Difference between revisions of "Os08g0517200"
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Revision as of 20:52, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0517200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Potential calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type (EC 3.6.3.8) (Ca(2+)-ATPase isoform 9) |
| Version |
NM_001188728.1 GI:297726586 GeneID:9267724 |
| Length |
10955 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0517200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:25740745..25751699 |
| Sequence Coding Region |
25748264..25748284,25748374..25748457,25748630..25748701,25748804..25748881,25748956..25748958 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:25740745..25751699 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:25740745..25751699 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggttcctgccgatggtgtcctgatatctggccattctcttgcaattgatgaatcaagtatgactggggaatcaaaaactgttcacaaggataaaaaggaacccttcttgatgtctggctgcaaagttgcagatggctatggttctatgttggtaacaggtgtaggcaccaatactgaatggggtcagttgatggctaacctttccgaagataatggtgaagaaaccccgttgcagctatggagtaggtgcgcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVPADGVLISGHSLAIDESSMTGESKTVHKDKKEPFLMSGCKVA DGYGSMLVTGVGTNTEWGQLMANLSEDNGEETPLQLWSRCA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3416..3436#3243..3326#2999..3070#2819..2896#2742..2744#gagagagagggaggaggccagtggcgacgccgcaggggccaggggggggttagctgcgagtccgcgacgcgagagggcgcaagccgctgctggtggaaccttccagaaggttcgcgcgcgggggtgggggcgacggcgaagtgcgccgaggcgaggtgagattgatcgatcccgtctctatccgtggcgctgctgctgttgttgttgctgcaggaggggaggcggtgtcgatcgatggcggcggcggcggcggcgtgcgtgtgtggtggttgggtattgggtgctgagtgttgtatggtgtggtgattttgcgtgtgcagggggtggtcggtgtcatctctcctgtcctgcggttgagggggcgaaggtggattggtgggggatttgattgattgattgatcgggcatggcgctcgggaggtcgtcgccgccggcgccggagatccggtcgccggaactggacggcgcggaggatacggatgtcgaggagaagttcgacgacgcgttcgatattccacataagaacgcctcccacgatcgcttgcggcgatggagggtatgtgatctctctctctctctctctctctctctctctttctctctctctctctctctctcttgtgtcctgtgattttgtgatcgatgacgccggttcattcgaatcaggtcggtaatgcccgggggataggggtttgatcactgatcagtgtgtttggcgaatgctcaaaatatggcaattccggaatggcgagtctggatcacccattttagtgtgtacatagagcattggcaatttatgcagtgtcagtcccttgcatggagattatccactctgaaatgttgtgaaatggatgcactactgattacagttgttcagtcaccctcatttcttgttctgatgattggcatattacatgcatcttgtgcctagtcctgggaacaatttgatcctttgcagcagcattcattttgcattattacatgcattacctgacattcccacagccgagatagatgtttatctgtagctaaagtttacccagtccatatatcggggtaaaaacgaagagagcattaccaatttaaccttcttacttgagctagtgagatactaattatacttagttgttgtatgttggggccatgagaaacttgttgtgttagtaggtgaaaagcctttgggggaagacaggtttcaatggacactggagaaatgctcttccatctattcttgagttctgacaaatccggttactctccatttcagcaagctgctcttgtgcttaatgcctcacgccgcttcagatatactctagaccttaaaaaggaggaagagaaagagatgataagaagaaaaatccgagcacatgcacaagtgatacgggtaatgtgccatttttttcagcagatatatcctatcggctggctgtatttgtttgtcgattctaaaattgggttcttcaggcagcatttcttttcaaagaagctggggaaaaagatctcagaggtacaatctcagagttactgctaccttttcagtttatgtctatattaaaaaatctaccctttcctatcgctcttttcacacatataatttatatccttgtgtatttttaatgtcctttatctgaacagaagcttatactggtataaaacttgaaacggcctctcgcagttttccaattgaactggaaaagcttacagcattgaatagggatcatgatagtgttttgcttcaggaagtcggaggagtaagttcatactgagctagatttatattctcatttacagtcgcttgtctcaactactctttttgttcaggttaaggggctgtcagatttattgaagagtaatttagagaagggaatttctctaaatgcggatgacttgttgcaaaggaggggtatttttggagcaaacacatatccacgcaagaaaaggaaaagcatactggtatatgcttttacatcatttttaaatgaacccaaaagttctatgtgcttaacattttagttgcaaaatttaataatattaatgtctgatatgcagcgtttcatatttgaagcatgcaaagatttaactcttatcattttaatggtggctgctgccatatcacttacattgggcatgaccacagaggtattttggttacctcttctaattatttcatacatggtgttcttactttttgtcatgctccttggttgtggtagatttgaactaaaacggattttcatgctgtaagtacagatatgatcaagatttttctttaatttcttttattttagggcgcagatgaaggatggtatgatggtggaagtattttcttagctgtttttcttgtgatacttgttacaggtaatggagtcatgtttgtaaattacttgatcttttagctacctttaagtatttcagtctaataattcagctctatttattattttttggcaataagtcaggttctaatttgtctccttatgatatatttagctatcagtgattacagacagtctcttcagtttcgacatctaaatgaggagaaacagaacatacaagtggaggttggtgtggttatgtgtgaccattttccactatagtagcattaagtgtcactctttggctgtattctgatttactttctctttttattaggttgttagaggtggtaaaagatgtggaacttcaatatttgaccttgttgttggtgatgtggttcctcttaaaattggtgaccaagtaagatggtatatcatttatcgactccatgtttgttttttccattggaacaatttacttacatttattcttgtaccatcaggttcctgccgatggtgtcctgatatctggccattctcttgcaattgatgaatcaagtatgactggggaatcaaaaactgtgagtttctatggcaaatctcttggttgctcagtttctatggcaaatctcttggttgtttcatacttacctttgctgatgattcatggatattacttttaggttcacaaggataaaaaggaacccttcttgatgtctggctgcaaagttgcagatggctatggttctatgttggtgagtgtgctatcttgagtggttttacaacatatggagttgagcattgctgtttttctgtcaccgttcagaacattgttttcattatttattctgtctaccatttgtccttcttttcatgtttaaaatgacctgacttcatacttatgtatttcacctttcaaatacaaaggtaacaggtgtaggcaccaatactgaatggggtcagttgatggctaacctttccgaagataatggtgaagaaaccccgttgcaggttaacttttgttcatgattgtgtttattcttagatgaatggaattctgacatcttgatttatttttatggctgtcgcccttcctacaactatggagtaggtgcgcttgaatggcgttgcaacttttattggtatggtgggtttgacagtggctggtgctgtacttgtagtcctttggataaggtaagtaaacttgataatttagcgagcacaaatgtactctttataaccatttttcatctacagatattttactggacataccaaggatccggatggcactactcaatttgtggctggaactactcgggcaaaaaaaggatttatgggggcaatcagaattttgacaattgctgtatgtaattctaatctacatatagtatgactaatattaatatcatgattgtatctcttttgttatcactgattctatctcttatttatccgtaggttactattgtggttgttgctgtgcctgagggactcccattagcagtaacattaacgtacgagtcacctacttattaaacaaattcatcataaattttagttacatgactattcatatcccttggaattctcggtcacataactgttggcactattttggtttcagacttgcatactcaatgagaaagatgatgcgagacaaggcactggtaaaagaaaattctattcttatgcaattctagaaagatgatgcatgttctgaaaattgacattgctccatttctgtctaggtgagacgtctctcatcctgcgaaacaatgggatctgcaactacaatatgcagtgataaaacagggacacttaccttgaataaggtttgtgaagttaattgctggtgcacttcatgaaaattgctatttgaagttgtatcctgataaattcccaatatattgccctggcggctgcatgctagtagtctctgtttgatcaaaatcttggaacatacaccctccgattggaaacacttgacatggcggttgcacgatgtcaagtattcctgactggagggagtaccgattttcttttctatcaattacaacgatcaatgtttcaatatttgcaattcttcgaaatttccggcatcgtaccttgtttgctgaccagtgtgtcattgatcttctagatgacagttgttcaagcatattttggtggaacaatgttggatccttgtgatgatattagggcagtgtcatgtggggcaacagaacttcttattgaaggaatagcacaaaacacaactggaactatttttgtgccagaggtatagaaggcttttaattctatatgatgtattgatactcatacggttacattctgcacacattatcccttgtctgggtaaaagctacgccctactggttacaaacagttaattaaatggatcggcaactttttagtttttagggttataaattcccacttatccttaaaaggaaaactataattatttattatctgatggaaaaggaggaattggatgcagtctacgtctctagggagaatattgatagtcctccatgaaatttggatacattagttgttatattctctagtcacaattataaccattatttttctatctctaggatgggggag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