Difference between revisions of "Os07g0172900"
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Revision as of 20:31, 22 July 2012
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Contents
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Function
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0172900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Integral membrane protein |
| Version |
NM_001065535.1 GI:115470802 GeneID:4342519 |
| Length |
9950 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0172900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:3862470..3872419 |
| Sequence Coding Region |
3865147..3865183,3868282..3868544,3868680..3868744,3868828..3868990,3869798..3869946 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MTKTATPASVSSRFIPRYQVGSSKVDTSERYFDEWQKKLPNTDE IRKSKPRSRYFTISGVELSPDNMAVATVYFVQGVLGLARLAVSFYLKDDLHLDPAETA VISGFSSLPWLIKPLYGFISDSIPLFGYRRRSYLILSGFLGALSWGLMATLVDSKYSA AFSILLGSLSVAFSDVVVDSMVVERARGESQSTSGSLQSLCWGSSAFGGIVSAYFSGS LVDTYGVRFVFGVTAFLPLMTSAVAVLVNEHRLSSGERAMSHSGSGFIETSKQHIRQL WTSVKQPNIFLPTLFIFLWQATPKSDSAMFFFITNKLGFTPEFLGRVKLVTSIASLLG VGLYNYFLKAVPLRKIFLATTIIGSALGMTQVLLVTGLNRQFGISDEWFSIGDSLIIT VLSQASFMPVLVLAAKLCPPGMEATLFATLMSISNAGSVSGGLVGAGLTQFFGVTKDS FKNLALLIVICNLSALLPLPLLGLLPEESGNADDEETKHN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2678..2714#5813..6075#6211..6275#6359..6521#7329..7477#7572..7820#8391..8559#8641..8733#9234..9518#ctagtctttatcctttgctttccacttgatttctccactgactcatccccatcatctcctcttctgttcagaatctcctcctgctaaagcatttcgttgctgatttttttttttgctggaattcttgttgtggggtaaggcgcaaagcgctgcgaggcaaggcataacagctgaaagttgcaatctttatcggttttggattcctcctcctcctgctgctgctctctctcctccaaggctccaacacatcctggtcccgagagaaaaaggggagatatttttttgggggcgcatgattcgatcccttgttgtttgctgttgttgccttgctgcgcaaagatttggtcctttctcggtctgtttcttggcctgttcagctcggtggtggtggtgttgttggtggtgcagttcttggagtcacatggttggtggtggtgtgggcagttcttgatccaggctcagattgaaactggcggtcgagagattcctggttgcaggagaagttcttggtcgcatttcgggtggtggtggtggtggtggtggtggcagttcttgatctgctccctcgggagaattcgattgatgtggtgggttctcttcttcttcttctccttggagctcagttccccaattcgccattttgatgaggagctcccactgtgagagctactgcgctcctcccttgtgcaacctcccctgcctccccaaatccaaagacgattcgaccacggacgatgccgccgccgcgtcgtctccaactccggccaccgtcgtcgccgcagctttcgctgaggacaagcctcctccgctgcagaagattgaggcggcggtgacggcaaacaaggatcatgatgatgatggtgatggtggtggtgatgagggtagcaaggaagtggtggtgacagtggttcccaagagtagcctgaagaagactaattgtgaggacagtaagaatgtggtgaagggcaatgtgaaatggatggatttgctggggaaggatctcactcaagttaaagaatttgagccaaggtacatacattttttgttcactcccatgtttatttacttacttaattactgtttgttgaaatgtatggtgaattttggtgtgatgtagttgttcatcaatttaggtagagacggcttgttagcagaaatgtgggatgtctctaatctctagaggaatgttctggtcttaggtaatcgcttcacgcgtttgctataagtcatggtcatttgtagttggttgatattaggggttcattatcaaaaaggctgagtcaatggttgttttttttttgccttctgtcccttgatgatggtggacttcttttgttattccgatgtagtggccgtgtaagatgataatggggcaagtcgttaaagtattgtgcaactctactatattttgactttggttttggtgtgtaagcatagatgcggctgctgtgagcacagtccatctggtcatcatcagattaagaaattagatggctggggtcatactctgaagaagtaatatcacaatacattactaataataaaaccccaatttgtcgtgcttggataacggtgaagaccaagccatcttcttcccttattgggtagctgctctagattttttttcttcaatgtgtccaaaattggcggttttcttcaatgcagcaagaaaacataattgaatatccaaattacatttgtcgctatctatatttgtgcaagaccacctgtctaaattgaggcctagccactttgcactgcactgaagttgtcatgtacttcgcttttggtcagtttttctttgtaattttgggtaaaatgtaaacctgaagctctgcaagagatttgatttttaagactgagatgtatccatgcagcagccataatcagatttaaggtgtgacatggacatcatctttgtaaatataggtcatgtccatctgtcagtgaaatgttctgaatatgtgctactcaactaattaattataagtgcatttgccaagtttactctttccagatatttttcttctccaaacttacacgtcaaaatggatatttgattgtcaagctgcaagcaatcttttgtttttgtcatttctatctaaagaactggttaactgttttttcctcaattagtttgcagcaaaccaagtgggtaattgtatatcaccttgtatgaccctctgcacatccaagctaaagaccaagcaagctttcaatctagatcagcagattcagcaccatctttattaaaaaaaaaaaatcaatgcccagggcggttttgtacatgaaccttcatttttcagaaaaagtcattgggtttgttgtggattgcttccatctgctttatattatcgtatcatgagtggatacattgaatgttgattatctatgtctttcacatttaaactagtaatggcacattaacacaaacatctttcatagtcttattctatgatgatgggaacagcataccgacataattatccgttgttgtgtcgctttcgaagttcctttccctttacagctctaattgatttgaaactctccacgctaagtagtgtatatccttgattgccatgactgctcaaacctcttattacaaaaagatcaatgtatcattgttctttgatgcttatactacattttcttgcgtgcagcgaatctggagactcggatgacgaagacggcaacacctgcatctgtgtcatccagtaagcagccccttggagatcatccctgtaaattctctgaaaggaaaaaccgaaaaacaagtgtctgggtcagccattagttgtttatttgtcagtagagagatcagagagccccccattgtgtcgttggtttatctggaattgtggatggaattgggttgtgttgtactatcaatcagcagcagcttcaccagtacatgttgcacatgcatagagtttagattttagaagattcctgcaaagatctgatgattatgttcttgtctgaccttgttctggtaacctggttggggtgttttggtggcagtataatgattataaccagcattgcattaggctgactggattggctgaaatgtgggccccctcttctgtatgcccagcttgatgggctggtctgggctgggcttagcttgggccttaggccgcccagtctgatgacaccgtccggtccgaaactattcgggattcagacttccaggccaacttgattcataagaatccacagaaattttagattaagccctgtatttctcctgaatcctagtaccatttggacgaaaaatcctgtaaaaattgcttgtgaaattaccctcggcctagaattttgggagtatctatgcatctttcgaaagatttttatgatcatatcacatagatttttaatctttgcattaaaatccaataaacacagtaaaagataaaaaacaactaaaaacatcataatggacactaattaccatatcttcaagaaaaagaccaaatccatgcgaagataaatttcaaaacttacatgcgaagatctaaaaattacactgtaacttacaaaagttacaatgtaagtttcataaattacactgtaacttacaagaaaatgcattgtaaatttgagtgagaaaatcgagtgagagataagaaaaaaatatttcgagtgagaggtagcaaaatcaataatttttttgcttgtgaagttaggtcttacacgtgggcccggagccccagagagagagagagggggaatacaaaagcagatgagatcagatgaccaatccaacaaagcaggagagagatttggcatgtggggcccaccgcgcagtgagagagagagacacgaggcagatgtctcgcgtcgtgtagtggccgtttcactgctcccctcctggcctcctccctaccaaatctacccccgcctcgatccccaaaacccgcgccgctcgccgtcgccggagacggcgccgcgccccccctcccgccacgcccgcgcgcggcatggcctccggtagctcggtcggcggcgactcgtacgacgaggaggccgccgccgccgccgtcccccgccgccccccggtcgagctcgacggccgcggcgccgcctccgaccaccgctctggtgagtgagctcggggatttccttctccggggttcaggatcgcgtaactggcgagggcatggtgcggggattgcgggcgagggatgcggagaattgagggagcaaacgggattgcatttaaatgtgatcagaagtcccgcgttcttagcgttagtcgtgttgtggtcgttggtttctgaatttatgcaatgcggttgctgcctgcagctgcaatgtatgaattagtagagctcgtggaccttgcttatgcatcactgctacaattcagccactcttattgtaatgtgacagagagttaactaaattttatactacaggacggggttaaatgaatgggctaaacgcggcattctggagttcctcccttttatgtatgcatttaatcgtttggtgaaacaaattgtctatcggaaaggacagaagtatatacattgtaatcatctttctacaatgacccttattgttgtcaacgcagaaattttatttggttaagcttgttctatctgtgtggagcatgctagagatttaaagatatattggtgaaatgggtgccaattacttgagcatggcattttgttttctatactgcactaagggtgaataaataaatatagggttgtagtaacaaattaagggcatgctagctttgattccaaactcaaatttaccaaaatttggtaatgccagtttttggtaggctgcaggtatgtttggtttgaggccttatcaaagtttggcgtggtgttaaatatggaagtttctagagttagcagatttttgtat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