Difference between revisions of "Os07g0437500"

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Revision as of 20:35, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os07g0437500

Description

Similar to Tyrosine decarboxylase 1 (EC 4.1.1.25)

Version

NM_001066044.1 GI:115471820 GeneID:4343080

Length

8591 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0437500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:15328173..15336763

Sequence Coding Region

15328283..15328284,15328430..15328574,15331153..15331228,15331409..15331639,15332131..15332294
,15332532..15332672,15333369..15333428,15334095..15334259,15334413..15334469
,15334821..15334885,15335972..15336095,15336206..15336343,15336442..15336567

Expression

GEO Profiles:Os07g0437500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:15328173..15336763 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:15328173..15336763 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggagggagttggcggcggcggcggcggtgaggagtggctgcggccgatggacgcggagcagctgcgggagtgcgggcaccggatggtggatttcgtcgccgactactacaaatccatcgaggccttccccgtcctcagccaagtccagccaggatatctgaaggaagttcttccagattcagccccaagacaacctgatactttggattccctttttgatgatattcaacaaaaaataataccaggagtaacgcactggcaaagtccaaattattttgcttactatccttcaaatagcagcactgctggattcctgggggagatgcttagtgctgcctttaacattgttggcttcagttggataacctctcctgctgctactgagctagaggttatagtcttagactggtttgcaaaaatgctccagcttccaagccagtttctgtcaactgctcttggtggaggagtaatacaaggtactgccagtgaagctgttcttgttgcactattggctgcacgagatagagctttaaagaagcatgggaagcattcccttgaaaagttagtagtttatgcatctgaccagacacattctgctctacaaaaggcatgccagattgcaggaattttctcagagaatgttagggttgtaattgctgattgtaataagaactacgccgttgcccctgaggcagttagtgaggcgctttccatagacctgtcatctggtttgataccatttttcatctgtgcaacagtaggtacaacatcatcatcagctgtggaccccctgcctgaactaggacagatagcaaagtccaatgacatgtggttccatattgatgccgcatatgctggaagtgcttgtatatgcccagagtaccgacaccacctcaatggagtggaagaagctgattcgtttaatatgaatgcccacaaatggttcctcactaacttcgattgttccttgctatgggttaaggacaggagttttctcatacaatcattgtctacgaatccagagtttctcaaaaacaaggcttcccaagctaattcagttgttgatttcaaagattggcaaattccacttggacgacgctttagatcacttaagctatggatggtcttgagactttatggtgtggacaacctacaaagctatatccggaaacacatacatttggctgaacattttgagcaacttttattatctgattcaagatttgaggtagtgactccaaggactttttcacttgtttgtttccgacttgtgcctcccacttctgaccatgaaaatggacgtaaattgaattacgatatgatggatggtgtaaattcaagtggaaagatcttcctatctcacacggttctttcaggtaagttcgtcttgagatttgcagtaggagcgccacttacagaggagcgacacgtggatgccgcttggaagcttctacgagatgaggccaccaaggtcttggggaaaatggtgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEGVGGGGGGEEWLRPMDAEQLRECGHRMVDFVADYYKSIEAFP VLSQVQPGYLKEVLPDSAPRQPDTLDSLFDDIQQKIIPGVTHWQSPNYFAYYPSNSST AGFLGEMLSAAFNIVGFSWITSPAATELEVIVLDWFAKMLQLPSQFLSTALGGGVIQG TASEAVLVALLAARDRALKKHGKHSLEKLVVYASDQTHSALQKACQIAGIFSENVRVV IADCNKNYAVAPEAVSEALSIDLSSGLIPFFICATVGTTSSSAVDPLPELGQIAKSND MWFHIDAAYAGSACICPEYRHHLNGVEEADSFNMNAHKWFLTNFDCSLLWVKDRSFLI QSLSTNPEFLKNKASQANSVVDFKDWQIPLGRRFRSLKLWMVLRLYGVDNLQSYIRKH IHLAEHFEQLLLSDSRFEVVTPRTFSLVCFRLVPPTSDHENGRKLNYDMMDGVNSSGK IFLSHTVLSGKFVLRFAVGAPLTEERHVDAAWKLLRDEATKVLGKMV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>111..112#258..402#2981..3056#3237..3467#3959..4122#4360..4500#5197..5256#5923..6087#6241..6297#6649..6713#7800..7923#8034..8171#8270..8395#acagcccgcgcccgccttctcccctatctatcattctatcccgcccgcttccttctcccccgcggccggactgcaactgtaacccaattcctcctccctcctcgatcaccatgtaagtgtaaccatctgccaaaccgccgtcctctcctctcctctcctctccggcggcccgtttctccgagctcctcgcgaattccttttcttgttctttttttcttcttcggtttcttgatttgggttcgctcgatgttaccaagggagggagttggcggcggcggcggcggtgaggagtggctgcggccgatggacgcggagcagctgcgggagtgcgggcaccggatggtggatttcgtcgccgactactacaaatccatcgaggccttccccgtcctcagccaagtccaggcaagcatttgcaactctctttcactttcagagagattccttcctgcggatattcctgtacaaccctgcacctgctccacattttaattttatcaagtgactatctgtcctctggctttgctcatcggcaagtggttgcgcactgtgctctgtagggtgagctgagcagttttagggatgcaagtggggcggataagcgggattttttttagaacttttactggcagtatatagaagggcatgctaggaatttgctagaaaataaaataacactttagtaatttttggttcagattgaatctaattgggagtacccggtcctaaaccttatcgtgcactaggggagaagtatcctgagcgccattgttgacaaagcacgtgacgatagcatggtttgatgatagaataacgaagaaaagacaaaattaccctttcaaactttatactgccatctaattaactaaaaaatcaaatcaatctacaccgtaaggttatatatacttgcagtatattgtaccgtaaaaatcctttttttttttcgcccgcttattccacttctagtttttttttctaaaattgtattaccatgtagaaaatgagctagcaggcgggatatttacgcgggtagtgggattgtccaattgcatccctaagcatttttgtcccttgtatcagttataaatagaacaagagggcatcttttgatcatttctagtaatggaaatgggagaacaggagaagtttcccctctgtctaaaacaaggtgggcgaatgcgatcactctttgcaaatgtgttaaaatgataatgtgaaccacttgtgattgtctactagtcagagagtgagcaattcccccatgaattcctttcctctcttttttttttggcaacatttccatttttgacaagtcgttgcacattgctgctctgtagggtgagctgaacattttgtcccttgtgtcatctcaatagaacaagtgggcatcttttgatcatttaagtttcccctctctgtctcgagaaataataataaattaaacaagtgggcaaacgcgatcaattgttgcaaacagtttaaaatgattatgtgaaccacttgtgattgtgtacatagttagggagagaacaactcaattaatcatacgctaatagctttctcgtttaatccccattttcttactgaagtttcacattggacccgttttggcacatagtttcactttggacaccctttttcttttaccattttgtttcgctttggacaccttctcttccacatcacggcagttgagacaagaggagcttgactagggtgcatgtcacggtggcacactgggagtaagcttgacggcaagagtaaaaggaggtacaaagtgaaacaaaaaggtaagaaaagggggtccaaggtgaaaatatgttctaagagggttcagagtgaagcttcaaagtgatgttttagagtttcctcattataaggtgtaactttgttaatccatttcaatggagtcaaacatgtccttacactttgattataaaagtataaaattgcttcttcgatggtgggaaaagattgcttcttcgatgcaaggagaaagaaaaaagaaattgataggggctttgctggtaacttggtggcaggtgtggcttgaacgtaatcgcagggtctttcaacaaagttacctaagtgccacccaagtagcttttctggttaaagaagatatagacctcatacagcttgtgctccaaacctgacggttttgagtgcggtctttagctgcttttattttgtctgtaatctctgaaagtgattctgtgttttagggtgatcttgattctctccctgtacttttctcccttctaatatatccagcacatctcctgctgtcatttgcttcaaaaaaaaggtataaaattgaaacatatatactttcacattgttgaagtatattataccctttttaaagaaaatctcaatacccatagaccatagcttacgcagtgttcaaaaaaattacacgttggtttttgtaatcgcggaaaagcatatgccaaggagctaactaatattgtgtttgtgataaaaataggcaattgctttatttaggctgttgtttggtttagggcaagtcaaaattatggcaagatgatccacctgtcagtctctcgctgtaattatgatatctgttttgttctggacaaaatgtatgggaaatagaaatctgcattcccctgatgtgtttgccacacccttgtatggaagtggaggagtacatcatgccttttgttaggaagtttcaattattccactgcaaacagttcaggttgtgaagtgataaaatggtgatagtatcagttattaagaattaagagaactagcaaaactagtgttattttatatgtggaagatttattcagttactttttatagtgggaggtaaaaccatctggcctctccatccatggatagatgcacagtgtcaccatcattcttgcagccatcaaatatgttatgtaatatcttttccactccactaagatttcagtttcaatggccgttgatttgagtgacttctttgcagccaggatatctgaaggaagttcttccagattcagccccaagacaacctgatactttggattccctttttgatggtgatgacccctttcgctctattttcaagtaacacagtaatttactccttattctttatctttgatacttgatacactcgtctgttaattgttattcttcaagtgtattccggctaaacacaaagaacacttcatgctttctgataaatgctctaaacagatattcttttttacgtacagatattcaacaaaaaataataccaggagtaacgcactggcaaagtccaaattattttgcttactatccttcaaatagcagcactgctggattcctgggggagatgcttagtgctgcctttaacattgttggcttcagttggataacctctcctgctgctactgagctagaggttatagtcttagactggtttgcaaaaatgctccagcttccaagccagtttctgtcaactggtaaggcctgttggcttttaactgagattctatgcttcgtgacttggttctctagccatactacagtatcagataattgactgactattacatttggatcttcccaattctacagtttcaacttcccaatagaggagataggagttgctaagactgataaattgctattgttttgagtttaaccatattaagatgtgcttccatccattcttcattggagtaatgtttcttatttccttattcttcgtcagtattggatgtttggtacagttgtgcatgtgaatcctgaactagttgcgcacgctattcatcagctttctcagtgtgctactgtatatccatgtcagacaatgtgaaatttacattctatgcagtgaaacaatagttattcatgtagtgtgtaaatatatctctcataagtatagatgattgtatacttttccttgctcaagttgcattcccaagtttctccatcgcttctccctttgtagctcttggtggaggagtaatacaaggtactgccagtgaagctgttcttgttgcactattggctgcacgagatagagctttaaagaagcatgggaagcattcccttgaaaagttagtagtttatgcatctgaccagacacattctgctctacaaaaggcatgccaggtgtgaaaacagaacatatctcatttggtatcacaacaatgaataatcagttctataaaaagttcttgtttttccataacacatacagattggtatgcccaaaataacatgtcttatcctcttcctcgaacttctattcacaaaataagaaattaaaatttatgtatagtaaatatcttgggtgttatattattattttttaattttttttctgagctggcatgcttctgcttacagattgcaggaattttctcagagaatgttagggttgtaattgctgattgtaataagaactacgccgttgcccctgaggcagttagtgaggcgctttccatagacctgtcatctggtttgataccatttttcatctgtgcaacagtaagcaatttgccttgctttttttcatatgccaattttttagaccttgagatgcttcgtatttataagctagtttggacatgacacctcaacttgaattattgtattatttttagtaaattactccctcggtcctactatatagttcattggaatgaatgtgtaatttcacaatgtaattttagaaaatcaagttgttgctatatttttgttccccagaaagtggataagtaactgtagtataccatttaacaggggtacatatagtccaatgccataacactttcttttatttggtactcgttcatctgcctgtgccttgggttgggacattaaattgcaagaca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External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0437500, RefSeq:Os07g0437500