Difference between revisions of "Os08g0201900"

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Revision as of 20:45, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0201900

Description

Similar to Pol

Version

NM_001188501.1 GI:297726132 GeneID:9270829

Length

8891 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0201900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:5905942..5914832

Sequence Coding Region

5905942..5906001,5907952..5907997,5908087..5908324,5909024..5909134,5909906..5910728
,5911988..5912090,5912174..5913049,5914726..5914832

Expression

GEO Profiles:Os08g0201900

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgagtgtgcctcactcaccaagacctgctgctgctaagtgccattgccaacatgaagcctgccacagatggaggagtttggtgattggagtttgggagaggacaggtaggatgcaatcttacattatggctgaagattatgatatttggagaaaagtttctcatgcttatgtgattcctgaagttattaatactgctgctgaaaaaactgcttttgaacaaaattgcaaagctcgcaattttcttttgagtggtatttctcattctgattatgatcatgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaagaattttcatcaaggaacaaataacattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgagatgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgctaattatccacaatctgagatttctcgtcactttttgaatggtctcgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaatatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaactcatgagatgaatgttctctctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcttcttcttcctctttggttgttgatgcttcttcatctatgccctcttttcttgctgcttttaatgccacatctgatgatcaactcgaacaaatcgaggatgaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgagtgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagatggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaatgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaaagtctctgatgtttgcttcatggcgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgagtactggattcctaaatttttattatcatctaaccccagtactgaggcttcgacatctgcttgtgtgtcgactttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattggttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctgatgcttctactagtgccgttgtcgctacatgtttggttaaggtaaatgaaaaatttgaattgaagaatgtagctttggttaaggatttaaagtacaatttgctttcggtttcacaaattgttgatgaagagtttgaagttcactttaagaaaactggaagtaaagttttttattctcgtggtgattctgtgttgaatatttctcgctatggaatagtgtttaaagctggttttgaaaattctgtttcacctgtgataacatgtttggttgctaagtttgataaagcagtgatgttttggcatcgtagacttggacatgttggttttgatcatctcactaggttaagtggtttggatcttgttcgtggtttgcctaaacttaagaaagatcttgatttggtttgtacaccgtgtcgtcatgctaagatggtttctacttcacatgctcctattgtttctgtgatgacggatgcaccgggacagctattacatatggacactgttggtccagttagagtgaaatctgttggaggaaagtggtatgtgttggttattgttgacgatttttctcgatactcttgggttttctttatggcaactaaggacgaagcctttcaacactttcgtgagaattcaacttcgaccagtactgaaacagaacttggatcaacttcagaagttgctgctcctttgcacattcaacgacgacatccgccagaacaaattattggtaatatagtagattttgctgagactatgcgcagggaatttgagatgagcatgatgggtgagttatcgtactttttgggattgcaaattaagcaaacacctcaaggtacctttgtgcatcaaacgaagtatacaaatgatcttttgcgacggttcaagatggagaattacaagccaatttcaacaccaattggttctacagctgtgttggatcctgatgaagatggtgaagccgttgatcaaaaggacgtctcctcgtgcttcacatcgtcaagcggtcaagcgaataatgaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSVPHSPRPAAAKCHCQHEACHRWRSLVIGVWERTGRMQSYIMA EDYDIWRKVSHAYVIPEVINTAAEKTAFEQNCKARNFLLSGISHSDYDHVAHLETAHE IWNALKNFHQGTNNIKELRRDLFKKEYIKFEMKSGEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSS YDANYPQSEISRHFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHEMNVLSR KVDSKSSALVSSSSSLVVDASSSMPSFLAAFNATSDDQLEQIEDEDLALVANRIARAM NNARNRKRGGPNRCFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYNDVDGES GDDDKGKKVSDVCFMARGESDTEYEDNEYWIPKFLLSSNPSTEASTSACVSTLVARKE NVWIVDSGCSRHMTGDKNWFSSLKKASKTESIVFADASTSAVVATCLVKVNEKFELKN VALVKDLKYNLLSVSQIVDEEFEVHFKKTGSKVFYSRGDSVLNISRYGIVFKAGFENS VSPVITCLVAKFDKAVMFWHRRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKKDLDLVCTPCR HAKMVSTSHAPIVSVMTDAPGQLLHMDTVGPVRVKSVGGKWYVLVIVDDFSRYSWVFF MATKDEAFQHFRENSTSTSTETELGSTSEVAAPLHIQRRHPPEQIIGNIVDFAETMRR EFEMSMMGELSYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYTNDLLRRFKMENYKPISTPIGSTAVL DPDEDGEAVDQKDVSSCFTSSSGQANNEVTRCLGRVFAVMDRESAWG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8832..8891#6836..6881#6509..6746#5699..5809#4105..4927#2743..2845#1784..2659#1..107#atgagtgtgcctcactcaccaagacctgctgctgctaagtgccattgccaacatgaagcctgccacagatggaggagtttggtgattggagtttgggagaggacagggtgaaggagatgaagagagagggtggtctagactgcaacaaaaaggaaatattaactagcccaaactgaaaacataggtaaaggggtagttcaaagtgaaagcttggtaataaaaggtggtccaatatgcaatttactctaatttttataatagacataaagatatataaacatatcaataaatatatgattttgttgaagtattttttttagattaatctatacatatgagctctgtatttttaagataaatattttagaaattatttataatgaaagatttcaaagtttaacattaagcttatccagaacgataagggttattgtaaaatcaaaggtgttttttactattattctgtgatgaacaattgggcattggagattattggttttgttatttggaatttattcacgaagtggttttggagatgattggatttacaggtaaatttacaggatactgctgtgattttatgtggaccggtcagactgggctctggtagccggtcagaccggcgtgtaatgcgcggtcagaccggtgcagcccgcggtctgaccggccgacactgtgtcggtttcggtttcgggttgtttatttggatatccgagtttattccatgattatgacttctagatggatactatacgtatgtaatactattgtttgctgctaatgagtcaagttggagatagcttggtttcggaatatggtttctttgtttgttccatgtgtaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataagacgacgtccgtggtggtcagagatcatgcgggatacttaggctagagttgatgcacgtggttgatggagattccatatggcatacgatggaggaattgtgtgcgtatgggatgcggagtcgaatttggaaggagtccaaatttggtacgtttggttatgtaaagtttctttcttgtactagtgggtttcctaaggtgtttaggactcctagtatgagtttggttcgtggctttaggctgcctacctcatgtataaatagagggggagcgtgaggcttctcggtatcgctttagagagcaattgagttgagttttgagttagggtttcgagtttagtcgaaatttttgtaaggagtgctgttggtgcactttgtaaacacagagagaagtaatagagtcgtcatccactttaagagttcttcgatttgtgtttcaccgggtttcgacggtctaaccggcggcgcaccggcggtcagaccggcggcatcgtggcggtccgaccggcgggcacacggcggtcagaccggcggctacaggagtcgacgacaggcgttttcggcggttcgaccgatcgatctacatcggtcagaccgacgttcattaggcggtcagaccggcgcaactacttcggtcagaccgcgatccatcgatttcgagggtaacttttatttccgctaaaagttttcggtttttgggtataccaaccattcaccccccctctggttggcttagttcttgtgattcgatcctacaagtggtatcagagcctcgttttcttctctggatttttatctatctaaagtttttgccattgctactcctgctaggttttcaactaaggctcatattttcgatggaacggatttttctcattggtgtagtaggatgcaatcttacattatggctgaagattatgatatttggagaaaagtttctcatgcttatgtgattcctgaagttattaatactgctgctgaaaaaactgcttttgaacaaaattgcaaagctcgcaattttcttttgagtggtatttctcattctgattatgatcatgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaagaattttcatcaaggaacaaataacattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgagatgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgctaattatccacaatctgagatttctcgtcactttttgaatggtctcgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaatatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaactcatgagatgaatgttctctctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcttcttcttcctctttggttgttgatgcttcttcatctatgccctcttttcttgctgcttttaatgccacatctgatgatcaactcgaacaaatcgaggatgaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgagtgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagatggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaagtcgaagggttttaaccaagggaggaagatggagaatcttaggaaggcttttcaacaagttcgtgccgctttcgagccactagtgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaaagtctctgatgtttgcttcatggcgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgaggtgagtgcttttgaggaagctattaatattttgagtgcaaaaaataaaaagtgtgagaagatgtataaaaaacaggaatttatcattgaatctcttaaatctgaaattgataggttaaaatctcttattcctaatgatgatgattgtgaaaattgtgaggttttaatgaatgagatttcaaaaattagagatgttaatgctgcacatgatttgaaaaatagatcttctcttgcttgtagttttgctttgcacacacgcactttggatgagtagttcttaactaaaaagttgttgcaaaaatatcaaattgcttttcatgctagtttgatgtttaatatgatttctgctaaaaagttaaaacaaccttatggtgttttggattgctcaatatgtaatttgaataagatgaaactaaaagatgctttaggtcgtgttgagtacatggaagatgttgtgaaaaacaatgaagtgctttcttgccccaaatgtcgtaaaagcaaaggtgtcatggtagattgtgaaaattgtgctaatttggaaaaagaggtttcttatttgaaaaattctttgctaagattttctgatggtaaaaagaacctcaatttgattttggatcaatcaaaggatagcacaaataaccgtggtttaggttttgatccttatgcttataattctagacatcctcctgttgtgttagatgttagtgctagaagaggtgagattttggttaaacctaatactaataaaactgtgtttaaatctgctggtatcatgtctaccatgaatgcatcttcttcaaaatccaatgttgtgcatgcaaaacctcttgtttctgcttgtgttgctaaaacttctagttctaacaatgtgtctaaacaacgtgagaaatatacttgttcttttttggcaaagatggacatattgttgatttttgtttcagattagctcataaacagaaaaaggagagagagattgcttttgcaaaatcaaagtggcaaaaatctggttttccctcgaggaaactagtcagaccgcagtgggtcccgcggtcaaaccggcgaccggtcagaccggcgaccggtcagaccggctgaacagcctcggtcagaccggcggtacagaggcggtcagaccggcccccggtcagactggccactgtacctcggtcagaccggcctcggaagaatttttctgaaaattctaaaattgattttgcacgtggatatatgcctattggatcttttggtcgtgtgtctcagtactggattcctaaatttttattatcatctaaccccagtactgaggcttcgacatctgcttgtgtgtcgactttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattggttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctgatgcttctactagtgccgttgtcgctacatgtttggttaaggtaaatgaaaaatttgaattgaagaatgtagctttggttaaggatttaaagtacaatttgctttcggtttcacaaattgttgatgaagagtttgaagttcactttaagaaaactggaagtaaagttttttattctcgtggtgattctgtgttgaatatttctcgctatggaatagtgtttaaagctggttttgaaaattctgtttcacctgtgataacatgtttggttgctaagtttgataaagcagtgatgttttggcatcgtagacttggacatgttggttttgatcatctcactaggttaagtggtttggatcttgttcgtggtttgcctaaacttaagaaagatcttgatttggtttgtacaccgtgtcgtcatgctaagatggtttctacttcacatgctcctattgtttctgtgatgacggatgcaccgggacagctattacatatggacactgttggtccagttagagtgaaatctgttggaggaaagtggtatgtgttggttattgttgacgatttttctcgatactcttgggttttctttatggcaactaag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External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0201900, RefSeq:Os08g0201900