaagtggcttttcattttgtagataatgctattgtgattacatgaaataattgattggtttttatctgttgtttctgttaatggatttatttttatgaggaatttcttgaaagttaaagtgtcctgggctcttgttcttgtcccaggtgatgccttacagtacaggatgcaagactgcactatcaaactttgaggccgcacttgactatagggttggttattgactttgttcatgtcgtagctcataaattttctatgcaatttgtagtaacttctttttatgatgccatagactgtcccagatccagcaatcatggtgtctttccctattatcggtgatgcggacaatgcagcacttgttgcatggactacaactccctggacacttccaagcaacttagccttgtgtgtcaatgccaatcttgtgtatgtcaaggttagtacttctcctttatttccttgggctatttttccattctttaactttagactatagctgtcaagtttacccactgttaacatcatacatacaaaacttgattttacaaggaacagaactttcactgatgatatattaagcaaaaaaaccagtgaaatactcttgaggaatcttctcgctagtaaatccaaaatgtgcagaagttttgaactctggatgttatgtaaactaatgcatacataatgctatacacaatagatcattggtttctgtgttatattgcattaagtggctgtcttgtttatcctataatcattttgctgcacatacatgatgcttgtccttattttagtggatatctcctgggatcttatagtagtttcccagttcccgcaaataatttaattgctgcatccggttaatccatatttatcagtatagagaaccatgtaccagtcaatctagcagctgcaactgccctgttcttactgtttgcgaaaaaacattttagaccctttttgtttaacttaatgatgcattcttgcattacttatttctttttttgtgataaatcgatcaaattgattgtagaagaaagacattatcgactattgtttcctattctgctccatgtctagaccaccccattcatttagtcagaaaaaaactatacaactgtcacccttctctgcttgtaagttgatgttttcttctgttgaggatgtgtactgtgttgcgaacaggttaaggacaagtcaactggagcagtgtatgttgttgctgaatctaggcttgggcaattgccagccaaggctaaatcatctggaaagaagcaagcaccttctaagggaggcactgctgaagttgttcagggtggattggatactgaagcatatgaattattggcaaagtttccaggatcatccttagtaggcctaaagtgagtgctctgtcttcctaatcatataatactttcatagtttattattagtttcccatgacattatgaaagttaaatgcatgttaacactatctgtgctaggaagcatttcactgaactagtgaacagtttctgaaagtagatatcggagttatgtgtgtgagatgatgcttttccttaagttgttaaccatgtttggttttgttggacttgcttttttctgggcagggctgaataatccacatcacttgttatttgaatttttcatgcaacgtttatatatctctatgcttttggagagatcattttggttgctactcaaacaatgtgtaccacttgtgtagtttagttttataattggtgaactttgttttgtgcggtaatatcagtaatgcttagttggtatacactagaggattggatccaaaatctgcaattttccttctttttttttttggcttttgtctgttgttatattaataaaatcttaaccacgggccctcccctgctgtttttcagttttaaaaaaaagcttagttgattactcctgatacttgttttctagatgttaatagaacaatacggaacatgccatactgccatagccaaatttggagtatatatctggggcgcttcctgtttttaactgttacttttcctacttgcagatacaaacctctgttcgattttttcttggagctccaagagactgcctttagggtgatagcggataactacgtaactgatgatagtggaactggtgttgtccattgtgctcctgcttttggtgaagatgaccaccgtgtttgtcttgctgctggtatcattgaggttggaaaaattctcctttactgtttgggtatttaaactaactatcatgctgccaagaccttggaggttgagacagttgacctatcaatctactaaatatgcatattctccatatttccattactttgtgttgtagtctagaatatgtacttttatatattttctgtgtcaagctttattaaattatctaagggcttttttggcaacaattgggaaagggagtgtgagtttagaggagggagtttatggtgggttagtcatgcggatttgtttttatttactccagtttttttcctgatgtctgtttcatatccaggccagtgggcttgttgtcgccgttgatgatgatggctgcttcattgaaaagatatctgagttcagtgggcgatatgtcaaagaggctgacagggatatcatcaactctgttaaggtaagctgttgtttcagtattccttggaccatttactgtatgtaacacatttacattttagttgcctacttgtttatgtggactattatctatagattttggatttgattaataaattagtgccgtaggacattgcattatatagattctcatgctagtatgtaccggaataatgtcaggacctgtatgtgcattttatgcattatcatgttaattgtctggatgaccttgaagtgggtgcacacaaaaggaaatcagatgtatagcataaagtttctcaatgtatgtctgcactctgtggattgcaccttcgtaaatcataactcataagcagttttggttgatattatagcagcatatttattgcatatgttggatagttttatatccctgaggatgtcattctgaagattataaactttgtgaacaggataaaggaagacttgtcagtaaagggagcattgaacactcttatccattttgctggcgctcgggcactcctcttatttaccgggctgtcccaagctggtaagcatctactgctgctaccatgcaaatttgttagtcggtgtcttctttaccctttgagttatatataattctctatccatctggttgtttagcacaaatggtaatgcagtccatcttatacttgtaacacatgtacatgatgtaccctccgccccaacatataacaacttctaacattcaaaatttgtcccaaaatataacaacttttgcacctacattatctttttaaatcaatcacaaccttccaccttttaatttctccacctacttcctttttttcaaccaatcacaaccttctctccatttaatttcacctgctttcttaatacccgtgtacaaccccaaaactcatattttgggacggagatagtagaagttacttcaatttaacttcatcatgttttaattccatctagatgaacgaatgtggctttcttttgaatctttgtggttcctatttgttggttttgttcatctgtcttttatggtcattgttgttttcctgttccattacctgtttttatttgagaaatgtatgcctgaaagagcttttctgtaggtttgtgaaggttgaaaagattagggaccagttgctggaatgtaacaagcagacctattgggttccagattatgttaaggtactctatcttttcttgtttgtcacacaa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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0645400, RefSeq:Os06g0645400