Difference between revisions of "Os10g0474933"

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Revision as of 21:10, 22 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0474933

Description

Peptidase, trypsin-like serine and cysteine domain containing protein

Version

NM_001189275.1 GI:297727680 GeneID:9268404

Length

8545 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0474933, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:18113284..18121828

Sequence Coding Region

18113284..18113342,18113679..18113827,18113925..18114146,18114228..18114364,18114496..18114747
,18116092..18116240,18116653..18116717,18116810..18116878,18117191..18117321
,18117395..18117682,18117846..18117988,18118075..18118128,18118177..18118257
,18121225..18121828

Expression

GEO Profiles:Os10g0474933

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggacagaaagcccaggtggccagggaagaacaaggaggcagatgcacgagtccgattgactgcaaagaccctgagaaacagggggcagattgactgcaccaggggtgtgagtagggagcaaagagccataaatagaaggaaaaaacttgagtcgagttctggttatgtcaagtcccgcaagaggctcctaaaagtttacgttgaatatcaaaagagactgaaggcattggatgcttttgaaaaaaatcaatgtgctattgaggaggaacgatttggtgaaggtctttgtgatcgagaagtttcgaccattgcttttaaagaggaatcatttggccatattgtcgaacccagccaacaaacttatcgaaccagtgctagtgatgatcttgatttgtctgacattgtcgtctcccttgctttgtttgatggagataagatgttatttgcattctcgggcatacctctaccatccagaagatctagagaagaactaacaagttttgtgacatcagctgatttggctagagcatttaatgagcatagaaatagggatgataatttgacggttgcagtgcgccttcctgataatacaactactgatgggttcttaggactatatgatcatgatattgttattgtcacatgcttgggtctcgaagaggtcagtcctatagattttaatggaacacctgcctgtcctgatggtagtcctcttctagctgctgggcgtgccttcaagtcaggcaatttaatggccatgagtgggtctgttcatagtggcaacacctgggttcctgatagtcaagatatctctaaggctgtacttagagggccacttcttggaaaggataacatatttcttgggatgaactttagtatttatgatgatgatgatcggactgtgaaatatgctttcctaccaatggaattacttcatgagcgcttgaagcattttgggatactcgatcctaaacatctccacttccggggatattcgttgcctaaaggtgtaaaaagcatagtaccttcagggtttatgaaaactatttaccggttaaaatcctttggctatcccatgccgccaccacttgtgcttgaacgtcttgtgagatcatttgcatgcacaggtttgattataaattggcatggaagcaaagctttgcgccctgtcatcctgacttcagccagtttgatcagtcataataaagacaagattgatagtaacctgaagattgaggtttttctcccaccgaatcaacgtggtagtgggatattggaattctatagtctaaactataatattgctattgtcagtctcaagcggaatttcaatgctgttcgcccagaaaacattttcagtggaacagtggaaatgccatctgaaaaagtagtagctataggacgagacgttactcttggaccattgatggccacaattggtaaagtgattcagcatggtaaaaacaattgcaaacttgattgcaaagatcttaaggtttccacatgtaaaatcacaaaggctgggatcggaggccctcttattaagtttgatgggagttttgttggcatgaacttttatgatggaagtagagtaactcctttcctaccaaaggataagattgttaaagttttaagcacagtgaataatttaccatcggaaagtgggcgtaaccatcctatgcccatagatgttgacgatggcacaaagaaaaatagcttagattattatattcaacaatcaacttatatgggaaatattatattggatgacaggtggcctgtgccagagccatactgttcgatctacttctttctatattctccttgcgactgtatcctggtctcttttctccctgcacctgcttttaattcatggatcaggtcggtgtattatatccttcatgtgttctactattttataacacattttttactctacttttctgattttatatcccttattattattcaggttcgtagttcaattgttcgtttacgttttatttgggaaaaggaggaaaaacaagatgactctactgttattatcaagacacagcatatggttattcctgggatcataatctcaatcagtggtagagaagaggctgttatgatagcaaacgccactttctttaataacaagaagagtcaacttaacttttgggtgagctttccaaattctaccggatatgaacaagaacgttctgttccctttagtgaagtggttcttgaggatgagttcttctgcacatttactcttaagccaattgaaggcggttttataaaaccgatccaatttgaaattcagcctgttaaaaggatggatgaagttcattcatttgtttttcctagagaagaatatattacaccaacaagctatccaaatggttttattacgtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDRKPRWPGKNKEADARVRLTAKTLRNRGQIDCTRGVSREQRAI NRRKKLESSSGYVKSRKRLLKVYVEYQKRLKALDAFEKNQCAIEEERFGEGLCDREVS TIAFKEESFGHIVEPSQQTYRTSASDDLDLSDIVVSLALFDGDKMLFAFSGIPLPSRR SREELTSFVTSADLARAFNEHRNRDDNLTVAVRLPDNTTTDGFLGLYDHDIVIVTCLG LEEVSPIDFNGTPACPDGSPLLAAGRAFKSGNLMAMSGSVHSGNTWVPDSQDISKAVL RGPLLGKDNIFLGMNFSIYDDDDRTVKYAFLPMELLHERLKHFGILDPKHLHFRGYSL PKGVKSIVPSGFMKTIYRLKSFGYPMPPPLVLERLVRSFACTGLIINWHGSKALRPVI LTSASLISHNKDKIDSNLKIEVFLPPNQRGSGILEFYSLNYNIAIVSLKRNFNAVRPE NIFSGTVEMPSEKVVAIGRDVTLGPLMATIGKVIQHGKNNCKLDCKDLKVSTCKITKA GIGGPLIKFDGSFVGMNFYDGSRVTPFLPKDKIVKVLSTVNNLPSESGRNHPMPIDVD DGTKKNSLDYYIQQSTYMGNIILDDRWPVPEPYCSIYFFLYSPCDCILVSFLPAPAFN SWIRSVYYILHVFYYFITHFLLYFSDFISLIIIQVRSSIVRLRFIWEKEEKQDDSTVI IKTQHMVIPGIIISISGREEAVMIANATFFNNKKSQLNFWVSFPNSTGYEQERSVPFS EVVLEDEFFCTFTLKPIEGGFIKPIQFEIQPVKRMDEVHSFVFPREEYITPTSYPNGF IT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..59#396..544#642..863#945..1081#1213..1464#2809..2957#3370..3434#3527..3595#3908..4038#4112..4399#4563..4705#4792..4845#4894..4974#7942..8545#atggacagaaagcccaggtggccagggaagaacaaggaggcagatgcacgagtccgattgtatattcgtatgcacgtcaccgtccgcttgctgctcgcatgattgcacgagtccgactcgatgacaaggcgacgtactgcccgacaaaaacatctttattttttaaatattttttaaatagtagagatagagatctatacccaaataatcaagtcaatttggtattgattttgagcacatgctgcttcatagtgttacgattactagcattatcagtgaacccgaaaataaatggttacaaggtagtaaggtgctctattgttttagttttccaattggtgttgctacattatgatcaaaccttgaccaaccatttgcattactttcttcttcaggactgcaaagaccctgagaaacagggggcagattgactgcaccaggggtgtgagtagggagcaaagagccataaatagaaggaaaaaacttgagtcgagttctggttatgtcaagtcccgcaagaggctcctaaaagtttacgttgaatgtgagtaattgatttgaattttcaggttcttctttttctgttacatattgctctaataaaatactcatagttgtgatgtatcattttcgttaatcagatcaaaagagactgaaggcattggatgcttttgaaaaaaatcaatgtgctattgaggaggaacgatttggtgaaggtctttgtgatcgagaagtttcgaccattgcttttaaagaggaatcatttggccatattgtcgaacccagccaacaaacttatcgaaccagtgctagtgatgatcttgatttgtctgacattgtcgtctcccttgctttgtttgatggtggatgcactacaatgcttatgaattttccttatttgtgtttagttgtcacttaattatttaaatcgtgatcttgtccaggagataagatgttatttgcattctcgggcatacctctaccatccagaagatctagagaagaactaacaagttttgtgacatcagctgatttggctagagcatttaatgagcatagaaatagggatgataatttgacggttggtgctgcaaatcattgtgccattcgttttgcttgtttatttgggctttactacgtccaccatttcactttatttatccagatgaattgtggctattgtacgatgatgtactgcttttatcactataggttgcagtgcgccttcctgataatacaactactgatgggttcttaggactatatgatcatgatattgttattgtcacatgcttgggtctcgaagaggtcagtcctatagattttaatggaacacctgcctgtcctgatggtagtcctcttctagctgctgggcgtgccttcaagtcaggcaatttaatggccatgagtgggtctgttcatagtggcaacacctgggttcctgatagtcaagatatctctaaggtatgctttgatctgttttctactttttgcattgatggaaaacttgaattagataattgtatgatgatatcggtgatcttataagccttaaggcaccactgtttgctgcaaagtaatatatatatagtgtggatagacatatacagatgtctaagaaaatcagccacacgatagcagtggaaaagatttgagtagtttagaatcaaactgcaaatatgaaactattacaaacatgaagcaagtaaaagcgggatgttggcactctgaaactgcaaacctgaaacgcttctattatgtgcttgttgactgcaaacctgaaacggtggagatcgaccgagaggcgacgttgccggtggagacaagcggatccagacacggcatcgattgttggctgctgtcgtgcatgtatttcacctaggatggcaacaaaatcatgacaacaattccagcagaacaaaataatgacagtaaaaattatttgggatggacgctctcagccggtgcccggcggatgtgcagacgcgatgccgaaggtctgacgctctggggcggagctcgtggagactggatcttggggcgtcgtcgagcctgaagcctgacgggcagagtagtggcgtcaagacggggccacggggaggggtgggggggagccgaggggcgcggaggtagcagcgagactggactggaggcggacggccacgaccgcgacgacgaccccgggcggcgcaccacgaacaaaggttgagagagggcgggactaaggtcggccggcaacgatggagctccatggggatcttgagccgccaagccacagtgtgcatgccttcacccgagcaagacccgcgtgggagggaggggacgtcggatccgccatcgcgccgccttcagctgtgccggatccgcctcgctgcgaccagatccgccgccgcctcgccgagcctccagtcacccaccaccaccgcgcccgcccccgttcagcggtggaggaggtggagccgccgcacctcccgcccgccgacgccacgcccgcagtcgcttgtcgccccgaaccgctatcgccgccgctccgccgcatgagaaactgcatgcctccgccggatccataaaaagtggagagggagggaaaaatgggtggacggtttctacgatggaagaatagcatgtagattcaatagtaagcaatttactccataaaagtgggatggggagggggcgcaggtgggctggggtgcacgggagtgggggtgggggtgggtaggatgtgatggggagcgttgtgcggtatagtatgtgtgtgtatgtaatttttctttataaataaatcctaccactttgatttgttaggctgtacttagagggccacttcttggaaaggataacatatttcttgggatgaactttagtatttatgatgatgatgatcggactgtgaaatatgctttcctaccaatggaattacttcatgagcgcttgaagcattttgggatactcgagtatgtcttctacgcatcctgtatttgagtttttttcttccccacttagcttattctaagttgttccaaacctatctcttattccccttcctcatttaataaggtaagccattttttatactaacagcattaggaccttgggagttttcacacaataatcttttgatactagctgcataagagtaatctggatagtgcaatatggatagtgcaacttatatttgtgacatttgaatattctcagtcctctcatgtgttatattgaatatttaatattctgattttctagtcctttattcataccttggttcctttcatacaattcggttcatgtgttggtatgtctgtttttgctgttgggctagttcctgtacttttgtttatttttataacaagtctactttgtttgcagtcctaaacatctccacttccggggatattcgttgcctaaaggtgtaaaaagcatagtaccttcaggtgtgaataataatgctacctatgttcattactatgttaatgttatcgtacatatgatctgagtactaataatgatctcctaattgcatcagggtttatgaaaactatttaccggttaaaatcctttggctatcccatgccgccaccacttgtgcttgaacgtaagtcgttgcttttgatattactttcaactcccttgtgcactttacaattaattttttatcttgtttctttaaccagtcaatggggaattgcttaatcaatttgaagattgcttccgtgagagtacccttacgttgatccggccattggttgcagggagcgtgtctggaagcatcttcggaaagaagttgtgacagacatatcttgtcgtgttgtctcacttgcatcattcaatggtaatttttacaatgatcattacttccgtgcaatttttatattcactaactaatgattaaagttgtaatgtataggtcttgtgagatcatttgcatgcacaggtttgattataaattggcatggaagcaaagctttgcgccctgtcatcctgacttcagccagtttgatcagtcataataaagacaagattgatagtaacctgaaggttggatctcataatcatttatcttgatctttacattatatgatgacttgctgaactcactttatctttgcagattgaggtttttctcccaccgaatcaacgtggtagtgggatattggaattctatagtctaaactataatattgctattgtcagtctcaagcggaatttcaatgctgttcgcccagaaaacattttcagtggaacagtggaaatgccatctgaaaaagtagtagctataggacgagacgttactcttggaccattgatggccacaattggtaaagtgattcagcatggtaaaaacaattgcaaacttgattgcaaagatcttaaggtttccacatgtaaaatcacaaaggtaccgtggtgaatttctcttgctgttttattacatggtaacccatatagatagtttgcattggaatttgagttatctctgtaatcacatgacacatccgctgaaatctcaggattcacaacttatacagtaacatgggtcttttatttttattttgtactaggctgggatcggaggccctcttattaagtttgatgggagttttgttggcatgaacttttatgatggaagtagagtaactcctttcctaccaaaggataagattgttaaagttttaagcacagtgaataatttaccatcggaaaggtactttttcagttatatctcgatgatagctggtagggataatgcttatttatgaacttacattgtataaaaatatttgatgacagtgggcgtaaccatcctatgcccatagatgttgacgatggcacaaagaaaaa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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0474933, RefSeq:Os10g0474933