Difference between revisions of "Os09g0128600"
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Revision as of 20:55, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0128600 |
|---|---|
| Description |
CMP/dCMP deaminase, zinc-binding domain containing protein |
| Version |
NM_001069149.1 GI:115478037 GeneID:4346442 |
| Length |
10630 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0128600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:2158974..2169603 |
| Sequence Coding Region |
2159123..2159315,2159393..2159499,2159594..2160055,2162755..2162836,2164222..2164304 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcatgggaactcactgaggtcccaggcaacccaactccctccctccgtggctctacagttgaagtgattgctgccaagattgagcccaagttagccaacagtctcattcggcaattgagtcaagcatgcccattggagaatcttcggcatgtaaaacgggtgcgtcggtgctgtgaatatggtgaaaaatctgagttatcaatcatcttatgccttgcaactgggcctgaacattgtagcgaaatgtttcctcaagatgtaaaaaagattgtaggtacctacgaattgaatactttcattgcaaaagttgcgaggtttcctgctacttcaaaagaggagtgggaggaacaatgcaaactttggccaacatcttatcatcccccacacgacttggatggtgtatctggattcaaagagtgtgaattgccatcaatatttaattgcatgagaactgcactgcggttatctgaggtgggcaatgctgctgttgttgttaatccatcaaccatgcagattattgcaaaggctacagaccaaacgctccaacatgatagtttaaaaagtaacaaatgtgctgaattgaattcagacagccccttctcatcacttgaagtaactgagaagaaagggagcaggttgttcctgtcaaactccaatgtttctaaatgcaacagcctgaatatggaagcctcatgtttaaacccttggggatggatgaaaccaaggccgtctgagcagaagtcattgccctgtgaaggtggttttccatggcaccctctgagacatgctgccatagttgcgattgaaaatgctgcggagagggataaagtgatgttcccttcaattatatcatcaaccaaaccaaattcagatggaaatatggagtattattctgttaatgaatcagcaaaacgactaaaggtggatagaaatgacgacaaaaaaattgcacatgaagcaatctgcgatgacttgtcagaaaccagaccatacctttgtacaggatttgacatttacctagtctgggaaccttgctcaatgtgtgcgatggcacttgtacatcaaagattcaaacgtatcttctatgctttcccaaatccaattactggagcactgggcagtgtctacagattgcacggggagaaaagtttaaatcatcgttactctgtatttagggtaaaagtgcccgagtcatattcgaatagttcgggcgattgttctgacaaatgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAWELTEVPGNPTPSLRGSTVEVIAAKIEPKLANSLIRQLSQAC PLENLRHVKRVRRCCEYGEKSELSIILCLATGPEHCSEMFPQDVKKIVGTYELNTFIA KVARFPATSKEEWEEQCKLWPTSYHPPHDLDGVSGFKECELPSIFNCMRTALRLSEVG NAAVVVNPSTMQIIAKATDQTLQHDSLKSNKCAELNSDSPFSSLEVTEKKGSRLFLSN SNVSKCNSLNMEASCLNPWGWMKPRPSEQKSLPCEGGFPWHPLRHAAIVAIENAAERD KVMFPSIISSTKPNSDGNMEYYSVNESAKRLKVDRNDDKKIAHEAICDDLSETRPYLC TGFDIYLVWEPCSMCAMALVHQRFKRIFYAFPNPITGALGSVYRLHGEKSLNHRYSVF RVKVPESYSNSSGDCSDKC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10289..10481#10105..10211#9549..10010#6768..6849#5300..5382#4548..4669#3733..3806#2883..2934#2743..2803#ggggagagagccggagaggggagtcgaacggcgtcggctgtagtcgccggcggcgggcggcaacgagggaagaacgagcgccgtctgtgctcccgctagcggcgacgaggagaggaagaagacgccggtaagccctcctcccccatcgccgccgccgtcttcctccctcttcgccggcgtcttcctcccccatcgccggcgtcttccttccccatcgccgtcgccgtcttcctccccctgtccgcccgtcgcagcccgccccagtgcgctcgccacccgccgccggcgagcatgagcgtcgtccgggtcaaccttccgctcctccctcttcctctctatccacagccagcggtattttggtcttaaaatccctcaaagtggcaaaatatcctgaaagtaatatattgagtggcattttatcatttgcaatgtattgggtggcattttatctaaacccaccgaatggagtggcatattgtcctttttctcagctctgtactgcctaaatccaggatggttactttggttagaaacattttgggttaggaattgttcacagttgaatctaggatggttcatttgatttaggatttaggattagtttatttgaatccaggaatcaggaatggttcatggttgaacattttttttatttaggatttgaatccagccatccagggatggttcatggttcatggttgaacaattgaactttgaaacttgtgattcactgatttctgaagctttgtagcagagttagtatttatcagtgcacatatttagcagagttagcatggtcagtacttaaattggaagaccatattgtagtatttatcagtgcacatattttcaaaatatcaagaagcggaatgttcttttctgaattgtaagatttcttatcatttttccattttctatgctctataaatttgatatgttctgtcaattaatagtttagtactgtactttaatatgcttaacacattcaatttttggtcgattctatgaacactttataccgttataaatatacaactattagactttgtgggttggaaaaaaatattttatcccttctaatttcgaatacccaagttgaaaatcctgggcccgcccctggaggccagcagccgcccaacgccctcactgactctgtctgtttgtctatctatcttagcgtttgactgtttcaagtcctcactatcttgtctcaggtttgttccacggctccaattctgtatgtgctgcgactttacattttgtaagtttgcatgcatcaatagaactagagtcattaagggattttcttcaatgaactatataaaaacaatttaagaagcaagggcaaaaaaacttgaatggttgcttggttacatttattgaaagggatttcttctcaagttaaggatgaggacagcatcattcattttttttttaaaaaaaagcattggcaaattgtcctctaaattgtaagatttatttattatcatttgccatgttctagatattgatatgttgaaaaattgtaaattaaatgttgtaattctatatgtggaggattttatatgaaaattctatgaatatacaaaattatgctcaagtttgtgttatatccgctatagaatatacacaactaatagtttagaattgtgtgatattatacatgccaaacattagtcttttgctctaaaaaaaaattcctacccttttacgttttgaatacacaactttaaaatcctgggcctgctcatctatgatgagtcagcgatatgctgctgatttgctgccattgtagtttgtaggatttgtagattctgatgaagagtaatgtggatattgcatcgtttgaacttgcacattttgaacgtgctttttaaaattagtcgattattgatgttaaaagatattattgatttatttttatcacattttaattaaatttgtacttgtatatgggatttgcggtgttcggaaattttttatatgtgatgtgaacctttgaagtaggactacccaaccaaaaaatcctggctactccccgctccggcacatgcctccacatccgaggctcctactcaacgcagtgttaccgggacacggacacaggtgtcggagtccgactcggactcgagtgtccgacttggcaagctgaaaaaaaaaaggattcggggactcgccccatatatatatatatatatttttagtgaaaatattatatatatcatcaaatataacatactcttatagtcagtaaaacactaaaaacatatggtgtcacacattattctgcacaaaagatcttatcttcttattagttcccacatagaacaaaaactgccagccaaaataagtgaatttcatgtgtagaggatcccttgttcacaaaaaatcccactgctatcctgccgcccacaggccacatgccaatactagatttgtgaatgactggatgcaagtaagtcgctgctgtcattgtatgttttggtattggcctattgggcaagacatgaataggaatggggaagtagtaattttgttaagggtggtcggagaaattggaacagagctgatgcacttgataaacatgcagggggcagttgattctttgatctacgatttagcattactgaggcaaaatgtgtgcatccttgctttttttcatttttgatggcgtatctaccttagaacctctgcctaagatctcttgttctcgactccagtttaccttgcgaattggtcttcatggcatgggaactcactgaggtcccaggcaacccaactccctccctccgtggctctacaggtttctgttttattcaatctagttattttttccctatgctagtttcatagtgttatttcttatttattttcttgggcagttgaagtgattgctgccaagattgagcccaagttagccaacagtctcattcggtaaaggactggaactccacattttctccctttttaatgctaattatagcattctcatttacaaatttcaattcaggaatttagaactgaatttaccaagaacttgaatggattgtttactctgttctgcgcaatttagtcgataaaaaaacagagagatggcattgttttaggttacgctgtattatgaattttataatgttacatttcgaatttaatttctcttgataggactttttctttatgtcatcgtctaagagttaaataaaaatcttaatttgaatatttcttgtcaaaaagactgaatacatatttgtttaattcatttcaggaatcattgggattcagaatctaaaccccaactaatttaacagaagcttatataatgatttaattgtaaagaatgtacatatattgattacaattcgtatgttggcatgaaattggaattttaattgttttgttgatagtttcttcaaataggaagtttgaattatgtgtcacagttgcttaatttccgatgtctaaatggcatgtgtatctttattgagtgaaatacatgagcagtccctaaacttgtgtggtggtgtcacttaggtccctaaaagtggtcaagtttagggacctaagtgacaccaccccagaagtttaaggaccggccatgtatttcacttatttatttgacatgtttgtctcttcttttcatgtgctgttatttttcttttgttacggtttgactataattaacaagtgggctatatttagagcagtgatgttatcaatgtgactgggtttcaggcaattgagtcaagcatgcccattggagaatcttcggcatgtaaaacgggtgcgtcggtgctgtgaatatggtggtaaatgttcttttttcttttctcaatcgattccatgatatgtccatctactttataagttggtccagcttcaccattcatccatacactgtaatactggccacacatccaacacccaaacaaaatagatggtttgtagcagctttgggtctactgttgtaaaaacttgtgcatgcatgtgcacggcagtttatatgaagccaaatcatcaattcaacatgcaaagctccaccttttcagattgagcttaatttggtctgtcattgtgaataccagggggttgggggtggtattgcccccagaattatagtatatgagtgtaagtgtaacaaaactatcttaaatgtggatttccaaccctataaatgattataaccttggtggaatttatcagcaggctttctcttcaacaagttaaatatataatttgattcctcattcaacgatactcttcaatctttaatgctgatattgtcatgtgagatgctgaaccttattttcaagaaacttagtcttacctaaaaaagcagcagaactgggaactaaaatctagaagctcatagtgttttccgttgattctgcctaagaagaagtgcaagagtaggctagtacatgctgatccattgctagaatatggacataaaactgaccagcctacaaatgttttaagttagttcctgggtaattatgttgaacacttttctgtttacttttataatttgattatcttttccttgacagaaaaatctgagttatcaatcatcttatgccttgcaactgggcctgaacattgtagcgaaatgtttcctcaagatgtaaaaaagattgtaggtacctacgaattgaatactttcattgcaaaagtaagtacttttgttaaccttgggagttcggaaatttgagttctctgttgtttttgtaggcatattggacttatttactaacttaatcatgtcatacattcattaagatcaaaattattggtctctagttttacttatatggaaattatccaccaagatagtgattgttccgtgttaaatccttacatgtttctttgtgtgacctacaggcaa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