Difference between revisions of "Os10g0556801"

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Revision as of 21:12, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0556801

Description

CCR4-Not complex component, Not1 family protein

Version

NM_001189339.1 GI:297727808 GeneID:9272729

Length

18781 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0556801, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:22340084..22358864

Sequence Coding Region

22340084..22340221,22340304..22340405,22340497..22340739,22341140..22341268,22341454..22341558
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,22349681..22349786,22349865..22349947,22350031..22350183,22350274..22350513
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,22357610..22357910,22358766..22358864

Expression

GEO Profiles:Os10g0556801

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:22340084..22358864 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008403:22340084..22358864 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgatccccttcaattccgccgtagccgaggatgtccgctccctggtgcagggcgtggacgactccaccttcgactccacccaccgcgagctctgccagctagcggactgcagtcctgatggatgcagtttgctgcttcaagtttgtttggatgaagtgctgctgaatgccgacgtggcaaagagctctcgattgaaacctgagctcttatcaactgttttcaagtattgtctggataaaccatacttcagcaccagtttttgtgaagcactgaagacagtacatgtcagtgatatgttccttgtaaaattgtcaaatgaacttaatctatctgctggagagagggttggagttgggcttgccctatcagattctggaaatctaggcttgattacgaaagggcaaaagttctcaatcgctgaaatcgaggagatatgtgcaaatccagcccatgttttaacaaatgatcaaattcacgatattgttgtgtttcttcaccagactgatggcctctcaaagcatatggattctttcactaacatcatctccctattaaatgtcaaagagatgccattctatgttcctgccccaattaaggaaggcaacgctcggccaacaatttcttcaaggcacatggaactatacactggtagcttggatgatgattttgattcccttctatctgaaattgggaaagaaataagcatggctgacatcattactgaattaggctacgggtgtacttcagatattgctcattgtaaagaaatactgtcactatttgagcctcttgatgatatgggaatctctaagttgcttggagcagttgtttgcactcatgttggtcttggtgaagctcataatacatattcaacgttcatgtcggccgttggcaacagccaaccaagtgactcatctcaatttactgcatggaatattgatgttctcgtggattcaattaatgaaattgccccaagaactaattggattactgtagtggaaaatcttgatcatgagggtttctgtatccctgatgaagcggcattttgtttgctgatgtctatatattctcgggcctgcaaggatccatttcctcttcatgctgtctgtgggtcactgtggaagaatacagaaggacaattatcattcttgaaacatgcggtggctgcgccaactgatacatttacattcaaacattgttccaggaagatggtatttccagaatttgctaaccgcatgcaaggcaatcaggcttggtactgcctggaccttctagaggttttatgccaacttgctgaacttggctatgcaacaatggttcggtcaatgcttgactacccactgattcattgccctgatgttttacttcttggtgttagccacatcaatactccatataatctcctccagtatgaagtattgtcttgtgttttccctatgatactgaaggacactacatacagtagtcttatgaactctctctggcatgtcaacccttacctcactcttcgtggatttgttgattcacattccgacgcaaattgccttctcagaactgttgagatatgtcaagacctaacgatcctatccgcagtccttgattccaccccgtttgcatttagcatcaagcttgctacagttgcttttaggcaaagtcatagcaatcttgagaaatggttggttgaaaagctgactgctcaaggagagacttttcttgaggaaattatgagcaacacaacttatgaggctgcagaaggtgctgtccaacaacctcaagtgatgattttggatatttgccgagaatcttgccctctaattataaaggttctgcaatctcactcgggccagctgttatctaaccaacttgtggaggaactaaggagagtggaagcagtgcatgaatcaaggaatcatggtgttgtaggaagggatgcccctacttctgagggaggtcctgacgacattgaagcacaggcaaatatatattttcaccagatgttttctggacagataagcgttgatgctatggtacaaatgcttgcacgtttcaaagaatctacaaacaagagggagctatcaattttcaattgcatggtttcaaatttgttcgaggagtacaaattcttcccaaagtatccagatacacaacttaagttagcagctgtgctcatgggatctctcattaagcatcaacttgtggctcacctgggacttggaattgctctacgtagtgttcttgatgccttgcgtaaatctatcgattcaaagatgtttatgttcggaacaacagcgctagagcagtttatggatcgtctaatcgagtggccacagtactgtaaccatatattgcagatatcacatcttcgtgcaacacatgccgaattagttgctgcaattgaacgagtgctcgccaagatatcgtcaagtcaaaatgagccaaatgtaggcagcatgctttctgcagatcagcatggttcatcatctattggaaatatggaggcttctgaagcatcgtggcagctcatcaatccaactccaacacaacttgaacggtcacaccaacagaggcaccagggtttccttggggagaggtccaagggctctacaaacatcattcaagccaaaaacattctttctagtgggcaaatgccacttgcttcatcacctggtgatttggctgtcaatctaaaggctgccacaacaccatcgtcacaagcttctcctcatcattctaccactgtatcagctcctttacaacccactggctttctgcggtctagaagttctgctccttcaggcattcgacaaccttccttcaccacaggatttggagctgctctgaatattgaaactctagttgccgctgcagaaagaagagatacaccgattgaggcccctccttctgaagttcaagacaagattttcttcatgatcaataatatttccacttccaatatggaggctaaggcaagagaatttaacgaggttttgcaagaacagtattatccctggtttgcgcaatatatggtcatgaaaagggcaagcattgaaccaaattttcatgatttatacttgaagtttttcgacaaagtcaactcaaaatcattgaataaggaaatggttaaagctacatatgagaactgcaaggtcttattacagtccgatctcataaaatctagttcggaagaacgttcattgcttaaaaatcttggtagttggctaggaaaattcactataggaaggaatcaaacattacgagcaaaggaaattgatcccaaaattcttattatagaggcatatgaaaggggtttgatgattgctattataccattcacatcaaagtcgagtatagcataccgtcctccaaatccttggacaatgggtattcttagccttctcgttgagatctataatctacctaatctcaagatgaacctgaagtttgacattgaggtcttgtttaagaatctaagtgttgatatgaaagatgtgaaaccatcttctcttctgaaagaccgtattcggcaaatagagggaaatccagatttttcaaataaagatgttagtgcatctcaagcaccagtagttgctgaggtttcctctggcgtcatgcctacaataaaccatgtggaaccacaaccagagataaatagcacttcccgtgctacaagccttccaaatatgttgagtcagtatgcagcacctcttcgccttcctacaaacaatatggtagaagatgacaagtccgctttaatcatgcctgaacaggtttcctctcttggtttgagccaggtttcgccatcacaaacaccatcactatcatcgtcttcattttctcttagccagcttattgcggcaattccacgtgcagatatatatttcagaattaatgaaaagcttagctcttttggctcgttgcagtatagcaaaatcatggatatggctttggataaggccatcaaagagattataggtcctgtcattcaaagaagtgttacaatagcgagccgaacaactaaggaacttattctaaaggattatgcaatggaagcggatgatagtgccgtatctcgttctgcacatttgatggtcggtacactagctggaagtcttgcccatgttacatccaaggaacctcttcgtgttgctttatcatctcatcttcgtagtcttattcagggcataactaataatactgaatccacagagcagattatgcttattcttgtcaatgataatctggatcttggatgtgccctaatagagaccgttgcaacacgcaaggctgttgagatgatcgatggggaaatcaagcagcccttttcacaactaaggagacaaaaagaactacttggatctgcatattatgatgcttttccttacactcaaggtcttaagcgtgttccggatgctcttcgtcctaagcctactggccatttatctgctgcccaacgacgagtgtatgaggacttcattactgtatggcacagtcagagtagtcaaaatgcgggtggttcagctactgctacagcgatggcggtcgctccaagcaattccagtgtacctcgagtttacagtccaaattcagcactgacagactccagtagcttttcctcccattttgcatctgcaagtcagactacagaactggtacatgaagaatcagatcgcaatgcacacctttcaagcctttcttcaaaaattggcgcgagtgacacatctacccaagttattggaaccacaaatgttgcatctgtttttccgcctatggttcccaatgaccttccagtgggtgaaccaacaaccacgaataaagatcttgttacttcggcaccactttcacctacaactgctgttgatcggatgggatctgtttttgtggaacctttgaatactagtgatgcgctggagatgtaccaacaagtttcacaaaagctggatactttgatcgcaaaggatggcaaagatgcagaaattcagtctgtcattgc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Protein Sequence

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Gene Sequence

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NCBI Gene:Os10g0556801, RefSeq:Os10g0556801

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