Difference between revisions of "Os08g0307400"
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GeneName = Os08g0307400| | GeneName = Os08g0307400| | ||
Revision as of 20:47, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0307400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phosphatidylinositol 3-kinase, root isoform (EC 2.7.1.137) (PI3- kinase) (PtdIns-3-kinase) (PI3K) (SPI3K-5) |
| Version |
NM_001068041.1 GI:115475819 GeneID:4345232 |
| Length |
19933 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0307400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:12942503..12962435 |
| Sequence Coding Region |
12942988..12943125,12944355..12944493,12944583..12944735,12946093..12946247,12948566..12948703 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgtcggcgcccgacgaagcccaagcgggtgtcaccaccggaaccgccgatcattcctcctgcagcggcggcaaagagtttcggttcatcctgtcacaggacatcagcctgccgctgtcgttccgcgtcaaccgcttcgtgccagatcgcaccctgttgattgaaagaagtgctccagtgctctttgttgagtgtacactatacattgatggagtacagtttggattgtccacaaatacaaggttgaaatctttgggatcaccatactgctggaatgagcttgtaacattaagtgccaaatacagagacctaacgcccttctcacatcttgcattcacggtgtgggatatgtcatctggtgaagacaacatctatattgttggtggaaccactatatctcttttcaatagcaaaaaccaacttaaaactgggaggctgaggctgagagtatggcccaataaaatggcagatggaagtctctccacctctacccctggcaaggttcccaagaccaagagggaagaaatagagaggttggaaagggttgctaacaagtacatcagagggcagataccacatataggttggctagacaatctcattgcaaatgctgctgataaacttgagaaagagagtgagagaactgaaaatttgcattctagccttattgttgaactatgcagctttgaacacagagttgtctttcaggaatatggagcaaagttgcatacatcagtcccttcatccttagtggatatatctaagaataaacttgttattgcatgtgatcctgagattgggcgaatcaatccatctgagcataaacactctgtgcttgcttggagcttggctcgtggagtaaatgatagagagatgaagccaagctcagttgaccaaaagttaatacaaaacatcctcaagtatccacccacacgcactttaaatgtggatgaaaagcaattgttgtggaaatttcgtttctatttgacatctgagaagaaagctcttgtaaagttcctcctctctgtggaatggagtgacatccaggaagccaaacaagctgttgcgttgattccaaggtgggaatctattgatgtggctgatgcattggggcttctttcaccagtttttcaaaatgaggaagttcgtgcttatgctgtcggcgtgtttgaaagggccagcgacgaagaactgcaatgctatttgctgcaacttgtacaaggcctgcggtttgaaagatctgacagatctcgtctagcacacttccttgtgaatcgggctttgtcaaattacgaacttgctagctttcttcgctggtatttagttgttgagcttcatgatccttctcatgcaagaaggtatctatgtacatatgagatgcttgaagatgctataatgagatcagtacataaggaggaaaatggatttcaagtgtggcagagtttgatagagcaggcagaactcactgctcagttacgttctataatgaaggaactatcaaatgtcaaacatgacgcacaaactaaaggcaggatattagaacagttattctccggaattttcagtgagcttaaaaacttcagtgagccaattccatctccattaacaccgactgtcctccttgacggaattgtgcctgaagagtcattggtattcaaaagtgctaattatccattgtgtatagcatttagtactgtgaatgggggtacatcgaaaatgattttcaagaagggagataatctccgcaaggatcagttggttattcaaataatctctttgatggatcggttgctcaagtcagataatctagacttacaccttactccttatcaagttcttgcgactggtctagaagaagggttggttgagtttattccttcaatttctgttgcaaagattatacaaaaaacgggcagtatagaaagttacctacaaaagtgtaatccggatgaagatggcccttttggtataactgcccaatgtttggaaacttttataaaaagttgtgctggctacagtgtcattacatacatactggggattggagacaggcatcttgacaaccttctcctacaagacgatggaagacttttccatgttgacttctcgtatatgcttggggaacaaccacatcgatttgcaccaccatcaccaccgatgaaattatgcaaagaaatggttgaggccatgggtggtactgaaagtgaatactatgcaagattcaagtcctactgttgcgaggcatacaacatattacgaaagtccagcaacctcatactgaatcttttttatctgatgactggatcaaatattgagagtatcacagacaaagggacttctaagctacagcaaaatttccggttggatctagacgacgaggatgctatacattttctccagggtcttatcaacgaaagtatcagtgctttcttccctcaagtggttgagaccatccatcaatgggcacagtctaggcgttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSAPDEAQAGVTTGTADHSSCSGGKEFRFILSQDISLPLSFRV NRFVPDRTLLIERSAPVLFVECTLYIDGVQFGLSTNTRLKSLGSPYCWNELVTLSAKY RDLTPFSHLAFTVWDMSSGEDNIYIVGGTTISLFNSKNQLKTGRLRLRVWPNKMADGS LSTSTPGKVPKTKREEIERLERVANKYIRGQIPHIGWLDNLIANAADKLEKESERTEN LHSSLIVELCSFEHRVVFQEYGAKLHTSVPSSLVDISKNKLVIACDPEIGRINPSEHK HSVLAWSLARGVNDREMKPSSVDQKLIQNILKYPPTRTLNVDEKQLLWKFRFYLTSEK KALVKFLLSVEWSDIQEAKQAVALIPRWESIDVADALGLLSPVFQNEEVRAYAVGVFE RASDEELQCYLLQLVQGLRFERSDRSRLAHFLVNRALSNYELASFLRWYLVVELHDPS HARRYLCTYEMLEDAIMRSVHKEENGFQVWQSLIEQAELTAQLRSIMKELSNVKHDAQ TKGRILEQLFSGIFSELKNFSEPIPSPLTPTVLLDGIVPEESLVFKSANYPLCIAFST VNGGTSKMIFKKGDNLRKDQLVIQIISLMDRLLKSDNLDLHLTPYQVLATGLEEGLVE FIPSISVAKIIQKTGSIESYLQKCNPDEDGPFGITAQCLETFIKSCAGYSVITYILGI GDRHLDNLLLQDDGRLFHVDFSYMLGEQPHRFAPPSPPMKLCKEMVEAMGGTESEYYA RFKSYCCEAYNILRKSSNLILNLFYLMTGSNIESITDKGTSKLQQNFRLDLDDEDAIH FLQGLINESISAFFPQVVETIHQWAQSRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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